MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis str. BSP1 chromosome

Total Repeats: 70515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019896	GCA	2	6	252	257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756781
2	NC_019896	A	6	6	289	294	100 %	0 %	0 %	0 %	430756781
3	NC_019896	GTC	2	6	297	302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756781
4	NC_019896	CGC	2	6	320	325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430756781
5	NC_019896	TAT	2	6	339	344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756781
6	NC_019896	GAA	2	6	506	511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756780
7	NC_019896	TA	3	6	592	597	50 %	50 %	0 %	0 %	430756780
8	NC_019896	ATG	2	6	616	621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756780
9	NC_019896	A	7	7	648	654	100 %	0 %	0 %	0 %	430756780
10	NC_019896	AAGAGA	2	12	712	723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756780
11	NC_019896	CAT	2	6	743	748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430756780
12	NC_019896	A	7	7	792	798	100 %	0 %	0 %	0 %	430756780
13	NC_019896	GCA	2	6	803	808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756780
14	NC_019896	TA	3	6	829	834	50 %	50 %	0 %	0 %	430756780
15	NC_019896	TGT	2	6	1000	1005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756779
16	NC_019896	GTA	2	6	1122	1127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756779
17	NC_019896	TTA	2	6	1144	1149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756779
18	NC_019896	ATT	2	6	1191	1196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756779
19	NC_019896	TTA	2	6	1218	1223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756779
20	NC_019896	TGA	2	6	1234	1239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756779
21	NC_019896	AGC	2	6	1243	1248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756779
22	NC_019896	A	6	6	1324	1329	100 %	0 %	0 %	0 %	430756779
23	NC_019896	GCA	2	6	1331	1336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756779
24	NC_019896	CAG	2	6	1344	1349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756779
25	NC_019896	CTT	2	6	1481	1486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430756779
26	NC_019896	TTC	2	6	1522	1527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430756779
27	NC_019896	TGA	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756779
28	NC_019896	TGGC	2	8	1573	1580	0 %	25 %	50 %	25 %	430756779
29	NC_019896	GCA	2	6	1586	1591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756779
30	NC_019896	GAT	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756779
31	NC_019896	CGG	2	6	1660	1665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430756779
32	NC_019896	CTCTTT	2	12	1666	1677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430756779
33	NC_019896	A	8	8	1740	1747	100 %	0 %	0 %	0 %	430756779
34	NC_019896	GGA	2	6	1767	1772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430756779
35	NC_019896	CTG	2	6	1794	1799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756778
36	NC_019896	GCA	2	6	2075	2080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756778
37	NC_019896	TTG	2	6	2081	2086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756778
38	NC_019896	GAAAA	2	10	2200	2209	80 %	0 %	20 %	0 %	430756778
39	NC_019896	A	6	6	2261	2266	100 %	0 %	0 %	0 %	430756778
40	NC_019896	TCCA	2	8	2267	2274	25 %	25 %	0 %	50 %	430756778
41	NC_019896	GAAA	2	8	2297	2304	75 %	0 %	25 %	0 %	430756778
42	NC_019896	ATT	2	6	2306	2311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756778
43	NC_019896	ACC	2	6	2337	2342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430756778
44	NC_019896	AAC	2	6	2712	2717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430756777
45	NC_019896	GCGATT	2	12	2760	2771	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	430756777
46	NC_019896	AGAC	2	8	2885	2892	50 %	0 %	25 %	25 %	430756777
47	NC_019896	GA	3	6	3026	3031	50 %	0 %	50 %	0 %	430756777
48	NC_019896	ATG	3	9	3265	3273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756777
49	NC_019896	CCG	2	6	3313	3318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430756777
50	NC_019896	ATT	2	6	3393	3398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756777
51	NC_019896	GGCC	2	8	3399	3406	0 %	0 %	50 %	50 %	430756777
52	NC_019896	ATC	2	6	3419	3424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430756777
53	NC_019896	TCT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430756777
54	NC_019896	ACG	2	6	3480	3485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756777
55	NC_019896	CAG	2	6	3544	3549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756777
56	NC_019896	TTG	2	6	3571	3576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756777
57	NC_019896	GAA	2	6	3663	3668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756777
58	NC_019896	GTT	2	6	3786	3791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756777
59	NC_019896	GAA	2	6	3831	3836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756777
60	NC_019896	AC	3	6	3898	3903	50 %	0 %	0 %	50 %	430756777
61	NC_019896	AGCA	2	8	3922	3929	50 %	0 %	25 %	25 %	430756777
62	NC_019896	ATA	2	6	4094	4099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430756777
63	NC_019896	TGTGAT	2	12	4144	4155	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	430756776
64	NC_019896	CGG	2	6	4273	4278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430756776
65	NC_019896	GTC	2	6	4295	4300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756776
