MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_8p

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018881	GAA	2	6	75	80	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678744
2	NC_018881	TAAA	2	8	82	89	75 %	25 %	0 %	0 %	410678744
3	NC_018881	A	6	6	87	92	100 %	0 %	0 %	0 %	410678744
4	NC_018881	AAG	2	6	133	138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678744
5	NC_018881	TGGT	2	8	143	150	0 %	50 %	50 %	0 %	410678744
6	NC_018881	A	6	6	157	162	100 %	0 %	0 %	0 %	410678744
7	NC_018881	ATTT	2	8	195	202	25 %	75 %	0 %	0 %	410678744
8	NC_018881	AT	3	6	215	220	50 %	50 %	0 %	0 %	410678744
9	NC_018881	ACA	3	9	221	229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678744
10	NC_018881	GAG	2	6	240	245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678744
11	NC_018881	CAA	2	6	258	263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678744
12	NC_018881	ACA	4	12	278	289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678744
13	NC_018881	TAA	2	6	320	325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678744
14	NC_018881	AGTTT	2	10	343	352	20 %	60 %	20 %	0 %	410678744
15	NC_018881	TAATT	2	10	354	363	40 %	60 %	0 %	0 %	410678744
16	NC_018881	ATTA	2	8	721	728	50 %	50 %	0 %	0 %	410678745
17	NC_018881	GAA	2	6	730	735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678745
18	NC_018881	T	6	6	803	808	0 %	100 %	0 %	0 %	410678745
19	NC_018881	CAATC	2	10	836	845	40 %	20 %	0 %	40 %	410678745
20	NC_018881	TCT	2	6	881	886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678745
21	NC_018881	T	6	6	939	944	0 %	100 %	0 %	0 %	410678745
22	NC_018881	CGG	2	6	1518	1523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410678746
23	NC_018881	GAA	2	6	1567	1572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
24	NC_018881	GCA	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678746
25	NC_018881	T	6	6	1671	1676	0 %	100 %	0 %	0 %	410678746
26	NC_018881	TGA	2	6	1703	1708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
27	NC_018881	AT	3	6	1769	1774	50 %	50 %	0 %	0 %	410678746
28	NC_018881	A	6	6	1782	1787	100 %	0 %	0 %	0 %	410678746
29	NC_018881	GTTA	2	8	1788	1795	25 %	50 %	25 %	0 %	410678746
30	NC_018881	GAAAA	2	10	1818	1827	80 %	0 %	20 %	0 %	410678746
31	NC_018881	A	7	7	1830	1836	100 %	0 %	0 %	0 %	410678746
32	NC_018881	A	6	6	1880	1885	100 %	0 %	0 %	0 %	410678746
33	NC_018881	A	6	6	1910	1915	100 %	0 %	0 %	0 %	410678746
34	NC_018881	TAT	2	6	1920	1925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
35	NC_018881	A	6	6	1945	1950	100 %	0 %	0 %	0 %	410678746
36	NC_018881	TAG	2	6	1978	1983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
37	NC_018881	TAA	2	6	2012	2017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
38	NC_018881	ACGA	2	8	2047	2054	50 %	0 %	25 %	25 %	410678746
39	NC_018881	GAAT	2	8	2075	2082	50 %	25 %	25 %	0 %	410678746
40	NC_018881	TTA	2	6	2098	2103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
41	NC_018881	AGTTG	2	10	2108	2117	20 %	40 %	40 %	0 %	410678746
42	NC_018881	T	6	6	2144	2149	0 %	100 %	0 %	0 %	410678746
43	NC_018881	ATT	2	6	2170	2175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
44	NC_018881	GAA	2	6	2180	2185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
45	NC_018881	GTGA	2	8	2202	2209	25 %	25 %	50 %	0 %	410678746
46	NC_018881	GA	3	6	2247	2252	50 %	0 %	50 %	0 %	410678746
47	NC_018881	AAGG	2	8	2364	2371	50 %	0 %	50 %	0 %	410678746
48	NC_018881	ATTA	2	8	2387	2394	50 %	50 %	0 %	0 %	410678746
49	NC_018881	GTT	2	6	2414	2419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678746
50	NC_018881	TGA	2	6	2420	2425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
51	NC_018881	GAA	3	9	2433	2441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
52	NC_018881	CAA	2	6	2485	2490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678746
53	NC_018881	AGA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
54	NC_018881	TTA	2	6	2533	2538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
55	NC_018881	GAT	2	6	2610	2615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
56	NC_018881	TGA	2	6	2699	2704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
57	NC_018881	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
58	NC_018881	AAAAT	2	10	2752	2761	80 %	20 %	0 %	0 %	410678746
59	NC_018881	ATT	2	6	2765	2770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
60	NC_018881	A	6	6	2820	2825	100 %	0 %	0 %	0 %	410678746
61	NC_018881	TTTTA	2	10	2849	2858	20 %	80 %	0 %	0 %	410678746
62	NC_018881	TTG	2	6	2895	2900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678746
63	NC_018881	T	6	6	2972	2977	0 %	100 %	0 %	0 %	410678746
64	NC_018881	TAA	2	6	2990	2995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
65	NC_018881	ATT	2	6	3015	3020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
66	NC_018881	TGA	2	6	3052	3057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
