MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_15p

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018880	ACT	2	6	126	131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678729
2	NC_018880	ATG	2	6	155	160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678729
3	NC_018880	GAG	2	6	173	178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678729
4	NC_018880	A	6	6	354	359	100 %	0 %	0 %	0 %	410678729
5	NC_018880	AGA	2	6	457	462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678729
6	NC_018880	TA	3	6	492	497	50 %	50 %	0 %	0 %	410678729
7	NC_018880	GAA	2	6	503	508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678729
8	NC_018880	TAA	2	6	589	594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678729
9	NC_018880	TAAT	2	8	603	610	50 %	50 %	0 %	0 %	410678729
10	NC_018880	AT	3	6	617	622	50 %	50 %	0 %	0 %	410678729
11	NC_018880	TTTC	2	8	629	636	0 %	75 %	0 %	25 %	410678729
12	NC_018880	AGA	2	6	661	666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678729
13	NC_018880	CTT	2	6	730	735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678729
14	NC_018880	CAAT	2	8	865	872	50 %	25 %	0 %	25 %	410678729
15	NC_018880	AAG	2	6	944	949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678729
16	NC_018880	GCG	2	6	1032	1037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410678729
17	NC_018880	A	6	6	1052	1057	100 %	0 %	0 %	0 %	410678729
18	NC_018880	AGAC	2	8	1092	1099	50 %	0 %	25 %	25 %	410678729
19	NC_018880	TTA	2	6	1125	1130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678729
20	NC_018880	ATTT	2	8	2546	2553	25 %	75 %	0 %	0 %	410678730
21	NC_018880	TAA	2	6	2577	2582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678730
22	NC_018880	TGT	2	6	2583	2588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678730
23	NC_018880	T	6	6	3131	3136	0 %	100 %	0 %	0 %	410678731
24	NC_018880	TGT	2	6	3320	3325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678731
25	NC_018880	CAAGT	2	10	3377	3386	40 %	20 %	20 %	20 %	410678731
26	NC_018880	TTTA	2	8	3433	3440	25 %	75 %	0 %	0 %	410678731
27	NC_018880	T	8	8	3446	3453	0 %	100 %	0 %	0 %	410678731
28	NC_018880	GCG	2	6	3814	3819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410678732
29	NC_018880	CAG	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678732
30	NC_018880	CGG	2	6	3947	3952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410678732
31	NC_018880	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678732
32	NC_018880	TAA	2	6	3987	3992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678732
33	NC_018880	TAG	2	6	4020	4025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678732
34	NC_018880	AGA	2	6	4032	4037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678732
35	NC_018880	AAAGT	2	10	4043	4052	60 %	20 %	20 %	0 %	410678732
36	NC_018880	AAC	2	6	4106	4111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678732
37	NC_018880	AGA	2	6	4167	4172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678732
38	NC_018880	AGAA	2	8	4260	4267	75 %	0 %	25 %	0 %	410678732
39	NC_018880	A	6	6	4269	4274	100 %	0 %	0 %	0 %	410678732
40	NC_018880	CTT	2	6	4384	4389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678732
41	NC_018880	TGA	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678732
42	NC_018880	AGA	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678732
43	NC_018880	TGA	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678732
44	NC_018880	AAAGAG	2	12	4531	4542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678732
45	NC_018880	T	6	6	4690	4695	0 %	100 %	0 %	0 %	410678733
46	NC_018880	AGA	2	6	4698	4703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678733
47	NC_018880	GAA	2	6	4711	4716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678733
48	NC_018880	TC	3	6	4726	4731	0 %	50 %	0 %	50 %	410678733
49	NC_018880	TGA	2	6	4742	4747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678733
50	NC_018880	TCAT	2	8	4763	4770	25 %	50 %	0 %	25 %	410678733
51	NC_018880	T	6	6	4770	4775	0 %	100 %	0 %	0 %	410678733
52	NC_018880	AG	3	6	4786	4791	50 %	0 %	50 %	0 %	410678733
53	NC_018880	T	7	7	4808	4814	0 %	100 %	0 %	0 %	410678733
54	NC_018880	TTG	2	6	4891	4896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678733
55	NC_018880	GAT	2	6	4903	4908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678733
56	NC_018880	TTG	3	9	4909	4917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678733
57	NC_018880	TTG	2	6	5008	5013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678733
58	NC_018880	GAT	2	6	5168	5173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678733
59	NC_018880	CTT	2	6	5193	5198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678733
60	NC_018880	TCCG	2	8	5212	5219	0 %	25 %	25 %	50 %	410678733
61	NC_018880	GTT	2	6	5274	5279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678733
62	NC_018880	ATT	2	6	5284	5289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678733
63	NC_018880	TCT	2	6	5873	5878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678734
64	NC_018880	TAG	2	6	6070	6075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678734
65	NC_018880	CAA	2	6	6116	6121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678734
66	NC_018880	TTG	2	6	6186	6191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678734
67	NC_018880	A	6	6	6202	6207	100 %	0 %	0 %	0 %	410678734
68	NC_018880	GT	3	6	6219	6224	0 %	50 %	50 %	0 %	410678734
69	NC_018880	ATA	2	6	6231	6236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678734
