MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 chromosome

Total Repeats: 105160

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018693	A	6	6	1487	1492	100 %	0 %	0 %	0 %	407703237
2	NC_018693	GCT	2	6	1561	1566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407703237
3	NC_018693	GAAG	2	8	1575	1582	50 %	0 %	50 %	0 %	407703237
4	NC_018693	GATT	2	8	1592	1599	25 %	50 %	25 %	0 %	407703237
5	NC_018693	GTT	2	6	1651	1656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703237
6	NC_018693	TAA	2	6	1686	1691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703237
7	NC_018693	GAC	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407703237
8	NC_018693	GAT	2	6	1735	1740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703237
9	NC_018693	AGT	2	6	1794	1799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703237
10	NC_018693	GAT	2	6	1861	1866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703237
11	NC_018693	AT	3	6	2435	2440	50 %	50 %	0 %	0 %	407703238
12	NC_018693	AAT	2	6	2448	2453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703238
13	NC_018693	ATT	2	6	2462	2467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703238
14	NC_018693	GAAA	2	8	2528	2535	75 %	0 %	25 %	0 %	407703238
15	NC_018693	AGA	2	6	2549	2554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407703238
16	NC_018693	AGC	2	6	2561	2566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407703238
17	NC_018693	GAAT	2	8	2581	2588	50 %	25 %	25 %	0 %	407703238
18	NC_018693	TTC	2	6	2644	2649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407703238
19	NC_018693	TTGG	2	8	2665	2672	0 %	50 %	50 %	0 %	407703238
20	NC_018693	TTA	2	6	2788	2793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703238
21	NC_018693	TAT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703238
22	NC_018693	TTC	2	6	2916	2921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407703238
23	NC_018693	AGC	2	6	2956	2961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407703238
24	NC_018693	ATG	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703238
25	NC_018693	TA	3	6	3016	3021	50 %	50 %	0 %	0 %	407703238
26	NC_018693	TTG	2	6	3030	3035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703238
27	NC_018693	AGT	2	6	3086	3091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703238
28	NC_018693	GAT	2	6	3162	3167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703238
29	NC_018693	TGA	2	6	3178	3183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703238
30	NC_018693	ATG	2	6	3189	3194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703238
31	NC_018693	TTA	2	6	3246	3251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703238
32	NC_018693	GCAT	2	8	3290	3297	25 %	25 %	25 %	25 %	407703238
33	NC_018693	ATT	2	6	3298	3303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703238
34	NC_018693	GAA	2	6	3306	3311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407703238
35	NC_018693	TAC	2	6	3352	3357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407703238
36	NC_018693	TA	3	6	3363	3368	50 %	50 %	0 %	0 %	407703238
37	NC_018693	CGA	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407703238
38	NC_018693	A	6	6	3492	3497	100 %	0 %	0 %	0 %	407703238
39	NC_018693	TTTA	2	8	3510	3517	25 %	75 %	0 %	0 %	407703238
40	NC_018693	CTT	2	6	3785	3790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407703239
41	NC_018693	T	6	6	3798	3803	0 %	100 %	0 %	0 %	407703239
42	NC_018693	ATT	2	6	3804	3809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703239
43	NC_018693	AAT	2	6	3835	3840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703239
44	NC_018693	TAG	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703239
45	NC_018693	ATAA	2	8	3875	3882	75 %	25 %	0 %	0 %	407703239
46	NC_018693	TAA	2	6	3893	3898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703239
47	NC_018693	CAT	2	6	3981	3986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407703239
48	NC_018693	CTAA	2	8	4122	4129	50 %	25 %	0 %	25 %	407703240
49	NC_018693	T	6	6	4156	4161	0 %	100 %	0 %	0 %	407703240
50	NC_018693	ATGA	2	8	4210	4217	50 %	25 %	25 %	0 %	407703240
51	NC_018693	TGT	2	6	4304	4309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703240
52	NC_018693	AAT	2	6	4366	4371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703240
53	NC_018693	TAA	2	6	4378	4383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407703240
54	NC_018693	TGC	2	6	4424	4429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407703240
55	NC_018693	CTG	2	6	4510	4515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407703240
56	NC_018693	CTA	2	6	4636	4641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407703240
57	NC_018693	ATTTA	2	10	4709	4718	40 %	60 %	0 %	0 %	407703240
58	NC_018693	TAG	2	6	4963	4968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703240
59	NC_018693	GTTT	2	8	4975	4982	0 %	75 %	25 %	0 %	407703240
60	NC_018693	T	7	7	4980	4986	0 %	100 %	0 %	0 %	407703240
61	NC_018693	TAT	2	6	5020	5025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703240
62	NC_018693	GTT	2	6	5052	5057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703240
63	NC_018693	TAT	2	6	5113	5118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703240
64	NC_018693	CTT	2	6	5119	5124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407703240
65	NC_018693	GAAG	2	8	5217	5224	50 %	0 %	50 %	0 %	407703240
66	NC_018693	AGT	2	6	5243	5248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703240
67	NC_018693	TCATAT	2	12	5269	5280	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407703240
68	NC_018693	AT	3	6	5890	5895	50 %	50 %	0 %	0 %	407703241
