MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p08

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018490	A	7	7	536	542	100 %	0 %	0 %	0 %	402574995
2	NC_018490	CCA	2	6	545	550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402574995
3	NC_018490	T	9	9	551	559	0 %	100 %	0 %	0 %	402574995
4	NC_018490	TGC	2	6	566	571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402574995
5	NC_018490	T	7	7	577	583	0 %	100 %	0 %	0 %	402574995
6	NC_018490	TTTC	2	8	595	602	0 %	75 %	0 %	25 %	402574995
7	NC_018490	CTAA	2	8	609	616	50 %	25 %	0 %	25 %	402574995
8	NC_018490	ATC	2	6	648	653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574995
9	NC_018490	TGATT	2	10	660	669	20 %	60 %	20 %	0 %	402574995
10	NC_018490	ATTTA	2	10	674	683	40 %	60 %	0 %	0 %	402574995
11	NC_018490	TAT	2	6	703	708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574995
12	NC_018490	TTA	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574995
13	NC_018490	C	7	7	754	760	0 %	0 %	0 %	100 %	402574995
14	NC_018490	AT	3	6	772	777	50 %	50 %	0 %	0 %	402574995
15	NC_018490	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574995
16	NC_018490	TCCT	2	8	847	854	0 %	50 %	0 %	50 %	402574995
17	NC_018490	ATA	2	6	871	876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574995
18	NC_018490	AAG	2	6	936	941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402574995
19	NC_018490	TC	3	6	956	961	0 %	50 %	0 %	50 %	402574995
20	NC_018490	ATA	2	6	971	976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574995
21	NC_018490	T	6	6	977	982	0 %	100 %	0 %	0 %	402574995
22	NC_018490	TGC	2	6	1013	1018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	402574995
23	NC_018490	TTGTT	2	10	1019	1028	0 %	80 %	20 %	0 %	402574995
24	NC_018490	AT	3	6	1034	1039	50 %	50 %	0 %	0 %	402574995
25	NC_018490	AAC	2	6	1040	1045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574995
26	NC_018490	AT	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	402574996
27	NC_018490	TCA	2	6	3287	3292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574996
28	NC_018490	CAAA	2	8	3384	3391	75 %	0 %	0 %	25 %	402574996
29	NC_018490	TTC	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574996
30	NC_018490	AAT	2	6	3430	3435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574996
31	NC_018490	TCA	4	12	3437	3448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574996
32	NC_018490	ATTA	2	8	3469	3476	50 %	50 %	0 %	0 %	402574996
33	NC_018490	TCT	2	6	3506	3511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574996
34	NC_018490	ATA	2	6	3515	3520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574996
35	NC_018490	A	6	6	3636	3641	100 %	0 %	0 %	0 %	402574997
36	NC_018490	CAAT	2	8	3666	3673	50 %	25 %	0 %	25 %	402574997
37	NC_018490	A	6	6	3677	3682	100 %	0 %	0 %	0 %	402574997
38	NC_018490	AGA	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402574997
39	NC_018490	CTA	2	6	3715	3720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574997
40	NC_018490	CAA	2	6	3727	3732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574997
41	NC_018490	TAAA	3	12	3757	3768	75 %	25 %	0 %	0 %	402574997
42	NC_018490	A	8	8	3766	3773	100 %	0 %	0 %	0 %	402574997
43	NC_018490	CTAA	2	8	3800	3807	50 %	25 %	0 %	25 %	402574998
44	NC_018490	TA	3	6	3818	3823	50 %	50 %	0 %	0 %	402574998
45	NC_018490	A	6	6	3882	3887	100 %	0 %	0 %	0 %	402574998
46	NC_018490	AAAT	2	8	4024	4031	75 %	25 %	0 %	0 %	402574998
47	NC_018490	CAA	2	6	4039	4044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574998
48	NC_018490	TTC	2	6	4068	4073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
49	NC_018490	TTTCAC	2	12	4088	4099	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	402574998
50	NC_018490	CTT	2	6	4107	4112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
