MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 73099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_019842	ATG	2	6	2212830	2212835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505626
40003	NC_019842	ATC	2	6	2212847	2212852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505626
40004	NC_019842	CCA	2	6	2212939	2212944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429505626
40005	NC_019842	T	7	7	2212972	2212978	0 %	100 %	0 %	0 %	429505626
40006	NC_019842	T	6	6	2213046	2213051	0 %	100 %	0 %	0 %	429505626
40007	NC_019842	CTT	2	6	2213083	2213088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505626
40008	NC_019842	TCA	2	6	2213091	2213096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505626
40009	NC_019842	CAG	2	6	2213105	2213110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505626
40010	NC_019842	CTG	2	6	2213112	2213117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505626
40011	NC_019842	A	6	6	2213172	2213177	100 %	0 %	0 %	0 %	429505626
40012	NC_019842	CCGCT	2	10	2213179	2213188	0 %	20 %	20 %	60 %	429505626
40013	NC_019842	AGC	2	6	2213244	2213249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505626
40014	NC_019842	CCGCT	2	10	2213270	2213279	0 %	20 %	20 %	60 %	429505626
40015	NC_019842	CCGT	2	8	2213280	2213287	0 %	25 %	25 %	50 %	429505626
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40019	NC_019842	TG	3	6	2213540	2213545	0 %	50 %	50 %	0 %	429505626
40020	NC_019842	CT	3	6	2213563	2213568	0 %	50 %	0 %	50 %	429505626
40021	NC_019842	ATG	2	6	2213600	2213605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505626
40022	NC_019842	TCA	2	6	2213610	2213615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505626
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40024	NC_019842	GCAG	2	8	2213634	2213641	25 %	0 %	50 %	25 %	429505626
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40027	NC_019842	A	7	7	2213765	2213771	100 %	0 %	0 %	0 %	429505626
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40033	NC_019842	AGAGT	2	10	2214048	2214057	40 %	20 %	40 %	0 %	429505626
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40051	NC_019842	GCT	2	6	2215273	2215278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505627
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40057	NC_019842	CAT	2	6	2215479	2215484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505627
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40103	NC_019842	GATCCC	2	12	2217779	2217790	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	429505630
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40115	NC_019842	AAAT	2	8	2218379	2218386	75 %	25 %	0 %	0 %	429505631
40116	NC_019842	ATG	2	6	2218415	2218420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505631
40117	NC_019842	CTT	2	6	2218475	2218480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505631
40118	NC_019842	TTC	2	6	2218494	2218499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505631
40119	NC_019842	CG	3	6	2218515	2218520	0 %	0 %	50 %	50 %	429505631
40120	NC_019842	ATCAG	2	10	2218537	2218546	40 %	20 %	20 %	20 %	429505631
40121	NC_019842	GCT	2	6	2218586	2218591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505631
40122	NC_019842	TCA	2	6	2218624	2218629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505631
40123	NC_019842	CCCG	2	8	2218684	2218691	0 %	0 %	25 %	75 %	429505631
40124	NC_019842	CGCTTC	2	12	2218698	2218709	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	429505631
40125	NC_019842	T	7	7	2218746	2218752	0 %	100 %	0 %	0 %	429505631
40126	NC_019842	GCC	2	6	2218831	2218836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505631
40127	NC_019842	TTC	2	6	2218842	2218847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505631
40128	NC_019842	AGA	2	6	2218860	2218865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505631
40129	NC_019842	GCTT	2	8	2218878	2218885	0 %	50 %	25 %	25 %	429505631
40130	NC_019842	TGC	2	6	2218894	2218899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505631
40131	NC_019842	CT	3	6	2219058	2219063	0 %	50 %	0 %	50 %	429505631
40132	NC_019842	TCA	2	6	2219114	2219119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505631
40133	NC_019842	AGC	2	6	2219212	2219217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505631
40134	NC_019842	CATCGC	2	12	2219232	2219243	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	429505631
40135	NC_019842	TC	3	6	2219257	2219262	0 %	50 %	0 %	50 %	429505631
40136	NC_019842	TCT	2	6	2219272	2219277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505631
40137	NC_019842	AAG	2	6	2219282	2219287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505631
40138	NC_019842	GTG	2	6	2219347	2219352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429505631
40139	NC_019842	TCA	2	6	2219543	2219548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505631
40140	NC_019842	TGA	2	6	2219551	2219556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505631