66	NC_019896	CGG	2	6	4318	4323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430756776
67	NC_019896	GAA	2	6	4332	4337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756776
68	NC_019896	TGCG	2	8	4404	4411	0 %	25 %	50 %	25 %	430756776
69	NC_019896	TGC	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756776
70	NC_019896	TTA	2	6	4533	4538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756776
71	NC_019896	GAC	2	6	4579	4584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756776
72	NC_019896	CAG	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756776
73	NC_019896	GGA	2	6	4681	4686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430756776
74	NC_019896	CGC	2	6	4722	4727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430756776
75	NC_019896	GATT	2	8	4747	4754	25 %	50 %	25 %	0 %	430756776
76	NC_019896	AT	3	6	4819	4824	50 %	50 %	0 %	0 %	430756776
77	NC_019896	ATT	2	6	4877	4882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756776
78	NC_019896	AGA	2	6	5068	5073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756776
79	NC_019896	ATG	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756776
80	NC_019896	ATG	2	6	5151	5156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756776
81	NC_019896	A	8	8	5194	5201	100 %	0 %	0 %	0 %	430756776
82	NC_019896	GAA	2	6	5249	5254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756776
83	NC_019896	AGA	2	6	5311	5316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756776
84	NC_019896	TGAT	2	8	5355	5362	25 %	50 %	25 %	0 %	430756776
85	NC_019896	TGC	2	6	5427	5432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756776
86	NC_019896	GATT	2	8	5484	5491	25 %	50 %	25 %	0 %	430756776
87	NC_019896	TGA	2	6	5494	5499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756776
88	NC_019896	GAA	2	6	5518	5523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756776
89	NC_019896	A	6	6	5522	5527	100 %	0 %	0 %	0 %	430756776
90	NC_019896	GCG	2	6	5528	5533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430756776
91	NC_019896	A	6	6	5546	5551	100 %	0 %	0 %	0 %	430756776
92	NC_019896	AT	3	6	5596	5601	50 %	50 %	0 %	0 %	430756776
93	NC_019896	TGA	2	6	5652	5657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430756776
94	NC_019896	GCC	2	6	5698	5703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430756776
95	NC_019896	AT	3	6	5764	5769	50 %	50 %	0 %	0 %	430756776
96	NC_019896	GAA	2	6	5800	5805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756776
97	NC_019896	A	7	7	5816	5822	100 %	0 %	0 %	0 %	430756776
98	NC_019896	CGG	2	6	5940	5945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430756776
99	NC_019896	GAA	2	6	6027	6032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756775
100	NC_019896	A	6	6	6127	6132	100 %	0 %	0 %	0 %	430756775
101	NC_019896	A	6	6	6156	6161	100 %	0 %	0 %	0 %	430756775
102	NC_019896	GCT	2	6	6198	6203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756775
103	NC_019896	GGAGCG	2	12	6246	6257	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	430756775
104	NC_019896	ACA	2	6	6378	6383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430756775
105	NC_019896	CGTG	2	8	6425	6432	0 %	25 %	50 %	25 %	430756775
106	NC_019896	TGAG	2	8	6481	6488	25 %	25 %	50 %	0 %	430756775
107	NC_019896	TTGC	2	8	6491	6498	0 %	50 %	25 %	25 %	430756775
108	NC_019896	GAA	2	6	6506	6511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756775
109	NC_019896	TTG	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756775
110	NC_019896	CAG	2	6	6544	6549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756775
111	NC_019896	AAG	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756775
112	NC_019896	A	6	6	6570	6575	100 %	0 %	0 %	0 %	430756775
113	NC_019896	ACG	2	6	6582	6587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430756775
114	NC_019896	GGA	2	6	6591	6596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430756775
115	NC_019896	GAA	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756775
116	NC_019896	A	6	6	6671	6676	100 %	0 %	0 %	0 %	430756775
117	NC_019896	AAG	2	6	6684	6689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756775
118	NC_019896	TAA	2	6	6713	6718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	430756775
119	NC_019896	CATT	2	8	6865	6872	25 %	50 %	0 %	25 %	430756774
120	NC_019896	TTC	2	6	6880	6885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430756774
121	NC_019896	AGA	2	6	6939	6944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756774
122	NC_019896	A	6	6	7013	7018	100 %	0 %	0 %	0 %	430756774
123	NC_019896	AC	3	6	7045	7050	50 %	0 %	0 %	50 %	430756774
124	NC_019896	ATT	2	6	7054	7059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756774
125	NC_019896	TTG	2	6	7067	7072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430756774
126	NC_019896	AGA	3	9	7083	7091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756774
127	NC_019896	ATT	2	6	7168	7173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756774
128	NC_019896	GAA	2	6	7231	7236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430756774
129	NC_019896	TCT	2	6	7240	7245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430756774
130	NC_019896	GCT	2	6	7272	7277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430756774
131	NC_019896	AGG	2	6	7298	7303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430756774
132	NC_019896	TTA	2	6	7357	7362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	430756774
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