MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 73099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019842	GGA	2	6	90568	90573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503616
1502	NC_019842	TCG	2	6	90606	90611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503616
1503	NC_019842	AGA	2	6	90694	90699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503616
1504	NC_019842	ATG	2	6	90719	90724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503616
1505	NC_019842	GCC	2	6	90760	90765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503616
1506	NC_019842	GTATCG	2	12	90780	90791	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	429503616
1507	NC_019842	TAT	2	6	90840	90845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503616
1508	NC_019842	ATA	2	6	90865	90870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503616
1509	NC_019842	ATA	2	6	102075	102080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503617
1510	NC_019842	CAT	2	6	102088	102093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503617
1511	NC_019842	TTCC	2	8	102183	102190	0 %	50 %	0 %	50 %	429503617
1512	NC_019842	AAAT	2	8	102192	102199	75 %	25 %	0 %	0 %	429503617
1513	NC_019842	TCA	2	6	102204	102209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503617
1514	NC_019842	AT	3	6	102235	102240	50 %	50 %	0 %	0 %	429503617
1515	NC_019842	GGC	2	6	102260	102265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503617
1516	NC_019842	TAT	2	6	102277	102282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503617
1517	NC_019842	GTC	2	6	102305	102310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503617
1518	NC_019842	TCA	2	6	102312	102317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503617
1519	NC_019842	ATA	2	6	102318	102323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503617
1520	NC_019842	TGA	2	6	102364	102369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503617
1521	NC_019842	ATT	2	6	102371	102376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503617
1522	NC_019842	ATG	2	6	102422	102427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503617
1523	NC_019842	TA	3	6	102453	102458	50 %	50 %	0 %	0 %	429503617
1524	NC_019842	ATG	2	6	102494	102499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503617
1525	NC_019842	GATT	2	8	102544	102551	25 %	50 %	25 %	0 %	429503618
1526	NC_019842	GA	3	6	102567	102572	50 %	0 %	50 %	0 %	429503618
1527	NC_019842	GTT	2	6	102597	102602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503618
1528	NC_019842	AAG	2	6	102616	102621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503618
1529	NC_019842	TAT	2	6	102703	102708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503618
1530	NC_019842	GCT	2	6	102713	102718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503618
1531	NC_019842	CAG	2	6	102810	102815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503618
1532	NC_019842	A	7	7	102980	102986	100 %	0 %	0 %	0 %	429503618
1533	NC_019842	AGC	2	6	103025	103030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503618
1534	NC_019842	AGATC	2	10	103040	103049	40 %	20 %	20 %	20 %	429503618
1535	NC_019842	CAG	2	6	103180	103185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503619
1536	NC_019842	CCCG	2	8	103226	103233	0 %	0 %	25 %	75 %	429503619
1537	NC_019842	GAA	2	6	103244	103249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503619
1538	NC_019842	CATC	2	8	103254	103261	25 %	25 %	0 %	50 %	429503619
1539	NC_019842	GGC	2	6	103412	103417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503619
1540	NC_019842	GAA	2	6	103436	103441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503619
1541	NC_019842	GAA	2	6	103460	103465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503619
1542	NC_019842	GCG	2	6	103523	103528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503619
1543	NC_019842	TGA	2	6	103537	103542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503619
1544	NC_019842	GAG	2	6	103550	103555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503619
1545	NC_019842	GA	3	6	103575	103580	50 %	0 %	50 %	0 %	429503619
1546	NC_019842	GGGAC	2	10	103616	103625	20 %	0 %	60 %	20 %	429503619
1547	NC_019842	ATG	2	6	103640	103645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503619
1548	NC_019842	GTT	2	6	103715	103720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503619
1549	NC_019842	TCAAA	2	10	103772	103781	60 %	20 %	0 %	20 %	429503619
1550	NC_019842	GAT	2	6	103814	103819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503619
1551	NC_019842	GGA	2	6	103900	103905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503619
1552	NC_019842	TGA	2	6	104046	104051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503619
1553	NC_019842	CGAA	2	8	104103	104110	50 %	0 %	25 %	25 %	429503619
1554	NC_019842	AGA	2	6	104120	104125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503619
1555	NC_019842	AGG	2	6	104175	104180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503619
1556	NC_019842	ATG	2	6	104191	104196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503619
1557	NC_019842	TGGCAC	2	12	104231	104242	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429503620
1558	NC_019842	GAA	2	6	104245	104250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503620
1559	NC_019842	TTA	2	6	104293	104298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503620
1560	NC_019842	ACTCGG	2	12	104346	104357	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429503620
1561	NC_019842	AGAA	2	8	104372	104379	75 %	0 %	25 %	0 %	429503620
1562	NC_019842	A	7	7	104442	104448	100 %	0 %	0 %	0 %	429503620
1563	NC_019842	GAACA	2	10	104501	104510	60 %	0 %	20 %	20 %	429503620
1564	NC_019842	GCG	2	6	104548	104553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503620
1565	NC_019842	AAT	2	6	104563	104568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503620
1566	NC_019842	TCT	2	6	104635	104640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503620
1567	NC_019842	GAAG	2	8	104712	104719	50 %	0 %	50 %	0 %	429503620
1568	NC_019842	GAA	2	6	104790	104795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503620
1569	NC_019842	CAG	2	6	104857	104862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503620
1570	NC_019842	ATC	2	6	104863	104868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503620
1571	NC_019842	AAT	2	6	104869	104874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503620
1572	NC_019842	A	6	6	104974	104979	100 %	0 %	0 %	0 %	429503620
