MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p04

Total Repeats: 1274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018488	AT	3	6	196	201	50 %	50 %	0 %	0 %	402558330
2	NC_018488	TCTG	2	8	279	286	0 %	50 %	25 %	25 %	402558330
3	NC_018488	TAA	2	6	291	296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558330
4	NC_018488	ATT	2	6	307	312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558330
5	NC_018488	TG	3	6	321	326	0 %	50 %	50 %	0 %	402558330
6	NC_018488	GA	3	6	360	365	50 %	0 %	50 %	0 %	402558330
7	NC_018488	GAT	2	6	403	408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558330
8	NC_018488	TTG	2	6	411	416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558330
9	NC_018488	TAT	2	6	456	461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558330
10	NC_018488	TCA	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558330
11	NC_018488	TTA	2	6	519	524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558330
12	NC_018488	A	7	7	593	599	100 %	0 %	0 %	0 %	402558330
13	NC_018488	CAG	2	6	657	662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558330
14	NC_018488	AAAT	2	8	710	717	75 %	25 %	0 %	0 %	402558330
15	NC_018488	ATT	2	6	798	803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558331
16	NC_018488	ACAGCA	2	12	808	819	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	402558331
17	NC_018488	TAT	2	6	825	830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558331
18	NC_018488	CAG	2	6	836	841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558331
19	NC_018488	ATA	2	6	875	880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558331
20	NC_018488	ATG	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558331
21	NC_018488	AGT	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558331
22	NC_018488	AAT	2	6	976	981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558331
23	NC_018488	TTTGGT	2	12	985	996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558331
24	NC_018488	ATTT	2	8	1100	1107	25 %	75 %	0 %	0 %	402558331
25	NC_018488	GAT	2	6	1177	1182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558331
26	NC_018488	ACA	2	6	1246	1251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558331
27	NC_018488	AGA	2	6	1305	1310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558331
28	NC_018488	AGG	2	6	1332	1337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558331
29	NC_018488	CAC	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402558331
30	NC_018488	GTA	2	6	1408	1413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558331
31	NC_018488	GAAAA	2	10	1414	1423	80 %	0 %	20 %	0 %	402558331
32	NC_018488	A	6	6	1420	1425	100 %	0 %	0 %	0 %	402558331
33	NC_018488	AGA	2	6	1584	1589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558331
34	NC_018488	TAA	2	6	1656	1661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558331
35	NC_018488	AAT	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558331
36	NC_018488	GTAT	2	8	1787	1794	25 %	50 %	25 %	0 %	402558331
37	NC_018488	TAG	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558331
38	NC_018488	ACA	2	6	1874	1879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558331
39	NC_018488	TTG	2	6	1915	1920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558331
40	NC_018488	TAAAA	2	10	2147	2156	80 %	20 %	0 %	0 %	402558332
41	NC_018488	T	7	7	2164	2170	0 %	100 %	0 %	0 %	402558332
42	NC_018488	ATT	2	6	2189	2194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558332
43	NC_018488	ATG	2	6	2224	2229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558332
44	NC_018488	ACC	2	6	2321	2326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	402558332
45	NC_018488	TGG	2	6	2330	2335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558332
46	NC_018488	TAA	2	6	2399	2404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558332
47	NC_018488	ATG	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558332
48	NC_018488	GAAT	2	8	2521	2528	50 %	25 %	25 %	0 %	402558332
49	NC_018488	AATGGA	2	12	2553	2564	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	402558332
50	NC_018488	GGA	2	6	2667	2672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	402558332
51	NC_018488	TAAA	2	8	2689	2696	75 %	25 %	0 %	0 %	402558332
52	NC_018488	A	6	6	2822	2827	100 %	0 %	0 %	0 %	402558332
53	NC_018488	CAG	2	6	2884	2889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558332
54	NC_018488	ATG	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558332
55	NC_018488	TA	3	6	2961	2966	50 %	50 %	0 %	0 %	402558332
56	NC_018488	CAA	3	9	2973	2981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558332
57	NC_018488	TAA	2	6	2984	2989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558332
58	NC_018488	AAG	2	6	3007	3012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558332
59	NC_018488	GTA	2	6	3096	3101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558332
60	NC_018488	GTA	2	6	3160	3165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558332
61	NC_018488	GAT	2	6	3204	3209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558332
62	NC_018488	AGA	2	6	3349	3354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558332
63	NC_018488	CT	3	6	3359	3364	0 %	50 %	0 %	50 %	402558332
64	NC_018488	AAAT	2	8	3373	3380	75 %	25 %	0 %	0 %	402558332
65	NC_018488	GAT	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558332
66	NC_018488	AAC	2	6	3466	3471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558332
67	NC_018488	TGG	2	6	3495	3500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558332
68	NC_018488	GAA	2	6	3501	3506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558332
