MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus cereus FRI-35 plasmid p01

Total Repeats: 3820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018492	AG	3	6	198651	198656	50 %	0 %	50 %	0 %	402558201
3502	NC_018492	AAT	2	6	198703	198708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558201
3503	NC_018492	ATT	3	9	198734	198742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558201
3504	NC_018492	TCT	2	6	198843	198848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558201
3505	NC_018492	A	6	6	198900	198905	100 %	0 %	0 %	0 %	402558201
3506	NC_018492	AAT	2	6	198939	198944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558201
3507	NC_018492	GTT	2	6	198979	198984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558201
3508	NC_018492	A	6	6	200517	200522	100 %	0 %	0 %	0 %	402558202
3509	NC_018492	TA	3	6	200529	200534	50 %	50 %	0 %	0 %	402558202
3510	NC_018492	ATT	2	6	200545	200550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558202
3511	NC_018492	A	6	6	200551	200556	100 %	0 %	0 %	0 %	402558202
3512	NC_018492	T	6	6	200601	200606	0 %	100 %	0 %	0 %	402558202
3513	NC_018492	TTA	2	6	200636	200641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558202
3514	NC_018492	AGA	2	6	200692	200697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558202
3515	NC_018492	A	7	7	200709	200715	100 %	0 %	0 %	0 %	402558202
3516	NC_018492	TTCAT	2	10	200725	200734	20 %	60 %	0 %	20 %	402558202
3517	NC_018492	CAA	2	6	200747	200752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558202
3518	NC_018492	ATG	2	6	200850	200855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558202
3519	NC_018492	TTG	2	6	200862	200867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558202
3520	NC_018492	ATT	2	6	200896	200901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558202
3521	NC_018492	ATT	2	6	200915	200920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558202
3522	NC_018492	CAT	2	6	200924	200929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558202
3523	NC_018492	ATA	2	6	200936	200941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558202
3524	NC_018492	A	6	6	200963	200968	100 %	0 %	0 %	0 %	402558202
3525	NC_018492	TAA	2	6	201420	201425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558203
3526	NC_018492	TGT	2	6	201439	201444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558203
3527	NC_018492	ATTT	2	8	201471	201478	25 %	75 %	0 %	0 %	402558203
3528	NC_018492	ATTT	2	8	201498	201505	25 %	75 %	0 %	0 %	402558203
3529	NC_018492	TA	3	6	201558	201563	50 %	50 %	0 %	0 %	402558203
3530	NC_018492	TA	3	6	201605	201610	50 %	50 %	0 %	0 %	402558203
3531	NC_018492	TTAA	2	8	201682	201689	50 %	50 %	0 %	0 %	402558203
3532	NC_018492	ATT	2	6	201690	201695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558203
3533	NC_018492	T	6	6	201705	201710	0 %	100 %	0 %	0 %	402558203
3534	NC_018492	AAT	2	6	201728	201733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558203
3535	NC_018492	TGC	2	6	201737	201742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558203
3536	NC_018492	ATA	2	6	201796	201801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558203
3537	NC_018492	TA	3	6	202016	202021	50 %	50 %	0 %	0 %	402558204
3538	NC_018492	TTATAT	2	12	202049	202060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558204
3539	NC_018492	TCTTT	2	10	202065	202074	0 %	80 %	0 %	20 %	402558204
3540	NC_018492	TAA	2	6	202140	202145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558204
3541	NC_018492	TTTA	2	8	202180	202187	25 %	75 %	0 %	0 %	402558204
3542	NC_018492	ACT	2	6	202538	202543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
3543	NC_018492	CTG	2	6	202731	202736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558205
3544	NC_018492	GTA	2	6	202737	202742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558205
3545	NC_018492	ACT	2	6	202776	202781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
3546	NC_018492	ACA	2	6	202832	202837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558205
3547	NC_018492	GGA	2	6	202961	202966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558205
3548	NC_018492	TTG	2	6	203001	203006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558205
3549	NC_018492	CTG	2	6	203040	203045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558205
3550	NC_018492	CTG	2	6	203127	203132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558205
3551	NC_018492	AGG	2	6	203179	203184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558205
3552	NC_018492	ATT	2	6	203200	203205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558205
