MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia garinii NMJW1 chromosome

Total Repeats: 23058

< Previous12...35363738394041424344454647Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_018747	GTAT	2	8	900455	900462	25 %	50 %	25 %	0 %	408671445
23002	NC_018747	ATT	2	6	900515	900520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671445
23003	NC_018747	AGA	2	6	900594	900599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671445
23004	NC_018747	TAT	2	6	900687	900692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671445
23005	NC_018747	ATTACA	2	12	900790	900801	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	408671445
23006	NC_018747	AGA	2	6	900810	900815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671445
23007	NC_018747	TGT	2	6	900834	900839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671445
23008	NC_018747	TG	3	6	900849	900854	0 %	50 %	50 %	0 %	408671445
23009	NC_018747	AAT	2	6	900871	900876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671445
23010	NC_018747	TCT	2	6	900894	900899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	408671445
23011	NC_018747	GAT	2	6	900943	900948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671445
23012	NC_018747	TGGT	2	8	900995	901002	0 %	50 %	50 %	0 %	408671445
23013	NC_018747	AGA	2	6	901047	901052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671445
23014	NC_018747	GTT	2	6	901075	901080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671445
23015	NC_018747	AC	3	6	901104	901109	50 %	0 %	0 %	50 %	408671445
23016	NC_018747	TAT	2	6	901119	901124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671445
23017	NC_018747	AGT	2	6	901202	901207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671446
23018	NC_018747	AAT	2	6	901213	901218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671446
23019	NC_018747	CTG	2	6	901263	901268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671446
23020	NC_018747	GA	3	6	901314	901319	50 %	0 %	50 %	0 %	408671446
23021	NC_018747	TAT	2	6	901378	901383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671446
23022	NC_018747	TTA	2	6	901431	901436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671446
23023	NC_018747	TTG	2	6	901449	901454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671446
23024	NC_018747	TTA	2	6	901470	901475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671446
23025	NC_018747	AAG	2	6	901517	901522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	408671446
23026	NC_018747	T	6	6	901566	901571	0 %	100 %	0 %	0 %	408671446
23027	NC_018747	TGG	2	6	901576	901581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	408671446
23028	NC_018747	CCTT	2	8	901609	901616	0 %	50 %	0 %	50 %	408671446
23029	NC_018747	TTG	2	6	901665	901670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671446
23030	NC_018747	GCT	2	6	901673	901678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	408671446
23031	NC_018747	ATT	2	6	901679	901684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671446
23032	NC_018747	GGAT	2	8	901774	901781	25 %	25 %	50 %	0 %	408671446
23033	NC_018747	A	6	6	901859	901864	100 %	0 %	0 %	0 %	408671446
23034	NC_018747	A	7	7	901893	901899	100 %	0 %	0 %	0 %	408671446
23035	NC_018747	A	8	8	901922	901929	100 %	0 %	0 %	0 %	408671446
23036	NC_018747	ATA	2	6	901947	901952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671446
23037	NC_018747	ATTT	2	8	902017	902024	25 %	75 %	0 %	0 %	408671446
23038	NC_018747	TAT	2	6	902035	902040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671446
23039	NC_018747	TGGT	2	8	902047	902054	0 %	50 %	50 %	0 %	408671446
23040	NC_018747	TAT	2	6	902092	902097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671446
23041	NC_018747	AGC	2	6	902098	902103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671446
23042	NC_018747	CAG	2	6	902172	902177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	408671446
23043	NC_018747	TGA	2	6	902218	902223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	408671446
23044	NC_018747	CGC	2	6	902251	902256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	408671446
23045	NC_018747	T	6	6	902263	902268	0 %	100 %	0 %	0 %	408671446
23046	NC_018747	T	7	7	902287	902293	0 %	100 %	0 %	0 %	408671446
23047	NC_018747	TGAA	2	8	902301	902308	50 %	25 %	25 %	0 %	408671446
23048	NC_018747	ATT	2	6	902309	902314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671446
23049	NC_018747	AAT	2	6	902374	902379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671446
23050	NC_018747	T	6	6	902395	902400	0 %	100 %	0 %	0 %	408671446
23051	NC_018747	GTT	2	6	902420	902425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	408671446
23052	NC_018747	TTA	2	6	902451	902456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671446
23053	NC_018747	TAA	2	6	902460	902465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	408671446
23054	NC_018747	GT	3	6	902520	902525	0 %	50 %	50 %	0 %	408671446
23055	NC_018747	ATT	2	6	902545	902550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671446
23056	NC_018747	TAT	2	6	902551	902556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671446
23057	NC_018747	TTA	2	6	902580	902585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	408671446
23058	NC_018747	ATTT	2	8	902594	902601	25 %	75 %	0 %	0 %	408671446

< Previous12...35363738394041424344454647Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.