MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 73099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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73002	NC_019842	TGA	2	6	3956402	3956407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429507387
73003	NC_019842	GAT	2	6	3956518	3956523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429507387
73004	NC_019842	CAGC	2	8	3956551	3956558	25 %	0 %	25 %	50 %	429507387
73005	NC_019842	GC	3	6	3956603	3956608	0 %	0 %	50 %	50 %	429507387
73006	NC_019842	GAG	2	6	3956670	3956675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429507387
73007	NC_019842	CTC	2	6	3956713	3956718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429507387
73008	NC_019842	GAA	2	6	3956916	3956921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429507387
73009	NC_019842	T	6	6	3956937	3956942	0 %	100 %	0 %	0 %	429507387
73010	NC_019842	CCG	2	6	3957077	3957082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429507387
73011	NC_019842	GAC	2	6	3957100	3957105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429507387
73012	NC_019842	GCC	2	6	3957121	3957126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429507387
73013	NC_019842	GC	3	6	3957199	3957204	0 %	0 %	50 %	50 %	429507387
73014	NC_019842	CGT	2	6	3957255	3957260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429507387
73015	NC_019842	TTTA	2	8	3957298	3957305	25 %	75 %	0 %	0 %	429507388
73016	NC_019842	GAT	2	6	3957362	3957367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429507388
73017	NC_019842	CAG	2	6	3957374	3957379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429507388
73018	NC_019842	CAT	2	6	3957448	3957453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429507388
73019	NC_019842	GCTT	2	8	3957459	3957466	0 %	50 %	25 %	25 %	429507388
73020	NC_019842	CTT	3	9	3957580	3957588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429507388
73021	NC_019842	GAC	2	6	3957605	3957610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429507388
73022	NC_019842	GGCC	2	8	3957612	3957619	0 %	0 %	50 %	50 %	429507388
73023	NC_019842	AATGAC	2	12	3957680	3957691	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	429507388
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73025	NC_019842	CTTC	2	8	3957778	3957785	0 %	50 %	0 %	50 %	429507388
73026	NC_019842	CGA	2	6	3957820	3957825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429507388
73027	NC_019842	TCT	2	6	3957828	3957833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429507388
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73030	NC_019842	CGT	2	6	3957911	3957916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429507388
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73032	NC_019842	GAT	2	6	3957998	3958003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429507388
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73034	NC_019842	TTTC	2	8	3958066	3958073	0 %	75 %	0 %	25 %	429507388
73035	NC_019842	CGC	2	6	3958078	3958083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429507388
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73040	NC_019842	CGG	2	6	3958194	3958199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429507388
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73042	NC_019842	GC	3	6	3958323	3958328	0 %	0 %	50 %	50 %	429507388
73043	NC_019842	AAGC	2	8	3958372	3958379	50 %	0 %	25 %	25 %	429507388
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73046	NC_019842	AATG	2	8	3958525	3958532	50 %	25 %	25 %	0 %	429507388
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73050	NC_019842	TTTC	2	8	3959086	3959093	0 %	75 %	0 %	25 %	429507389
73051	NC_019842	T	6	6	3959124	3959129	0 %	100 %	0 %	0 %	429507389
73052	NC_019842	CTTG	2	8	3959141	3959148	0 %	50 %	25 %	25 %	429507389
73053	NC_019842	TCT	2	6	3959181	3959186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429507389
73054	NC_019842	CCG	2	6	3959190	3959195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429507389
73055	NC_019842	AGC	2	6	3959305	3959310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429507389
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73082	NC_019842	TACG	2	8	3960233	3960240	25 %	25 %	25 %	25 %	429507390
73083	NC_019842	ACA	2	6	3960264	3960269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429507390
73084	NC_019842	CAG	2	6	3960332	3960337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429507390
73085	NC_019842	AGT	2	6	3960360	3960365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429507390
73086	NC_019842	TA	3	6	3960536	3960541	50 %	50 %	0 %	0 %	429507391
73087	NC_019842	TGC	2	6	3960562	3960567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429507391
73088	NC_019842	TTC	2	6	3960582	3960587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429507391
73089	NC_019842	CGG	2	6	3960602	3960607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429507391
73090	NC_019842	ATA	3	9	3960619	3960627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429507391
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73093	NC_019842	ACG	2	6	3960700	3960705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429507391
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73095	NC_019842	CTT	2	6	3960858	3960863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429507391
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73097	NC_019842	GCG	2	6	3961047	3961052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429507392
73098	NC_019842	GAC	2	6	3961070	3961075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429507392
73099	NC_019842	T	6	6	3961078	3961083	0 %	100 %	0 %	0 %	429507392

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.