MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella parapertussis Bpp5

Total Repeats: 116005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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101002	NC_018828	GCC	2	6	4282345	4282350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410474446
101003	NC_018828	GTC	2	6	4282426	4282431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474446
101004	NC_018828	CAG	2	6	4282450	4282455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410474446
101005	NC_018828	ATG	2	6	4282510	4282515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410474446
101006	NC_018828	CGA	2	6	4282578	4282583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410474446
101007	NC_018828	TCG	2	6	4282595	4282600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474446
101008	NC_018828	CAG	2	6	4282609	4282614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410474446
101009	NC_018828	TCG	2	6	4282670	4282675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474446
101010	NC_018828	GGT	2	6	4282687	4282692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410474446
101011	NC_018828	TCGG	2	8	4282706	4282713	0 %	25 %	50 %	25 %	410474446
101012	NC_018828	GC	3	6	4282762	4282767	0 %	0 %	50 %	50 %	410474446
101013	NC_018828	CGC	2	6	4282788	4282793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410474446
101014	NC_018828	TGC	2	6	4282823	4282828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474446
101015	NC_018828	GCT	2	6	4282851	4282856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474446
101016	NC_018828	CCAG	2	8	4282901	4282908	25 %	0 %	25 %	50 %	410474446
101017	NC_018828	GC	3	6	4282909	4282914	0 %	0 %	50 %	50 %	410474446
101018	NC_018828	CTG	2	6	4282921	4282926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474446
101019	NC_018828	CGGCG	2	10	4282927	4282936	0 %	0 %	60 %	40 %	410474446
101020	NC_018828	CG	3	6	4282944	4282949	0 %	0 %	50 %	50 %	410474446
101021	NC_018828	GCC	2	6	4282966	4282971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410474446
101022	NC_018828	AGGCC	2	10	4283157	4283166	20 %	0 %	40 %	40 %	410474446
101023	NC_018828	GCCGG	2	10	4283197	4283206	0 %	0 %	60 %	40 %	410474446
101024	NC_018828	CG	3	6	4283239	4283244	0 %	0 %	50 %	50 %	410474446
101025	NC_018828	GCG	2	6	4283260	4283265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410474446
101026	NC_018828	CGGG	2	8	4283274	4283281	0 %	0 %	75 %	25 %	410474446
101027	NC_018828	GC	3	6	4283307	4283312	0 %	0 %	50 %	50 %	410474446
101028	NC_018828	CGA	2	6	4283337	4283342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410474446
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101031	NC_018828	GC	4	8	4283402	4283409	0 %	0 %	50 %	50 %	410474446
101032	NC_018828	GCC	2	6	4283414	4283419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410474446
101033	NC_018828	CGA	2	6	4283472	4283477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410474446
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101035	NC_018828	TGAGCG	2	12	4283611	4283622	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410474447
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101037	NC_018828	CCGG	2	8	4283641	4283648	0 %	0 %	50 %	50 %	410474447
101038	NC_018828	GC	3	6	4283681	4283686	0 %	0 %	50 %	50 %	410474447
101039	NC_018828	TGC	2	6	4283688	4283693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474447
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101042	NC_018828	GGC	2	6	4283827	4283832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410474447
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101044	NC_018828	TGC	2	6	4284010	4284015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474447
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101051	NC_018828	AGT	2	6	4284298	4284303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410474447
101052	NC_018828	GCG	2	6	4284307	4284312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410474447
101053	NC_018828	CAG	2	6	4284338	4284343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410474447
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101055	NC_018828	AGC	2	6	4284414	4284419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410474447
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101083	NC_018828	CG	3	6	4285225	4285230	0 %	0 %	50 %	50 %	410474449
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101112	NC_018828	CG	3	6	4287230	4287235	0 %	0 %	50 %	50 %	410474452
101113	NC_018828	GGC	2	6	4287269	4287274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410474452
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101117	NC_018828	GC	3	6	4287422	4287427	0 %	0 %	50 %	50 %	410474452
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101119	NC_018828	ACC	2	6	4287436	4287441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410474452
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101122	NC_018828	GAT	2	6	4287669	4287674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410474452
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101460	NC_018828	GCG	2	6	4300185	4300190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410474465
101461	NC_018828	CGG	3	9	4300219	4300227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410474465
101462	NC_018828	CAA	2	6	4300234	4300239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410474465
101463	NC_018828	ACCC	2	8	4300258	4300265	25 %	0 %	0 %	75 %	410474465
101464	NC_018828	CAT	2	6	4300282	4300287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410474465
101465	NC_018828	CTG	2	6	4300301	4300306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474465
101466	NC_018828	CGA	2	6	4300441	4300446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410474465
101467	NC_018828	AGC	2	6	4300476	4300481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410474465
101468	NC_018828	GCC	2	6	4300489	4300494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410474465
101469	NC_018828	ACG	2	6	4300532	4300537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410474465
101470	NC_018828	CTG	2	6	4300553	4300558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474465
101471	NC_018828	CGC	2	6	4300739	4300744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410474465
101472	NC_018828	GGC	2	6	4300745	4300750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410474465
101473	NC_018828	CTG	2	6	4300778	4300783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474465
101474	NC_018828	CTT	2	6	4300792	4300797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410474465
101475	NC_018828	GCC	2	6	4300843	4300848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410474465
101476	NC_018828	CTG	3	9	4300883	4300891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474465
101477	NC_018828	GC	3	6	4300899	4300904	0 %	0 %	50 %	50 %	410474465
101478	NC_018828	GAT	2	6	4300909	4300914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410474465
101479	NC_018828	GCT	2	6	4301015	4301020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474466
101480	NC_018828	GC	3	6	4301021	4301026	0 %	0 %	50 %	50 %	410474466
101481	NC_018828	TGC	2	6	4301129	4301134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474466
101482	NC_018828	CAT	2	6	4301139	4301144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410474466
101483	NC_018828	GGC	2	6	4301199	4301204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410474466
101484	NC_018828	TGC	2	6	4301252	4301257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474466
101485	NC_018828	AGA	2	6	4301438	4301443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410474466
101486	NC_018828	GAC	2	6	4301473	4301478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410474466
101487	NC_018828	GGC	2	6	4301485	4301490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410474466
101488	NC_018828	TCA	3	9	4301504	4301512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410474466
101489	NC_018828	CCA	2	6	4301564	4301569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410474466
101490	NC_018828	GGCC	3	12	4301588	4301599	0 %	0 %	50 %	50 %	410474466
101491	NC_018828	CTG	2	6	4301677	4301682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474466
101492	NC_018828	GCG	2	6	4301726	4301731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410474466
101493	NC_018828	GC	3	6	4301872	4301877	0 %	0 %	50 %	50 %	410474467
101494	NC_018828	TGC	2	6	4301921	4301926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474467
101495	NC_018828	ACC	2	6	4301948	4301953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410474467
101496	NC_018828	GTC	2	6	4301969	4301974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410474467
101497	NC_018828	CCA	2	6	4301997	4302002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410474467
101498	NC_018828	CGA	2	6	4302015	4302020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410474467
101499	NC_018828	CGCTG	2	10	4302033	4302042	0 %	20 %	40 %	40 %	410474467
101500	NC_018828	GC	4	8	4302092	4302099	0 %	0 %	50 %	50 %	410474467

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