MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 73099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_019842	AAG	2	6	1820287	1820292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505272
33003	NC_019842	CGGA	2	8	1820320	1820327	25 %	0 %	50 %	25 %	429505272
33004	NC_019842	CGG	2	6	1820435	1820440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505272
33005	NC_019842	GAC	2	6	1820456	1820461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505272
33006	NC_019842	GTC	2	6	1820487	1820492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505272
33007	NC_019842	TA	3	6	1820538	1820543	50 %	50 %	0 %	0 %	429505272
33008	NC_019842	CGGAAC	2	12	1820552	1820563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505272
33009	NC_019842	A	6	6	1820623	1820628	100 %	0 %	0 %	0 %	429505272
33010	NC_019842	CCG	2	6	1820638	1820643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505272
33011	NC_019842	TCA	2	6	1820782	1820787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505272
33012	NC_019842	A	6	6	1820833	1820838	100 %	0 %	0 %	0 %	429505272
33013	NC_019842	ATC	2	6	1820872	1820877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505272
33014	NC_019842	CGG	2	6	1820912	1820917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505272
33015	NC_019842	GTC	2	6	1820931	1820936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505272
33016	NC_019842	GAA	2	6	1820940	1820945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505272
33017	NC_019842	GAAG	2	8	1820954	1820961	50 %	0 %	50 %	0 %	429505272
33018	NC_019842	CA	3	6	1820981	1820986	50 %	0 %	0 %	50 %	429505272
33019	NC_019842	AGA	3	9	1821014	1821022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505272
33020	NC_019842	GCA	2	6	1821041	1821046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505272
33021	NC_019842	CTT	2	6	1821058	1821063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505272
33022	NC_019842	CAG	2	6	1821102	1821107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505272
33023	NC_019842	GAA	2	6	1821123	1821128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505272
33024	NC_019842	ATC	2	6	1821138	1821143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505272
33025	NC_019842	GAA	2	6	1821156	1821161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505272
33026	NC_019842	CT	3	6	1821239	1821244	0 %	50 %	0 %	50 %	429505272
33027	NC_019842	GCC	2	6	1821298	1821303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505272
33028	NC_019842	GA	3	6	1821304	1821309	50 %	0 %	50 %	0 %	429505272
33029	NC_019842	TGC	2	6	1821487	1821492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505272
33030	NC_019842	GCT	2	6	1821497	1821502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505272
33031	NC_019842	AGC	2	6	1821529	1821534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505272
33032	NC_019842	ATC	2	6	1821577	1821582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505272
33033	NC_019842	TTA	2	6	1821583	1821588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429505272
33034	NC_019842	GCG	2	6	1821636	1821641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505272
33035	NC_019842	AAGC	2	8	1821814	1821821	50 %	0 %	25 %	25 %	429505272
33036	NC_019842	GGCA	2	8	1821822	1821829	25 %	0 %	50 %	25 %	429505272
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33038	NC_019842	CAG	2	6	1821996	1822001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505272
33039	NC_019842	CCTT	2	8	1822044	1822051	0 %	50 %	0 %	50 %	429505272
33040	NC_019842	GAA	2	6	1822056	1822061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505272
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33042	NC_019842	GAT	2	6	1822140	1822145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505272
33043	NC_019842	GAA	2	6	1822173	1822178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505272
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33045	NC_019842	TGA	2	6	1822274	1822279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505272
33046	NC_019842	CCGG	2	8	1822282	1822289	0 %	0 %	50 %	50 %	429505272
33047	NC_019842	TTC	2	6	1822313	1822318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505272
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33049	NC_019842	CAT	2	6	1822348	1822353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505272
33050	NC_019842	CAT	2	6	1822479	1822484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505272
33051	NC_019842	GGA	2	6	1822514	1822519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429505272
33052	NC_019842	CTGAA	2	10	1822540	1822549	40 %	20 %	20 %	20 %	429505272
33053	NC_019842	TGA	2	6	1822601	1822606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505272
33054	NC_019842	TGCT	2	8	1822663	1822670	0 %	50 %	25 %	25 %	429505272
33055	NC_019842	CGG	2	6	1822735	1822740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505272
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33057	NC_019842	GCTC	2	8	1822783	1822790	0 %	25 %	25 %	50 %	429505272
33058	NC_019842	TGAT	2	8	1822822	1822829	25 %	50 %	25 %	0 %	429505272
