MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p07

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018503	GAA	2	6	121	126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558242
2	NC_018503	AAAG	2	8	132	139	75 %	0 %	25 %	0 %	402558242
3	NC_018503	T	6	6	168	173	0 %	100 %	0 %	0 %	402558242
4	NC_018503	AGC	2	6	203	208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558242
5	NC_018503	TAC	3	9	234	242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558242
6	NC_018503	ATT	2	6	251	256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558242
7	NC_018503	TAA	2	6	305	310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558242
8	NC_018503	T	6	6	324	329	0 %	100 %	0 %	0 %	402558242
9	NC_018503	AGT	2	6	349	354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558242
10	NC_018503	TTTA	2	8	369	376	25 %	75 %	0 %	0 %	402558242
11	NC_018503	AT	3	6	485	490	50 %	50 %	0 %	0 %	402558242
12	NC_018503	A	6	6	514	519	100 %	0 %	0 %	0 %	402558242
13	NC_018503	AAC	2	6	549	554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558242
14	NC_018503	AGA	2	6	555	560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558242
15	NC_018503	GT	3	6	568	573	0 %	50 %	50 %	0 %	402558242
16	NC_018503	TGT	2	6	610	615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558242
17	NC_018503	GAAAA	2	10	685	694	80 %	0 %	20 %	0 %	402558242
18	NC_018503	A	6	6	691	696	100 %	0 %	0 %	0 %	402558242
19	NC_018503	TAAA	2	8	721	728	75 %	25 %	0 %	0 %	402558242
20	NC_018503	ATCA	2	8	1365	1372	50 %	25 %	0 %	25 %	402558243
21	NC_018503	TTC	2	6	1393	1398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558243
22	NC_018503	TAA	2	6	1415	1420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558243
23	NC_018503	TAA	2	6	1512	1517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558243
24	NC_018503	GATA	2	8	1529	1536	50 %	25 %	25 %	0 %	402558243
25	NC_018503	TTA	2	6	1549	1554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558243
26	NC_018503	ATA	2	6	1585	1590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558243
27	NC_018503	CTA	2	6	1595	1600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558243
28	NC_018503	CTTT	2	8	1609	1616	0 %	75 %	0 %	25 %	402558243
29	NC_018503	TCA	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558243
30	NC_018503	TAA	2	6	1629	1634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558243
31	NC_018503	AG	3	6	1639	1644	50 %	0 %	50 %	0 %	402558243
32	NC_018503	AGTG	2	8	1686	1693	25 %	25 %	50 %	0 %	402558243
33	NC_018503	TAA	2	6	1724	1729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558243
34	NC_018503	T	7	7	1744	1750	0 %	100 %	0 %	0 %	402558243
35	NC_018503	AGCATT	2	12	1915	1926	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558243
36	NC_018503	ATGA	2	8	1927	1934	50 %	25 %	25 %	0 %	402558243
37	NC_018503	T	6	6	1950	1955	0 %	100 %	0 %	0 %	402558243
38	NC_018503	TC	3	6	2006	2011	0 %	50 %	0 %	50 %	402558243
39	NC_018503	T	8	8	2031	2038	0 %	100 %	0 %	0 %	402558243
40	NC_018503	ATA	3	9	2049	2057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558243
41	NC_018503	GATAA	2	10	2063	2072	60 %	20 %	20 %	0 %	402558243
42	NC_018503	AT	3	6	2077	2082	50 %	50 %	0 %	0 %	402558243
43	NC_018503	TGG	2	6	2230	2235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558243
44	NC_018503	TAAA	2	8	2246	2253	75 %	25 %	0 %	0 %	402558243
45	NC_018503	ATAA	2	8	2272	2279	75 %	25 %	0 %	0 %	402558243
46	NC_018503	TCA	2	6	2287	2292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558243
47	NC_018503	TGGAT	2	10	2310	2319	20 %	40 %	40 %	0 %	402558243
48	NC_018503	ATCTAA	2	12	2328	2339	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	402558243
