MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 chromosome

Total Repeats: 113647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018500	GTA	2	6	460	465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558826
2	NC_018500	GTG	2	6	545	550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558826
3	NC_018500	GGA	2	6	558	563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558826
4	NC_018500	TAT	2	6	564	569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558826
5	NC_018500	GCAG	2	8	574	581	25 %	0 %	50 %	25 %	402558826
6	NC_018500	GAG	2	6	588	593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558826
7	NC_018500	AAT	2	6	628	633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558826
8	NC_018500	GT	4	8	667	674	0 %	50 %	50 %	0 %	402558826
9	NC_018500	CGT	2	6	679	684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558826
10	NC_018500	TAA	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558826
11	NC_018500	ATTT	2	8	752	759	25 %	75 %	0 %	0 %	402558826
12	NC_018500	ATT	2	6	793	798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558826
13	NC_018500	AGT	2	6	826	831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558826
14	NC_018500	AGA	2	6	837	842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
15	NC_018500	GAA	2	6	859	864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
16	NC_018500	AAAG	2	8	897	904	75 %	0 %	25 %	0 %	402558826
17	NC_018500	AGT	2	6	970	975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558826
18	NC_018500	AGA	2	6	1032	1037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
19	NC_018500	GAA	2	6	1078	1083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
20	NC_018500	ATA	2	6	1124	1129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558826
21	NC_018500	GAA	2	6	1135	1140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
22	NC_018500	A	6	6	1163	1168	100 %	0 %	0 %	0 %	402558826
23	NC_018500	GAA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
24	NC_018500	AAG	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
25	NC_018500	CTT	3	9	1243	1251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558826
26	NC_018500	GTT	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558826
27	NC_018500	AG	3	6	1299	1304	50 %	0 %	50 %	0 %	402558826
28	NC_018500	ACG	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558826
29	NC_018500	TTG	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558826
30	NC_018500	TGAA	2	8	1424	1431	50 %	25 %	25 %	0 %	402558826
31	NC_018500	TGCT	2	8	1472	1479	0 %	50 %	25 %	25 %	402558826
32	NC_018500	CAA	2	6	1546	1551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558826
33	NC_018500	GAA	2	6	1582	1587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
34	NC_018500	GAAA	2	8	1707	1714	75 %	0 %	25 %	0 %	402558826
35	NC_018500	AGA	2	6	1742	1747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
36	NC_018500	GGC	2	6	1752	1757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558826
37	NC_018500	AAG	2	6	1865	1870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
38	NC_018500	ATT	2	6	1871	1876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558826
39	NC_018500	GCA	2	6	2016	2021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558826
40	NC_018500	TTG	2	6	2024	2029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558826
41	NC_018500	TTA	2	6	2114	2119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558826
42	NC_018500	GGC	2	6	2184	2189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558826
43	NC_018500	AAT	2	6	2206	2211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558826
44	NC_018500	TTA	2	6	2236	2241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558826
45	NC_018500	TTG	2	6	2252	2257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558826
46	NC_018500	AAC	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558826
47	NC_018500	TGG	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558826
48	NC_018500	TCT	2	6	2386	2391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558826
49	NC_018500	TTA	2	6	2392	2397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558826
50	NC_018500	GAA	2	6	2446	2451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
51	NC_018500	A	6	6	2450	2455	100 %	0 %	0 %	0 %	402558826
52	NC_018500	AAG	2	6	2507	2512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
53	NC_018500	AAGAG	2	10	2571	2580	60 %	0 %	40 %	0 %	402558826
54	NC_018500	AGA	2	6	2598	2603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
55	NC_018500	T	6	6	2652	2657	0 %	100 %	0 %	0 %	402558826
56	NC_018500	AACAA	2	10	2760	2769	80 %	0 %	0 %	20 %	402558826
57	NC_018500	A	6	6	2768	2773	100 %	0 %	0 %	0 %	402558826
58	NC_018500	TTC	2	6	2784	2789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558826
59	NC_018500	CAA	2	6	2845	2850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558826
60	NC_018500	AAAAAG	2	12	2864	2875	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558826
61	NC_018500	AGA	2	6	2898	2903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
62	NC_018500	GTG	2	6	2975	2980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558826
63	NC_018500	GAA	2	6	3006	3011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
64	NC_018500	AATT	2	8	3038	3045	50 %	50 %	0 %	0 %	402558826
65	NC_018500	TCG	2	6	3051	3056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558826
66	NC_018500	AAC	2	6	3059	3064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558826
67	NC_018500	AG	4	8	3078	3085	50 %	0 %	50 %	0 %	402558826
68	NC_018500	GAAA	2	8	3108	3115	75 %	0 %	25 %	0 %	402558826
69	NC_018500	AT	3	6	3132	3137	50 %	50 %	0 %	0 %	402558826
70	NC_018500	AAG	2	6	3158	3163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
71	NC_018500	ACA	2	6	3204	3209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558826
72	NC_018500	ACAATG	2	12	3259	3270	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	402558826
73	NC_018500	AGA	2	6	3276	3281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
74	NC_018500	AGA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
75	NC_018500	TGA	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558826
