MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC429

Total Repeats: 7186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018689	TTA	2	6	50	55	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702825
2	NC_018689	GAT	3	9	113	121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702825
3	NC_018689	TGA	2	6	172	177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702825
4	NC_018689	AGA	2	6	208	213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702825
5	NC_018689	TAAT	2	8	219	226	50 %	50 %	0 %	0 %	407702825
6	NC_018689	A	6	6	228	233	100 %	0 %	0 %	0 %	407702825
7	NC_018689	CTTTT	2	10	237	246	0 %	80 %	0 %	20 %	407702825
8	NC_018689	TTG	2	6	266	271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702825
9	NC_018689	ATA	2	6	309	314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702825
10	NC_018689	TAA	2	6	321	326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702825
11	NC_018689	TTTA	2	8	386	393	25 %	75 %	0 %	0 %	407702825
12	NC_018689	GT	3	6	496	501	0 %	50 %	50 %	0 %	407702826
13	NC_018689	TAA	2	6	507	512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702826
14	NC_018689	AATT	2	8	513	520	50 %	50 %	0 %	0 %	407702826
15	NC_018689	ATTG	2	8	523	530	25 %	50 %	25 %	0 %	407702826
16	NC_018689	TAT	2	6	546	551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702826
17	NC_018689	AAG	2	6	574	579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702826
18	NC_018689	TA	3	6	605	610	50 %	50 %	0 %	0 %	407702826
19	NC_018689	T	6	6	662	667	0 %	100 %	0 %	0 %	407702826
20	NC_018689	AG	3	6	690	695	50 %	0 %	50 %	0 %	407702826
21	NC_018689	A	7	7	702	708	100 %	0 %	0 %	0 %	407702826
22	NC_018689	ATAA	2	8	710	717	75 %	25 %	0 %	0 %	407702826
23	NC_018689	AGA	2	6	1294	1299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
24	NC_018689	A	6	6	1348	1353	100 %	0 %	0 %	0 %	407702827
25	NC_018689	GGC	2	6	1361	1366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407702827
26	NC_018689	AAG	2	6	1473	1478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
27	NC_018689	AAGG	2	8	1526	1533	50 %	0 %	50 %	0 %	407702827
28	NC_018689	TAC	2	6	1581	1586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702827
29	NC_018689	T	6	6	1619	1624	0 %	100 %	0 %	0 %	407702827
30	NC_018689	CAC	2	6	1635	1640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407702827
31	NC_018689	ATTG	2	8	1645	1652	25 %	50 %	25 %	0 %	407702827
32	NC_018689	GGAA	2	8	1659	1666	50 %	0 %	50 %	0 %	407702827
33	NC_018689	CTC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407702827
34	NC_018689	AAGA	2	8	1739	1746	75 %	0 %	25 %	0 %	407702827
35	NC_018689	T	7	7	1752	1758	0 %	100 %	0 %	0 %	407702827
36	NC_018689	A	6	6	1773	1778	100 %	0 %	0 %	0 %	407702827
37	NC_018689	ATTT	2	8	1786	1793	25 %	75 %	0 %	0 %	407702827
38	NC_018689	CATA	2	8	1856	1863	50 %	25 %	0 %	25 %	407702827
39	NC_018689	T	6	6	1888	1893	0 %	100 %	0 %	0 %	407702827
40	NC_018689	ATC	2	6	1939	1944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702827
41	NC_018689	AGA	3	9	1951	1959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
42	NC_018689	AGA	2	6	1987	1992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
43	NC_018689	CAG	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702827
44	NC_018689	AAG	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
45	NC_018689	CAT	2	6	2064	2069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702827
46	NC_018689	AG	5	10	2209	2218	50 %	0 %	50 %	0 %	407702827
47	NC_018689	GGA	2	6	2231	2236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407702827
48	NC_018689	GTA	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702827
49	NC_018689	GGAAA	2	10	2297	2306	60 %	0 %	40 %	0 %	407702827
50	NC_018689	T	6	6	2366	2371	0 %	100 %	0 %	0 %	407702827
51	NC_018689	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702827
52	NC_018689	AATT	2	8	2421	2428	50 %	50 %	0 %	0 %	407702827
53	NC_018689	CAA	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702827
54	NC_018689	AAG	2	6	2502	2507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
55	NC_018689	A	6	6	2615	2620	100 %	0 %	0 %	0 %	407702827
56	NC_018689	TATG	2	8	2635	2642	25 %	50 %	25 %	0 %	407702827
57	NC_018689	GAA	2	6	2725	2730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
58	NC_018689	TTG	2	6	2799	2804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702827
59	NC_018689	ATTG	2	8	2888	2895	25 %	50 %	25 %	0 %	407702827
60	NC_018689	GAA	2	6	2896	2901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
61	NC_018689	TGTT	2	8	2910	2917	0 %	75 %	25 %	0 %	407702827
62	NC_018689	TGG	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407702827
63	NC_018689	A	6	6	2979	2984	100 %	0 %	0 %	0 %	407702827
64	NC_018689	AGA	2	6	2998	3003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
65	NC_018689	GAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
66	NC_018689	A	6	6	3009	3014	100 %	0 %	0 %	0 %	407702827
67	NC_018689	TTGAAG	2	12	3015	3026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702827
68	NC_018689	GAGAA	2	10	3027	3036	60 %	0 %	40 %	0 %	407702827
69	NC_018689	ATT	2	6	3044	3049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702827
70	NC_018689	ATT	2	6	3081	3086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702827
71	NC_018689	A	6	6	3095	3100	100 %	0 %	0 %	0 %	407702827
72	NC_018689	TGT	2	6	3103	3108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702827
73	NC_018689	ATT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702827
74	NC_018689	ATGAA	2	10	3117	3126	60 %	20 %	20 %	0 %	407702827
75	NC_018689	ATTG	2	8	3205	3212	25 %	50 %	25 %	0 %	407702827
76	NC_018689	CTTG	2	8	3301	3308	0 %	50 %	25 %	25 %	407702827
