MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-9

Total Repeats: 124

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020378	T	6	6	1321	1326	0 %	100 %	0 %	0 %	452202111
2	NC_020378	GTA	2	6	1478	1483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202111
3	NC_020378	TTG	2	6	1506	1511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202111
4	NC_020378	CATA	2	8	1541	1548	50 %	25 %	0 %	25 %	452202111
5	NC_020378	GAA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202111
6	NC_020378	TAT	2	6	1610	1615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202111
7	NC_020378	TTG	2	6	1629	1634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202111
8	NC_020378	TAA	2	6	1647	1652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202111
9	NC_020378	AGA	2	6	1668	1673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202111
10	NC_020378	TTC	2	6	1755	1760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202111
11	NC_020378	CCAG	2	8	1833	1840	25 %	0 %	25 %	50 %	452202111
12	NC_020378	ATTTT	2	10	2056	2065	20 %	80 %	0 %	0 %	452202112
13	NC_020378	T	6	6	2062	2067	0 %	100 %	0 %	0 %	452202112
14	NC_020378	AGT	2	6	2095	2100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202112
15	NC_020378	AGA	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202112
16	NC_020378	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202112
17	NC_020378	GAC	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202112
18	NC_020378	TAA	2	6	2273	2278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202112
19	NC_020378	CTGTA	2	10	2300	2309	20 %	40 %	20 %	20 %	452202112
20	NC_020378	TCGA	2	8	2316	2323	25 %	25 %	25 %	25 %	452202112
21	NC_020378	GTT	2	6	2375	2380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202112
22	NC_020378	CCT	2	6	2383	2388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452202112
23	NC_020378	AAT	2	6	2400	2405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202112
24	NC_020378	TCAT	2	8	2431	2438	25 %	50 %	0 %	25 %	452202112
25	NC_020378	GATA	2	8	2442	2449	50 %	25 %	25 %	0 %	452202112
26	NC_020378	TTA	2	6	2512	2517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202112
27	NC_020378	AC	3	6	2525	2530	50 %	0 %	0 %	50 %	452202112
28	NC_020378	T	6	6	2542	2547	0 %	100 %	0 %	0 %	452202112
29	NC_020378	CAA	2	6	2558	2563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202112
30	NC_020378	TTG	2	6	2628	2633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202112
31	NC_020378	CTA	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202112
32	NC_020378	TAAGA	2	10	2864	2873	60 %	20 %	20 %	0 %	452202112
33	NC_020378	T	7	7	3285	3291	0 %	100 %	0 %	0 %	452202113
34	NC_020378	T	6	6	3334	3339	0 %	100 %	0 %	0 %	452202113
35	NC_020378	ATA	2	6	3358	3363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202113
36	NC_020378	AT	3	6	3437	3442	50 %	50 %	0 %	0 %	452202113
37	NC_020378	TA	4	8	3483	3490	50 %	50 %	0 %	0 %	452202113
38	NC_020378	T	6	6	3493	3498	0 %	100 %	0 %	0 %	452202113
39	NC_020378	TAAA	2	8	3513	3520	75 %	25 %	0 %	0 %	452202113
40	NC_020378	CAT	2	6	3559	3564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202113
41	NC_020378	GAACCA	2	12	3710	3721	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	452202114
42	NC_020378	T	7	7	3764	3770	0 %	100 %	0 %	0 %	452202114
43	NC_020378	TAAA	2	8	3799	3806	75 %	25 %	0 %	0 %	452202114
44	NC_020378	AGT	2	6	3826	3831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202114
45	NC_020378	TTG	2	6	3955	3960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202114
46	NC_020378	CTA	2	6	4026	4031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202114
47	NC_020378	CTG	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452202114
48	NC_020378	AT	3	6	4062	4067	50 %	50 %	0 %	0 %	452202114
49	NC_020378	TCA	2	6	4115	4120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202114
50	NC_020378	ATT	2	6	4156	4161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202114
51	NC_020378	CATT	2	8	4172	4179	25 %	50 %	0 %	25 %	452202114
52	NC_020378	AT	3	6	4225	4230	50 %	50 %	0 %	0 %	452202114
53	NC_020378	TTC	2	6	4240	4245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202114
54	NC_020378	CATT	2	8	4262	4269	25 %	50 %	0 %	25 %	452202114
55	NC_020378	CTT	2	6	4299	4304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202114
56	NC_020378	AAT	2	6	4336	4341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202114
57	NC_020378	CAG	2	6	4347	4352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452202114
58	NC_020378	A	6	6	4381	4386	100 %	0 %	0 %	0 %	452202114
59	NC_020378	TAAT	2	8	4404	4411	50 %	50 %	0 %	0 %	452202114
60	NC_020378	T	6	6	4414	4419	0 %	100 %	0 %	0 %	452202114
61	NC_020378	A	6	6	4987	4992	100 %	0 %	0 %	0 %	452202115
62	NC_020378	T	6	6	5006	5011	0 %	100 %	0 %	0 %	452202115
63	NC_020378	ATAA	2	8	5031	5038	75 %	25 %	0 %	0 %	452202115
64	NC_020378	GTT	2	6	5049	5054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202115
