MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 73099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_019842	TCA	2	6	859821	859826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504345
15002	NC_019842	GCC	2	6	859844	859849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504345
15003	NC_019842	T	6	6	859894	859899	0 %	100 %	0 %	0 %	429504345
15004	NC_019842	GGC	2	6	859900	859905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504345
15005	NC_019842	CCGCAT	2	12	859922	859933	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	429504345
15006	NC_019842	GCC	2	6	859940	859945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504345
15007	NC_019842	GAAA	2	8	859950	859957	75 %	0 %	25 %	0 %	429504345
15008	NC_019842	TGT	2	6	859990	859995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429504345
15009	NC_019842	GAC	2	6	860034	860039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504346
15010	NC_019842	CCG	2	6	860040	860045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504346
15011	NC_019842	AATGGC	2	12	860054	860065	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	429504346
15012	NC_019842	CCGG	2	8	860238	860245	0 %	0 %	50 %	50 %	429504346
15013	NC_019842	GTC	2	6	860259	860264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504346
15014	NC_019842	CGTAGT	2	12	860320	860331	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	429504346
15015	NC_019842	GAT	2	6	860403	860408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504346
15016	NC_019842	CCG	2	6	860476	860481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504346
15017	NC_019842	A	7	7	860504	860510	100 %	0 %	0 %	0 %	429504346
15018	NC_019842	TGC	2	6	860533	860538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504346
15019	NC_019842	TGTA	2	8	860542	860549	25 %	50 %	25 %	0 %	429504346
15020	NC_019842	GCTGT	2	10	860557	860566	0 %	40 %	40 %	20 %	429504346
15021	NC_019842	ATG	2	6	860581	860586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504346
15022	NC_019842	TTCG	2	8	860605	860612	0 %	50 %	25 %	25 %	429504346
15023	NC_019842	AAT	2	6	860621	860626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504346
15024	NC_019842	TGT	2	6	860720	860725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429504346
15025	NC_019842	CTC	2	6	860756	860761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429504346
15026	NC_019842	GCT	2	6	860796	860801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504346
15027	NC_019842	CTG	2	6	860803	860808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504346
15028	NC_019842	AAT	2	6	860817	860822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504346
15029	NC_019842	GT	5	10	861017	861026	0 %	50 %	50 %	0 %	429504347
15030	NC_019842	GCCT	2	8	861031	861038	0 %	25 %	25 %	50 %	429504347
15031	NC_019842	AATT	2	8	861067	861074	50 %	50 %	0 %	0 %	429504347
15032	NC_019842	TTA	2	6	861132	861137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504347
15033	NC_019842	AT	3	6	861310	861315	50 %	50 %	0 %	0 %	429504348
15034	NC_019842	TGC	2	6	861333	861338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504348
15035	NC_019842	GCCG	2	8	861425	861432	0 %	0 %	50 %	50 %	429504348
15036	NC_019842	CGT	2	6	861463	861468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504348
15037	NC_019842	GCA	2	6	861492	861497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504348
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15039	NC_019842	T	7	7	861777	861783	0 %	100 %	0 %	0 %	429504349
15040	NC_019842	GCA	2	6	861803	861808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504349
15041	NC_019842	GCA	2	6	861833	861838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504349
15042	NC_019842	AT	3	6	861844	861849	50 %	50 %	0 %	0 %	429504349
15043	NC_019842	CA	3	6	862003	862008	50 %	0 %	0 %	50 %	429504349
15044	NC_019842	TGA	2	6	862014	862019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504349
15045	NC_019842	AGC	2	6	862020	862025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504349
15046	NC_019842	CGGTGA	2	12	862035	862046	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429504349
15047	NC_019842	A	6	6	862085	862090	100 %	0 %	0 %	0 %	429504349
15048	NC_019842	GGA	2	6	862148	862153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504349
15049	NC_019842	CGG	2	6	862183	862188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504349
15050	NC_019842	CGG	2	6	862331	862336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504350
