MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bartonella quintana RM-11 chromosome

Total Repeats: 25360

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_018533	TGC	2	6	610089	610094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530409
10002	NC_018533	TATTGA	2	12	610116	610127	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	403530409
10003	NC_018533	GATT	2	8	610133	610140	25 %	50 %	25 %	0 %	403530409
10004	NC_018533	A	6	6	610142	610147	100 %	0 %	0 %	0 %	403530409
10005	NC_018533	TTG	2	6	610175	610180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530409
10006	NC_018533	GCT	2	6	610210	610215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530409
10007	NC_018533	TGA	2	6	610257	610262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530409
10008	NC_018533	TGG	2	6	610271	610276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530409
10009	NC_018533	CTCA	2	8	610289	610296	25 %	25 %	0 %	50 %	403530409
10010	NC_018533	CAA	2	6	610310	610315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530409
10011	NC_018533	GA	3	6	610376	610381	50 %	0 %	50 %	0 %	403530409
10012	NC_018533	GAAGTT	2	12	610411	610422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530409
10013	NC_018533	CGT	2	6	610438	610443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530409
10014	NC_018533	GAT	2	6	610486	610491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530409
10015	NC_018533	TTG	2	6	610493	610498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530409
10016	NC_018533	TTA	2	6	610532	610537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530409
10017	NC_018533	GAC	2	6	610581	610586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530409
10018	NC_018533	TTG	2	6	610615	610620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530409
10019	NC_018533	TTG	2	6	610667	610672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403530409
10020	NC_018533	ATT	2	6	610741	610746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530409
10021	NC_018533	G	6	6	610753	610758	0 %	0 %	100 %	0 %	403530409
10022	NC_018533	AGAA	2	8	610832	610839	75 %	0 %	25 %	0 %	403530409
10023	NC_018533	AAC	2	6	610872	610877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530409
10024	NC_018533	TTC	2	6	610910	610915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530409
10025	NC_018533	TAT	2	6	610989	610994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530409
10026	NC_018533	AAT	2	6	611035	611040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530409
10027	NC_018533	CAA	2	6	611122	611127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530409
10028	NC_018533	CGT	2	6	611131	611136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530409
10029	NC_018533	ATT	2	6	611182	611187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530409
10030	NC_018533	TTGG	2	8	611215	611222	0 %	50 %	50 %	0 %	403530409
10031	NC_018533	AAT	2	6	611289	611294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530409
10032	NC_018533	GT	3	6	611358	611363	0 %	50 %	50 %	0 %	403530409
10033	NC_018533	ATG	2	6	611366	611371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530409
10034	NC_018533	AAC	2	6	611375	611380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530409
10035	NC_018533	AT	3	6	611409	611414	50 %	50 %	0 %	0 %	403530409
10036	NC_018533	AAG	2	6	611529	611534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530410
10037	NC_018533	T	7	7	611662	611668	0 %	100 %	0 %	0 %	403530410
10038	NC_018533	CAG	2	6	611690	611695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530410
10039	NC_018533	TTGG	2	8	611701	611708	0 %	50 %	50 %	0 %	403530410
10040	NC_018533	GTTTG	2	10	611756	611765	0 %	60 %	40 %	0 %	403530410
10041	NC_018533	AGGT	2	8	611784	611791	25 %	25 %	50 %	0 %	403530410
10042	NC_018533	CCA	2	6	611810	611815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403530410
10043	NC_018533	TAT	2	6	611824	611829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530410
10044	NC_018533	ATT	2	6	611844	611849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530410
10045	NC_018533	GGCA	2	8	611851	611858	25 %	0 %	50 %	25 %	403530410
10046	NC_018533	CGT	2	6	611891	611896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530410
10047	NC_018533	A	7	7	611924	611930	100 %	0 %	0 %	0 %	403530410
10048	NC_018533	ATG	2	6	611973	611978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530410
10049	NC_018533	T	7	7	612007	612013	0 %	100 %	0 %	0 %	403530410
10050	NC_018533	AAGCA	2	10	612018	612027	60 %	0 %	20 %	20 %	403530410
10051	NC_018533	TAT	2	6	612041	612046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530410
10052	NC_018533	AT	3	6	612067	612072	50 %	50 %	0 %	0 %	403530410
10053	NC_018533	TCCATA	2	12	612126	612137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530410
10054	NC_018533	ACT	2	6	612149	612154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530410
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10056	NC_018533	T	6	6	612454	612459	0 %	100 %	0 %	0 %	403530411
10057	NC_018533	TTA	2	6	612487	612492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530411
10058	NC_018533	TTGT	2	8	612523	612530	0 %	75 %	25 %	0 %	403530411
10059	NC_018533	AAGA	2	8	612564	612571	75 %	0 %	25 %	0 %	403530411
10060	NC_018533	TA	3	6	612582	612587	50 %	50 %	0 %	0 %	403530411
10061	NC_018533	GGT	2	6	612597	612602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530411
10062	NC_018533	GTA	2	6	612603	612608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530411
10063	NC_018533	TCC	2	6	612650	612655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530411
