MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 25360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018533	ATCA	2	8	245481	245488	50 %	25 %	0 %	25 %	403530108
4002	NC_018533	A	6	6	245510	245515	100 %	0 %	0 %	0 %	403530108
4003	NC_018533	CTGT	2	8	245542	245549	0 %	50 %	25 %	25 %	403530108
4004	NC_018533	T	6	6	245567	245572	0 %	100 %	0 %	0 %	403530108
4005	NC_018533	TCA	3	9	245609	245617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530108
4006	NC_018533	CAAT	2	8	245641	245648	50 %	25 %	0 %	25 %	403530108
4007	NC_018533	ACC	2	6	245664	245669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530108
4008	NC_018533	TAA	2	6	245753	245758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530108
4009	NC_018533	TCA	2	6	245809	245814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530108
4010	NC_018533	ACA	2	6	245815	245820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530108
4011	NC_018533	GTTT	2	8	245914	245921	0 %	75 %	25 %	0 %	403530108
4012	NC_018533	TGT	2	6	245943	245948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530108
4013	NC_018533	TGAC	2	8	245979	245986	25 %	25 %	25 %	25 %	403530108
4014	NC_018533	GAG	2	6	246018	246023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530108
4015	NC_018533	TAA	2	6	246033	246038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530108
4016	NC_018533	T	7	7	246059	246065	0 %	100 %	0 %	0 %	403530108
4017	NC_018533	T	8	8	246108	246115	0 %	100 %	0 %	0 %	403530108
4018	NC_018533	CTG	2	6	246164	246169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530108
4019	NC_018533	CAT	2	6	246170	246175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530108
4020	NC_018533	AG	3	6	246204	246209	50 %	0 %	50 %	0 %	403530108
4021	NC_018533	ACC	2	6	246415	246420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530109
4022	NC_018533	CCAT	2	8	246451	246458	25 %	25 %	0 %	50 %	403530109
4023	NC_018533	CAA	2	6	246492	246497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530109
4024	NC_018533	AGC	2	6	246514	246519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530109
4025	NC_018533	TGA	2	6	246574	246579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530109
4026	NC_018533	TTG	2	6	246655	246660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530109
4027	NC_018533	GCT	2	6	246719	246724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530109
4028	NC_018533	TCA	2	6	246767	246772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530109
4029	NC_018533	CCT	2	6	246980	246985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530109
4030	NC_018533	T	6	6	246994	246999	0 %	100 %	0 %	0 %	403530109
4031	NC_018533	C	6	6	247036	247041	0 %	0 %	0 %	100 %	403530109
4032	NC_018533	CCAA	2	8	247064	247071	50 %	0 %	0 %	50 %	403530109
4033	NC_018533	GTG	2	6	247119	247124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530109
4034	NC_018533	TGC	2	6	247128	247133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530109
4035	NC_018533	ATC	2	6	247154	247159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530109
4036	NC_018533	TG	3	6	247167	247172	0 %	50 %	50 %	0 %	403530109
4037	NC_018533	CTT	2	6	247236	247241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530109
4038	NC_018533	TGA	2	6	247281	247286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530109
4039	NC_018533	A	6	6	247297	247302	100 %	0 %	0 %	0 %	403530109
4040	NC_018533	GAGG	2	8	247372	247379	25 %	0 %	75 %	0 %	403530109
4041	NC_018533	TGC	2	6	247450	247455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530109
4042	NC_018533	AAG	2	6	247495	247500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530109
4043	NC_018533	T	7	7	247546	247552	0 %	100 %	0 %	0 %	403530109
4044	NC_018533	TTG	2	6	247629	247634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530109
4045	NC_018533	TTG	2	6	247662	247667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530109
4046	NC_018533	AAG	2	6	247676	247681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530109
4047	NC_018533	T	6	6	247788	247793	0 %	100 %	0 %	0 %	403530110
4048	NC_018533	AT	3	6	247834	247839	50 %	50 %	0 %	0 %	403530110
4049	NC_018533	AGT	2	6	247911	247916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530110
4050	NC_018533	A	6	6	248036	248041	100 %	0 %	0 %	0 %	403530110
4051	NC_018533	CGAAA	2	10	248045	248054	60 %	0 %	20 %	20 %	403530110
4052	NC_018533	AAT	2	6	248057	248062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530110
4053	NC_018533	CAA	2	6	248110	248115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530110
4054	NC_018533	CAT	2	6	248161	248166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530110
4055	NC_018533	AGAA	2	8	248222	248229	75 %	0 %	25 %	0 %	403530110
4056	NC_018533	T	6	6	248240	248245	0 %	100 %	0 %	0 %	403530110