15051	NC_019842	T	6	6	862371	862376	0 %	100 %	0 %	0 %	429504350
15052	NC_019842	CCG	2	6	862377	862382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504350
15053	NC_019842	AAG	2	6	862447	862452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504350
15054	NC_019842	CGG	2	6	862498	862503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504350
15055	NC_019842	TAT	2	6	862570	862575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504350
15056	NC_019842	ATC	2	6	862596	862601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504350
15057	NC_019842	AGAA	2	8	862610	862617	75 %	0 %	25 %	0 %	429504350
15058	NC_019842	AAAC	2	8	862623	862630	75 %	0 %	0 %	25 %	429504350
15059	NC_019842	GAG	2	6	862634	862639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504350
15060	NC_019842	ATGA	2	8	862645	862652	50 %	25 %	25 %	0 %	429504350
15061	NC_019842	AAAC	2	8	862673	862680	75 %	0 %	0 %	25 %	429504351
15062	NC_019842	TGC	3	9	862733	862741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504351
15063	NC_019842	TGT	2	6	862809	862814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429504351
15064	NC_019842	GAC	2	6	862891	862896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504351
15065	NC_019842	CGT	2	6	862935	862940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504351
15066	NC_019842	GAG	2	6	862958	862963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504351
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15068	NC_019842	CGC	2	6	863069	863074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504351
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15071	NC_019842	AAG	2	6	863225	863230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504351
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15073	NC_019842	GAT	2	6	863397	863402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504351
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15080	NC_019842	GCA	2	6	864011	864016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504352
15081	NC_019842	CTG	2	6	864027	864032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504352
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15084	NC_019842	TTC	2	6	864122	864127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504352
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15086	NC_019842	CAA	2	6	864146	864151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504352
15087	NC_019842	CTG	2	6	864195	864200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504352
15088	NC_019842	CTG	2	6	864266	864271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504352
15089	NC_019842	GAA	2	6	864317	864322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504352
15090	NC_019842	GTC	2	6	864375	864380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504352
15091	NC_019842	CAA	3	9	864386	864394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504352
15092	NC_019842	AC	3	6	864480	864485	50 %	0 %	0 %	50 %	429504352
15093	NC_019842	ATT	2	6	864513	864518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504352
15094	NC_019842	CCG	2	6	864520	864525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504352
15095	NC_019842	CAT	2	6	864563	864568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504352
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15097	NC_019842	TTAA	2	8	864621	864628	50 %	50 %	0 %	0 %	429504352
15098	NC_019842	A	6	6	864674	864679	100 %	0 %	0 %	0 %	429504352
15099	NC_019842	A	8	8	864738	864745	100 %	0 %	0 %	0 %	429504353
15100	NC_019842	TG	3	6	864768	864773	0 %	50 %	50 %	0 %	429504353
15101	NC_019842	T	7	7	864796	864802	0 %	100 %	0 %	0 %	429504353
15102	NC_019842	GCT	2	6	864878	864883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504353
15103	NC_019842	AT	3	6	864893	864898	50 %	50 %	0 %	0 %	429504353
15104	NC_019842	TTCG	2	8	864923	864930	0 %	50 %	25 %	25 %	429504353
15105	NC_019842	TAT	2	6	864963	864968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504353
15106	NC_019842	CTT	2	6	864976	864981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504353
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15110	NC_019842	ACGG	2	8	865145	865152	25 %	0 %	50 %	25 %	429504353
15111	NC_019842	ATT	2	6	865191	865196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504353
15112	NC_019842	A	6	6	865273	865278	100 %	0 %	0 %	0 %	429504353
15113	NC_019842	A	7	7	865288	865294	100 %	0 %	0 %	0 %	429504353
15114	NC_019842	CAA	2	6	865334	865339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504353