49	NC_018503	TTAT	2	8	2359	2366	25 %	75 %	0 %	0 %	402558243
50	NC_018503	TCC	2	6	2430	2435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402558244
51	NC_018503	TTG	2	6	2483	2488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558244
52	NC_018503	GTT	2	6	2514	2519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558244
53	NC_018503	GTTG	2	8	2574	2581	0 %	50 %	50 %	0 %	402558244
54	NC_018503	T	7	7	2614	2620	0 %	100 %	0 %	0 %	402558244
55	NC_018503	TC	3	6	2685	2690	0 %	50 %	0 %	50 %	402558244
56	NC_018503	TTTC	2	8	2692	2699	0 %	75 %	0 %	25 %	402558244
57	NC_018503	AG	3	6	2720	2725	50 %	0 %	50 %	0 %	402558244
58	NC_018503	ATT	2	6	2744	2749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558244
59	NC_018503	T	6	6	2783	2788	0 %	100 %	0 %	0 %	402558244
60	NC_018503	T	7	7	2861	2867	0 %	100 %	0 %	0 %	402558244
61	NC_018503	TTTTG	2	10	2957	2966	0 %	80 %	20 %	0 %	402558244
62	NC_018503	GCC	2	6	2991	2996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	402558244
63	NC_018503	GAAA	2	8	3856	3863	75 %	0 %	25 %	0 %	402558245
64	NC_018503	TATT	2	8	3872	3879	25 %	75 %	0 %	0 %	402558245
65	NC_018503	AGC	2	6	3889	3894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558245
66	NC_018503	A	6	6	3925	3930	100 %	0 %	0 %	0 %	402558245
67	NC_018503	GAT	2	6	3973	3978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558245
68	NC_018503	T	6	6	3998	4003	0 %	100 %	0 %	0 %	402558245
69	NC_018503	A	8	8	4023	4030	100 %	0 %	0 %	0 %	402558245
70	NC_018503	AAG	2	6	4036	4041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558245
71	NC_018503	A	6	6	4043	4048	100 %	0 %	0 %	0 %	402558245
72	NC_018503	T	6	6	4173	4178	0 %	100 %	0 %	0 %	402558246
73	NC_018503	GAAAA	2	10	4193	4202	80 %	0 %	20 %	0 %	402558246
74	NC_018503	A	6	6	4199	4204	100 %	0 %	0 %	0 %	402558246
75	NC_018503	TTAG	2	8	4223	4230	25 %	50 %	25 %	0 %	402558246
76	NC_018503	TA	3	6	4246	4251	50 %	50 %	0 %	0 %	402558246
77	NC_018503	T	6	6	4312	4317	0 %	100 %	0 %	0 %	402558246
78	NC_018503	AT	5	10	4339	4348	50 %	50 %	0 %	0 %	402558246
79	NC_018503	TAA	2	6	4368	4373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558246
80	NC_018503	TGA	2	6	4414	4419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558246
81	NC_018503	ATTT	2	8	4592	4599	25 %	75 %	0 %	0 %	402558246
82	NC_018503	TA	3	6	4616	4621	50 %	50 %	0 %	0 %	402558246
83	NC_018503	AGA	2	6	4627	4632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558246
84	NC_018503	A	7	7	4660	4666	100 %	0 %	0 %	0 %	402558246
85	NC_018503	AGA	2	6	4669	4674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558246
86	NC_018503	ACGA	2	8	4709	4716	50 %	0 %	25 %	25 %	402558246
87	NC_018503	CG	3	6	4751	4756	0 %	0 %	50 %	50 %	402558246
88	NC_018503	ACAGCA	2	12	4839	4850	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	402558247
89	NC_018503	TTA	2	6	4872	4877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558247
90	NC_018503	ATA	2	6	4909	4914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558247
91	NC_018503	ATG	2	6	4933	4938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558247
92	NC_018503	AGT	2	6	4991	4996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558247
93	NC_018503	CAG	2	6	5083	5088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558247
94	NC_018503	GAT	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558247
95	NC_018503	TTTAAA	2	12	5259	5270	50 %	50 %	0 %	0 %	402558247
96	NC_018503	ACA	3	9	5280	5288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558247
97	NC_018503	CAC	2	6	5386	5391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402558247
98	NC_018503	CAG	2	6	5683	5688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558247