40141	NC_019842	ACTG	2	8	2219634	2219641	25 %	25 %	25 %	25 %	429505632
40142	NC_019842	GAA	2	6	2219654	2219659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505632
40143	NC_019842	CCA	2	6	2219670	2219675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429505632
40144	NC_019842	TCT	2	6	2219717	2219722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505632
40145	NC_019842	GCC	2	6	2219747	2219752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505632
40146	NC_019842	CCA	2	6	2219769	2219774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429505632
40147	NC_019842	CCG	2	6	2219813	2219818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505632
40148	NC_019842	GCACG	2	10	2219833	2219842	20 %	0 %	40 %	40 %	429505632
40149	NC_019842	CTTT	2	8	2219879	2219886	0 %	75 %	0 %	25 %	429505632
40150	NC_019842	CAGA	2	8	2219889	2219896	50 %	0 %	25 %	25 %	429505632
40151	NC_019842	GAG	2	6	2219950	2219955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429505632
40152	NC_019842	GAC	2	6	2220124	2220129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505632
40153	NC_019842	CT	3	6	2220167	2220172	0 %	50 %	0 %	50 %	429505632
40154	NC_019842	TCA	2	6	2220197	2220202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505632
40155	NC_019842	T	7	7	2220225	2220231	0 %	100 %	0 %	0 %	429505632
40156	NC_019842	CCG	2	6	2220279	2220284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505632
40157	NC_019842	CGT	2	6	2220373	2220378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505632
40158	NC_019842	ATG	2	6	2220458	2220463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505632
40159	NC_019842	CG	3	6	2220476	2220481	0 %	0 %	50 %	50 %	429505632
40160	NC_019842	GAT	2	6	2220579	2220584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505632
40161	NC_019842	TGATG	2	10	2220610	2220619	20 %	40 %	40 %	0 %	429505632
40162	NC_019842	AGC	2	6	2220647	2220652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505632
40163	NC_019842	AAT	2	6	2220670	2220675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429505632
40164	NC_019842	CAT	3	9	2220746	2220754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505633
40165	NC_019842	AAG	2	6	2220778	2220783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505633
40166	NC_019842	CTT	2	6	2220806	2220811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505633
40167	NC_019842	CCA	2	6	2220836	2220841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429505633
40168	NC_019842	GT	3	6	2220866	2220871	0 %	50 %	50 %	0 %	429505633
40169	NC_019842	ACTG	2	8	2220874	2220881	25 %	25 %	25 %	25 %	429505633
40170	NC_019842	CTTT	2	8	2220919	2220926	0 %	75 %	0 %	25 %	429505633
40171	NC_019842	T	6	6	2220924	2220929	0 %	100 %	0 %	0 %	429505633
40172	NC_019842	ATA	2	6	2220990	2220995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429505633
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40175	NC_019842	GCC	2	6	2221084	2221089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505633
40176	NC_019842	CGGC	2	8	2221143	2221150	0 %	0 %	50 %	50 %	429505633
40177	NC_019842	TGA	2	6	2221157	2221162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505633
40178	NC_019842	CGG	2	6	2221174	2221179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505633
40179	NC_019842	TC	3	6	2221230	2221235	0 %	50 %	0 %	50 %	429505633
40180	NC_019842	GCC	2	6	2221255	2221260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505633
40181	NC_019842	CTT	3	9	2221268	2221276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505633
40182	NC_019842	CCGTT	2	10	2221289	2221298	0 %	40 %	20 %	40 %	429505633
40183	NC_019842	GAT	2	6	2221300	2221305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505633
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40186	NC_019842	CTC	2	6	2221446	2221451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429505634
40187	NC_019842	CCG	2	6	2221481	2221486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505634
40188	NC_019842	CA	3	6	2221551	2221556	50 %	0 %	0 %	50 %	429505634
40189	NC_019842	CAAT	2	8	2221644	2221651	50 %	25 %	0 %	25 %	429505634
40190	NC_019842	CCG	2	6	2221670	2221675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505634
40191	NC_019842	ATG	2	6	2221759	2221764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505634
40192	NC_019842	T	8	8	2221811	2221818	0 %	100 %	0 %	0 %	429505634
40193	NC_019842	ATA	2	6	2221876	2221881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429505635
40194	NC_019842	TCA	2	6	2221913	2221918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505635
40195	NC_019842	TGG	2	6	2222020	2222025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429505635
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40197	NC_019842	TCA	2	6	2222107	2222112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505635
40198	NC_019842	CTG	2	6	2222121	2222126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505635
40199	NC_019842	ATG	2	6	2222202	2222207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505635
