MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 25360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_018533	ACA	2	6	910493	910498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530633
15002	NC_018533	TTA	2	6	910558	910563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530633
15003	NC_018533	CAA	2	6	910592	910597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530633
15004	NC_018533	ATA	2	6	910647	910652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530633
15005	NC_018533	TTA	2	6	910672	910677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530633
15006	NC_018533	T	7	7	910747	910753	0 %	100 %	0 %	0 %	403530633
15007	NC_018533	TCT	2	6	910774	910779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530633
15008	NC_018533	AAG	2	6	910809	910814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530633
15009	NC_018533	ACA	2	6	910858	910863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530633
15010	NC_018533	CAT	2	6	910946	910951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530633
15011	NC_018533	ATC	2	6	911026	911031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530633
15012	NC_018533	TG	3	6	911059	911064	0 %	50 %	50 %	0 %	403530633
15013	NC_018533	GCCC	2	8	911076	911083	0 %	0 %	25 %	75 %	403530633
15014	NC_018533	CAA	2	6	911087	911092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530633
15015	NC_018533	GAC	2	6	911185	911190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530633
15016	NC_018533	A	7	7	911276	911282	100 %	0 %	0 %	0 %	403530634
15017	NC_018533	ATA	2	6	911285	911290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530634
15018	NC_018533	TAA	2	6	911391	911396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530634
15019	NC_018533	A	7	7	911399	911405	100 %	0 %	0 %	0 %	403530634
15020	NC_018533	AAT	2	6	911410	911415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530634
15021	NC_018533	T	6	6	911415	911420	0 %	100 %	0 %	0 %	403530634
15022	NC_018533	GCT	2	6	911483	911488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530634
15023	NC_018533	CCAA	2	8	911611	911618	50 %	0 %	0 %	50 %	403530634
15024	NC_018533	CAG	2	6	911658	911663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530634
15025	NC_018533	A	6	6	911699	911704	100 %	0 %	0 %	0 %	403530634
15026	NC_018533	A	6	6	911723	911728	100 %	0 %	0 %	0 %	403530634
15027	NC_018533	ATA	2	6	911741	911746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530634
15028	NC_018533	CAG	2	6	911757	911762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530634
15029	NC_018533	ATA	2	6	911782	911787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530634
15030	NC_018533	CAA	2	6	911829	911834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530634
15031	NC_018533	AGA	2	6	911869	911874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530634
15032	NC_018533	ATC	2	6	911926	911931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530634
15033	NC_018533	AATACC	2	12	911932	911943	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	403530634
15034	NC_018533	ATAA	2	8	911955	911962	75 %	25 %	0 %	0 %	403530634
15035	NC_018533	GGA	2	6	911963	911968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530634
15036	NC_018533	AC	3	6	911981	911986	50 %	0 %	0 %	50 %	403530634
15037	NC_018533	A	6	6	911993	911998	100 %	0 %	0 %	0 %	403530634
15038	NC_018533	A	6	6	912013	912018	100 %	0 %	0 %	0 %	403530634
15039	NC_018533	TCA	2	6	912108	912113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530635
15040	NC_018533	TTG	2	6	912116	912121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530635
15041	NC_018533	CCA	2	6	912139	912144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530635
15042	NC_018533	TCA	2	6	912156	912161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530635
15043	NC_018533	TCCT	2	8	912332	912339	0 %	50 %	0 %	50 %	403530635
15044	NC_018533	TGAA	2	8	912422	912429	50 %	25 %	25 %	0 %	403530635
15045	NC_018533	ATC	2	6	912530	912535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530635
15046	NC_018533	TTTC	2	8	912538	912545	0 %	75 %	0 %	25 %	403530635
15047	NC_018533	ATAG	2	8	912554	912561	50 %	25 %	25 %	0 %	403530635
15048	NC_018533	ATTG	2	8	912581	912588	25 %	50 %	25 %	0 %	403530635
15049	NC_018533	CCA	2	6	912621	912626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530635
15050	NC_018533	TGCAC	2	10	912681	912690	20 %	20 %	20 %	40 %	403530635
15051	NC_018533	GC	3	6	912745	912750	0 %	0 %	50 %	50 %	403530635
15052	NC_018533	ACC	2	6	912752	912757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530635
15053	NC_018533	CAAT	2	8	912769	912776	50 %	25 %	0 %	25 %	403530635
15054	NC_018533	TAT	2	6	912784	912789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530635
15055	NC_018533	TAGGA	2	10	912797	912806	40 %	20 %	40 %	0 %	403530635
15056	NC_018533	CTG	2	6	912846	912851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530635