77	NC_018689	CGC	2	6	3323	3328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407702827
78	NC_018689	GAA	2	6	3338	3343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
79	NC_018689	TCT	2	6	3361	3366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407702827
80	NC_018689	TGA	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702827
81	NC_018689	TTA	2	6	3411	3416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702827
82	NC_018689	ATG	2	6	3549	3554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702827
83	NC_018689	AT	3	6	3610	3615	50 %	50 %	0 %	0 %	407702827
84	NC_018689	AGA	2	6	3625	3630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702827
85	NC_018689	ACG	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702828
86	NC_018689	TGA	2	6	3803	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702828
87	NC_018689	AT	3	6	3818	3823	50 %	50 %	0 %	0 %	407702828
88	NC_018689	GAA	2	6	3825	3830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702828
89	NC_018689	TGAT	2	8	3850	3857	25 %	50 %	25 %	0 %	407702828
90	NC_018689	ATTA	2	8	3882	3889	50 %	50 %	0 %	0 %	407702828
91	NC_018689	ATT	2	6	3927	3932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702828
92	NC_018689	A	6	6	4204	4209	100 %	0 %	0 %	0 %	407702828
93	NC_018689	TGA	2	6	4229	4234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702828
94	NC_018689	A	6	6	4289	4294	100 %	0 %	0 %	0 %	407702828
95	NC_018689	GTA	2	6	4362	4367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702828
96	NC_018689	TAT	2	6	4394	4399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702828
97	NC_018689	GCT	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407702828
98	NC_018689	GCTAA	2	10	4443	4452	40 %	20 %	20 %	20 %	407702828
99	NC_018689	TTG	2	6	4453	4458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702828
100	NC_018689	CAT	2	6	4492	4497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702828
101	NC_018689	TCTT	2	8	4503	4510	0 %	75 %	0 %	25 %	407702828
102	NC_018689	AT	3	6	4522	4527	50 %	50 %	0 %	0 %	407702828
103	NC_018689	AT	3	6	4538	4543	50 %	50 %	0 %	0 %	407702828
104	NC_018689	TAA	3	9	4571	4579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702828
105	NC_018689	AAT	2	6	4580	4585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702828
106	NC_018689	TAA	2	6	4616	4621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702828
107	NC_018689	TTA	2	6	4644	4649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702828
108	NC_018689	TGAT	2	8	4663	4670	25 %	50 %	25 %	0 %	407702828
109	NC_018689	CAA	2	6	4705	4710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702828
110	NC_018689	GAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407702828
111	NC_018689	ATC	2	6	4828	4833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702828
112	NC_018689	TG	3	6	4835	4840	0 %	50 %	50 %	0 %	407702828
113	NC_018689	A	6	6	4858	4863	100 %	0 %	0 %	0 %	407702828
114	NC_018689	TGA	2	6	4889	4894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702828
115	NC_018689	AAT	2	6	4945	4950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702828
116	NC_018689	ATT	2	6	5553	5558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702829
117	NC_018689	GTA	2	6	5563	5568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702829
118	NC_018689	TCCA	2	8	5602	5609	25 %	25 %	0 %	50 %	407702829
119	NC_018689	CCAT	2	8	5669	5676	25 %	25 %	0 %	50 %	407702829
120	NC_018689	ATT	3	9	5739	5747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702829
121	NC_018689	TA	3	6	5816	5821	50 %	50 %	0 %	0 %	407702829
122	NC_018689	CAA	2	6	6352	6357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407702830
123	NC_018689	ATG	2	6	6361	6366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702830
124	NC_018689	TAAT	2	8	6409	6416	50 %	50 %	0 %	0 %	407702830
125	NC_018689	A	6	6	6436	6441	100 %	0 %	0 %	0 %	407702830
126	NC_018689	AGT	2	6	6489	6494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702830
127	NC_018689	AGC	3	9	6497	6505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407702830
128	NC_018689	A	7	7	6516	6522	100 %	0 %	0 %	0 %	407702830
129	NC_018689	T	6	6	6564	6569	0 %	100 %	0 %	0 %	407702830
130	NC_018689	GTA	2	6	6631	6636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702830
131	NC_018689	CAAA	2	8	6645	6652	75 %	0 %	0 %	25 %	407702830
132	NC_018689	AT	3	6	6665	6670	50 %	50 %	0 %	0 %	407702830
133	NC_018689	TAT	2	6	6676	6681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702830
134	NC_018689	ATT	3	9	6702	6710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407702830
135	NC_018689	A	7	7	6741	6747	100 %	0 %	0 %	0 %	407702830
136	NC_018689	ATC	2	6	6787	6792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407702830
137	NC_018689	TGT	2	6	6809	6814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407702830
138	NC_018689	TGA	2	6	6821	6826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702830
139	NC_018689	ATG	2	6	6891	6896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407702830
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261	NC_018689	ATA	2	6	13348	13353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702835
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268	NC_018689	CTAC	2	8	13662	13669	25 %	25 %	0 %	50 %	407702835
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392	NC_018689	GGTAT	2	10	20530	20539	20 %	40 %	40 %	0 %	407702842
393	NC_018689	TA	3	6	20591	20596	50 %	50 %	0 %	0 %	407702842
394	NC_018689	TAA	3	9	20622	20630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407702842
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