MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella bronchiseptica 253

Total Repeats: 138120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019382	CGC	2	6	759	764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337339
2	NC_019382	GAT	2	6	789	794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337339
3	NC_019382	ATC	2	6	863	868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337339
4	NC_019382	ATGCGC	2	12	998	1009	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	412337339
5	NC_019382	CGG	2	6	1043	1048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337339
6	NC_019382	CGC	2	6	1102	1107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337339
7	NC_019382	GAAT	2	8	1134	1141	50 %	25 %	25 %	0 %	412337339
8	NC_019382	GCC	2	6	1246	1251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337339
9	NC_019382	CGC	2	6	1272	1277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337339
10	NC_019382	ATT	2	6	1788	1793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	412337340
11	NC_019382	CCA	2	6	1876	1881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337340
12	NC_019382	TGC	2	6	1883	1888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337340
13	NC_019382	GC	3	6	1896	1901	0 %	0 %	50 %	50 %	412337340
14	NC_019382	GCC	2	6	1945	1950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337340
15	NC_019382	CGG	2	6	1994	1999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337340
16	NC_019382	GCC	2	6	2008	2013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337340
17	NC_019382	GCC	2	6	2058	2063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337340
18	NC_019382	CAG	2	6	2070	2075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337340
19	NC_019382	GTCC	2	8	2172	2179	0 %	25 %	25 %	50 %	412337341
20	NC_019382	AACGC	2	10	2218	2227	40 %	0 %	20 %	40 %	412337341
21	NC_019382	AGC	2	6	2228	2233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337341
22	NC_019382	CTG	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337341
23	NC_019382	GCCA	2	8	2333	2340	25 %	0 %	25 %	50 %	412337341
24	NC_019382	CAG	2	6	2353	2358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337341
25	NC_019382	CG	3	6	2378	2383	0 %	0 %	50 %	50 %	412337341
26	NC_019382	TGT	2	6	2409	2414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337341
27	NC_019382	CGGGT	2	10	2435	2444	0 %	20 %	60 %	20 %	412337341
28	NC_019382	CGG	2	6	2553	2558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337341
29	NC_019382	GGCC	2	8	2570	2577	0 %	0 %	50 %	50 %	412337341
30	NC_019382	GCG	2	6	2582	2587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337341
31	NC_019382	AGC	2	6	2660	2665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337341
32	NC_019382	CGTT	2	8	2667	2674	0 %	50 %	25 %	25 %	412337341
33	NC_019382	AAG	2	6	2683	2688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337341
34	NC_019382	CCG	2	6	2744	2749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337341
35	NC_019382	GCA	2	6	2757	2762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337341
36	NC_019382	GGC	2	6	2766	2771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337341
37	NC_019382	GCT	2	6	2890	2895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337342
38	NC_019382	CCA	2	6	2984	2989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337342
39	NC_019382	CGG	2	6	3150	3155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337343
40	NC_019382	CGG	2	6	3176	3181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337343
41	NC_019382	GC	3	6	3191	3196	0 %	0 %	50 %	50 %	412337343
42	NC_019382	TCG	2	6	3200	3205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337343
43	NC_019382	CAG	2	6	3274	3279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337343
44	NC_019382	TTTCGG	2	12	3282	3293	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	412337343
45	NC_019382	CTGA	2	8	3454	3461	25 %	25 %	25 %	25 %	412337344
46	NC_019382	CG	4	8	3470	3477	0 %	0 %	50 %	50 %	412337344
47	NC_019382	GAC	2	6	3502	3507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337344
48	NC_019382	CTTT	2	8	3522	3529	0 %	75 %	0 %	25 %	412337344
49	NC_019382	TGG	2	6	3587	3592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337344
50	NC_019382	GC	3	6	3656	3661	0 %	0 %	50 %	50 %	412337344
51	NC_019382	GC	4	8	3728	3735	0 %	0 %	50 %	50 %	412337345
52	NC_019382	CGGA	2	8	3757	3764	25 %	0 %	50 %	25 %	412337345
53	NC_019382	CGC	2	6	3775	3780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337345
54	NC_019382	CG	3	6	3842	3847	0 %	0 %	50 %	50 %	412337345
