MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens IT-45 plasmid pBA45-1

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020273	TTC	3	9	262	270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348612
2	NC_020273	CTT	2	6	312	317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348612
3	NC_020273	AATC	2	8	378	385	50 %	25 %	0 %	25 %	451348612
4	NC_020273	GAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348613
5	NC_020273	CACT	2	8	886	893	25 %	25 %	0 %	50 %	451348613
6	NC_020273	CGA	2	6	894	899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348613
7	NC_020273	GAA	2	6	1003	1008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348613
8	NC_020273	A	6	6	1046	1051	100 %	0 %	0 %	0 %	451348613
9	NC_020273	CACT	2	8	1073	1080	25 %	25 %	0 %	50 %	451348613
10	NC_020273	A	7	7	1133	1139	100 %	0 %	0 %	0 %	451348613
11	NC_020273	GTG	2	6	1140	1145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451348613
12	NC_020273	GAA	2	6	1155	1160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348613
13	NC_020273	TATT	2	8	1205	1212	25 %	75 %	0 %	0 %	451348614
14	NC_020273	CT	3	6	1333	1338	0 %	50 %	0 %	50 %	451348614
15	NC_020273	CAG	2	6	1399	1404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348614
16	NC_020273	T	7	7	1437	1443	0 %	100 %	0 %	0 %	451348614
17	NC_020273	CTT	2	6	1563	1568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
18	NC_020273	TTC	2	6	1585	1590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
19	NC_020273	GCT	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
20	NC_020273	CCG	2	6	1624	1629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348614
21	NC_020273	CCT	2	6	1653	1658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451348614
22	NC_020273	GTC	2	6	1667	1672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
23	NC_020273	TTC	2	6	1717	1722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
24	NC_020273	GCC	2	6	1787	1792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348614
25	NC_020273	TGC	2	6	1838	1843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
26	NC_020273	T	6	6	1861	1866	0 %	100 %	0 %	0 %	451348614
27	NC_020273	CTT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
28	NC_020273	T	6	6	1936	1941	0 %	100 %	0 %	0 %	451348614
29	NC_020273	CTG	2	6	1972	1977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
30	NC_020273	TGAT	2	8	2048	2055	25 %	50 %	25 %	0 %	451348614
31	NC_020273	CTT	2	6	2080	2085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348614
32	NC_020273	ATC	2	6	2143	2148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348614
33	NC_020273	GCCG	2	8	2199	2206	0 %	0 %	50 %	50 %	451348614
34	NC_020273	ACA	2	6	2274	2279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348614
35	NC_020273	GAT	2	6	2307	2312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348614
36	NC_020273	CGC	2	6	2317	2322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348614
37	NC_020273	GCT	2	6	2337	2342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	451348614
38	NC_020273	ACTC	2	8	2391	2398	25 %	25 %	0 %	50 %	451348614
39	NC_020273	T	6	6	2445	2450	0 %	100 %	0 %	0 %	451348614
40	NC_020273	T	6	6	2541	2546	0 %	100 %	0 %	0 %	451348614
41	NC_020273	TCTT	2	8	2588	2595	0 %	75 %	0 %	25 %	451348614
42	NC_020273	ATT	2	6	2965	2970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348615
43	NC_020273	A	7	7	2996	3002	100 %	0 %	0 %	0 %	451348615
44	NC_020273	ATC	2	6	3025	3030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348615
45	NC_020273	TTA	2	6	3170	3175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348615
46	NC_020273	TAA	2	6	3210	3215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348615
47	NC_020273	GGT	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	451348615
48	NC_020273	TTC	2	6	3227	3232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348615
49	NC_020273	TTTCC	2	10	3288	3297	0 %	60 %	0 %	40 %	451348615
50	NC_020273	CTC	2	6	3315	3320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451348615
51	NC_020273	TA	3	6	3334	3339	50 %	50 %	0 %	0 %	451348615
52	NC_020273	AAT	2	6	3359	3364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348615
53	NC_020273	CAAA	2	8	3420	3427	75 %	0 %	0 %	25 %	451348615
54	NC_020273	A	6	6	3425	3430	100 %	0 %	0 %	0 %	451348615
55	NC_020273	AAG	2	6	3439	3444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348615
56	NC_020273	CTT	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348615
57	NC_020273	TCA	2	6	3610	3615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348616
58	NC_020273	CTA	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348616
59	NC_020273	AATT	2	8	3639	3646	50 %	50 %	0 %	0 %	451348616
60	NC_020273	TCCTTT	2	12	3799	3810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348616
61	NC_020273	CGC	2	6	3879	3884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348616
62	NC_020273	T	7	7	3895	3901	0 %	100 %	0 %	0 %	451348616
63	NC_020273	AGT	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348616
64	NC_020273	AGG	2	6	3970	3975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	451348616