3553	NC_018492	AAT	2	6	203309	203314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558205
3554	NC_018492	TTC	2	6	203315	203320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558205
3555	NC_018492	TAA	2	6	203332	203337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558205
3556	NC_018492	CTG	2	6	203412	203417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558205
3557	NC_018492	CCG	2	6	203481	203486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	402558205
3558	NC_018492	AAC	2	6	203497	203502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558205
3559	NC_018492	AT	3	6	203515	203520	50 %	50 %	0 %	0 %	402558205
3560	NC_018492	TAAA	2	8	203583	203590	75 %	25 %	0 %	0 %	402558205
3561	NC_018492	TGC	2	6	203596	203601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558205
3562	NC_018492	CTT	2	6	203648	203653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558205
3563	NC_018492	CAAA	2	8	203738	203745	75 %	0 %	0 %	25 %	402558205
3564	NC_018492	CAAT	2	8	203778	203785	50 %	25 %	0 %	25 %	402558205
3565	NC_018492	CCAAAT	2	12	203834	203845	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402558205
3566	NC_018492	GGA	2	6	203894	203899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558205
3567	NC_018492	CAA	2	6	203919	203924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558205
3568	NC_018492	CTG	2	6	203931	203936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558205
3569	NC_018492	CGC	2	6	204049	204054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	402558205
3570	NC_018492	AACG	2	8	204055	204062	50 %	0 %	25 %	25 %	402558205
3571	NC_018492	AT	3	6	204065	204070	50 %	50 %	0 %	0 %	402558205
3572	NC_018492	ACT	2	6	204092	204097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
3573	NC_018492	ACT	2	6	204194	204199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
3574	NC_018492	TTTCA	2	10	204201	204210	20 %	60 %	0 %	20 %	402558205
3575	NC_018492	CAAA	2	8	204233	204240	75 %	0 %	0 %	25 %	402558205
3576	NC_018492	ACG	2	6	204317	204322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558205
3577	NC_018492	ATG	2	6	204362	204367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558205
3578	NC_018492	TACAGG	2	12	204427	204438	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	402558205
3579	NC_018492	AAC	2	6	204487	204492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558205
3580	NC_018492	GATC	2	8	204567	204574	25 %	25 %	25 %	25 %	402558205
3581	NC_018492	CAA	2	6	204585	204590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558205
3582	NC_018492	A	6	6	204589	204594	100 %	0 %	0 %	0 %	402558205
3583	NC_018492	AGT	3	9	204607	204615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558205
3584	NC_018492	AATAC	2	10	204617	204626	60 %	20 %	0 %	20 %	402558205
3585	NC_018492	CTT	2	6	204660	204665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558205
3586	NC_018492	TCT	2	6	204713	204718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558205
3587	NC_018492	AACA	2	8	204773	204780	75 %	0 %	0 %	25 %	402558205
3588	NC_018492	TTA	2	6	204819	204824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558205
3589	NC_018492	AACG	2	8	204847	204854	50 %	0 %	25 %	25 %	402558205
3590	NC_018492	TC	3	6	204938	204943	0 %	50 %	0 %	50 %	402558205
3591	NC_018492	CGG	2	6	204970	204975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	402558205
3592	NC_018492	TAA	2	6	205039	205044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558205
3593	NC_018492	CTT	2	6	205053	205058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558205
3594	NC_018492	CCA	2	6	205085	205090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402558205
3595	NC_018492	AATTCT	2	12	205106	205117	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	402558205
3596	NC_018492	CAA	2	6	205125	205130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558205
3597	NC_018492	TAA	2	6	205153	205158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558205
3598	NC_018492	TAC	2	6	205369	205374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
3599	NC_018492	AGT	2	6	205393	205398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558205
3600	NC_018492	TCCAAA	2	12	205411	205422	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	402558205
3601	NC_018492	GTAA	2	8	205484	205491	50 %	25 %	25 %	0 %	402558205
3602	NC_018492	ACT	2	6	205496	205501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
3603	NC_018492	AT	3	6	205584	205589	50 %	50 %	0 %	0 %	402558205
3604	NC_018492	CTG	2	6	205629	205634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558205
