MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum AS43.3 chromosome

Total Repeats: 73099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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53002	NC_019842	CTGATC	2	12	2895690	2895701	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429506306
53003	NC_019842	TGG	2	6	2895966	2895971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429506306
53004	NC_019842	CAG	2	6	2896119	2896124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506306
53005	NC_019842	TTA	2	6	2896243	2896248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429506306
53006	NC_019842	ATC	2	6	2896326	2896331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506306
53007	NC_019842	CCG	2	6	2896348	2896353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506306
53008	NC_019842	CGG	2	6	2896376	2896381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506306
53009	NC_019842	CGC	2	6	2896412	2896417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506306
53010	NC_019842	TGA	2	6	2896444	2896449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506306
53011	NC_019842	AGCG	2	8	2896472	2896479	25 %	0 %	50 %	25 %	429506306
53012	NC_019842	AAG	2	6	2896520	2896525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429506306
53013	NC_019842	A	6	6	2896536	2896541	100 %	0 %	0 %	0 %	429506306
53014	NC_019842	T	6	6	2896579	2896584	0 %	100 %	0 %	0 %	429506307
53015	NC_019842	GCT	2	6	2896621	2896626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506307
53016	NC_019842	GCC	2	6	2896644	2896649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506307
53017	NC_019842	TCA	2	6	2896680	2896685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506307
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53019	NC_019842	TGA	2	6	2897058	2897063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506308
53020	NC_019842	A	7	7	2897118	2897124	100 %	0 %	0 %	0 %	429506308
53021	NC_019842	GAA	2	6	2897127	2897132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429506308
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53024	NC_019842	GAA	3	9	2897236	2897244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429506308
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53031	NC_019842	CGGGAG	2	12	2897521	2897532	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	429506308
53032	NC_019842	TGA	2	6	2897666	2897671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506308
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53034	NC_019842	CG	3	6	2897777	2897782	0 %	0 %	50 %	50 %	429506308
53035	NC_019842	CGG	2	6	2897786	2897791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506308
53036	NC_019842	TGA	2	6	2897811	2897816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506308
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53043	NC_019842	CCA	2	6	2898142	2898147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429506309
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53045	NC_019842	ATG	2	6	2898258	2898263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506309
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53053	NC_019842	GAT	2	6	2898516	2898521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506309
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53055	NC_019842	GCG	2	6	2898556	2898561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506309
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53104	NC_019842	ACTG	2	8	2901130	2901137	25 %	25 %	25 %	25 %	429506312
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53112	NC_019842	A	6	6	2901680	2901685	100 %	0 %	0 %	0 %	429506312
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53117	NC_019842	CAA	2	6	2901919	2901924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429506312
53118	NC_019842	GA	3	6	2901937	2901942	50 %	0 %	50 %	0 %	429506312
53119	NC_019842	CAT	2	6	2901946	2901951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506312
53120	NC_019842	CAA	2	6	2901952	2901957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429506312
53121	NC_019842	ATT	2	6	2902001	2902006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429506312
53122	NC_019842	CGG	2	6	2902039	2902044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506312
53123	NC_019842	AGC	2	6	2902158	2902163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506312
53124	NC_019842	AACA	2	8	2902180	2902187	75 %	0 %	0 %	25 %	429506312
53125	NC_019842	AC	3	6	2902191	2902196	50 %	0 %	0 %	50 %	429506312
53126	NC_019842	A	6	6	2902228	2902233	100 %	0 %	0 %	0 %	429506312
53127	NC_019842	GGC	2	6	2902249	2902254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506312
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53132	NC_019842	T	6	6	2902536	2902541	0 %	100 %	0 %	0 %	429506313
53133	NC_019842	CCG	2	6	2902545	2902550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429506313
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53146	NC_019842	TCCTTG	2	12	2903090	2903101	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	429506314
53147	NC_019842	CATC	2	8	2903109	2903116	25 %	25 %	0 %	50 %	429506314
53148	NC_019842	CTT	2	6	2903175	2903180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506314
53149	NC_019842	CT	3	6	2903185	2903190	0 %	50 %	0 %	50 %	429506314
53150	NC_019842	ATCA	2	8	2903194	2903201	50 %	25 %	0 %	25 %	429506314
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53154	NC_019842	GCT	2	6	2903497	2903502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506315
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53218	NC_019842	AT	3	6	2907065	2907070	50 %	50 %	0 %	0 %	429506317
53219	NC_019842	GCAAA	2	10	2907142	2907151	60 %	0 %	20 %	20 %	429506317
53220	NC_019842	ACCG	2	8	2907155	2907162	25 %	0 %	25 %	50 %	429506317
53221	NC_019842	CAA	2	6	2907164	2907169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429506317
53222	NC_019842	AAGA	2	8	2907181	2907188	75 %	0 %	25 %	0 %	429506317
53223	NC_019842	AGAA	2	8	2907198	2907205	75 %	0 %	25 %	0 %	429506317
53224	NC_019842	A	6	6	2907233	2907238	100 %	0 %	0 %	0 %	429506317
53225	NC_019842	AGAA	2	8	2907333	2907340	75 %	0 %	25 %	0 %	429506317
53226	NC_019842	ACG	2	6	2907377	2907382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506317
53227	NC_019842	TCCGA	2	10	2907400	2907409	20 %	20 %	20 %	40 %	429506317
53228	NC_019842	GAA	2	6	2907449	2907454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429506317