69	NC_018488	AGA	2	6	3542	3547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558332
70	NC_018488	AAAT	2	8	3566	3573	75 %	25 %	0 %	0 %	402558332
71	NC_018488	AGGA	2	8	3676	3683	50 %	0 %	50 %	0 %	402558332
72	NC_018488	TA	3	6	3824	3829	50 %	50 %	0 %	0 %	402558332
73	NC_018488	ATC	2	6	3838	3843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558332
74	NC_018488	GTA	2	6	3891	3896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558332
75	NC_018488	TAAT	2	8	3955	3962	50 %	50 %	0 %	0 %	402558332
76	NC_018488	AAC	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558332
77	NC_018488	AGT	2	6	4041	4046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558332
78	NC_018488	CAA	2	6	4081	4086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558332
79	NC_018488	TGA	2	6	4115	4120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558332
80	NC_018488	AAT	2	6	4262	4267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558332
81	NC_018488	TGG	2	6	4274	4279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558332
82	NC_018488	TAAA	2	8	4354	4361	75 %	25 %	0 %	0 %	402558332
83	NC_018488	TGA	2	6	4387	4392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558332
84	NC_018488	GAT	2	6	4428	4433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558332
85	NC_018488	AGA	2	6	4440	4445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558332
86	NC_018488	TGG	2	6	4530	4535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	402558332
87	NC_018488	TCC	2	6	4568	4573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	402558332
88	NC_018488	ATA	2	6	4633	4638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558332
89	NC_018488	TAA	2	6	4739	4744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558333
90	NC_018488	CAAGTT	2	12	4781	4792	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	402558333
91	NC_018488	TTTG	2	8	4794	4801	0 %	75 %	25 %	0 %	402558333
92	NC_018488	GCA	3	9	4837	4845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558333
93	NC_018488	GAA	2	6	4891	4896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558333
94	NC_018488	GTA	2	6	4915	4920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558333
95	NC_018488	AT	4	8	4985	4992	50 %	50 %	0 %	0 %	402558333
96	NC_018488	CCAT	2	8	5008	5015	25 %	25 %	0 %	50 %	402558333
97	NC_018488	AGA	2	6	5070	5075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558333
98	NC_018488	TGA	2	6	5076	5081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558333
99	NC_018488	A	7	7	5124	5130	100 %	0 %	0 %	0 %	402558333
100	NC_018488	A	6	6	5134	5139	100 %	0 %	0 %	0 %	402558333
101	NC_018488	TAAT	2	8	5142	5149	50 %	50 %	0 %	0 %	402558333
102	NC_018488	A	8	8	5167	5174	100 %	0 %	0 %	0 %	402558334
103	NC_018488	AAG	2	6	5185	5190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558334
104	NC_018488	AGC	2	6	5205	5210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558334
105	NC_018488	TAG	2	6	5222	5227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558334
106	NC_018488	TTG	2	6	5234	5239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	402558334
107	NC_018488	CTA	2	6	5536	5541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	402558334
108	NC_018488	CTT	2	6	5555	5560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558334
109	NC_018488	TAT	2	6	5571	5576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558334
110	NC_018488	GCA	2	6	5710	5715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558334
111	NC_018488	AGA	2	6	5772	5777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558334
112	NC_018488	TGAA	2	8	5819	5826	50 %	25 %	25 %	0 %	402558334
113	NC_018488	GAA	3	9	5824	5832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558334
114	NC_018488	AAT	2	6	5868	5873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558334
115	NC_018488	A	6	6	5912	5917	100 %	0 %	0 %	0 %	402558334
116	NC_018488	CAG	2	6	5918	5923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	402558334
117	NC_018488	AG	3	6	5973	5978	50 %	0 %	50 %	0 %	402558334
118	NC_018488	TAA	2	6	5999	6004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558335
119	NC_018488	AAT	2	6	6077	6082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	402558335
120	NC_018488	TTGT	2	8	6105	6112	0 %	75 %	25 %	0 %	402558335
121	NC_018488	ATT	2	6	6121	6126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	402558335
122	NC_018488	GAA	2	6	6192	6197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558335
123	NC_018488	A	7	7	6242	6248	100 %	0 %	0 %	0 %	402558335
124	NC_018488	GAA	2	6	6360	6365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558335
125	NC_018488	AT	3	6	6502	6507	50 %	50 %	0 %	0 %	402558335
126	NC_018488	AT	3	6	6536	6541	50 %	50 %	0 %	0 %	402558335
127	NC_018488	GTA	3	9	6610	6618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	402558335
128	NC_018488	TGAATT	2	12	6695	6706	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	402558335
129	NC_018488	TTC	2	6	6771	6776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	402558335
130	NC_018488	AAG	2	6	6784	6789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558335
131	NC_018488	A	6	6	6790	6795	100 %	0 %	0 %	0 %	402558335
132	NC_018488	AAC	2	6	6808	6813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	402558335
133	NC_018488	GAAAAA	2	12	6871	6882	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	402558336
134	NC_018488	A	7	7	6878	6884	100 %	0 %	0 %	0 %	402558336
135	NC_018488	GAA	2	6	6959	6964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	402558336
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