10064	NC_018533	GCAG	2	8	612677	612684	25 %	0 %	50 %	25 %	403530411
10065	NC_018533	TAT	2	6	612752	612757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530411
10066	NC_018533	TGG	2	6	612773	612778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530411
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10068	NC_018533	AAG	2	6	612928	612933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530411
10069	NC_018533	TGA	2	6	612953	612958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530411
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10072	NC_018533	GAA	2	6	613344	613349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530412
10073	NC_018533	TCT	2	6	613356	613361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530412
10074	NC_018533	CAG	2	6	613434	613439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530412
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10076	NC_018533	TTC	2	6	613537	613542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530412
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10078	NC_018533	TAT	2	6	613595	613600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530412
10079	NC_018533	ACT	2	6	613629	613634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530412
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10081	NC_018533	CTT	2	6	613686	613691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530412
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10085	NC_018533	GGAA	2	8	613838	613845	50 %	0 %	50 %	0 %	403530412
10086	NC_018533	TCC	2	6	613859	613864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403530412
10087	NC_018533	TTC	2	6	613897	613902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530412
10088	NC_018533	ACA	2	6	613911	613916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530412
10089	NC_018533	TATT	2	8	613924	613931	25 %	75 %	0 %	0 %	403530412
10090	NC_018533	ATT	2	6	613962	613967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530412
10091	NC_018533	GTG	2	6	613975	613980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403530412
10092	NC_018533	TGA	2	6	614021	614026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530412
10093	NC_018533	GTC	2	6	614104	614109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403530412
10094	NC_018533	AGA	2	6	614129	614134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530412
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10096	NC_018533	AAG	2	6	614265	614270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530412
10097	NC_018533	TAT	2	6	614309	614314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530412
10098	NC_018533	CTT	2	6	614325	614330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530412
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10100	NC_018533	TGA	2	6	614660	614665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530413
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10102	NC_018533	GAA	2	6	614784	614789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530413
10103	NC_018533	ATT	2	6	614813	614818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530413
10104	NC_018533	A	7	7	614827	614833	100 %	0 %	0 %	0 %	403530413
10105	NC_018533	TGA	3	9	614840	614848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530413
10106	NC_018533	ATC	2	6	614989	614994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403530413
10107	NC_018533	ATG	2	6	615031	615036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530413
10108	NC_018533	TAA	2	6	615095	615100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530413
10109	NC_018533	A	7	7	615099	615105	100 %	0 %	0 %	0 %	403530413
10110	NC_018533	TGA	2	6	615181	615186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530413
10111	NC_018533	TTCT	2	8	615250	615257	0 %	75 %	0 %	25 %	403530413
10112	NC_018533	GA	3	6	615268	615273	50 %	0 %	50 %	0 %	403530413
10113	NC_018533	A	7	7	615328	615334	100 %	0 %	0 %	0 %	403530413
10114	NC_018533	AGG	2	6	615386	615391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403530413
10115	NC_018533	TGA	2	6	615395	615400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403530413
10116	NC_018533	CT	3	6	615414	615419	0 %	50 %	0 %	50 %	403530413
10117	NC_018533	AGA	2	6	615425	615430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403530413
10118	NC_018533	GC	3	6	615462	615467	0 %	0 %	50 %	50 %	403530413
10119	NC_018533	TTA	2	6	615555	615560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403530413
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10121	NC_018533	AAT	2	6	615624	615629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403530413
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10232	NC_018533	TTGA	2	8	632110	632117	25 %	50 %	25 %	0 %	403530422
10233	NC_018533	T	7	7	632320	632326	0 %	100 %	0 %	0 %	403530423
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10241	NC_018533	ACA	2	6	632755	632760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403530424
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10243	NC_018533	AAAGC	2	10	632767	632776	60 %	0 %	20 %	20 %	403530424
10244	NC_018533	CTT	2	6	632780	632785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530424
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10246	NC_018533	CTT	2	6	632891	632896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403530424
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10485	NC_018533	GCA	2	6	645244	645249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403530431
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