15057	NC_018533	TTG	2	6	912934	912939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530635
15058	NC_018533	CTT	2	6	912970	912975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530635
15059	NC_018533	TTG	2	6	913071	913076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530635
15060	NC_018533	AAG	2	6	913097	913102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530635
15061	NC_018533	ACCGCA	2	12	913142	913153	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	403530636
15062	NC_018533	ATC	2	6	913202	913207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530636
15063	NC_018533	T	6	6	913277	913282	0 %	100 %	0 %	0 %	403530636
15064	NC_018533	ATC	2	6	913292	913297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530636
15065	NC_018533	ACCC	2	8	913345	913352	25 %	0 %	0 %	75 %	403530636
15066	NC_018533	GCA	2	6	913419	913424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530636
15067	NC_018533	CATT	2	8	913441	913448	25 %	50 %	0 %	25 %	403530636
15068	NC_018533	TGA	2	6	913723	913728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530637
15069	NC_018533	CG	3	6	913796	913801	0 %	0 %	50 %	50 %	403530637
15070	NC_018533	GGC	2	6	913913	913918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403530637
15071	NC_018533	TACAA	3	15	914085	914099	60 %	20 %	0 %	20 %	403530637
15072	NC_018533	TGC	2	6	914146	914151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530637
15073	NC_018533	TGA	2	6	914158	914163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530637
15074	NC_018533	TGA	2	6	914188	914193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530637
15075	NC_018533	TAC	2	6	914256	914261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530637
15076	NC_018533	CAGA	2	8	914323	914330	50 %	0 %	25 %	25 %	403530637
15077	NC_018533	AAC	2	6	914332	914337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530637
15078	NC_018533	TGG	2	6	914340	914345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530637
15079	NC_018533	CAA	2	6	914411	914416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530637
15080	NC_018533	A	6	6	914473	914478	100 %	0 %	0 %	0 %	403530637
15081	NC_018533	TTA	2	6	914497	914502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530637
15082	NC_018533	GTC	2	6	914520	914525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530637
15083	NC_018533	TTA	2	6	914566	914571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530637
15084	NC_018533	AAT	2	6	914720	914725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530637
15085	NC_018533	A	9	9	914787	914795	100 %	0 %	0 %	0 %	403530638
15086	NC_018533	A	6	6	914798	914803	100 %	0 %	0 %	0 %	403530638
15087	NC_018533	A	6	6	914830	914835	100 %	0 %	0 %	0 %	403530638
15088	NC_018533	TCC	2	6	914872	914877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530638
15089	NC_018533	TGC	2	6	914911	914916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530638
15090	NC_018533	TATCAA	2	12	915031	915042	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	403530638
15091	NC_018533	A	6	6	915086	915091	100 %	0 %	0 %	0 %	403530638
15092	NC_018533	GTAT	2	8	915145	915152	25 %	50 %	25 %	0 %	403530638
15093	NC_018533	CATG	2	8	915172	915179	25 %	25 %	25 %	25 %	403530638
15094	NC_018533	TTG	2	6	915234	915239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530638
15095	NC_018533	ATG	2	6	915270	915275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530638
15096	NC_018533	A	6	6	915339	915344	100 %	0 %	0 %	0 %	403530638
15097	NC_018533	ATG	2	6	915488	915493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530638
15098	NC_018533	GC	4	8	915575	915582	0 %	0 %	50 %	50 %	403530638
15099	NC_018533	CAC	2	6	915642	915647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530638
15100	NC_018533	AGA	2	6	915664	915669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530638
15101	NC_018533	GTTCC	2	10	915694	915703	0 %	40 %	20 %	40 %	403530638
15102	NC_018533	GAT	2	6	915716	915721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530638
15103	NC_018533	TGC	2	6	915766	915771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530638
15104	NC_018533	TGA	2	6	915811	915816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530638
15105	NC_018533	T	7	7	915912	915918	0 %	100 %	0 %	0 %	403530638
15106	NC_018533	TGT	2	6	916000	916005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530638
15107	NC_018533	AGA	2	6	916006	916011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530638
15108	NC_018533	ATG	2	6	916037	916042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530638
15109	NC_018533	TTGATT	2	12	916068	916079	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	403530638
15110	NC_018533	CAT	2	6	916282	916287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530638
15111	NC_018533	TGA	2	6	916411	916416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530638