69	NC_018693	GAAAT	2	10	5910	5919	60 %	20 %	20 %	0 %	407703241
70	NC_018693	ATC	2	6	5971	5976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407703241
71	NC_018693	GTA	2	6	5982	5987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703241
72	NC_018693	ATT	2	6	6033	6038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703241
73	NC_018693	ATT	2	6	6043	6048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703241
74	NC_018693	GAG	2	6	6204	6209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407703241
75	NC_018693	ATG	2	6	6258	6263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703241
76	NC_018693	AGC	2	6	6299	6304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407703241
77	NC_018693	CTT	2	6	6306	6311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407703241
78	NC_018693	ATGT	2	8	6314	6321	25 %	50 %	25 %	0 %	407703241
79	NC_018693	GA	3	6	6368	6373	50 %	0 %	50 %	0 %	407703241
80	NC_018693	GAA	2	6	6414	6419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407703241
81	NC_018693	TTA	2	6	6450	6455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703241
82	NC_018693	GAG	2	6	6579	6584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407703241
83	NC_018693	TAC	2	6	6593	6598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407703241
84	NC_018693	ATT	2	6	6838	6843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703242
85	NC_018693	TGC	2	6	6849	6854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407703242
86	NC_018693	AGA	2	6	6881	6886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407703242
87	NC_018693	AAG	2	6	6887	6892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407703242
88	NC_018693	ATT	2	6	7005	7010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703242
89	NC_018693	GA	3	6	7019	7024	50 %	0 %	50 %	0 %	407703242
90	NC_018693	TAT	2	6	7025	7030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703242
91	NC_018693	GTT	2	6	7089	7094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703242
92	NC_018693	A	6	6	7115	7120	100 %	0 %	0 %	0 %	407703242
93	NC_018693	TTTA	2	8	7125	7132	25 %	75 %	0 %	0 %	407703242
94	NC_018693	ATG	2	6	7139	7144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703242
95	NC_018693	GAA	2	6	7147	7152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407703242
96	NC_018693	GTT	2	6	7155	7160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703242
97	NC_018693	TCGAA	2	10	7165	7174	40 %	20 %	20 %	20 %	407703242
98	NC_018693	GTG	2	6	7180	7185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407703242
99	NC_018693	CAG	2	6	7189	7194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407703242
100	NC_018693	ACT	2	6	7201	7206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407703242
101	NC_018693	TA	3	6	7256	7261	50 %	50 %	0 %	0 %	407703242
102	NC_018693	CTT	2	6	7291	7296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407703242
103	NC_018693	ATG	2	6	7323	7328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703242
104	NC_018693	ACCGTC	2	12	7427	7438	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407703243
105	NC_018693	ATT	2	6	7475	7480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703243
106	NC_018693	CGT	2	6	7508	7513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407703243
107	NC_018693	GTT	2	6	7524	7529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703243
108	NC_018693	AATG	2	8	7565	7572	50 %	25 %	25 %	0 %	407703243
109	NC_018693	ATGG	2	8	7580	7587	25 %	25 %	50 %	0 %	407703243
110	NC_018693	ATT	2	6	7604	7609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703243
111	NC_018693	GTT	3	9	7689	7697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703243
112	NC_018693	GTA	2	6	7750	7755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703243
113	NC_018693	A	6	6	7758	7763	100 %	0 %	0 %	0 %	407703243
114	NC_018693	GAG	2	6	7770	7775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407703243
115	NC_018693	GAA	2	6	7799	7804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407703243
116	NC_018693	AAGTTA	2	12	7818	7829	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	407703243
117	NC_018693	T	8	8	7847	7854	0 %	100 %	0 %	0 %	407703243
118	NC_018693	GCA	2	6	7893	7898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407703243
119	NC_018693	ATG	2	6	7950	7955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407703243
120	NC_018693	ATTGT	2	10	7989	7998	20 %	60 %	20 %	0 %	407703243
121	NC_018693	ATT	2	6	8003	8008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703243
122	NC_018693	TTC	2	6	8016	8021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407703243
123	NC_018693	AGAAA	2	10	8042	8051	80 %	0 %	20 %	0 %	407703243
124	NC_018693	GGA	2	6	8062	8067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407703243
125	NC_018693	ATT	2	6	8107	8112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703244
126	NC_018693	A	6	6	8162	8167	100 %	0 %	0 %	0 %	407703244
127	NC_018693	GAAA	2	8	8170	8177	75 %	0 %	25 %	0 %	407703244
128	NC_018693	TTTA	2	8	8219	8226	25 %	75 %	0 %	0 %	407703244
129	NC_018693	GCA	2	6	8228	8233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407703244
130	NC_018693	AGA	2	6	8254	8259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407703244
131	NC_018693	GCA	2	6	8318	8323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407703244
132	NC_018693	TAT	2	6	8345	8350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407703244
133	NC_018693	GTT	2	6	8360	8365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407703244
134	NC_018693	CAG	2	6	8451	8456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407703244
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