65	NC_020378	ATA	2	6	5082	5087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202115
66	NC_020378	TAA	2	6	5095	5100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202115
67	NC_020378	GAAT	2	8	5262	5269	50 %	25 %	25 %	0 %	452202115
68	NC_020378	TACAA	2	10	5276	5285	60 %	20 %	0 %	20 %	452202115
69	NC_020378	TTC	2	6	5333	5338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202115
70	NC_020378	A	6	6	5345	5350	100 %	0 %	0 %	0 %	452202115
71	NC_020378	ACTTT	2	10	5398	5407	20 %	60 %	0 %	20 %	452202115
72	NC_020378	CTT	3	9	5488	5496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202115
73	NC_020378	CTTTT	2	10	5525	5534	0 %	80 %	0 %	20 %	452202115
74	NC_020378	CTT	2	6	6842	6847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202116
75	NC_020378	TAA	2	6	6909	6914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202116
76	NC_020378	T	6	6	6949	6954	0 %	100 %	0 %	0 %	452202116
77	NC_020378	TTTA	2	8	7036	7043	25 %	75 %	0 %	0 %	452202116
78	NC_020378	CTT	2	6	7044	7049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202116
79	NC_020378	ATT	2	6	7090	7095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202116
80	NC_020378	TCT	2	6	7109	7114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202116
81	NC_020378	TAT	2	6	7122	7127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202116
82	NC_020378	TCT	2	6	7164	7169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202116
83	NC_020378	T	6	6	7186	7191	0 %	100 %	0 %	0 %	452202116
84	NC_020378	TC	3	6	7226	7231	0 %	50 %	0 %	50 %	452202116
85	NC_020378	TCT	2	6	7266	7271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202116
86	NC_020378	GTT	2	6	7301	7306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202116
87	NC_020378	TCT	2	6	7322	7327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202116
88	NC_020378	TTTCT	2	10	7390	7399	0 %	80 %	0 %	20 %	452202116
89	NC_020378	T	7	7	7404	7410	0 %	100 %	0 %	0 %	452202116
90	NC_020378	TTG	2	6	7426	7431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202116
91	NC_020378	T	6	6	7437	7442	0 %	100 %	0 %	0 %	452202116
92	NC_020378	TGT	2	6	7481	7486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452202116
93	NC_020378	ACT	2	6	7505	7510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202116
94	NC_020378	ACTTCT	2	12	7550	7561	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	452202116
95	NC_020378	T	6	6	7600	7605	0 %	100 %	0 %	0 %	452202116
96	NC_020378	TCT	2	6	7724	7729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202116
97	NC_020378	GTG	2	6	7758	7763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452202116
98	NC_020378	TTTG	2	8	7800	7807	0 %	75 %	25 %	0 %	452202116
99	NC_020378	TTC	2	6	7858	7863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202116
100	NC_020378	AATG	2	8	7871	7878	50 %	25 %	25 %	0 %	452202116
101	NC_020378	TAC	2	6	7900	7905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452202116
102	NC_020378	T	6	6	7992	7997	0 %	100 %	0 %	0 %	452202116
103	NC_020378	CAA	2	6	8005	8010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202116
104	NC_020378	AAT	2	6	8034	8039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202116
105	NC_020378	TCT	2	6	8867	8872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202117
106	NC_020378	TTC	2	6	8896	8901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202117
107	NC_020378	AT	3	6	8915	8920	50 %	50 %	0 %	0 %	452202117
108	NC_020378	CA	3	6	8930	8935	50 %	0 %	0 %	50 %	452202117
109	NC_020378	TAA	2	6	8946	8951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452202117
110	NC_020378	A	6	6	9022	9027	100 %	0 %	0 %	0 %	452202117
111	NC_020378	ATTG	2	8	9046	9053	25 %	50 %	25 %	0 %	452202117
112	NC_020378	TTTA	2	8	9061	9068	25 %	75 %	0 %	0 %	452202117
113	NC_020378	TTA	2	6	9098	9103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202117
114	NC_020378	TTA	2	6	9276	9281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452202117
115	NC_020378	TTC	2	6	9328	9333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202117
116	NC_020378	CCA	2	6	9335	9340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	452202117
117	NC_020378	A	6	6	9348	9353	100 %	0 %	0 %	0 %	452202117
118	NC_020378	GAG	2	6	9381	9386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452202117
119	NC_020378	CAA	2	6	9400	9405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452202117
120	NC_020378	GT	3	6	9406	9411	0 %	50 %	50 %	0 %	452202117
121	NC_020378	TTC	2	6	9457	9462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452202117
122	NC_020378	ATG	2	6	9481	9486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202117
123	NC_020378	AAG	2	6	9487	9492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452202117
124	NC_020378	GTA	2	6	9527	9532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452202117

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.