MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 45739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017999	CGC	2	6	89	94	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935918
2	NC_017999	GCA	2	6	177	182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935918
3	NC_017999	GCT	2	6	210	215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935918
4	NC_017999	CTC	2	6	272	277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935918
5	NC_017999	GCC	2	6	300	305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935918
6	NC_017999	GCG	2	6	328	333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935918
7	NC_017999	TCC	2	6	424	429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935918
8	NC_017999	TCGAT	2	10	431	440	20 %	40 %	20 %	20 %	390935918
9	NC_017999	CTC	2	6	485	490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935918
10	NC_017999	GCA	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935918
11	NC_017999	CGTT	2	8	581	588	0 %	50 %	25 %	25 %	390935918
12	NC_017999	CGCA	2	8	609	616	25 %	0 %	25 %	50 %	390935918
13	NC_017999	CGG	2	6	675	680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935918
14	NC_017999	CCG	2	6	846	851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935918
15	NC_017999	CGA	2	6	879	884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935918
16	NC_017999	CGG	2	6	897	902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935918
17	NC_017999	TTC	2	6	925	930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935918
18	NC_017999	CA	3	6	931	936	50 %	0 %	0 %	50 %	390935918
19	NC_017999	CAA	2	6	957	962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935918
20	NC_017999	GCC	2	6	1062	1067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935918
21	NC_017999	ATG	2	6	1099	1104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935918
22	NC_017999	CG	3	6	1243	1248	0 %	0 %	50 %	50 %	390935918
23	NC_017999	CTT	2	6	1272	1277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935918
24	NC_017999	CAC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935918
25	NC_017999	CCGA	2	8	1300	1307	25 %	0 %	25 %	50 %	390935918
26	NC_017999	CAT	2	6	1308	1313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935918
27	NC_017999	CGA	2	6	1347	1352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935918
28	NC_017999	TCG	2	6	1355	1360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935918
29	NC_017999	GC	4	8	1362	1369	0 %	0 %	50 %	50 %	390935918
30	NC_017999	CGG	2	6	1461	1466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935918
31	NC_017999	CAC	2	6	1476	1481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935918
32	NC_017999	GAT	2	6	1510	1515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935918
33	NC_017999	CG	3	6	1560	1565	0 %	0 %	50 %	50 %	390935918
34	NC_017999	AGC	2	6	1571	1576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935918
35	NC_017999	GAC	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935918
36	NC_017999	GAC	2	6	2238	2243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935919
37	NC_017999	CAC	2	6	2353	2358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935919
38	NC_017999	CGA	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935919
39	NC_017999	CTC	2	6	2407	2412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935919
40	NC_017999	CTGC	2	8	2431	2438	0 %	25 %	25 %	50 %	390935919
41	NC_017999	ACCT	2	8	2446	2453	25 %	25 %	0 %	50 %	390935919
42	NC_017999	CGAC	2	8	2456	2463	25 %	0 %	25 %	50 %	390935919
43	NC_017999	CCA	2	6	2468	2473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935919
44	NC_017999	GAG	2	6	2626	2631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935919
45	NC_017999	CGAC	2	8	2693	2700	25 %	0 %	25 %	50 %	390935919
46	NC_017999	CGC	2	6	2735	2740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935919
47	NC_017999	CGT	2	6	2823	2828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935919
48	NC_017999	GCT	2	6	2856	2861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935919
49	NC_017999	CGA	2	6	2940	2945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935919
50	NC_017999	AGC	2	6	2972	2977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935919
51	NC_017999	AACGC	2	10	3017	3026	40 %	0 %	20 %	40 %	390935919
52	NC_017999	CCG	2	6	3068	3073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935919
53	NC_017999	CAG	2	6	3244	3249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935919
54	NC_017999	CGA	2	6	3261	3266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935919
55	NC_017999	CGAAT	2	10	3340	3349	40 %	20 %	20 %	20 %	390935920
56	NC_017999	CCG	2	6	3358	3363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935920
57	NC_017999	AC	3	6	3366	3371	50 %	0 %	0 %	50 %	390935920
58	NC_017999	ATGAC	2	10	3382	3391	40 %	20 %	20 %	20 %	390935920
59	NC_017999	TCG	2	6	3518	3523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935921
60	NC_017999	GCG	2	6	3590	3595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935921
61	NC_017999	CGA	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935921
62	NC_017999	TGA	2	6	3651	3656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935921
63	NC_017999	ACC	3	9	3721	3729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935921
64	NC_017999	CGG	2	6	3777	3782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935921
65	NC_017999	GGA	2	6	3840	3845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935921
66	NC_017999	CAG	2	6	3847	3852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935921
67	NC_017999	GGCG	2	8	3858	3865	0 %	0 %	75 %	25 %	390935921
68	NC_017999	CCG	2	6	3869	3874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935921