40200	NC_019842	GGC	2	6	2222241	2222246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505635
40201	NC_019842	TCA	3	9	2222261	2222269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505635
40202	NC_019842	GAT	2	6	2222298	2222303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505635
40203	NC_019842	TTC	2	6	2222319	2222324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505635
40204	NC_019842	T	6	6	2222418	2222423	0 %	100 %	0 %	0 %	429505635
40205	NC_019842	GTAT	2	8	2222550	2222557	25 %	50 %	25 %	0 %	429505635
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40211	NC_019842	CGT	2	6	2222846	2222851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505636
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40214	NC_019842	TTC	2	6	2222906	2222911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505636
40215	NC_019842	CAT	2	6	2222924	2222929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505636
40216	NC_019842	CTT	2	6	2222950	2222955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505636
40217	NC_019842	AT	3	6	2222967	2222972	50 %	50 %	0 %	0 %	429505636
40218	NC_019842	TCAC	2	8	2223009	2223016	25 %	25 %	0 %	50 %	429505636
40219	NC_019842	T	6	6	2223214	2223219	0 %	100 %	0 %	0 %	429505637
40220	NC_019842	GCT	2	6	2223284	2223289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505637
40221	NC_019842	TC	3	6	2223412	2223417	0 %	50 %	0 %	50 %	429505637
40222	NC_019842	GCC	2	6	2223486	2223491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505637
40223	NC_019842	ATT	2	6	2223528	2223533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429505637
40224	NC_019842	CGG	2	6	2223542	2223547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505637
40225	NC_019842	ACG	2	6	2223549	2223554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505637
40226	NC_019842	ATC	2	6	2223567	2223572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505637
40227	NC_019842	CAA	2	6	2223584	2223589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429505637
40228	NC_019842	CTTT	2	8	2223648	2223655	0 %	75 %	0 %	25 %	429505637
40229	NC_019842	TCTT	2	8	2223665	2223672	0 %	75 %	0 %	25 %	429505637
40230	NC_019842	GGC	2	6	2223741	2223746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505637
40231	NC_019842	ATT	2	6	2223768	2223773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429505637
40232	NC_019842	A	6	6	2223799	2223804	100 %	0 %	0 %	0 %	429505637
40233	NC_019842	GCG	2	6	2223823	2223828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505637
40234	NC_019842	AGA	2	6	2223863	2223868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505637
40235	NC_019842	CGT	2	6	2223887	2223892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505637
40236	NC_019842	TCA	2	6	2223925	2223930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505637
40237	NC_019842	TTG	2	6	2223952	2223957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429505637
40238	NC_019842	ATG	2	6	2223973	2223978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505637
40239	NC_019842	TGA	2	6	2224001	2224006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505637
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40242	NC_019842	CGG	2	6	2224104	2224109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505638
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40264	NC_019842	T	7	7	2225297	2225303	0 %	100 %	0 %	0 %	429505639
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40321	NC_019842	ATA	2	6	2228088	2228093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429505642
40322	NC_019842	ACA	2	6	2228114	2228119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429505642
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40335	NC_019842	GTAT	2	8	2229035	2229042	25 %	50 %	25 %	0 %	429505644
40336	NC_019842	TCA	2	6	2229116	2229121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505644
40337	NC_019842	AATA	2	8	2229190	2229197	75 %	25 %	0 %	0 %	429505644
40338	NC_019842	CCT	2	6	2229277	2229282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429505644
40339	NC_019842	GGCATC	2	12	2229345	2229356	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429505644
40340	NC_019842	TCG	2	6	2229496	2229501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505645
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40342	NC_019842	T	6	6	2229554	2229559	0 %	100 %	0 %	0 %	429505645
40343	NC_019842	ATAA	2	8	2229673	2229680	75 %	25 %	0 %	0 %	429505645
40344	NC_019842	CTG	2	6	2229684	2229689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505645
40345	NC_019842	TTTA	2	8	2229690	2229697	25 %	75 %	0 %	0 %	429505645
40346	NC_019842	TCA	2	6	2229769	2229774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505645
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40348	NC_019842	T	7	7	2229937	2229943	0 %	100 %	0 %	0 %	429505645
40349	NC_019842	TTC	2	6	2230078	2230083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505646
40350	NC_019842	TCCA	2	8	2230099	2230106	25 %	25 %	0 %	50 %	429505646