99	NC_018503	AGA	2	6	5720	5725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558247
100	NC_018503	TTA	2	6	5732	5737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558247
101	NC_018503	ATA	2	6	5821	5826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558247
102	NC_018503	GAT	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558247
103	NC_018503	AT	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	402558247
104	NC_018503	T	6	6	5942	5947	0 %	100 %	0 %	0 %	402558247
105	NC_018503	AAC	2	6	5952	5957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558247
106	NC_018503	TACTT	2	10	5990	5999	20 %	60 %	0 %	20 %	402558247
107	NC_018503	TTTAGA	2	12	6005	6016	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558247
108	NC_018503	AATA	2	8	6050	6057	75 %	25 %	0 %	0 %	402558247
109	NC_018503	AACA	2	8	6106	6113	75 %	0 %	0 %	25 %	402558247
110	NC_018503	TA	3	6	6117	6122	50 %	50 %	0 %	0 %	402558247
111	NC_018503	AAT	2	6	6136	6141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558247
112	NC_018503	TTA	2	6	6277	6282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558248
113	NC_018503	AT	3	6	6408	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	402558248
114	NC_018503	CAC	2	6	6434	6439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402558248
115	NC_018503	TA	3	6	6485	6490	50 %	50 %	0 %	0 %	402558248
116	NC_018503	ATG	2	6	6572	6577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558248
117	NC_018503	AGAA	2	8	6627	6634	75 %	0 %	25 %	0 %	402558248
118	NC_018503	AAT	2	6	6637	6642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558248
119	NC_018503	TAT	2	6	6645	6650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558248
120	NC_018503	TAA	2	6	6707	6712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558248
121	NC_018503	TATC	2	8	6769	6776	25 %	50 %	0 %	25 %	402558248
122	NC_018503	AGG	2	6	6777	6782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558248
123	NC_018503	TAA	2	6	6813	6818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558248
124	NC_018503	GTAC	2	8	6835	6842	25 %	25 %	25 %	25 %	402558248
125	NC_018503	AAGC	2	8	6843	6850	50 %	0 %	25 %	25 %	402558248
126	NC_018503	TAAA	2	8	6893	6900	75 %	25 %	0 %	0 %	402558248
127	NC_018503	ATTTA	2	10	6909	6918	40 %	60 %	0 %	0 %	402558248
128	NC_018503	AAAGGA	2	12	6940	6951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558248
129	NC_018503	AAC	2	6	6975	6980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558248
130	NC_018503	A	6	6	6995	7000	100 %	0 %	0 %	0 %	402558248
131	NC_018503	AGTAA	2	10	7054	7063	60 %	20 %	20 %	0 %	402558248
132	NC_018503	ATT	2	6	7076	7081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558248
133	NC_018503	GAT	2	6	7102	7107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558248
134	NC_018503	GTATT	2	10	7151	7160	20 %	60 %	20 %	0 %	402558248
135	NC_018503	TGT	2	6	7248	7253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558248
136	NC_018503	AAGGA	2	10	7367	7376	60 %	0 %	40 %	0 %	402558248
137	NC_018503	AAT	2	6	7450	7455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558248
138	NC_018503	TAA	2	6	7458	7463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558248
139	NC_018503	CAG	2	6	7468	7473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558248
140	NC_018503	TA	3	6	7478	7483	50 %	50 %	0 %	0 %	402558248
141	NC_018503	GTC	2	6	7529	7534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558248
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143	NC_018503	TAGAT	2	10	7608	7617	40 %	40 %	20 %	0 %	402558248
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.