MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p02

Total Repeats: 4581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018509	A	6	6	230977	230982	100 %	0 %	0 %	0 %	434379514
4502	NC_018509	GAA	2	6	231010	231015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379514
4503	NC_018509	TAT	2	6	231021	231026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379514
4504	NC_018509	ATG	2	6	231036	231041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379514
4505	NC_018509	CAG	2	6	231090	231095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379514
4506	NC_018509	AGA	2	6	231106	231111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379514
4507	NC_018509	GGA	2	6	231133	231138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379514
4508	NC_018509	AAG	2	6	231215	231220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379514
4509	NC_018509	TTA	2	6	231230	231235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379514
4510	NC_018509	AGT	2	6	231239	231244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379514
4511	NC_018509	CAG	2	6	231366	231371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379514
4512	NC_018509	TGC	2	6	231409	231414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379514
4513	NC_018509	AT	3	6	231619	231624	50 %	50 %	0 %	0 %	434379515
4514	NC_018509	ATG	2	6	231664	231669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379515
4515	NC_018509	TAAA	2	8	231688	231695	75 %	25 %	0 %	0 %	434379515
4516	NC_018509	TAG	2	6	231715	231720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379515
4517	NC_018509	TAC	2	6	231756	231761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379515
4518	NC_018509	GA	3	6	231796	231801	50 %	0 %	50 %	0 %	434379515
4519	NC_018509	TA	3	6	232692	232697	50 %	50 %	0 %	0 %	434379516
4520	NC_018509	T	6	6	232700	232705	0 %	100 %	0 %	0 %	434379516
4521	NC_018509	AAAAG	2	10	232722	232731	80 %	0 %	20 %	0 %	434379516
4522	NC_018509	TAA	2	6	232738	232743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379516
4523	NC_018509	TTTTTG	2	12	232759	232770	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	434379516
4524	NC_018509	TTAT	2	8	232781	232788	25 %	75 %	0 %	0 %	434379516
4525	NC_018509	T	6	6	232868	232873	0 %	100 %	0 %	0 %	434379516
4526	NC_018509	AATT	2	8	232907	232914	50 %	50 %	0 %	0 %	434379516
4527	NC_018509	ATA	2	6	232979	232984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379517
4528	NC_018509	AAT	2	6	233007	233012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379517
4529	NC_018509	CAA	2	6	233043	233048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379517
4530	NC_018509	T	6	6	233083	233088	0 %	100 %	0 %	0 %	434379517
4531	NC_018509	TAC	2	6	233140	233145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379517
4532	NC_018509	TAC	2	6	233188	233193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379517
4533	NC_018509	TGC	2	6	233203	233208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379517
4534	NC_018509	ATT	3	9	233218	233226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379517
4535	NC_018509	TCT	2	6	233360	233365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379517
4536	NC_018509	ATT	3	9	233368	233376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379517
4537	NC_018509	AGAT	2	8	233377	233384	50 %	25 %	25 %	0 %	434379517
4538	NC_018509	AAT	2	6	233416	233421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379517
4539	NC_018509	TTTAGT	2	12	233434	233445	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434379517
4540	NC_018509	TCA	2	6	233504	233509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379517
4541	NC_018509	TTG	2	6	233553	233558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379517
4542	NC_018509	CTA	2	6	233565	233570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379517
4543	NC_018509	ACAA	2	8	233778	233785	75 %	0 %	0 %	25 %	434379518
4544	NC_018509	ATT	2	6	233805	233810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379518
4545	NC_018509	TCAC	2	8	233836	233843	25 %	25 %	0 %	50 %	434379518
4546	NC_018509	TTA	2	6	233917	233922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379518
4547	NC_018509	T	6	6	233956	233961	0 %	100 %	0 %	0 %	434379518
4548	NC_018509	TTC	2	6	234091	234096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379519
4549	NC_018509	GGTAA	2	10	234102	234111	40 %	20 %	40 %	0 %	434379519
4550	NC_018509	CTG	2	6	234144	234149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379519
4551	NC_018509	TTGG	2	8	234183	234190	0 %	50 %	50 %	0 %	434379519
4552	NC_018509	TCA	2	6	234230	234235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379519
4553	NC_018509	TGG	2	6	234271	234276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379519
4554	NC_018509	GT	3	6	234303	234308	0 %	50 %	50 %	0 %	434379519
4555	NC_018509	ACG	2	6	234322	234327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379519
4556	NC_018509	TGT	2	6	234352	234357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379519
4557	NC_018509	CATA	2	8	234414	234421	50 %	25 %	0 %	25 %	434379519
4558	NC_018509	GTT	2	6	234456	234461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379519
4559	NC_018509	TCT	2	6	234490	234495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379519
4560	NC_018509	TAT	2	6	234549	234554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379519
4561	NC_018509	GATG	2	8	234647	234654	25 %	25 %	50 %	0 %	434379519
4562	NC_018509	TGT	2	6	234678	234683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379519
4563	NC_018509	AATC	2	8	234712	234719	50 %	25 %	0 %	25 %	434379519
4564	NC_018509	ATTT	2	8	234738	234745	25 %	75 %	0 %	0 %	434379519
4565	NC_018509	GTT	2	6	234837	234842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379519
4566	NC_018509	TCA	2	6	234851	234856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379519
4567	NC_018509	TGA	2	6	234871	234876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379519
4568	NC_018509	GAAC	2	8	234953	234960	50 %	0 %	25 %	25 %	434379519
4569	NC_018509	AAC	3	9	234958	234966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379519
4570	NC_018509	TAA	2	6	234972	234977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379519
4571	NC_018509	GAA	2	6	235019	235024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379519
4572	NC_018509	TTGC	2	8	235031	235038	0 %	50 %	25 %	25 %	434379519
4573	NC_018509	TGT	2	6	235080	235085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379519
4574	NC_018509	CTTC	2	8	235115	235122	0 %	50 %	0 %	50 %	434379519
4575	NC_018509	AAG	2	6	235145	235150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379519
4576	NC_018509	CAT	2	6	235194	235199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379519
4577	NC_018509	CAAA	2	8	235215	235222	75 %	0 %	0 %	25 %	434379519
4578	NC_018509	GTA	2	6	235223	235228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379519
4579	NC_018509	TTC	2	6	235264	235269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379519
4580	NC_018509	AGA	2	6	235270	235275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379519
4581	NC_018509	TTTA	2	8	235285	235292	25 %	75 %	0 %	0 %	434379519

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.