1573	NC_019842	ATT	2	6	105010	105015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429503620
1574	NC_019842	G	6	6	105051	105056	0 %	0 %	100 %	0 %	429503620
1575	NC_019842	TGA	2	6	105141	105146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503620
1576	NC_019842	AT	3	6	105156	105161	50 %	50 %	0 %	0 %	429503620
1577	NC_019842	CGC	2	6	105171	105176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429503620
1578	NC_019842	GCG	2	6	105307	105312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503620
1579	NC_019842	CTTC	2	8	105345	105352	0 %	50 %	0 %	50 %	429503620
1580	NC_019842	CGAT	2	8	105362	105369	25 %	25 %	25 %	25 %	429503620
1581	NC_019842	TGA	2	6	105375	105380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503620
1582	NC_019842	CGTT	2	8	105403	105410	0 %	50 %	25 %	25 %	429503620
1583	NC_019842	AGC	2	6	105527	105532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503620
1584	NC_019842	GA	3	6	105537	105542	50 %	0 %	50 %	0 %	429503620
1585	NC_019842	A	7	7	105559	105565	100 %	0 %	0 %	0 %	429503620
1586	NC_019842	GAAA	2	8	105570	105577	75 %	0 %	25 %	0 %	429503620
1587	NC_019842	TTCA	2	8	105807	105814	25 %	50 %	0 %	25 %	429503620
1588	NC_019842	TGA	2	6	105882	105887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503620
1589	NC_019842	GAT	2	6	105894	105899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503620
1590	NC_019842	TCC	2	6	105957	105962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429503620
1591	NC_019842	ATG	2	6	105977	105982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503620
1592	NC_019842	GGC	2	6	105985	105990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503620
1593	NC_019842	GAA	2	6	106010	106015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503620
1594	NC_019842	TGA	2	6	106038	106043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503620
1595	NC_019842	GACG	2	8	106096	106103	25 %	0 %	50 %	25 %	429503620
1596	NC_019842	GAGC	3	12	106172	106183	25 %	0 %	50 %	25 %	429503620
1597	NC_019842	CAA	2	6	106191	106196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503620
1598	NC_019842	A	6	6	106336	106341	100 %	0 %	0 %	0 %	429503620
1599	NC_019842	TC	3	6	106404	106409	0 %	50 %	0 %	50 %	429503620
1600	NC_019842	TGC	2	6	106425	106430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503620
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1602	NC_019842	AAG	2	6	106485	106490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503620
1603	NC_019842	GGA	2	6	106509	106514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429503620
1604	NC_019842	AGA	2	6	106524	106529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503620
1605	NC_019842	CTC	2	6	106531	106536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429503620
1606	NC_019842	AAC	2	6	106602	106607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429503620
1607	NC_019842	ATGG	2	8	106773	106780	25 %	25 %	50 %	0 %	429503621
1608	NC_019842	TGG	2	6	106814	106819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429503621
1609	NC_019842	A	7	7	106830	106836	100 %	0 %	0 %	0 %	429503621
1610	NC_019842	CGG	2	6	106849	106854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503621
1611	NC_019842	TCA	2	6	106903	106908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503621
1612	NC_019842	GAA	2	6	106921	106926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503621
1613	NC_019842	CAAA	2	8	106936	106943	75 %	0 %	0 %	25 %	429503621
1614	NC_019842	GAA	2	6	106948	106953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503621
1615	NC_019842	GGC	3	9	106969	106977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503621
1616	NC_019842	CGG	2	6	107004	107009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503621
1617	NC_019842	GAA	2	6	107098	107103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503621
1618	NC_019842	GC	3	6	107124	107129	0 %	0 %	50 %	50 %	429503621
1619	NC_019842	TGT	2	6	107226	107231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503621
1620	NC_019842	AG	3	6	107299	107304	50 %	0 %	50 %	0 %	429503621
1621	NC_019842	TGA	2	6	107318	107323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503621
1622	NC_019842	AAAC	2	8	107333	107340	75 %	0 %	0 %	25 %	429503621
1623	NC_019842	TCG	2	6	107357	107362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503621
1624	NC_019842	GATC	2	8	107381	107388	25 %	25 %	25 %	25 %	429503621
1625	NC_019842	A	6	6	107478	107483	100 %	0 %	0 %	0 %	429503621
1626	NC_019842	AAATG	2	10	107499	107508	60 %	20 %	20 %	0 %	429503621
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1734	NC_019842	CTGA	2	8	112814	112821	25 %	25 %	25 %	25 %	429503626
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1863	NC_019842	ACG	2	6	119784	119789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429503637
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1868	NC_019842	TTG	2	6	120276	120281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429503637
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1881	NC_019842	CTTGCA	2	12	121123	121134	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429503638
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1987	NC_019842	GA	3	6	126442	126447	50 %	0 %	50 %	0 %	429503642
1988	NC_019842	GAA	2	6	126550	126555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503642
1989	NC_019842	CTT	2	6	126569	126574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429503642
1990	NC_019842	CGT	2	6	126576	126581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503642
1991	NC_019842	TAA	2	6	126699	126704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503642
1992	NC_019842	AAG	2	6	126731	126736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503642
1993	NC_019842	AGA	2	6	126750	126755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429503642
1994	NC_019842	GAT	2	6	126849	126854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429503642
1995	NC_019842	CGG	2	6	126909	126914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429503642
1996	NC_019842	CGT	2	6	126949	126954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429503642
1997	NC_019842	TCA	2	6	126956	126961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503642
1998	NC_019842	TAA	2	6	126966	126971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429503642
1999	NC_019842	GC	3	6	126998	127003	0 %	0 %	50 %	50 %	429503642
2000	NC_019842	CAT	2	6	127008	127013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429503642

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