MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Brachyspira pilosicoli P43/6/78 chromosome

Total Repeats: 64205

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019908	ATA	2	6	63	68	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806728
2	NC_019908	T	7	7	113	119	0 %	100 %	0 %	0 %	431806728
3	NC_019908	TGA	3	9	125	133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806728
4	NC_019908	TAT	2	6	146	151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806728
5	NC_019908	T	6	6	191	196	0 %	100 %	0 %	0 %	431806728
6	NC_019908	TGT	2	6	269	274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806728
7	NC_019908	TAA	3	9	275	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806728
8	NC_019908	GAA	3	9	285	293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806728
9	NC_019908	TGA	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806728
10	NC_019908	TGC	2	6	305	310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806728
11	NC_019908	AAC	2	6	323	328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431806728
12	NC_019908	ATA	5	15	334	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806728
13	NC_019908	AAT	2	6	408	413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806728
14	NC_019908	GCT	2	6	429	434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806728
15	NC_019908	AGTT	2	8	436	443	25 %	50 %	25 %	0 %	431806728
16	NC_019908	TA	4	8	477	484	50 %	50 %	0 %	0 %	431806728
17	NC_019908	ATT	3	9	532	540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806728
18	NC_019908	TA	3	6	570	575	50 %	50 %	0 %	0 %	431806728
19	NC_019908	AT	5	10	599	608	50 %	50 %	0 %	0 %	431806728
20	NC_019908	TGA	2	6	674	679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806728
21	NC_019908	A	6	6	818	823	100 %	0 %	0 %	0 %	431806728
22	NC_019908	GAAA	2	8	891	898	75 %	0 %	25 %	0 %	431806728
23	NC_019908	TGA	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806728
24	NC_019908	AGT	2	6	932	937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806728
25	NC_019908	AT	3	6	941	946	50 %	50 %	0 %	0 %	431806728
26	NC_019908	ACA	2	6	960	965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431806728
27	NC_019908	GA	3	6	1010	1015	50 %	0 %	50 %	0 %	431806728
28	NC_019908	TGA	2	6	1018	1023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806728
29	NC_019908	AT	3	6	1060	1065	50 %	50 %	0 %	0 %	431806728
30	NC_019908	ATT	2	6	1072	1077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806728
31	NC_019908	TAA	2	6	1082	1087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806728
32	NC_019908	A	6	6	1097	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	431806728
33	NC_019908	CTA	2	6	1105	1110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806728
34	NC_019908	ATT	2	6	1138	1143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806728
35	NC_019908	TAT	2	6	1289	1294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806728
36	NC_019908	GA	3	6	1301	1306	50 %	0 %	50 %	0 %	431806728
37	NC_019908	A	6	6	1306	1311	100 %	0 %	0 %	0 %	431806728
38	NC_019908	AGA	2	6	1316	1321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806728
39	NC_019908	ATA	2	6	1362	1367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806728
40	NC_019908	AAG	3	9	1856	1864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806729
41	NC_019908	AAG	2	6	1871	1876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806729
42	NC_019908	GCT	2	6	1885	1890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806729
43	NC_019908	GAA	3	9	1969	1977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806729
44	NC_019908	AAT	2	6	1993	1998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806729
45	NC_019908	A	6	6	2019	2024	100 %	0 %	0 %	0 %	431806729
46	NC_019908	AGA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806729
47	NC_019908	AT	3	6	2070	2075	50 %	50 %	0 %	0 %	431806729
48	NC_019908	AG	3	6	2141	2146	50 %	0 %	50 %	0 %	431806729
49	NC_019908	TAA	2	6	2148	2153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806729
50	NC_019908	TAT	3	9	2159	2167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806729
51	NC_019908	ATG	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806729
52	NC_019908	T	6	6	2286	2291	0 %	100 %	0 %	0 %	431806729
53	NC_019908	GTGA	2	8	2305	2312	25 %	25 %	50 %	0 %	431806729
54	NC_019908	AGGAG	2	10	2325	2334	40 %	0 %	60 %	0 %	431806729
55	NC_019908	ATG	2	6	2432	2437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806729
56	NC_019908	AAAG	2	8	2475	2482	75 %	0 %	25 %	0 %	431806729
57	NC_019908	AAAG	3	12	2564	2575	75 %	0 %	25 %	0 %	431806730
58	NC_019908	TAA	2	6	2588	2593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806730
59	NC_019908	AT	3	6	2696	2701	50 %	50 %	0 %	0 %	431806730
60	NC_019908	GAA	2	6	2717	2722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806730
61	NC_019908	ATT	2	6	2793	2798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806731
62	NC_019908	AAC	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431806731
63	NC_019908	GTA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806731
64	NC_019908	AACA	2	8	2864	2871	75 %	0 %	0 %	25 %	431806731
65	NC_019908	AAC	2	6	2885	2890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431806731
66	NC_019908	TAG	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806731
67	NC_019908	TAG	2	6	2929	2934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806731
