MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Blatta orientalis) str. Tarazona plasmid

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020196	A	7	7	275	281	100 %	0 %	0 %	0 %	444335883
2	NC_020196	T	7	7	303	309	0 %	100 %	0 %	0 %	444335883
3	NC_020196	A	7	7	325	331	100 %	0 %	0 %	0 %	444335883
4	NC_020196	GAA	2	6	332	337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335883
5	NC_020196	TTTA	2	8	362	369	25 %	75 %	0 %	0 %	444335883
6	NC_020196	A	7	7	375	381	100 %	0 %	0 %	0 %	444335883
7	NC_020196	AAG	2	6	399	404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335883
8	NC_020196	AGCAA	2	10	427	436	60 %	0 %	20 %	20 %	444335883
9	NC_020196	AGT	2	6	438	443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	444335883
10	NC_020196	AGA	2	6	484	489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335883
11	NC_020196	AGA	2	6	492	497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335883
12	NC_020196	CAT	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335883
13	NC_020196	A	7	7	531	537	100 %	0 %	0 %	0 %	444335883
14	NC_020196	TTC	2	6	546	551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444335883
15	NC_020196	AAC	2	6	565	570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444335883
16	NC_020196	A	7	7	584	590	100 %	0 %	0 %	0 %	444335883
17	NC_020196	TA	3	6	592	597	50 %	50 %	0 %	0 %	444335883
18	NC_020196	TC	3	6	674	679	0 %	50 %	0 %	50 %	444335884
19	NC_020196	AAT	2	6	698	703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335884
20	NC_020196	AT	3	6	752	757	50 %	50 %	0 %	0 %	444335884
21	NC_020196	TAA	2	6	769	774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335884
22	NC_020196	ATC	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335884
23	NC_020196	T	6	6	811	816	0 %	100 %	0 %	0 %	444335884
24	NC_020196	GAAG	2	8	834	841	50 %	0 %	50 %	0 %	444335884
25	NC_020196	T	8	8	854	861	0 %	100 %	0 %	0 %	444335884
26	NC_020196	ATC	2	6	884	889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335884
27	NC_020196	A	6	6	901	906	100 %	0 %	0 %	0 %	444335884
28	NC_020196	CATC	2	8	1047	1054	25 %	25 %	0 %	50 %	444335885
29	NC_020196	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	444335885
30	NC_020196	ATA	2	6	1119	1124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335885
31	NC_020196	GAG	2	6	1273	1278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	444335885
32	NC_020196	A	6	6	1325	1330	100 %	0 %	0 %	0 %	444335885
33	NC_020196	ATA	2	6	1350	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335885
34	NC_020196	GAATG	2	10	1377	1386	40 %	20 %	40 %	0 %	444335885
35	NC_020196	CTC	2	6	1413	1418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444335886
36	NC_020196	AAAATA	2	12	1432	1443	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	444335886
37	NC_020196	AT	3	6	1454	1459	50 %	50 %	0 %	0 %	444335886
38	NC_020196	TA	3	6	1461	1466	50 %	50 %	0 %	0 %	444335886
39	NC_020196	ATTTT	2	10	1477	1486	20 %	80 %	0 %	0 %	444335886
40	NC_020196	CATT	2	8	1504	1511	25 %	50 %	0 %	25 %	444335886
41	NC_020196	T	6	6	1538	1543	0 %	100 %	0 %	0 %	444335886
42	NC_020196	AAT	2	6	1548	1553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335886
43	NC_020196	T	10	10	1606	1615	0 %	100 %	0 %	0 %	444335886
44	NC_020196	ATCATA	2	12	1647	1658	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	444335886
45	NC_020196	ATA	2	6	1660	1665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335886
46	NC_020196	TCA	2	6	1697	1702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335886
47	NC_020196	AAT	2	6	1715	1720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335886
48	NC_020196	AACTA	2	10	1722	1731	60 %	20 %	0 %	20 %	444335886
49	NC_020196	CAA	2	6	1758	1763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444335886
50	NC_020196	AT	3	6	1789	1794	50 %	50 %	0 %	0 %	444335886
51	NC_020196	TTC	2	6	1798	1803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444335886
52	NC_020196	A	7	7	1806	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	444335886