65	NC_020273	ATT	2	6	3983	3988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348616
66	NC_020273	TAAT	2	8	4020	4027	50 %	50 %	0 %	0 %	451348616
67	NC_020273	ACTTT	2	10	4028	4037	20 %	60 %	0 %	20 %	451348616
68	NC_020273	T	6	6	4035	4040	0 %	100 %	0 %	0 %	451348616
69	NC_020273	CAA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348617
70	NC_020273	GAT	2	6	4200	4205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348617
71	NC_020273	ATGT	2	8	4206	4213	25 %	50 %	25 %	0 %	451348617
72	NC_020273	T	6	6	4330	4335	0 %	100 %	0 %	0 %	451348617
73	NC_020273	T	7	7	4366	4372	0 %	100 %	0 %	0 %	451348617
74	NC_020273	TAA	3	9	4480	4488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348617
75	NC_020273	AAT	2	6	4495	4500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348617
76	NC_020273	CTT	2	6	4523	4528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348617
77	NC_020273	TAA	2	6	4539	4544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348617
78	NC_020273	T	7	7	4736	4742	0 %	100 %	0 %	0 %	451348618
79	NC_020273	TCT	2	6	4817	4822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348618
80	NC_020273	CGC	2	6	4842	4847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	451348618
81	NC_020273	ACC	2	6	4894	4899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	451348618
82	NC_020273	CAT	2	6	4929	4934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348618
83	NC_020273	ATT	2	6	4957	4962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	451348618
84	NC_020273	CAT	2	6	5041	5046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348618
85	NC_020273	CT	3	6	5063	5068	0 %	50 %	0 %	50 %	451348618
86	NC_020273	CTCTT	2	10	5091	5100	0 %	60 %	0 %	40 %	451348618
87	NC_020273	CGA	2	6	5115	5120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348618
88	NC_020273	GCTT	2	8	5171	5178	0 %	50 %	25 %	25 %	451348618
89	NC_020273	AAT	2	6	5196	5201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348618
90	NC_020273	AAC	2	6	5216	5221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348618
91	NC_020273	GAT	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	451348618
92	NC_020273	TCT	2	6	5246	5251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348618
93	NC_020273	T	6	6	5308	5313	0 %	100 %	0 %	0 %	451348618
94	NC_020273	CAT	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348618
95	NC_020273	CGTCAA	2	12	5392	5403	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	451348618
96	NC_020273	A	7	7	5402	5408	100 %	0 %	0 %	0 %	451348618
97	NC_020273	AAT	2	6	5443	5448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348618
98	NC_020273	CA	3	6	5490	5495	50 %	0 %	0 %	50 %	451348618
99	NC_020273	T	6	6	5681	5686	0 %	100 %	0 %	0 %	451348618
100	NC_020273	CTA	2	6	6229	6234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348619
101	NC_020273	A	7	7	6234	6240	100 %	0 %	0 %	0 %	451348619
102	NC_020273	TAAA	2	8	6306	6313	75 %	25 %	0 %	0 %	451348619
103	NC_020273	A	6	6	6311	6316	100 %	0 %	0 %	0 %	451348619
104	NC_020273	A	7	7	6381	6387	100 %	0 %	0 %	0 %	451348619
105	NC_020273	CTC	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	451348620
106	NC_020273	TA	3	6	6600	6605	50 %	50 %	0 %	0 %	451348620
107	NC_020273	CTT	2	6	6623	6628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348620
108	NC_020273	AGCT	2	8	6653	6660	25 %	25 %	25 %	25 %	451348620
109	NC_020273	T	6	6	6708	6713	0 %	100 %	0 %	0 %	451348620
110	NC_020273	AATA	2	8	6737	6744	75 %	25 %	0 %	0 %	451348620
111	NC_020273	CAA	2	6	6761	6766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	451348620
112	NC_020273	A	6	6	6818	6823	100 %	0 %	0 %	0 %	451348620
113	NC_020273	TAA	2	6	6876	6881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
114	NC_020273	T	6	6	6909	6914	0 %	100 %	0 %	0 %	451348620
115	NC_020273	CTT	2	6	7024	7029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348620
116	NC_020273	ATC	2	6	7085	7090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348620
117	NC_020273	TGTA	2	8	7135	7142	25 %	50 %	25 %	0 %	451348620
118	NC_020273	CTT	2	6	7148	7153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	451348620
119	NC_020273	ATA	2	6	7178	7183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
120	NC_020273	A	6	6	7213	7218	100 %	0 %	0 %	0 %	451348620
121	NC_020273	TAAAA	2	10	7231	7240	80 %	20 %	0 %	0 %	451348620
122	NC_020273	TCA	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348620
123	NC_020273	CAG	2	6	7370	7375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	451348620
124	NC_020273	T	6	6	7433	7438	0 %	100 %	0 %	0 %	451348620
125	NC_020273	AGA	2	6	7439	7444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	451348620
126	NC_020273	CAT	2	6	7466	7471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	451348620
127	NC_020273	ATA	2	6	7499	7504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
128	NC_020273	TAA	2	6	7508	7513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	451348620
129	NC_020273	T	6	6	7543	7548	0 %	100 %	0 %	0 %	451348620
130	NC_020273	T	6	6	7575	7580	0 %	100 %	0 %	0 %	451348620
131	NC_020273	TA	3	6	7595	7600	50 %	50 %	0 %	0 %	451348620

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.