69	NC_017999	TCA	2	6	3887	3892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935921
70	NC_017999	GTC	2	6	3898	3903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935921
71	NC_017999	CTG	2	6	3907	3912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935921
72	NC_017999	CACG	2	8	3945	3952	25 %	0 %	25 %	50 %	390935921
73	NC_017999	GGC	2	6	3966	3971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935921
74	NC_017999	CGC	2	6	4020	4025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935921
75	NC_017999	CAT	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935921
76	NC_017999	GGCG	2	8	4155	4162	0 %	0 %	75 %	25 %	390935921
77	NC_017999	TGG	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935921
78	NC_017999	GCAG	2	8	4212	4219	25 %	0 %	50 %	25 %	390935921
79	NC_017999	CGA	2	6	4242	4247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935921
80	NC_017999	GGT	2	6	4482	4487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935921
81	NC_017999	CGA	2	6	4494	4499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935921
82	NC_017999	CGA	2	6	4515	4520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935921
83	NC_017999	CGC	2	6	4525	4530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935921
84	NC_017999	CCGCGG	2	12	4577	4588	0 %	0 %	50 %	50 %	390935921
85	NC_017999	CGA	2	6	4680	4685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935921
86	NC_017999	CGGG	2	8	4741	4748	0 %	0 %	75 %	25 %	390935922
87	NC_017999	GGA	2	6	4896	4901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935922
88	NC_017999	GAT	2	6	4913	4918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935922
89	NC_017999	GGT	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935922
90	NC_017999	ACCT	2	8	5160	5167	25 %	25 %	0 %	50 %	390935922
91	NC_017999	AGC	2	6	5523	5528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
92	NC_017999	AGC	2	6	5533	5538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
93	NC_017999	GAC	2	6	5595	5600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
94	NC_017999	CG	3	6	5701	5706	0 %	0 %	50 %	50 %	390935923
95	NC_017999	CAC	2	6	5712	5717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935923
96	NC_017999	TCG	2	6	5731	5736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935923
97	NC_017999	CGA	2	6	5747	5752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
98	NC_017999	CGT	2	6	5813	5818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935923
99	NC_017999	GAC	2	6	5820	5825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
100	NC_017999	CGA	2	6	5843	5848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
101	NC_017999	TGA	2	6	5884	5889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935923
102	NC_017999	CGG	2	6	5903	5908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935923
103	NC_017999	CGG	4	12	5915	5926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935923
104	NC_017999	CGG	2	6	5939	5944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935923
105	NC_017999	GCG	2	6	6005	6010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935923
106	NC_017999	GCG	2	6	6129	6134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935923
107	NC_017999	CAG	2	6	6183	6188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
108	NC_017999	TCAC	2	8	6219	6226	25 %	25 %	0 %	50 %	390935923
109	NC_017999	CGA	2	6	6254	6259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
110	NC_017999	GAG	2	6	6378	6383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935923
111	NC_017999	ACC	2	6	6450	6455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935923
112	NC_017999	CCA	2	6	6496	6501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935923
113	NC_017999	GCAC	2	8	6511	6518	25 %	0 %	25 %	50 %	390935923
114	NC_017999	GAA	2	6	6519	6524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935923
115	NC_017999	CGA	2	6	6611	6616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
116	NC_017999	CCG	2	6	6634	6639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935923
117	NC_017999	CTC	2	6	6661	6666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935923
118	NC_017999	TGA	2	6	6730	6735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935923
119	NC_017999	CAT	2	6	6785	6790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935923
120	NC_017999	GAA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935923
121	NC_017999	CGGC	2	8	6874	6881	0 %	0 %	50 %	50 %	390935923
122	NC_017999	TCG	2	6	6940	6945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935923
123	NC_017999	GGC	2	6	6960	6965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935923
124	NC_017999	ATG	2	6	7056	7061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935923
125	NC_017999	CGG	3	9	7097	7105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935923
126	NC_017999	TCA	3	9	7150	7158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935923
127	NC_017999	TTC	2	6	7212	7217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935923
128	NC_017999	GAT	2	6	7232	7237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935923
129	NC_017999	CG	3	6	7291	7296	0 %	0 %	50 %	50 %	390935923
130	NC_017999	ACCG	2	8	7317	7324	25 %	0 %	25 %	50 %	390935923
131	NC_017999	CGA	2	6	7331	7336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
132	NC_017999	ACC	2	6	7440	7445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935923
133	NC_017999	CGA	2	6	7529	7534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935923
134	NC_017999	ACG	2	6	7779	7784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935924
135	NC_017999	CGA	2	6	7843	7848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935924