51	NC_018490	ATC	3	9	4127	4135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574998
52	NC_018490	AAATC	2	10	4137	4146	60 %	20 %	0 %	20 %	402574998
53	NC_018490	TCA	2	6	4161	4166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574998
54	NC_018490	CTT	3	9	4183	4191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
55	NC_018490	ATTT	2	8	4199	4206	25 %	75 %	0 %	0 %	402574998
56	NC_018490	CAA	2	6	4231	4236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574998
57	NC_018490	TTC	2	6	4239	4244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
58	NC_018490	TAA	2	6	4298	4303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574998
59	NC_018490	CT	3	6	4325	4330	0 %	50 %	0 %	50 %	402574998
60	NC_018490	AATCA	2	10	4346	4355	60 %	20 %	0 %	20 %	402574998
61	NC_018490	ACCA	2	8	4393	4400	50 %	0 %	0 %	50 %	402574998
62	NC_018490	CAAT	2	8	4434	4441	50 %	25 %	0 %	25 %	402574998
63	NC_018490	TTA	2	6	4530	4535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574998
64	NC_018490	AT	3	6	4554	4559	50 %	50 %	0 %	0 %	402574998
65	NC_018490	GAC	2	6	4573	4578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402574998
66	NC_018490	AT	3	6	4648	4653	50 %	50 %	0 %	0 %	402574998
67	NC_018490	TCT	2	6	4665	4670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574998
68	NC_018490	AC	3	6	4696	4701	50 %	0 %	0 %	50 %	402574998
69	NC_018490	TGT	2	6	4709	4714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402574998
70	NC_018490	CT	3	6	4723	4728	0 %	50 %	0 %	50 %	402574998
71	NC_018490	A	6	6	4731	4736	100 %	0 %	0 %	0 %	402574998
72	NC_018490	TTG	2	6	4751	4756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402574998
73	NC_018490	TCA	2	6	4758	4763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574998
74	NC_018490	ATT	2	6	4776	4781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574998
75	NC_018490	CATA	2	8	4813	4820	50 %	25 %	0 %	25 %	402574998
76	NC_018490	T	8	8	4966	4973	0 %	100 %	0 %	0 %	402574999
77	NC_018490	ATT	2	6	5006	5011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574999
78	NC_018490	TTC	2	6	5097	5102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
79	NC_018490	TA	3	6	5119	5124	50 %	50 %	0 %	0 %	402574999
80	NC_018490	ATT	2	6	5129	5134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574999
81	NC_018490	TTC	2	6	5231	5236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
82	NC_018490	CAA	2	6	5311	5316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574999
83	NC_018490	AAT	2	6	5363	5368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
84	NC_018490	ATC	2	6	5399	5404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
85	NC_018490	TCTT	2	8	5421	5428	0 %	75 %	0 %	25 %	402574999
86	NC_018490	ATCC	2	8	5491	5498	25 %	25 %	0 %	50 %	402574999
87	NC_018490	CAAA	2	8	5536	5543	75 %	0 %	0 %	25 %	402574999
88	NC_018490	AAT	2	6	5663	5668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
89	NC_018490	CAT	2	6	5698	5703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
90	NC_018490	TCA	2	6	5784	5789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
91	NC_018490	CAAT	2	8	5805	5812	50 %	25 %	0 %	25 %	402574999
92	NC_018490	ATTC	2	8	5821	5828	25 %	50 %	0 %	25 %	402574999
93	NC_018490	AGA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402574999
94	NC_018490	AAT	2	6	5910	5915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
95	NC_018490	CTA	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
96	NC_018490	ACAA	2	8	5951	5958	75 %	0 %	0 %	25 %	402574999
97	NC_018490	TTCCTG	2	12	6016	6027	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	402574999
98	NC_018490	TCA	2	6	6070	6075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
99	NC_018490	CTA	2	6	6127	6132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