4057	NC_018533	T	7	7	248286	248292	0 %	100 %	0 %	0 %	403530110
4058	NC_018533	GAA	2	6	248380	248385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530110
4059	NC_018533	GGT	2	6	248393	248398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530110
4060	NC_018533	CTT	2	6	248458	248463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530110
4061	NC_018533	CTT	2	6	248557	248562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530110
4062	NC_018533	TCA	2	6	248604	248609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530110
4063	NC_018533	AGTG	2	8	248618	248625	25 %	25 %	50 %	0 %	403530110
4064	NC_018533	TCT	2	6	248712	248717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530110
4065	NC_018533	A	6	6	248932	248937	100 %	0 %	0 %	0 %	403530111
4066	NC_018533	CTG	2	6	248963	248968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530111
4067	NC_018533	ATAA	2	8	248969	248976	75 %	25 %	0 %	0 %	403530111
4068	NC_018533	GTT	2	6	249043	249048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530111
4069	NC_018533	T	6	6	249086	249091	0 %	100 %	0 %	0 %	403530111
4070	NC_018533	CTT	2	6	249116	249121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530111
4071	NC_018533	AGA	2	6	249219	249224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530111
4072	NC_018533	TCG	2	6	249247	249252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530111
4073	NC_018533	TGT	2	6	249270	249275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530111
4074	NC_018533	A	6	6	249280	249285	100 %	0 %	0 %	0 %	403530111
4075	NC_018533	TTCC	2	8	249311	249318	0 %	50 %	0 %	50 %	403530111
4076	NC_018533	CTGA	2	8	249347	249354	25 %	25 %	25 %	25 %	403530111
4077	NC_018533	GTGA	2	8	249398	249405	25 %	25 %	50 %	0 %	403530111
4078	NC_018533	TGC	2	6	249471	249476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530111
4079	NC_018533	GAAA	2	8	249568	249575	75 %	0 %	25 %	0 %	403530111
4080	NC_018533	A	7	7	249573	249579	100 %	0 %	0 %	0 %	403530111
4081	NC_018533	TTC	2	6	249585	249590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530111
4082	NC_018533	ACA	2	6	249616	249621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530111
4083	NC_018533	TGT	2	6	249643	249648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530111
4084	NC_018533	AAAGAT	2	12	249682	249693	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403530111
4085	NC_018533	TGA	2	6	249761	249766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530111
4086	NC_018533	CAG	2	6	249809	249814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530111
4087	NC_018533	T	7	7	249851	249857	0 %	100 %	0 %	0 %	403530111
4088	NC_018533	TAT	2	6	250101	250106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530112
4089	NC_018533	CAG	2	6	250247	250252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530112
4090	NC_018533	ATG	2	6	250378	250383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530112
4091	NC_018533	AGA	2	6	250443	250448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530112
4092	NC_018533	TCT	2	6	250621	250626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530112
4093	NC_018533	TGTAT	2	10	250648	250657	20 %	60 %	20 %	0 %	403530113
4094	NC_018533	TAT	2	6	250695	250700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530113
4095	NC_018533	ATG	2	6	250709	250714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530113
4096	NC_018533	ACA	2	6	250758	250763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530113
4097	NC_018533	TGA	2	6	250808	250813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530113
4098	NC_018533	ATT	2	6	250942	250947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530113
4099	NC_018533	TTG	2	6	250955	250960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530113
4100	NC_018533	A	8	8	250985	250992	100 %	0 %	0 %	0 %	403530113
4101	NC_018533	AAGTAA	2	12	251000	251011	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403530113
4102	NC_018533	TTG	2	6	251051	251056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530113
4103	NC_018533	A	6	6	251095	251100	100 %	0 %	0 %	0 %	403530113
4104	NC_018533	AGATTG	2	12	251129	251140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530113
4105	NC_018533	ATA	2	6	251150	251155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530113
4106	NC_018533	TGA	3	9	251301	251309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530113
4107	NC_018533	CTT	2	6	251320	251325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530113
4108	NC_018533	GATCAA	2	12	251326	251337	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403530113
4109	NC_018533	ATT	2	6	251338	251343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530113
4110	NC_018533	AAG	2	6	251345	251350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530113