136	NC_017999	TCG	2	6	7920	7925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935924
137	NC_017999	CCG	2	6	7969	7974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935924
138	NC_017999	CGG	2	6	7996	8001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935924
139	NC_017999	ACC	2	6	8064	8069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390935924
140	NC_017999	CGC	2	6	8080	8085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935924
141	NC_017999	GGGCA	2	10	8147	8156	20 %	0 %	60 %	20 %	390935924
142	NC_017999	TCGGC	2	10	8160	8169	0 %	20 %	40 %	40 %	390935924
143	NC_017999	GAC	2	6	8174	8179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935924
144	NC_017999	CCGC	2	8	8180	8187	0 %	0 %	25 %	75 %	390935924
145	NC_017999	ATG	2	6	8213	8218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935924
146	NC_017999	CG	3	6	8314	8319	0 %	0 %	50 %	50 %	390935924
147	NC_017999	CTG	2	6	8330	8335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935924
148	NC_017999	CCG	2	6	8381	8386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390935924
149	NC_017999	ATC	2	6	8430	8435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935924
150	NC_017999	GCT	2	6	8455	8460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935924
151	NC_017999	CAT	2	6	8476	8481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935924
152	NC_017999	GC	3	6	8572	8577	0 %	0 %	50 %	50 %	390935924
153	NC_017999	GGT	2	6	8578	8583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935924
154	NC_017999	GAG	2	6	8591	8596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935924
155	NC_017999	TGG	2	6	8616	8621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935924
156	NC_017999	CGA	2	6	8719	8724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935924
157	NC_017999	CTCGTG	2	12	8750	8761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935924
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159	NC_017999	CAA	2	6	8794	8799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390935924
160	NC_017999	GCA	2	6	8821	8826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935924
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162	NC_017999	CGA	2	6	9013	9018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935924
163	NC_017999	CCAG	2	8	9039	9046	25 %	0 %	25 %	50 %	390935924
164	NC_017999	AGA	2	6	9156	9161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390935924
165	NC_017999	CGA	2	6	9166	9171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935924
166	NC_017999	TCG	2	6	9243	9248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935924
167	NC_017999	CGA	2	6	9250	9255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935924
168	NC_017999	CGA	2	6	9259	9264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935924
169	NC_017999	TCG	2	6	9267	9272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935924
170	NC_017999	TCC	2	6	9303	9308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390935924
171	NC_017999	GAG	2	6	9347	9352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390935924
172	NC_017999	GTG	2	6	9356	9361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935924
173	NC_017999	TCA	2	6	9384	9389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390935924
174	NC_017999	CGG	2	6	9427	9432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390935924
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176	NC_017999	CTT	2	6	9481	9486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935924
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180	NC_017999	CG	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	390935924
181	NC_017999	CTG	2	6	9605	9610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935924
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238	NC_017999	ACGCC	2	10	12725	12734	20 %	0 %	20 %	60 %	390935928
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242	NC_017999	CGGTGG	2	12	12932	12943	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	390935928
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244	NC_017999	AGT	2	6	12992	12997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935928
245	NC_017999	CTT	2	6	13008	13013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935928
246	NC_017999	GAT	2	6	13014	13019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935928
247	NC_017999	CGA	2	6	13076	13081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935928
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249	NC_017999	ATG	2	6	13141	13146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390935928
250	NC_017999	CGTCCT	2	12	13157	13168	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	390935928
251	NC_017999	TGG	2	6	13211	13216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935928
252	NC_017999	GCA	2	6	13334	13339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935928
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254	NC_017999	TCT	2	6	13384	13389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390935928
255	NC_017999	GGT	2	6	13434	13439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935928
256	NC_017999	GTC	2	6	13884	13889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390935929
257	NC_017999	GCA	2	6	13891	13896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390935929
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259	NC_017999	GGT	2	6	13991	13996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390935929
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498	NC_017999	CGGC	2	8	25601	25608	0 %	0 %	50 %	50 %	390935939
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