MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 73099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_019842	G	6	6	3009485	3009490	0 %	0 %	100 %	0 %	429506418
55002	NC_019842	CCT	2	6	3009575	3009580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429506418
55003	NC_019842	GGC	2	6	3009628	3009633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506418
55004	NC_019842	GCA	2	6	3009677	3009682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506418
55005	NC_019842	GCT	2	6	3009784	3009789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506418
55006	NC_019842	ATGG	2	8	3009834	3009841	25 %	25 %	50 %	0 %	429506418
55007	NC_019842	GGAT	2	8	3009996	3010003	25 %	25 %	50 %	0 %	429506419
55008	NC_019842	TGC	2	6	3010006	3010011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506419
55009	NC_019842	TG	3	6	3010027	3010032	0 %	50 %	50 %	0 %	429506419
55010	NC_019842	TAA	2	6	3010214	3010219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429506419
55011	NC_019842	AAC	2	6	3010237	3010242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429506419
55012	NC_019842	GCC	2	6	3010314	3010319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506419
55013	NC_019842	CAG	2	6	3010368	3010373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506419
55014	NC_019842	A	6	6	3010455	3010460	100 %	0 %	0 %	0 %	429506419
55015	NC_019842	ATTT	2	8	3010500	3010507	25 %	75 %	0 %	0 %	429506419
55016	NC_019842	TAA	2	6	3010508	3010513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429506419
55017	NC_019842	CGG	2	6	3010534	3010539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506419
55018	NC_019842	TC	3	6	3010569	3010574	0 %	50 %	0 %	50 %	429506419
55019	NC_019842	TAA	2	6	3010610	3010615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429506419
55020	NC_019842	A	6	6	3010656	3010661	100 %	0 %	0 %	0 %	429506419
55021	NC_019842	A	7	7	3010688	3010694	100 %	0 %	0 %	0 %	429506419
55022	NC_019842	A	6	6	3010722	3010727	100 %	0 %	0 %	0 %	429506419
55023	NC_019842	GAAAAG	2	12	3010731	3010742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429506419
55024	NC_019842	A	6	6	3010762	3010767	100 %	0 %	0 %	0 %	429506419
55025	NC_019842	AAAT	2	8	3010769	3010776	75 %	25 %	0 %	0 %	429506419
55026	NC_019842	ATG	2	6	3010801	3010806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506419
55027	NC_019842	CA	3	6	3010811	3010816	50 %	0 %	0 %	50 %	429506419
55028	NC_019842	TCA	2	6	3010824	3010829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506419
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55030	NC_019842	CAGA	2	8	3010900	3010907	50 %	0 %	25 %	25 %	429506419
55031	NC_019842	ATC	2	6	3011038	3011043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506419
55032	NC_019842	ACAG	2	8	3011119	3011126	50 %	0 %	25 %	25 %	429506419
55033	NC_019842	GCT	2	6	3011147	3011152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506419
55034	NC_019842	CA	3	6	3011191	3011196	50 %	0 %	0 %	50 %	429506419
55035	NC_019842	GCAA	2	8	3011208	3011215	50 %	0 %	25 %	25 %	429506419
55036	NC_019842	GTACG	2	10	3011261	3011270	20 %	20 %	40 %	20 %	429506419
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55041	NC_019842	ATG	2	6	3011610	3011615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506419
55042	NC_019842	CGT	2	6	3011621	3011626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506419
55043	NC_019842	GAAA	2	8	3011641	3011648	75 %	0 %	25 %	0 %	429506419
55044	NC_019842	CGG	2	6	3011672	3011677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506419
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55047	NC_019842	TTA	2	6	3011840	3011845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429506419
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55050	NC_019842	GCG	2	6	3011929	3011934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506420
55051	NC_019842	TCA	2	6	3011944	3011949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506420
55052	NC_019842	CCGG	2	8	3011961	3011968	0 %	0 %	50 %	50 %	429506420
55053	NC_019842	CAT	2	6	3011983	3011988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506420
55054	NC_019842	A	6	6	3012084	3012089	100 %	0 %	0 %	0 %	429506420
55055	NC_019842	GGC	2	6	3012133	3012138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506420
55056	NC_019842	T	7	7	3012148	3012154	0 %	100 %	0 %	0 %	429506420
55057	NC_019842	GCCCC	2	10	3012161	3012170	0 %	0 %	20 %	80 %	429506420
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55059	NC_019842	CTCCC	2	10	3012243	3012252	0 %	20 %	0 %	80 %	429506420
55060	NC_019842	TAT	2	6	3012321	3012326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429506421
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55062	NC_019842	CGC	2	6	3012481	3012486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506421
55063	NC_019842	TCC	2	6	3012526	3012531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429506421