100	NC_018490	AGA	2	6	6143	6148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402574999
101	NC_018490	TCA	2	6	6192	6197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
102	NC_018490	CTAA	2	8	6213	6220	50 %	25 %	0 %	25 %	402574999
103	NC_018490	ATG	2	6	6221	6226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402574999
104	NC_018490	ACT	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
105	NC_018490	AT	3	6	6366	6371	50 %	50 %	0 %	0 %	402574999
106	NC_018490	TAA	2	6	6424	6429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
107	NC_018490	T	6	6	6431	6436	0 %	100 %	0 %	0 %	402574999
108	NC_018490	T	6	6	6564	6569	0 %	100 %	0 %	0 %	402574999
109	NC_018490	TCT	2	6	6579	6584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
110	NC_018490	TCAC	2	8	6609	6616	25 %	25 %	0 %	50 %	402574999
111	NC_018490	CTT	2	6	6632	6637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
112	NC_018490	A	6	6	6669	6674	100 %	0 %	0 %	0 %	402574999
113	NC_018490	TAA	2	6	6715	6720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
114	NC_018490	CAA	2	6	6730	6735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402574999
115	NC_018490	TTC	2	6	6743	6748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402574999
116	NC_018490	ATT	2	6	6764	6769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574999
117	NC_018490	AAAG	2	8	6820	6827	75 %	0 %	25 %	0 %	402574999
118	NC_018490	AAATC	2	10	6835	6844	60 %	20 %	0 %	20 %	402574999
119	NC_018490	TA	4	8	6847	6854	50 %	50 %	0 %	0 %	402574999
120	NC_018490	ATC	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
121	NC_018490	TAA	2	6	6894	6899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402574999
122	NC_018490	T	6	6	6902	6907	0 %	100 %	0 %	0 %	402574999
123	NC_018490	CAT	2	6	6931	6936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402574999
124	NC_018490	T	6	6	6982	6987	0 %	100 %	0 %	0 %	402574999
125	NC_018490	CTTT	2	8	6988	6995	0 %	75 %	0 %	25 %	402574999
126	NC_018490	TAAC	2	8	7023	7030	50 %	25 %	0 %	25 %	402574999
127	NC_018490	T	7	7	7031	7037	0 %	100 %	0 %	0 %	402574999
128	NC_018490	TTA	2	6	7233	7238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402574999
129	NC_018490	AAT	2	6	7350	7355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575000
130	NC_018490	AT	3	6	7365	7370	50 %	50 %	0 %	0 %	402575000
131	NC_018490	ATTC	2	8	7378	7385	25 %	50 %	0 %	25 %	402575000
132	NC_018490	TAT	2	6	7414	7419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402575000
133	NC_018490	ATAA	2	8	7506	7513	75 %	25 %	0 %	0 %	402575000
134	NC_018490	A	7	7	7574	7580	100 %	0 %	0 %	0 %	402575000
135	NC_018490	AGA	2	6	7628	7633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575000
136	NC_018490	AGA	2	6	7670	7675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402575000
137	NC_018490	AGGA	2	8	7693	7700	50 %	0 %	50 %	0 %	402575000
138	NC_018490	GA	3	6	7699	7704	50 %	0 %	50 %	0 %	402575000
139	NC_018490	TGT	2	6	8301	8306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402575001
140	NC_018490	TTTA	2	8	8325	8332	25 %	75 %	0 %	0 %	402575001
141	NC_018490	AACT	2	8	8361	8368	50 %	25 %	0 %	25 %	402575001
142	NC_018490	TA	3	6	8369	8374	50 %	50 %	0 %	0 %	402575001
143	NC_018490	ATC	2	6	8388	8393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575001
144	NC_018490	CAC	2	6	8441	8446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402575001
145	NC_018490	CAT	2	6	8471	8476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402575001
146	NC_018490	TAA	2	6	8499	8504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402575001
147	NC_018490	TTC	2	6	8505	8510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402575001

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.