MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 73099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40501	NC_019842	GATTT	2	10	2238529	2238538	20 %	60 %	20 %	0 %	429505653
40502	NC_019842	CTT	2	6	2238539	2238544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505653
40503	NC_019842	T	6	6	2238543	2238548	0 %	100 %	0 %	0 %	429505653
40504	NC_019842	CTG	2	6	2238549	2238554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505653
40505	NC_019842	TTC	2	6	2238577	2238582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505654
40506	NC_019842	CTT	2	6	2238657	2238662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505654
40507	NC_019842	GAG	2	6	2238766	2238771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429505654
40508	NC_019842	TTC	2	6	2238778	2238783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505654
40509	NC_019842	TCGG	2	8	2238887	2238894	0 %	25 %	50 %	25 %	429505654
40510	NC_019842	GC	3	6	2238985	2238990	0 %	0 %	50 %	50 %	429505654
40511	NC_019842	CAG	2	6	2239054	2239059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505654
40512	NC_019842	GCG	3	9	2239094	2239102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505654
40513	NC_019842	GCG	2	6	2239128	2239133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505654
40514	NC_019842	CAAA	2	8	2239134	2239141	75 %	0 %	0 %	25 %	429505654
40515	NC_019842	TTTCA	2	10	2239153	2239162	20 %	60 %	0 %	20 %	429505654
40516	NC_019842	TGC	2	6	2239164	2239169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505654
40517	NC_019842	GCA	2	6	2239283	2239288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505654
40518	NC_019842	CGC	2	6	2239300	2239305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505654
40519	NC_019842	GCCCGC	2	12	2239391	2239402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505654
40520	NC_019842	CTC	2	6	2239426	2239431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429505654
40521	NC_019842	CCG	2	6	2239469	2239474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505654
40522	NC_019842	TCA	3	9	2239500	2239508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505654
40523	NC_019842	TCT	2	6	2239585	2239590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505655
40524	NC_019842	TCT	2	6	2239611	2239616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505655
40525	NC_019842	TTC	2	6	2239661	2239666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505655
40526	NC_019842	CGCC	2	8	2239705	2239712	0 %	0 %	25 %	75 %	429505655
40527	NC_019842	CCG	2	6	2239803	2239808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505655
40528	NC_019842	CG	3	6	2239853	2239858	0 %	0 %	50 %	50 %	429505655
40529	NC_019842	GATG	2	8	2239918	2239925	25 %	25 %	50 %	0 %	429505655
40530	NC_019842	ACA	2	6	2239947	2239952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429505655
40531	NC_019842	GAT	2	6	2239955	2239960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505655
40532	NC_019842	GC	3	6	2240045	2240050	0 %	0 %	50 %	50 %	429505655
40533	NC_019842	CGA	2	6	2240056	2240061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505655
40534	NC_019842	CTTTTT	2	12	2240077	2240088	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	429505655
40535	NC_019842	TCAT	2	8	2240091	2240098	25 %	50 %	0 %	25 %	429505655
40536	NC_019842	T	6	6	2240105	2240110	0 %	100 %	0 %	0 %	429505655
40537	NC_019842	CTT	2	6	2240125	2240130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505655
40538	NC_019842	CTT	2	6	2240142	2240147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505655
40539	NC_019842	AATG	2	8	2240298	2240305	50 %	25 %	25 %	0 %	429505655
40540	NC_019842	TA	3	6	2240366	2240371	50 %	50 %	0 %	0 %	429505655
40541	NC_019842	CTT	2	6	2240404	2240409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505655
40542	NC_019842	A	7	7	2240464	2240470	100 %	0 %	0 %	0 %	429505655
40543	NC_019842	TCC	2	6	2240559	2240564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429505655
40544	NC_019842	TGAA	2	8	2240592	2240599	50 %	25 %	25 %	0 %	429505655
40545	NC_019842	GTTTC	2	10	2240608	2240617	0 %	60 %	20 %	20 %	429505655
40546	NC_019842	GAT	2	6	2240630	2240635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505655
40547	NC_019842	GCAT	2	8	2240653	2240660	25 %	25 %	25 %	25 %	429505655
40548	NC_019842	TCAA	2	8	2240703	2240710	50 %	25 %	0 %	25 %	429505655
40549	NC_019842	ACCG	2	8	2240735	2240742	25 %	0 %	25 %	50 %	429505655
40550	NC_019842	TCAT	2	8	2240793	2240800	25 %	50 %	0 %	25 %	429505655
