MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_6p

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018883	ATT	2	6	210	215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403583
2	NC_018883	TTG	2	6	239	244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403583
3	NC_018883	A	6	6	252	257	100 %	0 %	0 %	0 %	514403583
4	NC_018883	GTA	2	6	344	349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403583
5	NC_018883	CATT	2	8	371	378	25 %	50 %	0 %	25 %	514403583
6	NC_018883	AGA	2	6	520	525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403583
7	NC_018883	ACA	2	6	577	582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403583
8	NC_018883	A	6	6	644	649	100 %	0 %	0 %	0 %	514403583
9	NC_018883	AGT	2	6	739	744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403583
10	NC_018883	ACA	2	6	763	768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403583
11	NC_018883	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	514403583
12	NC_018883	CAA	2	6	818	823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403583
13	NC_018883	A	7	7	839	845	100 %	0 %	0 %	0 %	514403583
14	NC_018883	AAAAG	2	10	847	856	80 %	0 %	20 %	0 %	514403583
15	NC_018883	GAA	2	6	923	928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403583
16	NC_018883	AAC	2	6	943	948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403583
17	NC_018883	A	7	7	980	986	100 %	0 %	0 %	0 %	514403583
18	NC_018883	GA	3	6	1018	1023	50 %	0 %	50 %	0 %	514403583
19	NC_018883	TTA	2	6	1050	1055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403583
20	NC_018883	A	6	6	1080	1085	100 %	0 %	0 %	0 %	514403583
21	NC_018883	ACAA	2	8	1104	1111	75 %	0 %	0 %	25 %	514403583
22	NC_018883	ACAA	2	8	1188	1195	75 %	0 %	0 %	25 %	514403583
23	NC_018883	A	6	6	1274	1279	100 %	0 %	0 %	0 %	514403583
24	NC_018883	TTA	2	6	1314	1319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403583
25	NC_018883	ATT	2	6	2293	2298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403584
26	NC_018883	ATGAAA	2	12	2328	2339	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514403584
27	NC_018883	A	6	6	2337	2342	100 %	0 %	0 %	0 %	514403584
28	NC_018883	TAT	2	6	2371	2376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403584
29	NC_018883	GTT	2	6	2394	2399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403584
30	NC_018883	AGA	2	6	2408	2413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403584
31	NC_018883	ACA	2	6	2451	2456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403584
32	NC_018883	A	7	7	2456	2462	100 %	0 %	0 %	0 %	514403584
33	NC_018883	ATT	2	6	2520	2525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403584
34	NC_018883	AT	3	6	2549	2554	50 %	50 %	0 %	0 %	514403584
35	NC_018883	AATTAG	2	12	2575	2586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514403584
36	NC_018883	ATA	2	6	2698	2703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403584
37	NC_018883	AAT	2	6	2739	2744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403584
38	NC_018883	TGG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514403584
39	NC_018883	CAA	2	6	2838	2843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403584
40	NC_018883	AAT	2	6	2850	2855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403584
41	NC_018883	ATT	2	6	2903	2908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403584
42	NC_018883	CAG	2	6	2926	2931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514403584
43	NC_018883	CAG	2	6	2941	2946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	514403584
44	NC_018883	CA	3	6	3000	3005	50 %	0 %	0 %	50 %	514403584
45	NC_018883	GTTG	2	8	3034	3041	0 %	50 %	50 %	0 %	514403584
46	NC_018883	TAA	2	6	3059	3064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403584
47	NC_018883	T	7	7	3560	3566	0 %	100 %	0 %	0 %	514403585
48	NC_018883	TTA	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403585
49	NC_018883	T	7	7	3593	3599	0 %	100 %	0 %	0 %	514403585
50	NC_018883	ATT	2	6	3741	3746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403585
51	NC_018883	TTC	2	6	3812	3817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403585
52	NC_018883	TTA	2	6	3828	3833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403585
53	NC_018883	TTTGTT	2	12	3869	3880	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	514403585
54	NC_018883	TTTTG	2	10	3984	3993	0 %	80 %	20 %	0 %	514403585
55	NC_018883	CATA	2	8	3994	4001	50 %	25 %	0 %	25 %	514403585
56	NC_018883	TTC	2	6	4037	4042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403585
57	NC_018883	AT	3	6	4057	4062	50 %	50 %	0 %	0 %	514403585
58	NC_018883	TTC	2	6	4082	4087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403585
59	NC_018883	TG	3	6	4110	4115	0 %	50 %	50 %	0 %	514403585
60	NC_018883	TTA	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403585
61	NC_018883	TTG	2	6	4223	4228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403585
62	NC_018883	TAA	2	6	4257	4262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403585
63	NC_018883	A	6	6	4373	4378	100 %	0 %	0 %	0 %	514403585
64	NC_018883	ATA	2	6	4382	4387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403585
65	NC_018883	GA	3	6	4392	4397	50 %	0 %	50 %	0 %	514403585
66	NC_018883	GT	3	6	4411	4416	0 %	50 %	50 %	0 %	514403585
67	NC_018883	TGG	2	6	4476	4481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514403585
68	NC_018883	TCT	3	9	4521	4529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403585
69	NC_018883	T	7	7	4540	4546	0 %	100 %	0 %	0 %	514403585
70	NC_018883	TTTG	2	8	4644	4651	0 %	75 %	25 %	0 %	514403585
71	NC_018883	TAGAAA	2	12	5169	5180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514403586
72	NC_018883	ATC	2	6	5199	5204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514403586
73	NC_018883	A	7	7	5285	5291	100 %	0 %	0 %	0 %	514403586
74	NC_018883	TAAA	2	8	5346	5353	75 %	25 %	0 %	0 %	514403586
75	NC_018883	TAA	2	6	5368	5373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403586
76	NC_018883	TA	3	6	5405	5410	50 %	50 %	0 %	0 %	514403586
77	NC_018883	ATTGT	2	10	5424	5433	20 %	60 %	20 %	0 %	514403586
78	NC_018883	AATT	2	8	5487	5494	50 %	50 %	0 %	0 %	514403586
79	NC_018883	AAT	2	6	5582	5587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403586
80	NC_018883	CA	3	6	5616	5621	50 %	0 %	0 %	50 %	514403586
81	NC_018883	TGAA	2	8	5649	5656	50 %	25 %	25 %	0 %	514403586
82	NC_018883	ATGAAA	2	12	5684	5695	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	514403586
83	NC_018883	ATT	2	6	5719	5724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403586
84	NC_018883	TTC	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403587
85	NC_018883	T	6	6	5983	5988	0 %	100 %	0 %	0 %	514403587

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.