4111	NC_018533	ATG	2	6	251369	251374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530113
4112	NC_018533	TGC	2	6	251430	251435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530113
4113	NC_018533	TGG	2	6	251474	251479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530113
4114	NC_018533	AAC	2	6	251484	251489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530113
4115	NC_018533	ACG	2	6	251643	251648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530113
4116	NC_018533	AT	3	6	251685	251690	50 %	50 %	0 %	0 %	403530113
4117	NC_018533	GGA	2	6	251706	251711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530113
4118	NC_018533	GAT	2	6	251731	251736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530113
4119	NC_018533	CGT	2	6	251800	251805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530113
4120	NC_018533	GCT	2	6	251887	251892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530113
4121	NC_018533	TGC	2	6	251919	251924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530113
4122	NC_018533	TTGTTT	2	12	251965	251976	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	403530114
4123	NC_018533	T	6	6	252039	252044	0 %	100 %	0 %	0 %	403530114
4124	NC_018533	CAA	2	6	252076	252081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530114
4125	NC_018533	ACC	2	6	252092	252097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530114
4126	NC_018533	TAA	2	6	252124	252129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530114
4127	NC_018533	GT	3	6	252156	252161	0 %	50 %	50 %	0 %	403530114
4128	NC_018533	GCT	2	6	252285	252290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530114
4129	NC_018533	CTT	2	6	252342	252347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530114
4130	NC_018533	GAAA	2	8	252363	252370	75 %	0 %	25 %	0 %	403530114
4131	NC_018533	CCAG	2	8	252374	252381	25 %	0 %	25 %	50 %	403530114
4132	NC_018533	GCA	2	6	252435	252440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530114
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4134	NC_018533	ATTT	2	8	252490	252497	25 %	75 %	0 %	0 %	403530114
4135	NC_018533	TGTTT	2	10	252532	252541	0 %	80 %	20 %	0 %	403530114
4136	NC_018533	ATCT	2	8	252542	252549	25 %	50 %	0 %	25 %	403530114
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4151	NC_018533	GTTT	2	8	253068	253075	0 %	75 %	25 %	0 %	403530115
4152	NC_018533	T	6	6	253085	253090	0 %	100 %	0 %	0 %	403530115
4153	NC_018533	CTTTT	2	10	253102	253111	0 %	80 %	0 %	20 %	403530115
4154	NC_018533	TCA	2	6	253196	253201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530115
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4173	NC_018533	TTGC	2	8	254331	254338	0 %	50 %	25 %	25 %	403530115
4174	NC_018533	TCT	2	6	254387	254392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530115
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4177	NC_018533	TGA	2	6	254583	254588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530115
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4185	NC_018533	A	6	6	255073	255078	100 %	0 %	0 %	0 %	403530115
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4188	NC_018533	T	6	6	255243	255248	0 %	100 %	0 %	0 %	403530115
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4226	NC_018533	GCG	2	6	257997	258002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530118
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4229	NC_018533	TCATTT	2	12	258057	258068	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403530118
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4231	NC_018533	ATC	2	6	258119	258124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530118
4232	NC_018533	AAC	2	6	258175	258180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530118
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4234	NC_018533	CAA	2	6	258319	258324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530118
4235	NC_018533	TCT	2	6	258438	258443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530118
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4237	NC_018533	ATC	2	6	258488	258493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530118
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4239	NC_018533	CCAG	2	8	258716	258723	25 %	0 %	25 %	50 %	403530118
4240	NC_018533	GAC	2	6	258730	258735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530118
4241	NC_018533	T	7	7	258739	258745	0 %	100 %	0 %	0 %	403530118
4242	NC_018533	TCA	2	6	258777	258782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530119
4243	NC_018533	TGA	2	6	258992	258997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530119
4244	NC_018533	ATC	2	6	259073	259078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530119