55	NC_019382	GGT	2	6	3908	3913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337345
56	NC_019382	GGC	2	6	3944	3949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337345
57	NC_019382	TGA	2	6	4101	4106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337345
58	NC_019382	GC	3	6	4138	4143	0 %	0 %	50 %	50 %	412337346
59	NC_019382	GCT	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337346
60	NC_019382	AAG	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337346
61	NC_019382	CTG	2	6	4244	4249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337346
62	NC_019382	AC	3	6	4293	4298	50 %	0 %	0 %	50 %	412337346
63	NC_019382	CAT	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337346
64	NC_019382	CGG	2	6	4454	4459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337346
65	NC_019382	GCC	2	6	4460	4465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337346
66	NC_019382	CTCG	2	8	4555	4562	0 %	25 %	25 %	50 %	412337347
67	NC_019382	GC	3	6	4593	4598	0 %	0 %	50 %	50 %	412337347
68	NC_019382	GC	4	8	4612	4619	0 %	0 %	50 %	50 %	412337347
69	NC_019382	CG	3	6	4633	4638	0 %	0 %	50 %	50 %	412337347
70	NC_019382	GAA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	412337347
71	NC_019382	TGC	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337347
72	NC_019382	GCCC	2	8	4752	4759	0 %	0 %	25 %	75 %	412337347
73	NC_019382	AGGGCA	2	12	4769	4780	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	412337347
74	NC_019382	GC	3	6	4872	4877	0 %	0 %	50 %	50 %	412337347
75	NC_019382	GGTG	2	8	4901	4908	0 %	25 %	75 %	0 %	412337347
76	NC_019382	GC	3	6	4914	4919	0 %	0 %	50 %	50 %	412337347
77	NC_019382	CGC	2	6	5398	5403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337348
78	NC_019382	GGT	3	9	5428	5436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337348
79	NC_019382	CA	3	6	5459	5464	50 %	0 %	0 %	50 %	412337348
80	NC_019382	CAA	2	6	5492	5497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337348
81	NC_019382	GCA	2	6	5503	5508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337348
82	NC_019382	GTA	2	6	5520	5525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337348
83	NC_019382	ACC	2	6	5552	5557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337348
84	NC_019382	GGT	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337348
85	NC_019382	GCA	2	6	5602	5607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337348
86	NC_019382	AAC	2	6	5618	5623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337348
87	NC_019382	AAC	2	6	5628	5633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337348
88	NC_019382	AAC	2	6	5640	5645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337348
89	NC_019382	AAC	2	6	5650	5655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	412337348
90	NC_019382	CG	3	6	5794	5799	0 %	0 %	50 %	50 %	412337348
91	NC_019382	CAG	2	6	5801	5806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337348
92	NC_019382	GAC	2	6	5849	5854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337348
93	NC_019382	C	6	6	5896	5901	0 %	0 %	0 %	100 %	412337348
94	NC_019382	CGC	2	6	5951	5956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337348
95	NC_019382	GGC	2	6	5987	5992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337348
96	NC_019382	GCT	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337349
97	NC_019382	GCC	2	6	6096	6101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
98	NC_019382	CCG	2	6	6205	6210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
99	NC_019382	GCT	2	6	6231	6236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337349
100	NC_019382	GGCAC	2	10	6239	6248	20 %	0 %	40 %	40 %	412337349
101	NC_019382	CG	3	6	6299	6304	0 %	0 %	50 %	50 %	412337349
102	NC_019382	GGT	2	6	6318	6323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337349
103	NC_019382	CGA	2	6	6381	6386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337349
104	NC_019382	GC	3	6	6392	6397	0 %	0 %	50 %	50 %	412337349
105	NC_019382	TGG	2	6	6428	6433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337349
106	NC_019382	GGCA	2	8	6467	6474	25 %	0 %	50 %	25 %	412337349
107	NC_019382	CCG	2	6	6495	6500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
108	NC_019382	CCG	3	9	6515	6523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
109	NC_019382	CGGC	2	8	6527	6534	0 %	0 %	50 %	50 %	412337349
110	NC_019382	CGC	2	6	6555	6560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
111	NC_019382	GCT	2	6	6561	6566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337349