70	NC_018880	TATC	2	8	6300	6307	25 %	50 %	0 %	25 %	410678734
71	NC_018880	ATGA	2	8	6311	6318	50 %	25 %	25 %	0 %	410678734
72	NC_018880	TAT	2	6	6343	6348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678734
73	NC_018880	AGG	2	6	6361	6366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678734
74	NC_018880	AAC	2	6	6369	6374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678734
75	NC_018880	ATCG	2	8	6425	6432	25 %	25 %	25 %	25 %	410678734
76	NC_018880	TACAG	2	10	6440	6449	40 %	20 %	20 %	20 %	410678734
77	NC_018880	TTA	2	6	6471	6476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678734
78	NC_018880	GTC	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410678734
79	NC_018880	TTA	2	6	6540	6545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678734
80	NC_018880	CTT	2	6	6565	6570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678734
81	NC_018880	ACT	2	6	6649	6654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678734
82	NC_018880	A	6	6	6682	6687	100 %	0 %	0 %	0 %	410678734
83	NC_018880	CTGG	2	8	6909	6916	0 %	25 %	50 %	25 %	410678735
84	NC_018880	GAA	2	6	6989	6994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678735
85	NC_018880	TCT	2	6	7076	7081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678735
86	NC_018880	TTA	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678735
87	NC_018880	CAA	2	6	7115	7120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678735
88	NC_018880	AAT	2	6	7133	7138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678735
89	NC_018880	TTC	2	6	7191	7196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678735
90	NC_018880	TATG	2	8	7201	7208	25 %	50 %	25 %	0 %	410678735
91	NC_018880	AAGCA	2	10	7230	7239	60 %	0 %	20 %	20 %	410678735
92	NC_018880	GTATA	2	10	7258	7267	40 %	40 %	20 %	0 %	410678735
93	NC_018880	A	6	6	7425	7430	100 %	0 %	0 %	0 %	410678735
94	NC_018880	ATG	2	6	7622	7627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678735
95	NC_018880	CAAA	2	8	7634	7641	75 %	0 %	0 %	25 %	410678735
96	NC_018880	A	6	6	7646	7651	100 %	0 %	0 %	0 %	410678735
97	NC_018880	AGCA	2	8	7668	7675	50 %	0 %	25 %	25 %	410678735
98	NC_018880	A	6	6	7682	7687	100 %	0 %	0 %	0 %	410678735
99	NC_018880	TTA	2	6	7710	7715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678735
100	NC_018880	GAA	2	6	7814	7819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678735
101	NC_018880	AAC	2	6	7824	7829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678735
102	NC_018880	TTA	2	6	7907	7912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678735
103	NC_018880	CGA	2	6	7932	7937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678735
104	NC_018880	TGAAT	2	10	7978	7987	40 %	40 %	20 %	0 %	410678735
105	NC_018880	ATG	3	9	8061	8069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678735
106	NC_018880	TAT	2	6	8090	8095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678735
107	NC_018880	CAT	2	6	8165	8170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678735
108	NC_018880	TGA	2	6	8179	8184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678735
109	NC_018880	ATG	2	6	8199	8204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678735
110	NC_018880	TA	3	6	8264	8269	50 %	50 %	0 %	0 %	410678735
111	NC_018880	A	6	6	8314	8319	100 %	0 %	0 %	0 %	410678735
112	NC_018880	AGA	2	6	8392	8397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678735
113	NC_018880	CTT	2	6	8417	8422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678735
114	NC_018880	CAAT	2	8	8515	8522	50 %	25 %	0 %	25 %	410678735
115	NC_018880	ATG	3	9	8661	8669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678735
116	NC_018880	ATC	2	6	8722	8727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678735
117	NC_018880	CTT	3	9	8748	8756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678735
118	NC_018880	TAC	2	6	8890	8895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678735
119	NC_018880	CTT	2	6	8930	8935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678735
120	NC_018880	CAT	2	6	8936	8941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678735
121	NC_018880	GAA	2	6	8960	8965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678735
122	NC_018880	AC	3	6	9011	9016	50 %	0 %	0 %	50 %	410678735
123	NC_018880	TTG	2	6	9017	9022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410678735
124	NC_018880	CTC	2	6	9036	9041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678735
125	NC_018880	T	6	6	9069	9074	0 %	100 %	0 %	0 %	410678735
126	NC_018880	TGG	2	6	9082	9087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678735
127	NC_018880	AGA	2	6	9088	9093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678735
128	NC_018880	TAA	2	6	9141	9146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678735
129	NC_018880	TAA	2	6	9319	9324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678735
130	NC_018880	TAAA	2	8	9354	9361	75 %	25 %	0 %	0 %	410678735
131	NC_018880	CAAT	2	8	9369	9376	50 %	25 %	0 %	25 %	410678735
132	NC_018880	T	6	6	9395	9400	0 %	100 %	0 %	0 %	410678735
133	NC_018880	ATT	2	6	9470	9475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678735
134	NC_018880	GT	3	6	9486	9491	0 %	50 %	50 %	0 %	410678735
135	NC_018880	TA	3	6	9501	9506	50 %	50 %	0 %	0 %	410678735
136	NC_018880	AGA	2	6	9520	9525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678735
137	NC_018880	AGA	2	6	9550	9555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678735
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.