40351	NC_019842	CTT	2	6	2230137	2230142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505646
40352	NC_019842	AAG	2	6	2230163	2230168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505646
40353	NC_019842	ATC	2	6	2230195	2230200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505646
40354	NC_019842	T	7	7	2230230	2230236	0 %	100 %	0 %	0 %	429505646
40355	NC_019842	TCT	3	9	2230298	2230306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505646
40356	NC_019842	AAT	2	6	2230336	2230341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429505646
40357	NC_019842	TCT	2	6	2230355	2230360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505646
40358	NC_019842	GAA	2	6	2230428	2230433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505646
40359	NC_019842	CGC	2	6	2230477	2230482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505646
40360	NC_019842	GTAA	2	8	2230513	2230520	50 %	25 %	25 %	0 %	429505646
40361	NC_019842	CTT	2	6	2230524	2230529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505646
40362	NC_019842	AGGA	2	8	2230605	2230612	50 %	0 %	50 %	0 %	429505646
40363	NC_019842	GCT	2	6	2230635	2230640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505646
40364	NC_019842	GCC	2	6	2230718	2230723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505646
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40368	NC_019842	CGC	2	6	2230803	2230808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505646
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40380	NC_019842	T	7	7	2231803	2231809	0 %	100 %	0 %	0 %	429505647
40381	NC_019842	ACG	2	6	2231874	2231879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505647
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40383	NC_019842	CCG	2	6	2232006	2232011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505647
40384	NC_019842	ATCA	2	8	2232122	2232129	50 %	25 %	0 %	25 %	429505647
40385	NC_019842	CGTG	2	8	2232134	2232141	0 %	25 %	50 %	25 %	429505647
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40392	NC_019842	TCC	2	6	2232491	2232496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429505647
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40443	NC_019842	GC	3	6	2235308	2235313	0 %	0 %	50 %	50 %	429505650
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40452	NC_019842	TAA	2	6	2235941	2235946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429505650
40453	NC_019842	ATAA	2	8	2235952	2235959	75 %	25 %	0 %	0 %	429505650
40454	NC_019842	TCA	2	6	2236014	2236019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505651
40455	NC_019842	GAA	2	6	2236137	2236142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505651
40456	NC_019842	GCG	2	6	2236380	2236385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505651
40457	NC_019842	CGC	2	6	2236402	2236407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505651
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40460	NC_019842	GAT	2	6	2236549	2236554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505651
40461	NC_019842	ATACGG	2	12	2236576	2236587	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429505651
40462	NC_019842	TCG	2	6	2236662	2236667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505651
40463	NC_019842	CAC	2	6	2236702	2236707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429505651
40464	NC_019842	GC	3	6	2236750	2236755	0 %	0 %	50 %	50 %	429505651
40465	NC_019842	TCT	2	6	2236760	2236765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505651
40466	NC_019842	GAT	2	6	2236852	2236857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505651
40467	NC_019842	GTT	2	6	2236903	2236908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429505651
40468	NC_019842	TCT	2	6	2236937	2236942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505651
40469	NC_019842	AGAT	2	8	2236949	2236956	50 %	25 %	25 %	0 %	429505651
40470	NC_019842	CGGT	2	8	2237004	2237011	0 %	25 %	50 %	25 %	429505651
40471	NC_019842	GCC	2	6	2237134	2237139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505651
40472	NC_019842	TGGATA	2	12	2237167	2237178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505651
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40482	NC_019842	TGTC	2	8	2237653	2237660	0 %	50 %	25 %	25 %	429505652
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40492	NC_019842	TCC	2	6	2238220	2238225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429505653
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40495	NC_019842	A	7	7	2238315	2238321	100 %	0 %	0 %	0 %	429505653
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40497	NC_019842	AATC	2	8	2238405	2238412	50 %	25 %	0 %	25 %	429505653
40498	NC_019842	T	6	6	2238429	2238434	0 %	100 %	0 %	0 %	429505653
40499	NC_019842	T	6	6	2238480	2238485	0 %	100 %	0 %	0 %	429505653
40500	NC_019842	GCA	2	6	2238518	2238523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505653

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