MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 73099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_019842	CAG	2	6	642289	642294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504141
11002	NC_019842	A	7	7	642302	642308	100 %	0 %	0 %	0 %	429504141
11003	NC_019842	ACGG	2	8	642347	642354	25 %	0 %	50 %	25 %	429504141
11004	NC_019842	A	6	6	642443	642448	100 %	0 %	0 %	0 %	429504141
11005	NC_019842	ATG	2	6	642588	642593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504141
11006	NC_019842	GAT	2	6	642617	642622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504141
11007	NC_019842	GGC	2	6	642665	642670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504141
11008	NC_019842	AGAA	2	8	642671	642678	75 %	0 %	25 %	0 %	429504141
11009	NC_019842	CGG	3	9	642685	642693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504141
11010	NC_019842	AAAAC	2	10	642809	642818	80 %	0 %	0 %	20 %	429504141
11011	NC_019842	GAAAC	2	10	642833	642842	60 %	0 %	20 %	20 %	429504141
11012	NC_019842	ATC	2	6	642843	642848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504141
11013	NC_019842	TGA	2	6	642951	642956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504141
11014	NC_019842	A	7	7	642989	642995	100 %	0 %	0 %	0 %	429504141
11015	NC_019842	A	6	6	643025	643030	100 %	0 %	0 %	0 %	429504141
11016	NC_019842	TAT	2	6	643034	643039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504141
11017	NC_019842	GAT	2	6	643106	643111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504141
11018	NC_019842	TCAA	2	8	643170	643177	50 %	25 %	0 %	25 %	429504141
11019	NC_019842	ATG	2	6	643249	643254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504141
11020	NC_019842	T	6	6	643618	643623	0 %	100 %	0 %	0 %	429504142
11021	NC_019842	TGA	2	6	643629	643634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504142
11022	NC_019842	ATC	2	6	643660	643665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504142
11023	NC_019842	CGGC	2	8	643808	643815	0 %	0 %	50 %	50 %	429504142
11024	NC_019842	T	6	6	643882	643887	0 %	100 %	0 %	0 %	429504142
11025	NC_019842	A	6	6	643994	643999	100 %	0 %	0 %	0 %	429504142
11026	NC_019842	GTTT	2	8	644051	644058	0 %	75 %	25 %	0 %	429504142
11027	NC_019842	ATT	2	6	644089	644094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504142
11028	NC_019842	TGC	2	6	644147	644152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504142
11029	NC_019842	CGG	2	6	644205	644210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504142
11030	NC_019842	CGG	2	6	644234	644239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504142
11031	NC_019842	TCT	2	6	644345	644350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504142
11032	NC_019842	TCG	2	6	644387	644392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504142
11033	NC_019842	TGG	2	6	644417	644422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429504142
11034	NC_019842	TGA	2	6	644444	644449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504142
11035	NC_019842	AAAC	2	8	644454	644461	75 %	0 %	0 %	25 %	429504142
11036	NC_019842	CTT	2	6	644540	644545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504142
11037	NC_019842	GCG	2	6	644569	644574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504142
11038	NC_019842	GC	3	6	644578	644583	0 %	0 %	50 %	50 %	429504142
11039	NC_019842	TGT	2	6	644598	644603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429504142
11040	NC_019842	CGC	2	6	644639	644644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504142
11041	NC_019842	CAC	2	6	644658	644663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429504142
11042	NC_019842	ATT	2	6	644686	644691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504142
11043	NC_019842	GC	3	6	644696	644701	0 %	0 %	50 %	50 %	429504142
11044	NC_019842	TGG	2	6	644705	644710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429504142
11045	NC_019842	CGC	2	6	644711	644716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504142
11046	NC_019842	GAT	2	6	644769	644774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504142
11047	NC_019842	ATG	2	6	644776	644781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504142
11048	NC_019842	AAAGGA	2	12	644851	644862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504142
11049	NC_019842	TCT	2	6	644918	644923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504142
11050	NC_019842	GAA	2	6	645135	645140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504143
11051	NC_019842	AGAAA	2	10	645141	645150	80 %	0 %	20 %	0 %	429504143
11052	NC_019842	GAA	3	9	645156	645164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504143
11053	NC_019842	TGA	2	6	645182	645187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504143
11054	NC_019842	CAAAAG	2	12	645228	645239	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	429504143
11055	NC_019842	A	6	6	645240	645245	100 %	0 %	0 %	0 %	429504143