15115	NC_019842	GGTG	2	8	865393	865400	0 %	25 %	75 %	0 %	429504353
15116	NC_019842	CTCA	2	8	865431	865438	25 %	25 %	0 %	50 %	429504353
15117	NC_019842	GCC	2	6	865532	865537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504353
15118	NC_019842	ACA	2	6	865573	865578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504353
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15120	NC_019842	CGG	2	6	865609	865614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504353
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15241	NC_019842	GCT	2	6	871928	871933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504360
15242	NC_019842	TCA	2	6	871943	871948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504360
15243	NC_019842	TTG	2	6	871975	871980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429504360
15244	NC_019842	A	6	6	872143	872148	100 %	0 %	0 %	0 %	429504361
15245	NC_019842	CAT	2	6	872175	872180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504361
15246	NC_019842	GCT	2	6	872208	872213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504361
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15249	NC_019842	CAT	2	6	872295	872300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504361
15250	NC_019842	G	6	6	872393	872398	0 %	0 %	100 %	0 %	429504361
15251	NC_019842	ATG	2	6	872480	872485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504361
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15262	NC_019842	CGA	2	6	873057	873062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504361
15263	NC_019842	ACTG	2	8	873072	873079	25 %	25 %	25 %	25 %	429504361
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15265	NC_019842	TCG	2	6	873218	873223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504361
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15273	NC_019842	A	6	6	873582	873587	100 %	0 %	0 %	0 %	429504361
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15300	NC_019842	GT	3	6	874695	874700	0 %	50 %	50 %	0 %	429504362
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15319	NC_019842	CATA	2	8	875739	875746	50 %	25 %	0 %	25 %	429504363
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15339	NC_019842	TG	3	6	876952	876957	0 %	50 %	50 %	0 %	429504364
15340	NC_019842	GAA	3	9	876964	876972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504364
15341	NC_019842	AT	3	6	876985	876990	50 %	50 %	0 %	0 %	429504364
15342	NC_019842	T	6	6	877009	877014	0 %	100 %	0 %	0 %	429504364
15343	NC_019842	AAG	2	6	877023	877028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504364
15344	NC_019842	TAAT	2	8	877111	877118	50 %	50 %	0 %	0 %	429504364
15345	NC_019842	AAG	2	6	877261	877266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504365
15346	NC_019842	CTC	2	6	877303	877308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429504365
15347	NC_019842	AT	4	8	877366	877373	50 %	50 %	0 %	0 %	429504365
15348	NC_019842	CAG	2	6	877484	877489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504365
15349	NC_019842	TCACG	2	10	877595	877604	20 %	20 %	20 %	40 %	429504365
15350	NC_019842	CCA	2	6	877619	877624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429504365
15351	NC_019842	A	6	6	877662	877667	100 %	0 %	0 %	0 %	429504365
15352	NC_019842	T	6	6	877727	877732	0 %	100 %	0 %	0 %	429504366
15353	NC_019842	CT	3	6	877789	877794	0 %	50 %	0 %	50 %	429504366
15354	NC_019842	ATGC	2	8	877798	877805	25 %	25 %	25 %	25 %	429504366
15355	NC_019842	TTTC	2	8	877833	877840	0 %	75 %	0 %	25 %	429504366
15356	NC_019842	CGG	2	6	877902	877907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504366
15357	NC_019842	CAG	2	6	877924	877929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504366
15358	NC_019842	GCAA	2	8	877952	877959	50 %	0 %	25 %	25 %	429504366
15359	NC_019842	TTA	2	6	878039	878044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504366
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15482	NC_019842	CTC	2	6	891344	891349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429504371
15483	NC_019842	ATC	2	6	891430	891435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504371
15484	NC_019842	GGA	2	6	891443	891448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504371
15485	NC_019842	AAGT	2	8	891458	891465	50 %	25 %	25 %	0 %	429504371
15486	NC_019842	TCC	2	6	891492	891497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429504371
15487	NC_019842	TTC	2	6	891643	891648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504371
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