15112	NC_018533	ATC	2	6	916471	916476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530638
15113	NC_018533	AGC	2	6	916501	916506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530638
15114	NC_018533	CTT	2	6	916973	916978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530639
15115	NC_018533	T	6	6	917001	917006	0 %	100 %	0 %	0 %	403530639
15116	NC_018533	GAA	2	6	917011	917016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530639
15117	NC_018533	GAA	2	6	917020	917025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530639
15118	NC_018533	TTC	2	6	917031	917036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530639
15119	NC_018533	ATG	2	6	917048	917053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530639
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15121	NC_018533	A	6	6	917150	917155	100 %	0 %	0 %	0 %	403530639
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15243	NC_018533	TTGTTT	2	12	922437	922448	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	403530643
15244	NC_018533	TTA	2	6	922502	922507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530643
15245	NC_018533	T	6	6	922603	922608	0 %	100 %	0 %	0 %	403530643
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15357	NC_018533	T	6	6	933180	933185	0 %	100 %	0 %	0 %	403530652
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15360	NC_018533	A	7	7	933247	933253	100 %	0 %	0 %	0 %	403530652
15361	NC_018533	CAT	2	6	933257	933262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530652
15362	NC_018533	GCT	2	6	933341	933346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530652
15363	NC_018533	CTG	2	6	933356	933361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530652
15364	NC_018533	ACC	2	6	933381	933386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530652
15365	NC_018533	CTT	2	6	933423	933428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530652
15366	NC_018533	ACA	2	6	933484	933489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530652
15367	NC_018533	TTG	2	6	933490	933495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530652
15368	NC_018533	CCTT	2	8	933502	933509	0 %	50 %	0 %	50 %	403530652
15369	NC_018533	GA	3	6	933585	933590	50 %	0 %	50 %	0 %	403530652
15370	NC_018533	ATC	2	6	933627	933632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530652
15371	NC_018533	A	7	7	933650	933656	100 %	0 %	0 %	0 %	403530652
15372	NC_018533	A	6	6	933659	933664	100 %	0 %	0 %	0 %	403530652
15373	NC_018533	A	7	7	933842	933848	100 %	0 %	0 %	0 %	403530653
15374	NC_018533	ATCA	2	8	933967	933974	50 %	25 %	0 %	25 %	403530653
15375	NC_018533	TTC	2	6	934060	934065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530653
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15377	NC_018533	ACC	2	6	934112	934117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530653
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15379	NC_018533	ATT	2	6	934205	934210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530653
15380	NC_018533	ATT	2	6	934228	934233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530654
15381	NC_018533	TTC	2	6	934235	934240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530654
15382	NC_018533	TCA	2	6	934275	934280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530654
15383	NC_018533	CAT	2	6	934294	934299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530654
15384	NC_018533	TTCAGA	2	12	934301	934312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403530654
15385	NC_018533	T	6	6	934334	934339	0 %	100 %	0 %	0 %	403530654
15386	NC_018533	TCG	2	6	934372	934377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530654
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15389	NC_018533	CTA	2	6	934477	934482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530654
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15392	NC_018533	CAG	2	6	934711	934716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530654
15393	NC_018533	AG	3	6	934786	934791	50 %	0 %	50 %	0 %	403530654
15394	NC_018533	GTT	2	6	934908	934913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530654
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15398	NC_018533	TCA	2	6	934968	934973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530654
15399	NC_018533	ACG	2	6	935030	935035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530654
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15405	NC_018533	GAAAA	2	10	935229	935238	80 %	0 %	20 %	0 %	403530654
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15476	NC_018533	A	7	7	938612	938618	100 %	0 %	0 %	0 %	403530656
15477	NC_018533	GC	3	6	938627	938632	0 %	0 %	50 %	50 %	403530656
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15480	NC_018533	TGT	2	6	938705	938710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530656
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