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55065	NC_019842	A	6	6	3012648	3012653	100 %	0 %	0 %	0 %	429506421
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55068	NC_019842	GTC	2	6	3013078	3013083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506422
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55072	NC_019842	CG	3	6	3013203	3013208	0 %	0 %	50 %	50 %	429506422
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55084	NC_019842	CG	3	6	3013713	3013718	0 %	0 %	50 %	50 %	429506422
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55089	NC_019842	TCT	2	6	3014193	3014198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506422
55090	NC_019842	GTC	2	6	3014281	3014286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506422
55091	NC_019842	A	8	8	3014356	3014363	100 %	0 %	0 %	0 %	429506422
55092	NC_019842	CAG	2	6	3014515	3014520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506422
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55100	NC_019842	GAGC	2	8	3014749	3014756	25 %	0 %	50 %	25 %	429506423
55101	NC_019842	CTT	2	6	3014774	3014779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506423
55102	NC_019842	A	6	6	3014797	3014802	100 %	0 %	0 %	0 %	429506423
55103	NC_019842	CAAA	2	8	3014830	3014837	75 %	0 %	0 %	25 %	429506423
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55105	NC_019842	A	7	7	3014891	3014897	100 %	0 %	0 %	0 %	429506423
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55108	NC_019842	ATCA	2	8	3014994	3015001	50 %	25 %	0 %	25 %	429506423
55109	NC_019842	CA	3	6	3015000	3015005	50 %	0 %	0 %	50 %	429506423
55110	NC_019842	AGAA	2	8	3015018	3015025	75 %	0 %	25 %	0 %	429506423
55111	NC_019842	AGAA	2	8	3015048	3015055	75 %	0 %	25 %	0 %	429506423
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55113	NC_019842	ATATC	2	10	3015280	3015289	40 %	40 %	0 %	20 %	429506423
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55117	NC_019842	TA	3	6	3015415	3015420	50 %	50 %	0 %	0 %	429506424
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55119	NC_019842	A	6	6	3015733	3015738	100 %	0 %	0 %	0 %	429506425
55120	NC_019842	ATGGCG	2	12	3015751	3015762	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429506425
55121	NC_019842	CGG	2	6	3015770	3015775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506425
55122	NC_019842	GCA	2	6	3015827	3015832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506425
55123	NC_019842	CGG	2	6	3015864	3015869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506425
55124	NC_019842	TCAA	2	8	3015969	3015976	50 %	25 %	0 %	25 %	429506425
55125	NC_019842	TAAA	2	8	3016004	3016011	75 %	25 %	0 %	0 %	429506425
55126	NC_019842	A	6	6	3016129	3016134	100 %	0 %	0 %	0 %	429506425
55127	NC_019842	A	6	6	3016258	3016263	100 %	0 %	0 %	0 %	429506425
55128	NC_019842	GCGG	2	8	3016330	3016337	0 %	0 %	75 %	25 %	429506425
55129	NC_019842	CGGC	2	8	3016412	3016419	0 %	0 %	50 %	50 %	429506425
55130	NC_019842	AACGGG	2	12	3016422	3016433	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	429506425
55131	NC_019842	A	6	6	3016459	3016464	100 %	0 %	0 %	0 %	429506425
55132	NC_019842	GTCAA	2	10	3016523	3016532	40 %	20 %	20 %	20 %	429506425
55133	NC_019842	A	6	6	3016570	3016575	100 %	0 %	0 %	0 %	429506425
55134	NC_019842	A	6	6	3016603	3016608	100 %	0 %	0 %	0 %	429506425
55135	NC_019842	GGC	2	6	3016630	3016635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506425
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55139	NC_019842	CGGA	2	8	3016745	3016752	25 %	0 %	50 %	25 %	429506425
55140	NC_019842	TCG	2	6	3016994	3016999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506426
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55142	NC_019842	A	6	6	3017026	3017031	100 %	0 %	0 %	0 %	429506426
55143	NC_019842	GACA	2	8	3017281	3017288	50 %	0 %	25 %	25 %	429506426
55144	NC_019842	GC	3	6	3017289	3017294	0 %	0 %	50 %	50 %	429506426
55145	NC_019842	GCA	2	6	3017379	3017384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506426
55146	NC_019842	GCGG	2	8	3017385	3017392	0 %	0 %	75 %	25 %	429506426
55147	NC_019842	TCA	2	6	3017528	3017533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506426
55148	NC_019842	CAT	2	6	3017577	3017582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506426
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55151	NC_019842	ACTTTC	2	12	3017712	3017723	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	429506426
55152	NC_019842	CG	4	8	3017742	3017749	0 %	0 %	50 %	50 %	429506426
55153	NC_019842	TCAG	2	8	3017779	3017786	25 %	25 %	25 %	25 %	429506426
55154	NC_019842	TCG	2	6	3017798	3017803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506426
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55233	NC_019842	CTG	2	6	3021529	3021534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506430