11056	NC_019842	CCGGCT	2	12	645261	645272	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	429504143
11057	NC_019842	CAT	2	6	645492	645497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504143
11058	NC_019842	T	6	6	645501	645506	0 %	100 %	0 %	0 %	429504143
11059	NC_019842	CGT	2	6	645518	645523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504143
11060	NC_019842	T	6	6	645543	645548	0 %	100 %	0 %	0 %	429504143
11061	NC_019842	GCG	2	6	645555	645560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504143
11062	NC_019842	ATG	2	6	645588	645593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504143
11063	NC_019842	GAT	2	6	645674	645679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504143
11064	NC_019842	TCA	2	6	645703	645708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504143
11065	NC_019842	GTG	2	6	645711	645716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429504143
11066	NC_019842	GCC	2	6	645741	645746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504143
11067	NC_019842	CGG	2	6	645826	645831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504143
11068	NC_019842	TCA	3	9	645832	645840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504143
11069	NC_019842	GTT	2	6	646058	646063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429504144
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11071	NC_019842	TGAG	2	8	646162	646169	25 %	25 %	50 %	0 %	429504144
11072	NC_019842	A	6	6	646203	646208	100 %	0 %	0 %	0 %	429504144
11073	NC_019842	ATG	2	6	646345	646350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504145
11074	NC_019842	ATT	2	6	646387	646392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504145
11075	NC_019842	TCA	2	6	646394	646399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504145
11076	NC_019842	TA	3	6	646407	646412	50 %	50 %	0 %	0 %	429504145
11077	NC_019842	TCTT	2	8	646417	646424	0 %	75 %	0 %	25 %	429504145
11078	NC_019842	GAT	2	6	646434	646439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504145
11079	NC_019842	CGC	2	6	646467	646472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504145
11080	NC_019842	GAA	2	6	646606	646611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504145
11081	NC_019842	GCGG	2	8	646717	646724	0 %	0 %	75 %	25 %	429504145
11082	NC_019842	GACCG	2	10	646735	646744	20 %	0 %	40 %	40 %	429504145
11083	NC_019842	TGA	2	6	646806	646811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504145
11084	NC_019842	GAA	2	6	646875	646880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504145
11085	NC_019842	GAG	2	6	646881	646886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429504145
11086	NC_019842	A	6	6	646907	646912	100 %	0 %	0 %	0 %	429504146
11087	NC_019842	GAAG	2	8	646967	646974	50 %	0 %	50 %	0 %	429504146
11088	NC_019842	CGG	2	6	646992	646997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504146
11089	NC_019842	AGAAA	2	10	647018	647027	80 %	0 %	20 %	0 %	429504146
11090	NC_019842	A	7	7	647061	647067	100 %	0 %	0 %	0 %	429504146
11091	NC_019842	CG	3	6	647311	647316	0 %	0 %	50 %	50 %	429504147
11092	NC_019842	T	8	8	647365	647372	0 %	100 %	0 %	0 %	429504147
11093	NC_019842	ATC	2	6	647424	647429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504147
11094	NC_019842	CATG	2	8	647463	647470	25 %	25 %	25 %	25 %	429504148
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11096	NC_019842	ATT	2	6	647586	647591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504148
11097	NC_019842	GCG	2	6	647607	647612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504148
11098	NC_019842	CGG	2	6	647629	647634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504148
11099	NC_019842	ACG	2	6	647640	647645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504148
11100	NC_019842	TCT	2	6	647699	647704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504148
11101	NC_019842	GGC	2	6	647724	647729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504148
11102	NC_019842	CGA	2	6	647740	647745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504148
11103	NC_019842	GAA	2	6	647842	647847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504148
11104	NC_019842	ACAAA	2	10	647853	647862	80 %	0 %	0 %	20 %	429504148
11105	NC_019842	A	7	7	647896	647902	100 %	0 %	0 %	0 %	429504149
11106	NC_019842	ATG	2	6	647956	647961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504149
11107	NC_019842	CGC	2	6	647967	647972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429504149
11108	NC_019842	GTC	2	6	647998	648003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504149
11109	NC_019842	CAT	2	6	648105	648110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504149
11110	NC_019842	GCT	3	9	648189	648197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504149
11111	NC_019842	A	7	7	648221	648227	100 %	0 %	0 %	0 %	429504149
11112	NC_019842	CAG	2	6	648239	648244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504149