112	NC_019382	GCC	3	9	6567	6575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
113	NC_019382	GGT	2	6	6586	6591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337349
114	NC_019382	CGC	2	6	6609	6614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
115	NC_019382	CG	3	6	6624	6629	0 %	0 %	50 %	50 %	412337349
116	NC_019382	GC	3	6	6650	6655	0 %	0 %	50 %	50 %	412337349
117	NC_019382	CGC	3	9	6673	6681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337349
118	NC_019382	GGCC	2	8	6693	6700	0 %	0 %	50 %	50 %	412337349
119	NC_019382	CGG	2	6	6740	6745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337349
120	NC_019382	CCAGCA	2	12	6756	6767	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	412337349
121	NC_019382	AGC	2	6	6783	6788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337349
122	NC_019382	GCC	2	6	6804	6809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337350
123	NC_019382	GGC	2	6	6813	6818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337350
124	NC_019382	GCT	2	6	6856	6861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337350
125	NC_019382	GGC	2	6	6894	6899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337350
126	NC_019382	GCC	2	6	6913	6918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337350
127	NC_019382	GC	3	6	6928	6933	0 %	0 %	50 %	50 %	412337350
128	NC_019382	CGA	2	6	6947	6952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337350
129	NC_019382	GC	3	6	6958	6963	0 %	0 %	50 %	50 %	412337350
130	NC_019382	CTGG	2	8	7001	7008	0 %	25 %	50 %	25 %	412337350
131	NC_019382	CTG	2	6	7080	7085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337350
132	NC_019382	GCG	2	6	7105	7110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337350
133	NC_019382	ACC	2	6	7120	7125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337350
134	NC_019382	CGA	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337350
135	NC_019382	GCC	2	6	7162	7167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337350
136	NC_019382	CAC	2	6	7211	7216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337350
137	NC_019382	CTGG	2	8	7217	7224	0 %	25 %	50 %	25 %	412337350
138	NC_019382	GC	3	6	7408	7413	0 %	0 %	50 %	50 %	412337351
139	NC_019382	GTG	2	6	7464	7469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337351
140	NC_019382	ATCCG	2	10	7513	7522	20 %	20 %	20 %	40 %	412337351
141	NC_019382	CGC	2	6	7582	7587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337351
142	NC_019382	CAC	2	6	7600	7605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337351
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144	NC_019382	GC	3	6	7750	7755	0 %	0 %	50 %	50 %	412337351
145	NC_019382	GCCAG	2	10	7765	7774	20 %	0 %	40 %	40 %	412337351
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150	NC_019382	GAC	2	6	8009	8014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337351
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162	NC_019382	GCCG	2	8	8476	8483	0 %	0 %	50 %	50 %	412337353
163	NC_019382	GGGCA	2	10	8533	8542	20 %	0 %	60 %	20 %	412337353
164	NC_019382	GGGGA	2	10	8551	8560	20 %	0 %	80 %	0 %	412337353
165	NC_019382	GCGT	2	8	8566	8573	0 %	25 %	50 %	25 %	412337353
166	NC_019382	CGA	2	6	8579	8584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337353
167	NC_019382	TGC	2	6	8635	8640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337353
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169	NC_019382	CG	3	6	8722	8727	0 %	0 %	50 %	50 %	412337353
170	NC_019382	ACG	3	9	8731	8739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337353
171	NC_019382	GCGG	2	8	8747	8754	0 %	0 %	75 %	25 %	412337353
172	NC_019382	TTG	2	6	8773	8778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337353
173	NC_019382	GTT	2	6	8790	8795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	412337353
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176	NC_019382	CGC	2	6	9267	9272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337354
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178	NC_019382	A	6	6	9309	9314	100 %	0 %	0 %	0 %	412337354
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240	NC_019382	CAT	2	6	12095	12100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337356
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244	NC_019382	ATT	2	6	12268	12273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	412337357
245	NC_019382	GCCA	2	8	12336	12343	25 %	0 %	25 %	50 %	412337357
246	NC_019382	GC	3	6	12358	12363	0 %	0 %	50 %	50 %	412337357
247	NC_019382	GCG	2	6	12422	12427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337357