53229	NC_019842	GAT	2	6	2907506	2907511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506317
53230	NC_019842	CAC	2	6	2907581	2907586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429506317
53231	NC_019842	GAAT	2	8	2907648	2907655	50 %	25 %	25 %	0 %	429506317
53232	NC_019842	TTC	2	6	2907673	2907678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506317
53233	NC_019842	GTC	2	6	2907771	2907776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506318
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53331	NC_019842	TGA	3	9	2913106	2913114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506322
53332	NC_019842	TGA	2	6	2913285	2913290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506322
53333	NC_019842	GCT	2	6	2913292	2913297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506322
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53337	NC_019842	TTC	2	6	2913506	2913511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506322
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53339	NC_019842	AAG	2	6	2913641	2913646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429506322
53340	NC_019842	ACA	2	6	2913664	2913669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429506322
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53342	NC_019842	AT	3	6	2913696	2913701	50 %	50 %	0 %	0 %	429506322
53343	NC_019842	CTG	2	6	2913722	2913727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506322
53344	NC_019842	TTTC	2	8	2913753	2913760	0 %	75 %	0 %	25 %	429506322
53345	NC_019842	TCT	2	6	2913790	2913795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506323
53346	NC_019842	T	6	6	2913861	2913866	0 %	100 %	0 %	0 %	429506323
53347	NC_019842	TAT	2	6	2913896	2913901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429506323
53348	NC_019842	TCA	2	6	2913916	2913921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506323
53349	NC_019842	TGA	2	6	2913935	2913940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506323
53350	NC_019842	TTC	2	6	2913942	2913947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506323
53351	NC_019842	ATTTT	2	10	2913958	2913967	20 %	80 %	0 %	0 %	429506323
53352	NC_019842	CAGC	2	8	2913974	2913981	25 %	0 %	25 %	50 %	429506323
53353	NC_019842	TCA	2	6	2914082	2914087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506323
53354	NC_019842	CGG	2	6	2914117	2914122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506323
53355	NC_019842	ATC	2	6	2914179	2914184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506323
53356	NC_019842	GAT	2	6	2914220	2914225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506323
53357	NC_019842	TC	3	6	2914410	2914415	0 %	50 %	0 %	50 %	429506323
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53363	NC_019842	CATCGT	2	12	2914893	2914904	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	429506324
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53373	NC_019842	TTTG	2	8	2915259	2915266	0 %	75 %	25 %	0 %	429506324
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53428	NC_019842	CTG	2	6	2918255	2918260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506327
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53467	NC_019842	GCA	2	6	2919917	2919922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506329
53468	NC_019842	TCCG	2	8	2919948	2919955	0 %	25 %	25 %	50 %	429506329
53469	NC_019842	T	6	6	2920017	2920022	0 %	100 %	0 %	0 %	429506329
53470	NC_019842	TTC	2	6	2920048	2920053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506329
53471	NC_019842	TCA	2	6	2920076	2920081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506329
53472	NC_019842	CAA	2	6	2920133	2920138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429506329
53473	NC_019842	ATG	2	6	2920189	2920194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506329
53474	NC_019842	TAAA	2	8	2920235	2920242	75 %	25 %	0 %	0 %	429506329
53475	NC_019842	GCA	2	6	2920259	2920264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506329
53476	NC_019842	GTT	2	6	2920291	2920296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429506329
53477	NC_019842	AGC	2	6	2920318	2920323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506329
53478	NC_019842	CTT	2	6	2920370	2920375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506329
53479	NC_019842	GA	3	6	2920393	2920398	50 %	0 %	50 %	0 %	429506329
53480	NC_019842	CCT	2	6	2920424	2920429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429506330
53481	NC_019842	GAT	2	6	2920501	2920506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506330
53482	NC_019842	ATC	2	6	2920529	2920534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506330
53483	NC_019842	AT	3	6	2920575	2920580	50 %	50 %	0 %	0 %	429506330
53484	NC_019842	GAAG	2	8	2920691	2920698	50 %	0 %	50 %	0 %	429506330
53485	NC_019842	GAC	2	6	2920866	2920871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429506331
53486	NC_019842	GGC	2	6	2920905	2920910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506331
53487	NC_019842	ATA	2	6	2920912	2920917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	429506331
53488	NC_019842	GCT	2	6	2921219	2921224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429506332
53489	NC_019842	CT	3	6	2921223	2921228	0 %	50 %	0 %	50 %	429506332
53490	NC_019842	ATTC	2	8	2921264	2921271	25 %	50 %	0 %	25 %	429506332
53491	NC_019842	CAT	2	6	2921286	2921291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506332
53492	NC_019842	TCATTA	2	12	2921308	2921319	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	429506332
53493	NC_019842	CTT	2	6	2921380	2921385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429506332
53494	NC_019842	TTG	2	6	2921411	2921416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429506332
53495	NC_019842	ATC	2	6	2921718	2921723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429506333
53496	NC_019842	CGG	2	6	2921767	2921772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506333
53497	NC_019842	GCG	2	6	2921831	2921836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429506333
53498	NC_019842	AT	3	6	2921932	2921937	50 %	50 %	0 %	0 %	429506333
53499	NC_019842	ATG	3	9	2922275	2922283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429506333
53500	NC_019842	TTA	2	6	2922344	2922349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	429506333

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