MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 73099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_019842	TGC	2	6	1990369	1990374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505408
36003	NC_019842	TTC	2	6	1990391	1990396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505408
36004	NC_019842	GCT	2	6	1990401	1990406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505408
36005	NC_019842	CCGC	2	8	1990425	1990432	0 %	0 %	25 %	75 %	429505408
36006	NC_019842	TTC	2	6	1990442	1990447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505408
36007	NC_019842	AGC	2	6	1990464	1990469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505408
36008	NC_019842	T	7	7	1990483	1990489	0 %	100 %	0 %	0 %	429505408
36009	NC_019842	GAT	2	6	1990512	1990517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505408
36010	NC_019842	CTG	2	6	1990586	1990591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505408
36011	NC_019842	CTT	2	6	1990833	1990838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505409
36012	NC_019842	GCT	2	6	1990911	1990916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505409
36013	NC_019842	TAA	2	6	1990943	1990948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429505409
36014	NC_019842	T	7	7	1990953	1990959	0 %	100 %	0 %	0 %	429505409
36015	NC_019842	TTC	2	6	1991006	1991011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505409
36016	NC_019842	T	7	7	1991032	1991038	0 %	100 %	0 %	0 %	429505409
36017	NC_019842	T	6	6	1991111	1991116	0 %	100 %	0 %	0 %	429505409
36018	NC_019842	ATGC	2	8	1991155	1991162	25 %	25 %	25 %	25 %	429505409
36019	NC_019842	GTT	3	9	1991242	1991250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429505409
36020	NC_019842	CTGC	2	8	1991262	1991269	0 %	25 %	25 %	50 %	429505409
36021	NC_019842	AT	3	6	1991273	1991278	50 %	50 %	0 %	0 %	429505409
36022	NC_019842	CTT	2	6	1991301	1991306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505409
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36026	NC_019842	ATC	2	6	1991428	1991433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505409
36027	NC_019842	TGGTT	2	10	1991544	1991553	0 %	60 %	40 %	0 %	429505409
36028	NC_019842	TCA	2	6	1991594	1991599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505409
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36032	NC_019842	GAT	2	6	1991832	1991837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505409
36033	NC_019842	TG	3	6	1991860	1991865	0 %	50 %	50 %	0 %	429505409
36034	NC_019842	A	6	6	1991936	1991941	100 %	0 %	0 %	0 %	429505409
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36037	NC_019842	TC	4	8	1992185	1992192	0 %	50 %	0 %	50 %	429505409
36038	NC_019842	GCTT	2	8	1992205	1992212	0 %	50 %	25 %	25 %	429505409
36039	NC_019842	GGCG	2	8	1992568	1992575	0 %	0 %	75 %	25 %	429505410
36040	NC_019842	GGT	2	6	1992642	1992647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429505410
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36050	NC_019842	TAT	2	6	1993068	1993073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429505411
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36054	NC_019842	TGC	2	6	1993346	1993351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505411
36055	NC_019842	CATT	2	8	1993578	1993585	25 %	50 %	0 %	25 %	429505411
36056	NC_019842	CAAAC	2	10	1993606	1993615	60 %	0 %	0 %	40 %	429505411
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36060	NC_019842	GCA	2	6	1993896	1993901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505412
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36063	NC_019842	GC	3	6	1993940	1993945	0 %	0 %	50 %	50 %	429505412
36064	NC_019842	T	6	6	1993962	1993967	0 %	100 %	0 %	0 %	429505412
36065	NC_019842	ATG	2	6	1994195	1994200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505413
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36117	NC_019842	TGA	2	6	1996752	1996757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505413
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36235	NC_019842	ATG	2	6	2003717	2003722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505414
36236	NC_019842	GAT	2	6	2003830	2003835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505414
36237	NC_019842	AG	4	8	2003912	2003919	50 %	0 %	50 %	0 %	429505414
36238	NC_019842	GTTCTG	2	12	2003952	2003963	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	429505414
36239	NC_019842	CGC	2	6	2003979	2003984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505414
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36241	NC_019842	TCA	2	6	2004203	2004208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505414