53	NC_020196	ACA	2	6	1828	1833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444335886
54	NC_020196	ATA	2	6	1838	1843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335886
55	NC_020196	TTA	3	9	1893	1901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335887
56	NC_020196	TAT	2	6	1927	1932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335887
57	NC_020196	AACA	2	8	1954	1961	75 %	0 %	0 %	25 %	444335887
58	NC_020196	T	7	7	2001	2007	0 %	100 %	0 %	0 %	444335887
59	NC_020196	TTA	2	6	2022	2027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335887
60	NC_020196	TTG	2	6	2066	2071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	444335887
61	NC_020196	AT	3	6	2086	2091	50 %	50 %	0 %	0 %	444335887
62	NC_020196	TCA	2	6	2113	2118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335887
63	NC_020196	CA	4	8	2209	2216	50 %	0 %	0 %	50 %	444335887
64	NC_020196	TTCC	2	8	2234	2241	0 %	50 %	0 %	50 %	444335887
65	NC_020196	ATT	2	6	2249	2254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335887
66	NC_020196	T	6	6	2363	2368	0 %	100 %	0 %	0 %	444335888
67	NC_020196	T	7	7	2387	2393	0 %	100 %	0 %	0 %	444335888
68	NC_020196	GAA	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335888
69	NC_020196	A	7	7	2479	2485	100 %	0 %	0 %	0 %	444335888
70	NC_020196	TCTG	2	8	2486	2493	0 %	50 %	25 %	25 %	444335888
71	NC_020196	A	7	7	2566	2572	100 %	0 %	0 %	0 %	444335888
72	NC_020196	TC	3	6	2603	2608	0 %	50 %	0 %	50 %	444335888
73	NC_020196	CT	4	8	2626	2633	0 %	50 %	0 %	50 %	444335888
74	NC_020196	ATTC	2	8	2682	2689	25 %	50 %	0 %	25 %	444335888
75	NC_020196	TTC	2	6	2722	2727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444335888
76	NC_020196	TTTC	2	8	2733	2740	0 %	75 %	0 %	25 %	444335888
77	NC_020196	A	6	6	2817	2822	100 %	0 %	0 %	0 %	444335888
78	NC_020196	CTG	2	6	2827	2832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444335888
79	NC_020196	AAAG	2	8	2864	2871	75 %	0 %	25 %	0 %	444335888
80	NC_020196	AGA	2	6	2884	2889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	444335888
81	NC_020196	AAC	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	444335888
82	NC_020196	GCT	3	9	2909	2917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444335888
83	NC_020196	CTT	2	6	2933	2938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	444335888
84	NC_020196	TCC	2	6	2945	2950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	444335888
85	NC_020196	TTA	2	6	2951	2956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	444335888
86	NC_020196	CATC	2	8	2982	2989	25 %	25 %	0 %	50 %	444335888
87	NC_020196	CAT	2	6	3015	3020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335888
88	NC_020196	A	6	6	3026	3031	100 %	0 %	0 %	0 %	444335888
89	NC_020196	GCT	2	6	3077	3082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	444335888
90	NC_020196	CAT	2	6	3118	3123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335888
91	NC_020196	AAT	2	6	3168	3173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335888
92	NC_020196	TTCTGT	2	12	3181	3192	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	444335888
93	NC_020196	AT	3	6	3210	3215	50 %	50 %	0 %	0 %	444335888
94	NC_020196	ATTT	2	8	3280	3287	25 %	75 %	0 %	0 %	444335888
95	NC_020196	TTG	2	6	3310	3315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	444335888
96	NC_020196	CAT	2	6	3376	3381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	444335888
97	NC_020196	A	6	6	3447	3452	100 %	0 %	0 %	0 %	444335889
98	NC_020196	GC	5	10	3576	3585	0 %	0 %	50 %	50 %	444335889
99	NC_020196	TA	3	6	3609	3614	50 %	50 %	0 %	0 %	444335889
100	NC_020196	TAA	3	9	3623	3631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335889
101	NC_020196	TAA	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	444335889
102	NC_020196	AT	3	6	3650	3655	50 %	50 %	0 %	0 %	444335889
103	NC_020196	G	11	11	3690	3700	0 %	0 %	100 %	0 %	444335889

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.