248	NC_019382	CAC	2	6	12510	12515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	412337357
249	NC_019382	ATGG	2	8	12588	12595	25 %	25 %	50 %	0 %	412337357
250	NC_019382	GC	3	6	12612	12617	0 %	0 %	50 %	50 %	412337357
251	NC_019382	CAG	2	6	12670	12675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337357
252	NC_019382	GTG	2	6	12676	12681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337357
253	NC_019382	CTG	2	6	12724	12729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337357
254	NC_019382	CGAC	2	8	12735	12742	25 %	0 %	25 %	50 %	412337357
255	NC_019382	GTG	2	6	12757	12762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337357
256	NC_019382	CGGC	2	8	12782	12789	0 %	0 %	50 %	50 %	412337357
257	NC_019382	ACG	2	6	12818	12823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337357
258	NC_019382	CAT	2	6	12825	12830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337357
259	NC_019382	GC	3	6	12833	12838	0 %	0 %	50 %	50 %	412337357
260	NC_019382	CCAG	2	8	12869	12876	25 %	0 %	25 %	50 %	412337357
261	NC_019382	GCG	2	6	13039	13044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337357
262	NC_019382	GC	4	8	13061	13068	0 %	0 %	50 %	50 %	412337357
263	NC_019382	GCAG	2	8	13118	13125	25 %	0 %	50 %	25 %	412337357
264	NC_019382	CGC	2	6	13128	13133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	412337357
265	NC_019382	GC	3	6	13166	13171	0 %	0 %	50 %	50 %	412337357
266	NC_019382	G	8	8	13182	13189	0 %	0 %	100 %	0 %	412337357
267	NC_019382	TGC	2	6	13257	13262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337357
268	NC_019382	CGG	2	6	13330	13335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337358
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271	NC_019382	GC	3	6	13495	13500	0 %	0 %	50 %	50 %	412337358
272	NC_019382	CGT	2	6	13523	13528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337358
273	NC_019382	GGCGAA	2	12	13775	13786	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	412337359
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286	NC_019382	CGGC	2	8	14409	14416	0 %	0 %	50 %	50 %	412337360
287	NC_019382	TCC	2	6	14430	14435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	412337360
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299	NC_019382	TGG	2	6	14997	15002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337360
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378	NC_019382	ACG	2	6	18630	18635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337368
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382	NC_019382	GGGA	2	8	18766	18773	25 %	0 %	75 %	0 %	412337369
383	NC_019382	CAT	2	6	18781	18786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	412337369
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385	NC_019382	GAT	2	6	18961	18966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337369
386	NC_019382	CGA	2	6	19000	19005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	412337369
387	NC_019382	A	6	6	19093	19098	100 %	0 %	0 %	0 %	412337369
388	NC_019382	GGT	2	6	19227	19232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	412337370
389	NC_019382	GC	3	6	19295	19300	0 %	0 %	50 %	50 %	412337370
390	NC_019382	GAT	2	6	19392	19397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337370
391	NC_019382	TGA	2	6	19441	19446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	412337371
392	NC_019382	CTG	2	6	19497	19502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337371
393	NC_019382	CGG	2	6	19563	19568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337371
394	NC_019382	GGC	2	6	19573	19578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337371
395	NC_019382	GGC	2	6	19606	19611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337371
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409	NC_019382	GCTG	2	8	20215	20222	0 %	25 %	50 %	25 %	412337371
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476	NC_019382	CG	3	6	23921	23926	0 %	0 %	50 %	50 %	412337374
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478	NC_019382	CG	3	6	23996	24001	0 %	0 %	50 %	50 %	412337374
479	NC_019382	CG	3	6	24101	24106	0 %	0 %	50 %	50 %	412337374
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482	NC_019382	TCG	2	6	25160	25165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	412337375
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500	NC_019382	GCG	2	6	26297	26302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	412337376

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