33059	NC_019842	TGA	2	6	1822880	1822885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505272
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33062	NC_019842	GTC	2	6	1822995	1823000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505272
33063	NC_019842	CGG	2	6	1823003	1823008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505272
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33066	NC_019842	ACGC	2	8	1823210	1823217	25 %	0 %	25 %	50 %	429505272
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33069	NC_019842	CTTTG	2	10	1823369	1823378	0 %	60 %	20 %	20 %	429505272
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33087	NC_019842	CAG	2	6	1824057	1824062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505273
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33090	NC_019842	ACT	2	6	1824209	1824214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505273
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33097	NC_019842	A	6	6	1824549	1824554	100 %	0 %	0 %	0 %	429505273
33098	NC_019842	CGG	2	6	1824559	1824564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505273
33099	NC_019842	AGC	2	6	1824625	1824630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505273
33100	NC_019842	TGG	2	6	1824673	1824678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429505273
33101	NC_019842	CAG	2	6	1824808	1824813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505273
33102	NC_019842	GGC	2	6	1824819	1824824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505273
33103	NC_019842	TCA	2	6	1824839	1824844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505273
33104	NC_019842	AGC	2	6	1824851	1824856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505273
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33106	NC_019842	AC	3	6	1825110	1825115	50 %	0 %	0 %	50 %	429505273
33107	NC_019842	CCT	2	6	1825195	1825200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429505273
33108	NC_019842	AATG	2	8	1825224	1825231	50 %	25 %	25 %	0 %	429505273
33109	NC_019842	CGG	2	6	1825258	1825263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505273
33110	NC_019842	GAC	2	6	1825339	1825344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505273
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33112	NC_019842	TCT	2	6	1825467	1825472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505273
33113	NC_019842	AGA	2	6	1825500	1825505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505273
33114	NC_019842	CGG	2	6	1825521	1825526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505273
33115	NC_019842	GCA	2	6	1825533	1825538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505273
33116	NC_019842	CAAT	2	8	1825725	1825732	50 %	25 %	0 %	25 %	429505273
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33124	NC_019842	GC	3	6	1826348	1826353	0 %	0 %	50 %	50 %	429505273
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33133	NC_019842	AT	3	6	1826682	1826687	50 %	50 %	0 %	0 %	429505273
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33225	NC_019842	G	6	6	1831385	1831390	0 %	0 %	100 %	0 %	429505274
33226	NC_019842	T	6	6	1831438	1831443	0 %	100 %	0 %	0 %	429505274
33227	NC_019842	AATG	2	8	1831556	1831563	50 %	25 %	25 %	0 %	429505274
33228	NC_019842	ATC	2	6	1831620	1831625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505274
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33230	NC_019842	T	6	6	1831680	1831685	0 %	100 %	0 %	0 %	429505274
33231	NC_019842	CAT	2	6	1831734	1831739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505274
33232	NC_019842	CCG	2	6	1831775	1831780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505274
33233	NC_019842	TCT	2	6	1831808	1831813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505274
33234	NC_019842	AGA	2	6	1831831	1831836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505274
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33237	NC_019842	AT	3	6	1832017	1832022	50 %	50 %	0 %	0 %	429505274
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33262	NC_019842	TGC	2	6	1833810	1833815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505276
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33272	NC_019842	TGTA	2	8	1834221	1834228	25 %	50 %	25 %	0 %	429505277
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33335	NC_019842	CGGC	2	8	1837568	1837575	0 %	0 %	50 %	50 %	429505281
33336	NC_019842	GGAC	2	8	1837607	1837614	25 %	0 %	50 %	25 %	429505281
33337	NC_019842	TGA	2	6	1837634	1837639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505281
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33342	NC_019842	AAG	2	6	1837697	1837702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505281
33343	NC_019842	AGA	2	6	1837715	1837720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505281
33344	NC_019842	GT	3	6	1837762	1837767	0 %	50 %	50 %	0 %	429505281
33345	NC_019842	CCGT	2	8	1837790	1837797	0 %	25 %	25 %	50 %	429505281
33346	NC_019842	TAT	2	6	1837801	1837806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429505281
