MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 45739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_017999	CTGCGG	2	12	665041	665052	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	390936450
13503	NC_017999	CG	3	6	665104	665109	0 %	0 %	50 %	50 %	390936450
13504	NC_017999	GCC	2	6	665174	665179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936450
13505	NC_017999	GCG	2	6	665217	665222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936450
13506	NC_017999	GGT	2	6	665239	665244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936450
13507	NC_017999	CGA	2	6	665245	665250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936450
13508	NC_017999	CAT	2	6	665258	665263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936450
13509	NC_017999	GC	3	6	665277	665282	0 %	0 %	50 %	50 %	390936450
13510	NC_017999	CGC	2	6	665290	665295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936450
13511	NC_017999	TCG	2	6	665478	665483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936450
13512	NC_017999	CGA	2	6	665545	665550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936450
13513	NC_017999	GGC	2	6	665560	665565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936450
13514	NC_017999	GTG	2	6	665600	665605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936450
13515	NC_017999	GCAC	2	8	665653	665660	25 %	0 %	25 %	50 %	390936450
13516	NC_017999	CGG	2	6	665698	665703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936451
13517	NC_017999	ACG	2	6	665770	665775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936451
13518	NC_017999	TCG	2	6	665791	665796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936451
13519	NC_017999	TCG	2	6	666061	666066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936451
13520	NC_017999	CGGT	2	8	666076	666083	0 %	25 %	50 %	25 %	390936451
13521	NC_017999	TCG	2	6	666101	666106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936451
13522	NC_017999	CG	3	6	666108	666113	0 %	0 %	50 %	50 %	390936451
13523	NC_017999	AAG	2	6	666139	666144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936451
13524	NC_017999	CG	3	6	666207	666212	0 %	0 %	50 %	50 %	390936451
13525	NC_017999	GAA	2	6	666225	666230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936451
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13527	NC_017999	TGT	2	6	666311	666316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390936451
13528	NC_017999	TCAGCG	2	12	666350	666361	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390936451
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13531	NC_017999	CGCT	2	8	666514	666521	0 %	25 %	25 %	50 %	390936451
13532	NC_017999	GCA	2	6	666540	666545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936451
13533	NC_017999	CGC	2	6	666549	666554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936451
13534	NC_017999	TGG	2	6	666581	666586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936451
13535	NC_017999	AGG	2	6	666698	666703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936451
13536	NC_017999	CGG	2	6	666717	666722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936451
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13539	NC_017999	GTC	3	9	666811	666819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936451
13540	NC_017999	TCG	2	6	666857	666862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936451
13541	NC_017999	GCT	2	6	666867	666872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936451
13542	NC_017999	CAT	2	6	666933	666938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936451
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13544	NC_017999	TCC	2	6	667614	667619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936452
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13547	NC_017999	GCC	2	6	667835	667840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936452
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13549	NC_017999	C	6	6	667972	667977	0 %	0 %	0 %	100 %	390936452
13550	NC_017999	GT	3	6	668165	668170	0 %	50 %	50 %	0 %	390936453
13551	NC_017999	GTCG	2	8	668178	668185	0 %	25 %	50 %	25 %	390936453
13552	NC_017999	TGT	2	6	668187	668192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390936453
13553	NC_017999	CAG	2	6	668230	668235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936453
13554	NC_017999	CTG	3	9	668251	668259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936453
13555	NC_017999	TGGC	2	8	668299	668306	0 %	25 %	50 %	25 %	390936453
13556	NC_017999	TCTGCG	2	12	668316	668327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936453
13557	NC_017999	CGG	2	6	668376	668381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936453
13558	NC_017999	TCG	2	6	668447	668452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936453
13559	NC_017999	CAT	2	6	668478	668483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936453
13560	NC_017999	GCGCT	2	10	668503	668512	0 %	20 %	40 %	40 %	390936453
13561	NC_017999	ACG	2	6	668573	668578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936453
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13568	NC_017999	GCGACC	2	12	669104	669115	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	390936454
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13589	NC_017999	TGCCGA	2	12	669750	669761	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390936454
13590	NC_017999	CAG	2	6	669817	669822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936454
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13592	NC_017999	CGA	2	6	669849	669854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936454
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13596	NC_017999	TGG	2	6	669954	669959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936454
13597	NC_017999	TCG	2	6	670011	670016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936454
13598	NC_017999	CGA	2	6	670032	670037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936454
13599	NC_017999	GAA	2	6	670048	670053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936454
13600	NC_017999	CAGG	2	8	670065	670072	25 %	0 %	50 %	25 %	390936454
13601	NC_017999	TGG	2	6	670101	670106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936454
13602	NC_017999	CGG	2	6	670268	670273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936455
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13604	NC_017999	CGA	2	6	670370	670375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936455
13605	NC_017999	GGA	2	6	670401	670406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936455
13606	NC_017999	GAT	2	6	670422	670427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936455
13607	NC_017999	CCG	2	6	670444	670449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936455
13608	NC_017999	CGT	2	6	670499	670504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936455
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13613	NC_017999	AGT	2	6	670613	670618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936455
13614	NC_017999	CGC	2	6	670622	670627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936455
13615	NC_017999	GAA	2	6	670641	670646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936455
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13736	NC_017999	GCACG	2	10	676109	676118	20 %	0 %	40 %	40 %	390936461
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13854	NC_017999	CAT	2	6	680898	680903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936465
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13967	NC_017999	CAT	2	6	686067	686072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936469
13968	NC_017999	GCC	2	6	686075	686080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936469
13969	NC_017999	ATCTGG	2	12	686102	686113	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390936469
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