MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 25360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_018533	TCA	2	6	851243	851248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530588
14002	NC_018533	TCA	2	6	851252	851257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530588
14003	NC_018533	TAA	2	6	851320	851325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530588
14004	NC_018533	ATC	2	6	851326	851331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530588
14005	NC_018533	GCA	2	6	851378	851383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530588
14006	NC_018533	CAA	2	6	851412	851417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530588
14007	NC_018533	CAC	2	6	851421	851426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530588
14008	NC_018533	CCAT	2	8	851494	851501	25 %	25 %	0 %	50 %	403530588
14009	NC_018533	TAT	2	6	851526	851531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530588
14010	NC_018533	ATG	2	6	851624	851629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530588
14011	NC_018533	GCA	2	6	851684	851689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530588
14012	NC_018533	A	6	6	851734	851739	100 %	0 %	0 %	0 %	403530588
14013	NC_018533	TCA	2	6	851885	851890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530588
14014	NC_018533	GCA	2	6	851930	851935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530588
14015	NC_018533	TTC	2	6	851959	851964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530588
14016	NC_018533	CAA	2	6	851997	852002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530588
14017	NC_018533	CTC	2	6	852094	852099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530588
14018	NC_018533	ATG	2	6	852120	852125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530588
14019	NC_018533	A	6	6	852178	852183	100 %	0 %	0 %	0 %	403530588
14020	NC_018533	ATTGA	2	10	852205	852214	40 %	40 %	20 %	0 %	403530588
14021	NC_018533	AAATT	2	10	852527	852536	60 %	40 %	0 %	0 %	403530589
14022	NC_018533	CAG	2	6	852558	852563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530589
14023	NC_018533	T	6	6	852582	852587	0 %	100 %	0 %	0 %	403530589
14024	NC_018533	CTT	2	6	852651	852656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530589
14025	NC_018533	CTT	2	6	852684	852689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530589
14026	NC_018533	CAC	2	6	852711	852716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530589
14027	NC_018533	CAA	2	6	852720	852725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530589
14028	NC_018533	CAG	2	6	852753	852758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530589
14029	NC_018533	AGC	3	9	852763	852771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530589
14030	NC_018533	AGC	3	9	852799	852807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530589
14031	NC_018533	TTC	2	6	852823	852828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530589
14032	NC_018533	CAG	2	6	852846	852851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530589
14033	NC_018533	GTTAG	2	10	852863	852872	20 %	40 %	40 %	0 %	403530589
14034	NC_018533	TCT	2	6	852878	852883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530589
14035	NC_018533	CCT	2	6	853027	853032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530590
14036	NC_018533	CAG	2	6	853066	853071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530590
14037	NC_018533	TTG	2	6	853192	853197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530590
14038	NC_018533	TCT	2	6	853278	853283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530590
14039	NC_018533	CGAA	2	8	853409	853416	50 %	0 %	25 %	25 %	403530590
14040	NC_018533	AAT	2	6	853447	853452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530590
14041	NC_018533	CAA	3	9	853456	853464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530590
14042	NC_018533	TAG	2	6	853946	853951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530591
14043	NC_018533	AT	3	6	853972	853977	50 %	50 %	0 %	0 %	403530591
14044	NC_018533	TAA	2	6	854006	854011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530591
14045	NC_018533	CTA	2	6	854039	854044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530591
14046	NC_018533	TCT	2	6	854045	854050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530591
14047	NC_018533	AAG	2	6	854060	854065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530591
14048	NC_018533	CAC	2	6	854120	854125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530591
14049	NC_018533	GAC	2	6	854219	854224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530591
14050	NC_018533	CAA	2	6	854225	854230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530591
14051	NC_018533	CAT	2	6	854235	854240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530591
14052	NC_018533	TCA	2	6	854479	854484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530591
14053	NC_018533	CAC	2	6	854608	854613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530592
14054	NC_018533	TGC	2	6	854656	854661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530592
14055	NC_018533	GA	3	6	854724	854729	50 %	0 %	50 %	0 %	403530592
14056	NC_018533	TCC	2	6	854730	854735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530592
14057	NC_018533	GACA	2	8	854737	854744	50 %	0 %	25 %	25 %	403530592
14058	NC_018533	CTTC	2	8	854781	854788	0 %	50 %	0 %	50 %	403530592
14059	NC_018533	AGG	2	6	854806	854811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530592
14060	NC_018533	TAA	2	6	854846	854851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530592
14061	NC_018533	CGC	2	6	854896	854901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530592
14062	NC_018533	T	8	8	855018	855025	0 %	100 %	0 %	0 %	403530592
14063	NC_018533	ATA	2	6	855029	855034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530592
14064	NC_018533	TTC	3	9	855263	855271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530593