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33348	NC_019842	CAG	2	6	1838014	1838019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505282
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33350	NC_019842	ATC	2	6	1838051	1838056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505282
33351	NC_019842	CCT	2	6	1838073	1838078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429505282
33352	NC_019842	A	6	6	1838086	1838091	100 %	0 %	0 %	0 %	429505282
33353	NC_019842	GCG	2	6	1838141	1838146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505282
33354	NC_019842	TCA	2	6	1838313	1838318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505282
33355	NC_019842	TCA	2	6	1838342	1838347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505283
33356	NC_019842	GCTCC	2	10	1838449	1838458	0 %	20 %	20 %	60 %	429505283
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33358	NC_019842	GC	3	6	1838543	1838548	0 %	0 %	50 %	50 %	429505283
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33364	NC_019842	AAAACC	2	12	1838955	1838966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429505284
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33366	NC_019842	CGAATC	2	12	1839002	1839013	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	429505284
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33450	NC_019842	GC	3	6	1843199	1843204	0 %	0 %	50 %	50 %	429505291
33451	NC_019842	ATG	2	6	1843374	1843379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505291
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33455	NC_019842	ATG	2	6	1843661	1843666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505291
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33459	NC_019842	GAA	2	6	1843988	1843993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505291
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33466	NC_019842	TCTT	2	8	1844269	1844276	0 %	75 %	0 %	25 %	429505291
33467	NC_019842	GCA	2	6	1844323	1844328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429505292
33468	NC_019842	GAT	2	6	1844347	1844352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505292
33469	NC_019842	TCT	2	6	1844424	1844429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505292
33470	NC_019842	GAT	2	6	1844586	1844591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505292
33471	NC_019842	AATA	2	8	1844686	1844693	75 %	25 %	0 %	0 %	429505292
33472	NC_019842	A	6	6	1844701	1844706	100 %	0 %	0 %	0 %	429505292
33473	NC_019842	GAT	2	6	1844746	1844751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505292
33474	NC_019842	TAT	2	6	1844821	1844826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429505292
33475	NC_019842	TAA	2	6	1844943	1844948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429505292
33476	NC_019842	ACAG	2	8	1844949	1844956	50 %	0 %	25 %	25 %	429505292
33477	NC_019842	A	6	6	1844962	1844967	100 %	0 %	0 %	0 %	429505292
33478	NC_019842	TGA	2	6	1845107	1845112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505292
33479	NC_019842	GAA	2	6	1845136	1845141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505292
33480	NC_019842	CAAAA	2	10	1845180	1845189	80 %	0 %	0 %	20 %	429505292
33481	NC_019842	TCT	2	6	1845200	1845205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429505292
33482	NC_019842	ATA	2	6	1845291	1845296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429505292
33483	NC_019842	ATC	2	6	1845361	1845366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429505293
33484	NC_019842	T	7	7	1845474	1845480	0 %	100 %	0 %	0 %	429505293
33485	NC_019842	AGA	2	6	1845487	1845492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505293
33486	NC_019842	GTC	2	6	1845538	1845543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429505293
33487	NC_019842	CCG	2	6	1845546	1845551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505293
33488	NC_019842	GAT	2	6	1845553	1845558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505293
33489	NC_019842	ATA	2	6	1845608	1845613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429505293
33490	NC_019842	TC	3	6	1845619	1845624	0 %	50 %	0 %	50 %	429505293
33491	NC_019842	CGG	2	6	1845630	1845635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505293
33492	NC_019842	GGC	2	6	1845657	1845662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505293
33493	NC_019842	ACCG	2	8	1845691	1845698	25 %	0 %	25 %	50 %	429505293
33494	NC_019842	GAA	2	6	1845709	1845714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429505293
33495	NC_019842	GAG	2	6	1845727	1845732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429505293
33496	NC_019842	ACAA	2	8	1845734	1845741	75 %	0 %	0 %	25 %	429505293
33497	NC_019842	ATG	3	9	1845767	1845775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429505293
33498	NC_019842	GAAA	2	8	1845849	1845856	75 %	0 %	25 %	0 %	429505293
33499	NC_019842	GCC	2	6	1846118	1846123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429505294
33500	NC_019842	CGG	2	6	1846165	1846170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429505294

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