36242	NC_019842	T	6	6	2004234	2004239	0 %	100 %	0 %	0 %	429505414
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36245	NC_019842	TGA	2	6	2004272	2004277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505414
36246	NC_019842	CTT	3	9	2004327	2004335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505414
36247	NC_019842	A	6	6	2004406	2004411	100 %	0 %	0 %	0 %	429505414
36248	NC_019842	CTG	2	6	2004577	2004582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505414
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36252	NC_019842	CGA	2	6	2004840	2004845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505414
36253	NC_019842	AC	3	6	2004888	2004893	50 %	0 %	0 %	50 %	429505414
36254	NC_019842	AGC	2	6	2004896	2004901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505414
36255	NC_019842	TTTC	2	8	2004924	2004931	0 %	75 %	0 %	25 %	429505414
36256	NC_019842	TGA	2	6	2004966	2004971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505414
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36264	NC_019842	TCA	2	6	2005370	2005375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505414
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36351	NC_019842	TTC	3	9	2009615	2009623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505415
36352	NC_019842	TGC	2	6	2009635	2009640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505415
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36460	NC_019842	TGC	2	6	2015269	2015274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505415
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36467	NC_019842	T	6	6	2015563	2015568	0 %	100 %	0 %	0 %	429505415
36468	NC_019842	CGGC	2	8	2015588	2015595	0 %	0 %	50 %	50 %	429505415
36469	NC_019842	TCA	2	6	2015622	2015627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505415
36470	NC_019842	GCA	2	6	2015644	2015649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505415
36471	NC_019842	TTC	2	6	2015709	2015714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505415
36472	NC_019842	T	6	6	2015783	2015788	0 %	100 %	0 %	0 %	429505415
36473	NC_019842	A	6	6	2015833	2015838	100 %	0 %	0 %	0 %	429505415
36474	NC_019842	CTT	2	6	2015845	2015850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505415
36475	NC_019842	GA	3	6	2015906	2015911	50 %	0 %	50 %	0 %	429505415
36476	NC_019842	GCC	2	6	2015917	2015922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505415
36477	NC_019842	GA	3	6	2015930	2015935	50 %	0 %	50 %	0 %	429505415
36478	NC_019842	ATC	2	6	2015943	2015948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505415
36479	NC_019842	ATG	3	9	2015996	2016004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505415
36480	NC_019842	T	6	6	2016035	2016040	0 %	100 %	0 %	0 %	429505415
36481	NC_019842	CTTTAT	2	12	2016085	2016096	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	429505415
36482	NC_019842	CTT	2	6	2016097	2016102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505415
36483	NC_019842	TCGG	2	8	2016110	2016117	0 %	25 %	50 %	25 %	429505415
36484	NC_019842	ATCGT	2	10	2016245	2016254	20 %	40 %	20 %	20 %	429505415
36485	NC_019842	T	6	6	2016274	2016279	0 %	100 %	0 %	0 %	429505415
36486	NC_019842	CCT	2	6	2016376	2016381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429505415
36487	NC_019842	AT	4	8	2016398	2016405	50 %	50 %	0 %	0 %	429505415
36488	NC_019842	TGC	2	6	2016420	2016425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505415
36489	NC_019842	TTG	2	6	2016453	2016458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429505416
36490	NC_019842	CTC	2	6	2016497	2016502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429505416
36491	NC_019842	GCG	2	6	2016516	2016521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505416
36492	NC_019842	CTC	2	6	2016533	2016538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429505416
36493	NC_019842	GAT	2	6	2016557	2016562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505416
36494	NC_019842	CATG	2	8	2016640	2016647	25 %	25 %	25 %	25 %	429505416
36495	NC_019842	CGA	2	6	2016659	2016664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505416
36496	NC_019842	GT	3	6	2016685	2016690	0 %	50 %	50 %	0 %	429505416
36497	NC_019842	TA	3	6	2016839	2016844	50 %	50 %	0 %	0 %	429505416
36498	NC_019842	GCG	2	6	2016881	2016886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505416
36499	NC_019842	CAT	2	6	2016887	2016892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505416
36500	NC_019842	TCA	2	6	2016933	2016938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505416

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