4245	NC_018533	TGC	2	6	259092	259097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530119
4246	NC_018533	AGC	2	6	259622	259627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530120
4247	NC_018533	ATG	2	6	259653	259658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530120
4248	NC_018533	TTA	2	6	259710	259715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530120
4249	NC_018533	GC	3	6	259808	259813	0 %	0 %	50 %	50 %	403530120
4250	NC_018533	TCA	2	6	259930	259935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530120
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4252	NC_018533	CTT	2	6	260113	260118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530120
4253	NC_018533	GTC	2	6	260135	260140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530120
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4270	NC_018533	TGC	2	6	260691	260696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530120
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4277	NC_018533	AATGGT	2	12	261017	261028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530120
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4282	NC_018533	CTTC	2	8	261138	261145	0 %	50 %	0 %	50 %	403530120
4283	NC_018533	ACG	2	6	261179	261184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530120
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4292	NC_018533	TG	3	6	261514	261519	0 %	50 %	50 %	0 %	403530120
4293	NC_018533	CTT	2	6	261520	261525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530120
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4303	NC_018533	TGTAT	2	10	262044	262053	20 %	60 %	20 %	0 %	403530121
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4317	NC_018533	CCAG	2	8	262673	262680	25 %	0 %	25 %	50 %	403530122
4318	NC_018533	GTC	2	6	262685	262690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530122
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4323	NC_018533	TCA	2	6	262815	262820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530122
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4330	NC_018533	TTC	2	6	263051	263056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530122
4331	NC_018533	CTGTT	2	10	263057	263066	0 %	60 %	20 %	20 %	403530122
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4340	NC_018533	GAAA	2	8	263490	263497	75 %	0 %	25 %	0 %	403530122
4341	NC_018533	AATT	2	8	263579	263586	50 %	50 %	0 %	0 %	403530122
4342	NC_018533	CGT	2	6	263592	263597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530122
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4346	NC_018533	TTC	2	6	263693	263698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530122
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4350	NC_018533	TAATT	2	10	263906	263915	40 %	60 %	0 %	0 %	403530122
4351	NC_018533	GC	3	6	263972	263977	0 %	0 %	50 %	50 %	403530122
4352	NC_018533	TCGA	2	8	264024	264031	25 %	25 %	25 %	25 %	403530122
4353	NC_018533	TCT	2	6	264187	264192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530123
4354	NC_018533	AAAT	2	8	264194	264201	75 %	25 %	0 %	0 %	403530123
4355	NC_018533	T	8	8	264220	264227	0 %	100 %	0 %	0 %	403530123
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4358	NC_018533	T	6	6	264381	264386	0 %	100 %	0 %	0 %	403530123
4359	NC_018533	A	7	7	264441	264447	100 %	0 %	0 %	0 %	403530123
4360	NC_018533	GAGAT	2	10	264482	264491	40 %	20 %	40 %	0 %	403530123
4361	NC_018533	AAG	2	6	264531	264536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530123
4362	NC_018533	TCT	2	6	264568	264573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530123
4363	NC_018533	AGC	2	6	264690	264695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530123
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4366	NC_018533	TCAT	2	8	264745	264752	25 %	50 %	0 %	25 %	403530123
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4491	NC_018533	TCA	2	6	271065	271070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530130
4492	NC_018533	CAT	2	6	271172	271177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530130
4493	NC_018533	GAA	2	6	271240	271245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530130
4494	NC_018533	CCG	2	6	271270	271275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530130
4495	NC_018533	ATG	2	6	271299	271304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530130
4496	NC_018533	GCA	2	6	271323	271328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530130
4497	NC_018533	CTG	2	6	271360	271365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530130
4498	NC_018533	GT	3	6	271389	271394	0 %	50 %	50 %	0 %	403530130
4499	NC_018533	TA	3	6	271406	271411	50 %	50 %	0 %	0 %	403530130
4500	NC_018533	T	7	7	271444	271450	0 %	100 %	0 %	0 %	403530130

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