14065	NC_018533	ATA	2	6	855343	855348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530593
14066	NC_018533	A	6	6	855444	855449	100 %	0 %	0 %	0 %	403530593
14067	NC_018533	GAT	2	6	855478	855483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530593
14068	NC_018533	A	6	6	855527	855532	100 %	0 %	0 %	0 %	403530593
14069	NC_018533	ACG	2	6	855560	855565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530593
14070	NC_018533	CAA	2	6	855571	855576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530593
14071	NC_018533	GAT	2	6	855610	855615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530593
14072	NC_018533	CCT	2	6	855634	855639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530593
14073	NC_018533	TTTTC	2	10	855658	855667	0 %	80 %	0 %	20 %	403530593
14074	NC_018533	AGC	2	6	855701	855706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530593
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14076	NC_018533	ACG	2	6	855862	855867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530594
14077	NC_018533	TCA	2	6	855939	855944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530594
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14079	NC_018533	C	6	6	856317	856322	0 %	0 %	0 %	100 %	403530595
14080	NC_018533	TTC	2	6	856347	856352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530595
14081	NC_018533	A	6	6	856488	856493	100 %	0 %	0 %	0 %	403530595
14082	NC_018533	GTC	2	6	856696	856701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530595
14083	NC_018533	TAA	2	6	856748	856753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530595
14084	NC_018533	CAC	2	6	856754	856759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530595
14085	NC_018533	A	6	6	856802	856807	100 %	0 %	0 %	0 %	403530595
14086	NC_018533	TA	3	6	856860	856865	50 %	50 %	0 %	0 %	403530595
14087	NC_018533	TATCTT	2	12	856916	856927	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403530595
14088	NC_018533	GCC	2	6	856933	856938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530595
14089	NC_018533	ATC	2	6	856965	856970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530595
14090	NC_018533	CAA	2	6	857015	857020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530595
14091	NC_018533	CAT	2	6	857036	857041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530595
14092	NC_018533	TTA	2	6	857056	857061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530595
14093	NC_018533	ACA	2	6	857068	857073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530595
14094	NC_018533	GCAA	2	8	857098	857105	50 %	0 %	25 %	25 %	403530595
14095	NC_018533	AAC	2	6	857148	857153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530595
14096	NC_018533	CATC	2	8	857165	857172	25 %	25 %	0 %	50 %	403530595
14097	NC_018533	TTC	2	6	857194	857199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530595
14098	NC_018533	CTC	2	6	857298	857303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530595
14099	NC_018533	GCT	2	6	857359	857364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530595
14100	NC_018533	TTGT	2	8	857464	857471	0 %	75 %	25 %	0 %	403530595
14101	NC_018533	GAAA	2	8	858034	858041	75 %	0 %	25 %	0 %	403530596
14102	NC_018533	A	6	6	858039	858044	100 %	0 %	0 %	0 %	403530596
14103	NC_018533	GATC	2	8	858077	858084	25 %	25 %	25 %	25 %	403530596
14104	NC_018533	A	7	7	858092	858098	100 %	0 %	0 %	0 %	403530596
14105	NC_018533	AGC	2	6	858136	858141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530596
14106	NC_018533	A	6	6	858199	858204	100 %	0 %	0 %	0 %	403530596
14107	NC_018533	AAC	2	6	858309	858314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530596
14108	NC_018533	TCA	2	6	858343	858348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530596
14109	NC_018533	TTGTCA	2	12	858414	858425	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403530596
14110	NC_018533	TAT	2	6	858460	858465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530596
14111	NC_018533	TTA	2	6	858498	858503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530596
14112	NC_018533	TAAT	2	8	858570	858577	50 %	50 %	0 %	0 %	403530596
14113	NC_018533	GAA	2	6	858690	858695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530596
14114	NC_018533	A	7	7	858737	858743	100 %	0 %	0 %	0 %	403530596
14115	NC_018533	GCA	2	6	858815	858820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530596
14116	NC_018533	CAT	2	6	860229	860234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530597
14117	NC_018533	CATC	2	8	860278	860285	25 %	25 %	0 %	50 %	403530597
14118	NC_018533	CGC	2	6	860297	860302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403530597
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14120	NC_018533	AC	3	6	860380	860385	50 %	0 %	0 %	50 %	403530597
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14485	NC_018533	TAAAA	2	10	882384	882393	80 %	20 %	0 %	0 %	403530616
14486	NC_018533	A	6	6	882390	882395	100 %	0 %	0 %	0 %	403530616
14487	NC_018533	TGA	2	6	882616	882621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530617
14488	NC_018533	CTG	2	6	882627	882632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530617
14489	NC_018533	A	6	6	882654	882659	100 %	0 %	0 %	0 %	403530617
14490	NC_018533	TG	3	6	882660	882665	0 %	50 %	50 %	0 %	403530617
14491	NC_018533	CTT	2	6	882710	882715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530617
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14493	NC_018533	GCA	2	6	882785	882790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530618
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14497	NC_018533	TTTG	2	8	883058	883065	0 %	75 %	25 %	0 %	403530618
14498	NC_018533	AGT	2	6	883084	883089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530618
14499	NC_018533	TAT	2	6	883115	883120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530618
14500	NC_018533	ACT	2	6	883167	883172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530618

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