MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 chromosome

Total Repeats: 113647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018500	TAT	2	6	22623	22628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558847
502	NC_018500	TCG	2	6	22686	22691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558847
503	NC_018500	CAT	2	6	22743	22748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558847
504	NC_018500	A	6	6	22757	22762	100 %	0 %	0 %	0 %	402558847
505	NC_018500	A	6	6	22768	22773	100 %	0 %	0 %	0 %	402558847
506	NC_018500	GCT	2	6	22807	22812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558847
507	NC_018500	A	6	6	22843	22848	100 %	0 %	0 %	0 %	402558847
508	NC_018500	AAG	2	6	22856	22861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558847
509	NC_018500	AGA	2	6	22869	22874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558847
510	NC_018500	AAG	2	6	22988	22993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558847
511	NC_018500	TAC	2	6	23009	23014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558847
512	NC_018500	AAGA	2	8	23017	23024	75 %	0 %	25 %	0 %	402558847
513	NC_018500	GTT	2	6	23026	23031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558847
514	NC_018500	A	6	6	23038	23043	100 %	0 %	0 %	0 %	402558847
515	NC_018500	ATT	2	6	23106	23111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558847
516	NC_018500	GTA	2	6	23113	23118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558847
517	NC_018500	ATC	2	6	23173	23178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558847
518	NC_018500	GAT	2	6	23236	23241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558847
519	NC_018500	CTT	2	6	23260	23265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558847
520	NC_018500	GAA	2	6	23308	23313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558847
521	NC_018500	A	6	6	23469	23474	100 %	0 %	0 %	0 %	402558848
522	NC_018500	ATG	2	6	23486	23491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558848
523	NC_018500	A	6	6	23498	23503	100 %	0 %	0 %	0 %	402558848
524	NC_018500	CTT	2	6	23545	23550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558848
525	NC_018500	GCT	2	6	23573	23578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558848
526	NC_018500	A	6	6	23579	23584	100 %	0 %	0 %	0 %	402558848
527	NC_018500	TGC	2	6	23596	23601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558848
528	NC_018500	AAAC	2	8	23622	23629	75 %	0 %	0 %	25 %	402558848
529	NC_018500	ACG	2	6	23634	23639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558848
530	NC_018500	ATTA	2	8	23701	23708	50 %	50 %	0 %	0 %	402558848
531	NC_018500	GCT	2	6	23717	23722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558848
532	NC_018500	TTA	2	6	23726	23731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558848
533	NC_018500	GAA	2	6	23753	23758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558848
534	NC_018500	GGC	2	6	23780	23785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558848
535	NC_018500	AGA	2	6	23794	23799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558848
536	NC_018500	TCG	2	6	23845	23850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558848
537	NC_018500	GATGCA	2	12	23873	23884	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558848
538	NC_018500	TGA	2	6	23947	23952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558848
539	NC_018500	AGC	2	6	23953	23958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558848
540	NC_018500	GCA	2	6	23984	23989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558848
541	NC_018500	GAA	2	6	24029	24034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558848
542	NC_018500	ACA	2	6	24061	24066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558848
543	NC_018500	A	6	6	24090	24095	100 %	0 %	0 %	0 %	402558848
544	NC_018500	TTC	2	6	24131	24136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558848
545	NC_018500	TTCG	2	8	24230	24237	0 %	50 %	25 %	25 %	402558848
546	NC_018500	GAA	2	6	24284	24289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558848
547	NC_018500	GTA	2	6	24309	24314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558848
548	NC_018500	TTA	2	6	24474	24479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558849
549	NC_018500	TGT	3	9	24532	24540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558849
550	NC_018500	TGG	2	6	24541	24546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558849
551	NC_018500	A	6	6	24758	24763	100 %	0 %	0 %	0 %	402558849
552	NC_018500	GTT	2	6	24767	24772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558849
553	NC_018500	GCA	2	6	24779	24784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558849
554	NC_018500	ACA	2	6	24815	24820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558849
555	NC_018500	GCA	2	6	24821	24826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558849
556	NC_018500	AAT	2	6	24872	24877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558849