76	NC_018500	AG	3	6	3398	3403	50 %	0 %	50 %	0 %	402558826
77	NC_018500	AGA	2	6	3411	3416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
78	NC_018500	TTA	2	6	3440	3445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558826
79	NC_018500	GAA	2	6	3457	3462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
80	NC_018500	A	6	6	3466	3471	100 %	0 %	0 %	0 %	402558826
81	NC_018500	T	6	6	3475	3480	0 %	100 %	0 %	0 %	402558826
82	NC_018500	GAA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
83	NC_018500	GCC	2	6	3739	3744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	402558826
84	NC_018500	TGA	2	6	3747	3752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558826
85	NC_018500	TGA	2	6	3795	3800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558826
86	NC_018500	TGT	2	6	3854	3859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558826
87	NC_018500	GAA	2	6	3922	3927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558826
88	NC_018500	AGGA	2	8	3944	3951	50 %	0 %	50 %	0 %	402558826
89	NC_018500	T	7	7	3966	3972	0 %	100 %	0 %	0 %	402558827
90	NC_018500	A	6	6	3973	3978	100 %	0 %	0 %	0 %	402558827
91	NC_018500	A	6	6	3986	3991	100 %	0 %	0 %	0 %	402558827
92	NC_018500	AAAC	2	8	3997	4004	75 %	0 %	0 %	25 %	402558827
93	NC_018500	A	6	6	4040	4045	100 %	0 %	0 %	0 %	402558827
94	NC_018500	TTC	2	6	4111	4116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558827
95	NC_018500	AGA	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558827
96	NC_018500	AATT	2	8	4172	4179	50 %	50 %	0 %	0 %	402558827
97	NC_018500	AGA	2	6	4191	4196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558827
98	NC_018500	CGT	2	6	4204	4209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558827
99	NC_018500	AAG	2	6	4226	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558827
100	NC_018500	TAG	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558827
101	NC_018500	AAG	2	6	4307	4312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558827
102	NC_018500	GTT	2	6	4324	4329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558827
103	NC_018500	TTG	2	6	4334	4339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558827
104	NC_018500	ACG	2	6	4360	4365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558827
105	NC_018500	AGTC	2	8	4406	4413	25 %	25 %	25 %	25 %	402558827
106	NC_018500	GGC	2	6	4419	4424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558827
107	NC_018500	GGATCT	2	12	4504	4515	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	402558827
108	NC_018500	GCG	2	6	4522	4527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558827
109	NC_018500	TATG	2	8	4530	4537	25 %	50 %	25 %	0 %	402558827
110	NC_018500	CAG	2	6	4589	4594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558827
111	NC_018500	CTC	2	6	4673	4678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402558827
112	NC_018500	CAA	2	6	4703	4708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558827
113	NC_018500	GGT	2	6	4801	4806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558827
114	NC_018500	TTG	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558827
115	NC_018500	GCA	2	6	4881	4886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558827
116	NC_018500	TAG	2	6	4928	4933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558827
117	NC_018500	AGA	2	6	4938	4943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558827
118	NC_018500	A	6	6	5090	5095	100 %	0 %	0 %	0 %	402558828
119	NC_018500	TATT	2	8	5110	5117	25 %	75 %	0 %	0 %	402558828
120	NC_018500	GTT	2	6	5133	5138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558828
121	NC_018500	AAG	2	6	5151	5156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558828
122	NC_018500	TAT	2	6	5170	5175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558828
123	NC_018500	GAT	2	6	5179	5184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558828
124	NC_018500	GAA	2	6	5206	5211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558828
125	NC_018500	GAA	2	6	5269	5274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558828
126	NC_018500	GAA	2	6	5278	5283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558828
127	NC_018500	AGCGAC	2	12	5312	5323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558828
128	NC_018500	TTG	2	6	5324	5329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558828
129	NC_018500	GAA	2	6	5353	5358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558828
130	NC_018500	TGAA	2	8	5366	5373	50 %	25 %	25 %	0 %	402558828
131	NC_018500	GTT	2	6	5386	5391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558828
132	NC_018500	ATTAG	2	10	5406	5415	40 %	40 %	20 %	0 %	402558828
133	NC_018500	CCGA	2	8	5447	5454	25 %	0 %	25 %	50 %	402558829
134	NC_018500	A	6	6	5471	5476	100 %	0 %	0 %	0 %	402558829
135	NC_018500	GAAA	2	8	5511	5518	75 %	0 %	25 %	0 %	402558829
136	NC_018500	TGA	2	6	5519	5524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558829
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158	NC_018500	TCCA	2	8	6284	6291	25 %	25 %	0 %	50 %	402558829
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166	NC_018500	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558829
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258	NC_018500	ATGA	2	8	10923	10930	50 %	25 %	25 %	0 %	402558837
259	NC_018500	AGA	2	6	10931	10936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558837
260	NC_018500	AGAA	2	8	11023	11030	75 %	0 %	25 %	0 %	402558837
261	NC_018500	T	7	7	11039	11045	0 %	100 %	0 %	0 %	402558837
262	NC_018500	AT	3	6	11090	11095	50 %	50 %	0 %	0 %	402558837
263	NC_018500	TGA	2	6	11105	11110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558837
264	NC_018500	TGT	2	6	11138	11143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558837
265	NC_018500	GTC	2	6	11154	11159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558837
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267	NC_018500	ATG	2	6	11233	11238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558837
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