68	NC_019908	TAAC	2	8	2959	2966	50 %	25 %	0 %	25 %	431806731
69	NC_019908	AGA	2	6	3026	3031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806731
70	NC_019908	CTC	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	431806731
71	NC_019908	AAAC	2	8	3144	3151	75 %	0 %	0 %	25 %	431806731
72	NC_019908	ATC	2	6	3189	3194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806731
73	NC_019908	GAA	2	6	3247	3252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806731
74	NC_019908	AAT	2	6	3275	3280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806731
75	NC_019908	GCT	3	9	3294	3302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806731
76	NC_019908	TATGG	2	10	3309	3318	20 %	40 %	40 %	0 %	431806731
77	NC_019908	AAAG	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	431806731
78	NC_019908	GCG	2	6	3358	3363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	431806731
79	NC_019908	AT	3	6	3373	3378	50 %	50 %	0 %	0 %	431806731
80	NC_019908	TGA	2	6	3446	3451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806731
81	NC_019908	AGA	2	6	3482	3487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806731
82	NC_019908	AAGA	2	8	3492	3499	75 %	0 %	25 %	0 %	431806731
83	NC_019908	GCT	2	6	3552	3557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806731
84	NC_019908	A	6	6	3567	3572	100 %	0 %	0 %	0 %	431806731
85	NC_019908	CAG	2	6	3619	3624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431806731
86	NC_019908	TAG	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806731
87	NC_019908	A	6	6	3700	3705	100 %	0 %	0 %	0 %	431806731
88	NC_019908	CTA	2	6	3748	3753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806731
89	NC_019908	TTG	2	6	3775	3780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806731
90	NC_019908	TGC	2	6	3881	3886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	431806731
91	NC_019908	TAT	2	6	3899	3904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806731
92	NC_019908	TTC	3	9	3925	3933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806731
93	NC_019908	TTAA	2	8	3990	3997	50 %	50 %	0 %	0 %	431806731
94	NC_019908	ACT	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	431806731
95	NC_019908	ACAA	2	8	4017	4024	75 %	0 %	0 %	25 %	431806731
96	NC_019908	A	6	6	4023	4028	100 %	0 %	0 %	0 %	431806731
97	NC_019908	CAG	3	9	4042	4050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431806731
98	NC_019908	CAAT	2	8	4052	4059	50 %	25 %	0 %	25 %	431806731
99	NC_019908	GAAA	2	8	4089	4096	75 %	0 %	25 %	0 %	431806731
100	NC_019908	ACA	2	6	4108	4113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	431806731
101	NC_019908	GATTT	2	10	4126	4135	20 %	60 %	20 %	0 %	431806731
102	NC_019908	ACC	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	431806731
103	NC_019908	CTT	2	6	4264	4269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	431806731
104	NC_019908	GAA	2	6	4287	4292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806731
105	NC_019908	GAA	2	6	4329	4334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806731
106	NC_019908	A	6	6	4344	4349	100 %	0 %	0 %	0 %	431806731
107	NC_019908	CAG	2	6	4480	4485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431806731
108	NC_019908	ACAG	2	8	4500	4507	50 %	0 %	25 %	25 %	431806731
109	NC_019908	A	6	6	4512	4517	100 %	0 %	0 %	0 %	431806731
110	NC_019908	GAT	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806731
111	NC_019908	AGC	2	6	4535	4540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431806731
112	NC_019908	ACAA	2	8	4567	4574	75 %	0 %	0 %	25 %	431806731
113	NC_019908	CAG	2	6	4608	4613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	431806731
114	NC_019908	GTT	2	6	4683	4688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	431806731
115	NC_019908	AATA	2	8	4695	4702	75 %	25 %	0 %	0 %	431806731
116	NC_019908	ATA	3	9	4700	4708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806731
117	NC_019908	AT	5	10	5074	5083	50 %	50 %	0 %	0 %	431806732
118	NC_019908	T	6	6	5109	5114	0 %	100 %	0 %	0 %	431806732
119	NC_019908	TGA	2	6	5141	5146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	431806732
120	NC_019908	TACT	2	8	5176	5183	25 %	50 %	0 %	25 %	431806732
121	NC_019908	TAAT	2	8	5218	5225	50 %	50 %	0 %	0 %	431806732
122	NC_019908	ATA	2	6	5293	5298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806732
123	NC_019908	A	7	7	5298	5304	100 %	0 %	0 %	0 %	431806732
124	NC_019908	ATA	2	6	5307	5312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806732
125	NC_019908	T	6	6	5339	5344	0 %	100 %	0 %	0 %	431806732
126	NC_019908	TAT	3	9	5355	5363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806732
127	NC_019908	AT	3	6	5362	5367	50 %	50 %	0 %	0 %	431806732
128	NC_019908	A	6	6	5369	5374	100 %	0 %	0 %	0 %	431806732
129	NC_019908	AAT	2	6	5423	5428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	431806732
130	NC_019908	T	6	6	5438	5443	0 %	100 %	0 %	0 %	431806732
131	NC_019908	TTTAA	2	10	5448	5457	40 %	60 %	0 %	0 %	431806732
132	NC_019908	GAA	2	6	5595	5600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	431806732
133	NC_019908	AAAT	2	8	5609	5616	75 %	25 %	0 %	0 %	431806732
134	NC_019908	T	6	6	5634	5639	0 %	100 %	0 %	0 %	431806732
135	NC_019908	TAAA	2	8	5653	5660	75 %	25 %	0 %	0 %	431806732
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137	NC_019908	ATT	2	6	5688	5693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	431806732
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