MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella parapertussis Bpp5

Total Repeats: 116005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_018828	CGCCGG	2	12	119841	119852	0 %	0 %	50 %	50 %	410470924
2503	NC_018828	GCG	2	6	119862	119867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470924
2504	NC_018828	GAA	2	6	119971	119976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410470924
2505	NC_018828	CAG	2	6	120010	120015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470924
2506	NC_018828	GC	3	6	120023	120028	0 %	0 %	50 %	50 %	410470924
2507	NC_018828	GAT	2	6	120064	120069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410470924
2508	NC_018828	GGC	2	6	120094	120099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470924
2509	NC_018828	TGC	2	6	120105	120110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470924
2510	NC_018828	GCC	2	6	120164	120169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470924
2511	NC_018828	GGC	2	6	120196	120201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470924
2512	NC_018828	CGGC	2	8	120207	120214	0 %	0 %	50 %	50 %	410470924
2513	NC_018828	CAG	2	6	120280	120285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470924
2514	NC_018828	GC	3	6	120293	120298	0 %	0 %	50 %	50 %	410470924
2515	NC_018828	CAGCCA	2	12	120319	120330	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	410470924
2516	NC_018828	CAG	2	6	120415	120420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470924
2517	NC_018828	CAC	2	6	120448	120453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410470924
2518	NC_018828	CG	3	6	120473	120478	0 %	0 %	50 %	50 %	410470924
2519	NC_018828	GCA	2	6	120513	120518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470924
2520	NC_018828	GCG	2	6	120557	120562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470924
2521	NC_018828	CGG	2	6	120615	120620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470924
2522	NC_018828	CCA	2	6	120636	120641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410470924
2523	NC_018828	ACG	2	6	120646	120651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470924
2524	NC_018828	GAA	2	6	122166	122171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410470925
2525	NC_018828	CAC	2	6	122196	122201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410470925
2526	NC_018828	CG	3	6	122243	122248	0 %	0 %	50 %	50 %	410470925
2527	NC_018828	CGG	4	12	122259	122270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470925
2528	NC_018828	GGC	2	6	122272	122277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470925
2529	NC_018828	GGCC	2	8	122291	122298	0 %	0 %	50 %	50 %	410470925
2530	NC_018828	GAA	2	6	122319	122324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410470925
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2532	NC_018828	ATG	2	6	122353	122358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410470925
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2534	NC_018828	GCC	2	6	122398	122403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470925
2535	NC_018828	CGT	2	6	122426	122431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470925
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2538	NC_018828	GC	3	6	122581	122586	0 %	0 %	50 %	50 %	410470925
2539	NC_018828	ACC	2	6	122587	122592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410470925
2540	NC_018828	GGCA	2	8	122638	122645	25 %	0 %	50 %	25 %	410470925
2541	NC_018828	GGAA	2	8	122697	122704	50 %	0 %	50 %	0 %	410470925
2542	NC_018828	TCG	2	6	123061	123066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470926
2543	NC_018828	TTAT	2	8	123103	123110	25 %	75 %	0 %	0 %	410470926
2544	NC_018828	GC	3	6	123120	123125	0 %	0 %	50 %	50 %	410470926
2545	NC_018828	CGA	2	6	123143	123148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470926
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2547	NC_018828	ACG	2	6	123217	123222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470926
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2550	NC_018828	GT	3	6	123341	123346	0 %	50 %	50 %	0 %	410470926
2551	NC_018828	CAA	2	6	123350	123355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410470926
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2553	NC_018828	GAG	2	6	123423	123428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410470926
2554	NC_018828	CAA	2	6	123437	123442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410470926
2555	NC_018828	CAT	2	6	123593	123598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410470926
2556	NC_018828	CAA	2	6	123602	123607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410470926
2557	NC_018828	TCA	2	6	123631	123636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410470926
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2559	NC_018828	GC	3	6	123843	123848	0 %	0 %	50 %	50 %	410470926
2560	NC_018828	GCA	2	6	123999	124004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470927
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2562	NC_018828	GGC	2	6	124096	124101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470927
2563	NC_018828	ACG	2	6	124163	124168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470927
2564	NC_018828	CGA	2	6	124210	124215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470927
2565	NC_018828	GCG	2	6	124269	124274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470927
2566	NC_018828	ACATCG	2	12	124314	124325	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	410470927
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2568	NC_018828	GCGG	2	8	124411	124418	0 %	0 %	75 %	25 %	410470927
2569	NC_018828	TCG	2	6	124440	124445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470927
2570	NC_018828	GCC	2	6	124451	124456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470927
2571	NC_018828	GGCC	3	12	124481	124492	0 %	0 %	50 %	50 %	410470927
2572	NC_018828	TCT	2	6	124515	124520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410470927
2573	NC_018828	G	6	6	124555	124560	0 %	0 %	100 %	0 %	410470927
2574	NC_018828	CAC	2	6	124567	124572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410470927
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2578	NC_018828	CGA	2	6	124765	124770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470927
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2581	NC_018828	GC	3	6	124848	124853	0 %	0 %	50 %	50 %	410470927
2582	NC_018828	TCGT	2	8	124868	124875	0 %	50 %	25 %	25 %	410470927
2583	NC_018828	GTGG	2	8	124879	124886	0 %	25 %	75 %	0 %	410470927
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2591	NC_018828	GCCG	2	8	125425	125432	0 %	0 %	50 %	50 %	410470928
2592	NC_018828	CTG	2	6	125567	125572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470928
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2600	NC_018828	CG	3	6	125903	125908	0 %	0 %	50 %	50 %	410470928
2601	NC_018828	CGC	2	6	125959	125964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470928
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2604	NC_018828	GCC	2	6	126086	126091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410470928
2605	NC_018828	GGC	2	6	126094	126099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470928
2606	NC_018828	CGA	2	6	126175	126180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470928
2607	NC_018828	GCA	2	6	126183	126188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470928
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2611	NC_018828	CTA	2	6	126412	126417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410470928
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2615	NC_018828	TG	3	6	126541	126546	0 %	50 %	50 %	0 %	410470928
2616	NC_018828	CG	3	6	126549	126554	0 %	0 %	50 %	50 %	410470928
2617	NC_018828	ATCA	2	8	126614	126621	50 %	25 %	0 %	25 %	410470928
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2620	NC_018828	CG	3	6	126705	126710	0 %	0 %	50 %	50 %	410470928
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2744	NC_018828	CGA	2	6	134044	134049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470935
2745	NC_018828	GTCG	2	8	134056	134063	0 %	25 %	50 %	25 %	410470935
2746	NC_018828	CGA	2	6	134065	134070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470935
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2748	NC_018828	TGC	2	6	134160	134165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470935
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2986	NC_018828	GGCC	2	8	147692	147699	0 %	0 %	50 %	50 %	410470944
2987	NC_018828	GGC	2	6	147733	147738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470944
2988	NC_018828	GC	3	6	147772	147777	0 %	0 %	50 %	50 %	410470944
2989	NC_018828	GCA	2	6	147803	147808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470944
2990	NC_018828	CGGC	2	8	147818	147825	0 %	0 %	50 %	50 %	410470944
2991	NC_018828	CAG	2	6	147840	147845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410470944
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2994	NC_018828	GCG	2	6	147967	147972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410470944
2995	NC_018828	TGC	2	6	147982	147987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410470944
2996	NC_018828	CAGC	2	8	147992	147999	25 %	0 %	25 %	50 %	410470944
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