55234	NC_019842	TGA	2	6	3021539	3021544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506430
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55237	NC_019842	GCC	2	6	3021943	3021948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506430
55238	NC_019842	CGG	2	6	3021980	3021985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506430
55239	NC_019842	TTAA	2	8	3022009	3022016	50 %	50 %	0 %	0 %	429506430
55240	NC_019842	TTTA	2	8	3022038	3022045	25 %	75 %	0 %	0 %	429506430
55241	NC_019842	CGG	2	6	3022098	3022103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506430
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55243	NC_019842	TGC	2	6	3022217	3022222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506430
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55252	NC_019842	A	6	6	3022709	3022714	100 %	0 %	0 %	0 %	429506430
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55300	NC_019842	T	6	6	3024660	3024665	0 %	100 %	0 %	0 %	429506433
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55332	NC_019842	CAT	2	6	3026596	3026601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506436
55333	NC_019842	CTG	2	6	3026609	3026614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506436
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55339	NC_019842	AC	3	6	3026970	3026975	50 %	0 %	0 %	50 %	429506437
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55342	NC_019842	GCTT	2	8	3027295	3027302	0 %	50 %	25 %	25 %	429506438
55343	NC_019842	CT	3	6	3027368	3027373	0 %	50 %	0 %	50 %	429506438
55344	NC_019842	GAA	2	6	3027405	3027410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429506438
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55348	NC_019842	CG	3	6	3027548	3027553	0 %	0 %	50 %	50 %	429506438
55349	NC_019842	TTC	2	6	3027560	3027565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506438
55350	NC_019842	AAT	2	6	3027568	3027573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429506438
55351	NC_019842	AG	3	6	3027610	3027615	50 %	0 %	50 %	0 %	429506438
55352	NC_019842	TCA	2	6	3027660	3027665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506438
55353	NC_019842	GAT	2	6	3027811	3027816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506438
55354	NC_019842	ATCA	2	8	3027818	3027825	50 %	25 %	0 %	25 %	429506438
55355	NC_019842	TCCG	2	8	3027981	3027988	0 %	25 %	25 %	50 %	429506439
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55471	NC_019842	GTA	2	6	3033011	3033016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506445
55472	NC_019842	AATGAA	2	12	3033019	3033030	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	429506445
55473	NC_019842	TGA	2	6	3033049	3033054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506445
55474	NC_019842	A	6	6	3033069	3033074	100 %	0 %	0 %	0 %	429506445
55475	NC_019842	GCC	2	6	3033105	3033110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506445
55476	NC_019842	TAAA	2	8	3033146	3033153	75 %	25 %	0 %	0 %	429506445
55477	NC_019842	T	7	7	3033184	3033190	0 %	100 %	0 %	0 %	429506445
55478	NC_019842	AT	3	6	3033237	3033242	50 %	50 %	0 %	0 %	429506445
55479	NC_019842	TCA	2	6	3033244	3033249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506445
55480	NC_019842	ATC	2	6	3033293	3033298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506445
55481	NC_019842	TTC	2	6	3033321	3033326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506445
55482	NC_019842	ATA	2	6	3033384	3033389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429506445
55483	NC_019842	AGG	2	6	3033406	3033411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429506445
55484	NC_019842	AGC	2	6	3033454	3033459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506445
55485	NC_019842	TCAG	2	8	3033468	3033475	25 %	25 %	25 %	25 %	429506445
55486	NC_019842	TAA	2	6	3033505	3033510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429506445
55487	NC_019842	CGT	2	6	3033518	3033523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506445
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55491	NC_019842	TTCA	2	8	3033639	3033646	25 %	50 %	0 %	25 %	429506445
55492	NC_019842	TCT	2	6	3033769	3033774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506446
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55495	NC_019842	TTC	2	6	3033863	3033868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506446
55496	NC_019842	TCC	2	6	3033891	3033896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429506446
55497	NC_019842	GTG	2	6	3034115	3034120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429506446
55498	NC_019842	TTG	2	6	3034128	3034133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429506446
55499	NC_019842	CT	3	6	3034147	3034152	0 %	50 %	0 %	50 %	429506446
55500	NC_019842	TTC	2	6	3034153	3034158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506446

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