557	NC_018500	TA	3	6	24888	24893	50 %	50 %	0 %	0 %	402558849
558	NC_018500	CTTA	3	12	24938	24949	25 %	50 %	0 %	25 %	402558849
559	NC_018500	AAG	2	6	24960	24965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558849
560	NC_018500	CTT	2	6	24990	24995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558849
561	NC_018500	TATG	2	8	24999	25006	25 %	50 %	25 %	0 %	402558849
562	NC_018500	AAAT	2	8	25103	25110	75 %	25 %	0 %	0 %	402558849
563	NC_018500	ACA	2	6	25116	25121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558850
564	NC_018500	A	6	6	25142	25147	100 %	0 %	0 %	0 %	402558850
565	NC_018500	TGC	2	6	25161	25166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558850
566	NC_018500	ATG	2	6	25388	25393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558850
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568	NC_018500	CGT	3	9	25435	25443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558850
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570	NC_018500	GAA	2	6	25474	25479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558850
571	NC_018500	ACGT	2	8	25499	25506	25 %	25 %	25 %	25 %	402558850
572	NC_018500	ATG	2	6	25517	25522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558850
573	NC_018500	AAG	2	6	25528	25533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558850
574	NC_018500	AGA	2	6	25557	25562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558850
575	NC_018500	AT	3	6	25608	25613	50 %	50 %	0 %	0 %	402558850
576	NC_018500	A	6	6	25635	25640	100 %	0 %	0 %	0 %	402558850
577	NC_018500	AAAGAA	2	12	25642	25653	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558850
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579	NC_018500	T	7	7	25774	25780	0 %	100 %	0 %	0 %	402558851
580	NC_018500	ATC	2	6	25806	25811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558851
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583	NC_018500	AT	3	6	25834	25839	50 %	50 %	0 %	0 %	402558851
584	NC_018500	CAT	2	6	25855	25860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558851
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586	NC_018500	CAT	2	6	25916	25921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558851
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588	NC_018500	ATT	2	6	26037	26042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558851
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590	NC_018500	ATTG	2	8	26086	26093	25 %	50 %	25 %	0 %	402558851
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592	NC_018500	ATG	2	6	26261	26266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558851
593	NC_018500	AGGA	2	8	26277	26284	50 %	0 %	50 %	0 %	402558851
594	NC_018500	GAA	2	6	26309	26314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558851
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599	NC_018500	TGC	2	6	26577	26582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558852
600	NC_018500	ATTC	2	8	26589	26596	25 %	50 %	0 %	25 %	402558852
601	NC_018500	AATT	2	8	26666	26673	50 %	50 %	0 %	0 %	402558852
602	NC_018500	TAT	2	6	26723	26728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558852
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608	NC_018500	GGC	2	6	27076	27081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558852
609	NC_018500	TTC	2	6	27121	27126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558852
610	NC_018500	GTA	2	6	27142	27147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558852
611	NC_018500	TGG	2	6	27264	27269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558852
612	NC_018500	CTT	2	6	27318	27323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558852
613	NC_018500	TACAA	2	10	27326	27335	60 %	20 %	0 %	20 %	402558852
614	NC_018500	TAA	2	6	27337	27342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558852
615	NC_018500	TTA	2	6	27378	27383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558853
616	NC_018500	AG	3	6	27534	27539	50 %	0 %	50 %	0 %	402558853
617	NC_018500	GTA	2	6	27639	27644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558853
618	NC_018500	TGT	2	6	27650	27655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558853
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620	NC_018500	A	7	7	27699	27705	100 %	0 %	0 %	0 %	402558853
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622	NC_018500	TTA	2	6	27862	27867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558853
623	NC_018500	TGG	2	6	27878	27883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558853
624	NC_018500	CAT	2	6	27915	27920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558853
625	NC_018500	AGA	2	6	27929	27934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558853
626	NC_018500	ATG	2	6	27993	27998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558853
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628	NC_018500	AAAG	2	8	28074	28081	75 %	0 %	25 %	0 %	402558853
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