3605	NC_018492	TAC	2	6	205669	205674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
3606	NC_018492	TTA	2	6	205695	205700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558205
3607	NC_018492	CCA	2	6	205874	205879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402558205
3608	NC_018492	GTAA	2	8	205895	205902	50 %	25 %	25 %	0 %	402558205
3609	NC_018492	AAT	2	6	206030	206035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558205
3610	NC_018492	CTCC	2	8	206054	206061	0 %	25 %	0 %	75 %	402558205
3611	NC_018492	CAG	2	6	206154	206159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558205
3612	NC_018492	CTG	2	6	206271	206276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558205
3613	NC_018492	CTA	2	6	206289	206294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
3614	NC_018492	CTTC	2	8	206467	206474	0 %	50 %	0 %	50 %	402558205
3615	NC_018492	TCA	2	6	206558	206563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
3616	NC_018492	TTTCA	2	10	206571	206580	20 %	60 %	0 %	20 %	402558205
3617	NC_018492	AATC	2	8	206621	206628	50 %	25 %	0 %	25 %	402558205
3618	NC_018492	TAA	2	6	206713	206718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558205
3619	NC_018492	ATT	2	6	206774	206779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558205
3620	NC_018492	ACT	2	6	206789	206794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
3621	NC_018492	AC	3	6	206811	206816	50 %	0 %	0 %	50 %	402558205
3622	NC_018492	CAA	2	6	206820	206825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558205
3623	NC_018492	CAT	2	6	206859	206864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
3624	NC_018492	ATC	2	6	206963	206968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
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3737	NC_018492	CCAA	2	8	213412	213419	50 %	0 %	0 %	50 %	402558205
3738	NC_018492	TCCAA	2	10	213509	213518	40 %	20 %	0 %	40 %	402558205
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3742	NC_018492	AATC	2	8	213782	213789	50 %	25 %	0 %	25 %	402558205
3743	NC_018492	CCA	2	6	213827	213832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402558205
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3745	NC_018492	ATT	2	6	213887	213892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558205
3746	NC_018492	ATT	2	6	213935	213940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558205
3747	NC_018492	ACA	2	6	214002	214007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558205
3748	NC_018492	AATA	2	8	214045	214052	75 %	25 %	0 %	0 %	402558205
3749	NC_018492	TAT	2	6	214225	214230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558205
3750	NC_018492	ACT	2	6	214259	214264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
3751	NC_018492	ATC	2	6	214331	214336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
3752	NC_018492	TGC	2	6	214405	214410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558205
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3754	NC_018492	ACAAT	2	10	214509	214518	60 %	20 %	0 %	20 %	402558205
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3757	NC_018492	TAC	2	6	214648	214653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
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3760	NC_018492	T	6	6	214784	214789	0 %	100 %	0 %	0 %	402558205
3761	NC_018492	TATT	2	8	214815	214822	25 %	75 %	0 %	0 %	402558205
3762	NC_018492	GCA	2	6	214859	214864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558205
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3764	NC_018492	ACT	2	6	214913	214918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
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3769	NC_018492	CTG	2	6	215172	215177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402558205
3770	NC_018492	TGG	2	6	215200	215205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558205
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3772	NC_018492	GAA	2	6	215399	215404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558205
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3776	NC_018492	ATT	2	6	215555	215560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558205
3777	NC_018492	ATC	2	6	215570	215575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558205
3778	NC_018492	CAAA	2	8	215726	215733	75 %	0 %	0 %	25 %	402558205
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3804	NC_018492	ACA	3	9	216614	216622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558205
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.