67	NC_018881	TAT	2	6	3061	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
68	NC_018881	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
69	NC_018881	TGA	2	6	3104	3109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
70	NC_018881	TTC	2	6	3134	3139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678746
71	NC_018881	AATT	2	8	3250	3257	50 %	50 %	0 %	0 %	410678746
72	NC_018881	ATG	2	6	3271	3276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
73	NC_018881	A	8	8	3341	3348	100 %	0 %	0 %	0 %	410678746
74	NC_018881	TTAAT	2	10	3361	3370	40 %	60 %	0 %	0 %	410678746
75	NC_018881	TAA	2	6	3380	3385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
76	NC_018881	ATT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
77	NC_018881	TTG	2	6	3496	3501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678746
78	NC_018881	ATG	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678746
79	NC_018881	TAA	2	6	3677	3682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
80	NC_018881	TAT	2	6	3685	3690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678746
81	NC_018881	GAA	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678746
82	NC_018881	AAT	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678746
83	NC_018881	A	8	8	3839	3846	100 %	0 %	0 %	0 %	410678746
84	NC_018881	TAA	2	6	4286	4291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678747
85	NC_018881	A	6	6	4320	4325	100 %	0 %	0 %	0 %	410678747
86	NC_018881	GATT	2	8	4379	4386	25 %	50 %	25 %	0 %	410678747
87	NC_018881	TGGT	2	8	4421	4428	0 %	50 %	50 %	0 %	410678747
88	NC_018881	TGATT	2	10	4466	4475	20 %	60 %	20 %	0 %	410678747
89	NC_018881	AG	3	6	4491	4496	50 %	0 %	50 %	0 %	410678747
90	NC_018881	TTA	2	6	4518	4523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678747
91	NC_018881	AGA	2	6	4576	4581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678747
92	NC_018881	TTG	2	6	4585	4590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678747
93	NC_018881	AGA	2	6	4631	4636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678747
94	NC_018881	CTT	2	6	4645	4650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678747
95	NC_018881	TGA	2	6	4655	4660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678747
96	NC_018881	ATTTA	2	10	4676	4685	40 %	60 %	0 %	0 %	410678747
97	NC_018881	GAT	3	9	4686	4694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678747
98	NC_018881	GAA	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678747
99	NC_018881	TTG	2	6	4777	4782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678747
100	NC_018881	ATTT	2	8	4790	4797	25 %	75 %	0 %	0 %	410678747
101	NC_018881	T	6	6	4934	4939	0 %	100 %	0 %	0 %	410678747
102	NC_018881	TATT	2	8	4991	4998	25 %	75 %	0 %	0 %	410678747
103	NC_018881	TTAG	2	8	5014	5021	25 %	50 %	25 %	0 %	410678747
104	NC_018881	TTA	2	6	7710	7715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678748
105	NC_018881	TA	3	6	7714	7719	50 %	50 %	0 %	0 %	410678748
106	NC_018881	ACA	2	6	7724	7729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678748
107	NC_018881	AGC	2	6	7735	7740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678748
108	NC_018881	A	6	6	7772	7777	100 %	0 %	0 %	0 %	410678748
109	NC_018881	TAT	2	6	7778	7783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678748
110	NC_018881	GA	3	6	7793	7798	50 %	0 %	50 %	0 %	410678748
111	NC_018881	CTT	2	6	7813	7818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678748
112	NC_018881	TTA	3	9	7877	7885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678748
113	NC_018881	AGGA	2	8	7900	7907	50 %	0 %	50 %	0 %	410678748
114	NC_018881	AGA	2	6	7912	7917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678748
115	NC_018881	TTG	2	6	7929	7934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678748
116	NC_018881	AT	3	6	7977	7982	50 %	50 %	0 %	0 %	410678748
117	NC_018881	ATA	2	6	8001	8006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678748
118	NC_018881	AAT	2	6	8045	8050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678748
119	NC_018881	TGA	2	6	8056	8061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678748
120	NC_018881	ATTAA	2	10	8069	8078	60 %	40 %	0 %	0 %	410678748
121	NC_018881	TCAAA	2	10	8087	8096	60 %	20 %	0 %	20 %	410678748
122	NC_018881	GAT	2	6	8101	8106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678748
123	NC_018881	GAAA	2	8	8152	8159	75 %	0 %	25 %	0 %	410678748
124	NC_018881	TGG	2	6	8178	8183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678748
125	NC_018881	TAA	2	6	8191	8196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678748
126	NC_018881	A	7	7	8195	8201	100 %	0 %	0 %	0 %	410678748
127	NC_018881	TGG	2	6	8204	8209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678748
128	NC_018881	T	6	6	8212	8217	0 %	100 %	0 %	0 %	410678748
129	NC_018881	AAAT	2	8	8222	8229	75 %	25 %	0 %	0 %	410678748

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.