40551	NC_019842	CT	3	6	2240880	2240885	0 %	50 %	0 %	50 %	429505655
40552	NC_019842	GAC	2	6	2240937	2240942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505655
40553	NC_019842	GT	3	6	2241050	2241055	0 %	50 %	50 %	0 %	429505655
40554	NC_019842	T	6	6	2241337	2241342	0 %	100 %	0 %	0 %	429505656
40555	NC_019842	TCA	2	6	2241428	2241433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505656
40556	NC_019842	TGCA	2	8	2241478	2241485	25 %	25 %	25 %	25 %	429505656
40557	NC_019842	GGC	2	6	2241515	2241520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505656
40558	NC_019842	T	6	6	2241617	2241622	0 %	100 %	0 %	0 %	429505656
40559	NC_019842	AGC	2	6	2241625	2241630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505656
40560	NC_019842	T	6	6	2241638	2241643	0 %	100 %	0 %	0 %	429505656
40561	NC_019842	GTT	2	6	2241676	2241681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429505656
40562	NC_019842	ATC	2	6	2241700	2241705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505656
40563	NC_019842	TCC	2	6	2241714	2241719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429505657
40564	NC_019842	CG	3	6	2241820	2241825	0 %	0 %	50 %	50 %	429505657
40565	NC_019842	T	7	7	2241826	2241832	0 %	100 %	0 %	0 %	429505657
40566	NC_019842	TCAT	2	8	2241834	2241841	25 %	50 %	0 %	25 %	429505657
40567	NC_019842	GA	3	6	2241852	2241857	50 %	0 %	50 %	0 %	429505657
40568	NC_019842	TG	3	6	2241915	2241920	0 %	50 %	50 %	0 %	429505657
40569	NC_019842	TCAC	2	8	2241957	2241964	25 %	25 %	0 %	50 %	429505657
40570	NC_019842	TCCG	2	8	2242012	2242019	0 %	25 %	25 %	50 %	429505657
40571	NC_019842	CACG	2	8	2242102	2242109	25 %	0 %	25 %	50 %	429505657
40572	NC_019842	TTGA	2	8	2242119	2242126	25 %	50 %	25 %	0 %	429505657
40573	NC_019842	TCATT	2	10	2242141	2242150	20 %	60 %	0 %	20 %	429505657
40574	NC_019842	A	6	6	2242203	2242208	100 %	0 %	0 %	0 %	429505657
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40577	NC_019842	TGC	2	6	2242442	2242447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505657
40578	NC_019842	CGC	2	6	2242474	2242479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505657
40579	NC_019842	GAG	2	6	2242500	2242505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429505657
40580	NC_019842	CTT	2	6	2242567	2242572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505657
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40582	NC_019842	TCA	2	6	2242632	2242637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505657
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40584	NC_019842	GGA	2	6	2242760	2242765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429505657
40585	NC_019842	TCA	2	6	2242789	2242794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505657
40586	NC_019842	T	6	6	2242810	2242815	0 %	100 %	0 %	0 %	429505658
40587	NC_019842	ACG	2	6	2242871	2242876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505658
40588	NC_019842	CTG	2	6	2242899	2242904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505658
40589	NC_019842	TGC	2	6	2242921	2242926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505658
40590	NC_019842	CGC	2	6	2243034	2243039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505658
40591	NC_019842	GAC	2	6	2243041	2243046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505658
40592	NC_019842	CGT	2	6	2243059	2243064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505658
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40601	NC_019842	CAT	2	6	2243356	2243361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505658
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40604	NC_019842	CG	3	6	2243558	2243563	0 %	0 %	50 %	50 %	429505658
40605	NC_019842	CGGTCT	2	12	2243635	2243646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505658
40606	NC_019842	TTTCA	2	10	2243659	2243668	20 %	60 %	0 %	20 %	429505658
40607	NC_019842	TCT	4	12	2243672	2243683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505658
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40612	NC_019842	GTC	2	6	2243918	2243923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505658
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40616	NC_019842	A	7	7	2244050	2244056	100 %	0 %	0 %	0 %	429505659
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40618	NC_019842	ATAA	2	8	2244189	2244196	75 %	25 %	0 %	0 %	429505659
40619	NC_019842	GATCA	2	10	2244213	2244222	40 %	20 %	20 %	20 %	429505659
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