11113	NC_019842	CGG	2	6	648320	648325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504149
11114	NC_019842	CGG	2	6	648342	648347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504149
11115	NC_019842	GAA	2	6	648379	648384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504149
11116	NC_019842	GACA	2	8	648386	648393	50 %	0 %	25 %	25 %	429504149
11117	NC_019842	GCT	2	6	648514	648519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504149
11118	NC_019842	ATA	2	6	648536	648541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429504149
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11120	NC_019842	TCT	2	6	648807	648812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429504149
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11223	NC_019842	A	6	6	653912	653917	100 %	0 %	0 %	0 %	429504154
11224	NC_019842	GGC	2	6	653951	653956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504154
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11227	NC_019842	TCG	2	6	654063	654068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504154
11228	NC_019842	A	6	6	654077	654082	100 %	0 %	0 %	0 %	429504154
11229	NC_019842	GCG	2	6	654092	654097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504154
11230	NC_019842	GCGGCT	2	12	654104	654115	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	429504154
11231	NC_019842	GGAC	2	8	654172	654179	25 %	0 %	50 %	25 %	429504154
11232	NC_019842	GC	3	6	654214	654219	0 %	0 %	50 %	50 %	429504154
11233	NC_019842	TGCT	2	8	654239	654246	0 %	50 %	25 %	25 %	429504154
11234	NC_019842	TGAA	2	8	654260	654267	50 %	25 %	25 %	0 %	429504154
11235	NC_019842	GT	3	6	654275	654280	0 %	50 %	50 %	0 %	429504155
11236	NC_019842	GAA	2	6	654298	654303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429504155
11237	NC_019842	TTA	2	6	654416	654421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504155
11238	NC_019842	CGTT	2	8	654480	654487	0 %	50 %	25 %	25 %	429504155
11239	NC_019842	AGGCGG	2	12	654498	654509	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	429504155
11240	NC_019842	AAC	2	6	654547	654552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429504155
11241	NC_019842	CA	3	6	654594	654599	50 %	0 %	0 %	50 %	429504155
11242	NC_019842	AGC	3	9	654605	654613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504155
11243	NC_019842	TCC	2	6	654643	654648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429504155
11244	NC_019842	ATCAA	2	10	654704	654713	60 %	20 %	0 %	20 %	429504155
11245	NC_019842	CTAT	2	8	654721	654728	25 %	50 %	0 %	25 %	429504155
11246	NC_019842	ATG	2	6	654820	654825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504155
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11252	NC_019842	GTC	2	6	655096	655101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504155
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11303	NC_019842	TCA	2	6	657811	657816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504158
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11343	NC_019842	CGG	2	6	660032	660037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429504159
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11480	NC_019842	GAC	2	6	666416	666421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504167
11481	NC_019842	GCT	2	6	666431	666436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504167
11482	NC_019842	GGCG	2	8	666443	666450	0 %	0 %	75 %	25 %	429504167
11483	NC_019842	AGC	2	6	666554	666559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504167
11484	NC_019842	TGCG	2	8	666639	666646	0 %	25 %	50 %	25 %	429504167
11485	NC_019842	TTA	2	6	666724	666729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504167
11486	NC_019842	CAG	2	6	666797	666802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504167
11487	NC_019842	A	6	6	666806	666811	100 %	0 %	0 %	0 %	429504167
11488	NC_019842	CGGC	2	8	666844	666851	0 %	0 %	50 %	50 %	429504167
11489	NC_019842	CTA	2	6	666854	666859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429504167
11490	NC_019842	A	6	6	666897	666902	100 %	0 %	0 %	0 %	429504167
11491	NC_019842	CTG	2	6	666903	666908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504167
11492	NC_019842	TGA	2	6	666929	666934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429504167
11493	NC_019842	GAC	2	6	666944	666949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504167
11494	NC_019842	AGC	2	6	667063	667068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429504167
11495	NC_019842	CGT	2	6	667094	667099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429504167
11496	NC_019842	TCCTT	2	10	667153	667162	0 %	60 %	0 %	40 %	429504167
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11500	NC_019842	TTA	2	6	667319	667324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429504167

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