MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 45739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017999	CGA	2	6	641772	641777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936431
13002	NC_017999	CCG	2	6	641816	641821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936431
13003	NC_017999	CCG	2	6	641865	641870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936431
13004	NC_017999	CTG	2	6	642261	642266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936432
13005	NC_017999	GAG	2	6	642306	642311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936432
13006	NC_017999	GAG	2	6	642315	642320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936432
13007	NC_017999	GTG	2	6	642414	642419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936432
13008	NC_017999	TGG	2	6	642421	642426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936432
13009	NC_017999	ACC	3	9	642444	642452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936432
13010	NC_017999	GAG	2	6	642465	642470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936432
13011	NC_017999	CGC	2	6	642485	642490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936432
13012	NC_017999	CCG	2	6	642502	642507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936432
13013	NC_017999	GGT	2	6	642512	642517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936432
13014	NC_017999	CTG	2	6	642528	642533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936432
13015	NC_017999	TCG	2	6	642601	642606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936432
13016	NC_017999	CAT	2	6	642626	642631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936432
13017	NC_017999	CGA	2	6	642635	642640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936432
13018	NC_017999	GCC	2	6	642647	642652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936432
13019	NC_017999	CAGC	2	8	642653	642660	25 %	0 %	25 %	50 %	390936432
13020	NC_017999	GGA	2	6	642671	642676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936432
13021	NC_017999	CCA	2	6	642679	642684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936432
13022	NC_017999	GGT	2	6	642692	642697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936432
13023	NC_017999	CCA	2	6	642739	642744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936432
13024	NC_017999	AAGGC	2	10	642751	642760	40 %	0 %	40 %	20 %	390936432
13025	NC_017999	TGC	2	6	642790	642795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936432
13026	NC_017999	GGCG	2	8	642833	642840	0 %	0 %	75 %	25 %	390936432
13027	NC_017999	GCG	2	6	642941	642946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936432
13028	NC_017999	GGA	2	6	643232	643237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936432
13029	NC_017999	CAT	2	6	643253	643258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936432
13030	NC_017999	ACG	2	6	643315	643320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936432
13031	NC_017999	GAG	2	6	643344	643349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936432
13032	NC_017999	CG	3	6	643354	643359	0 %	0 %	50 %	50 %	390936432
13033	NC_017999	TCG	2	6	643360	643365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936432
13034	NC_017999	CAA	2	6	643370	643375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936432
13035	NC_017999	GGC	2	6	643412	643417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936432
13036	NC_017999	CCG	2	6	643444	643449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936432
13037	NC_017999	GAC	2	6	643467	643472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936432
13038	NC_017999	CTG	2	6	643473	643478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936432
13039	NC_017999	ATCGA	2	10	643485	643494	40 %	20 %	20 %	20 %	390936432
13040	NC_017999	TGC	2	6	643495	643500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936432
13041	NC_017999	GCT	2	6	643526	643531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936432
13042	NC_017999	GCT	2	6	643550	643555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936432
13043	NC_017999	CG	3	6	643558	643563	0 %	0 %	50 %	50 %	390936432
13044	NC_017999	CCG	2	6	643634	643639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936432
13045	NC_017999	CGC	2	6	643643	643648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936432
13046	NC_017999	TCG	2	6	643654	643659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936432
13047	NC_017999	CGAT	2	8	643666	643673	25 %	25 %	25 %	25 %	390936432
13048	NC_017999	GACG	2	8	643676	643683	25 %	0 %	50 %	25 %	390936432
13049	NC_017999	ATG	2	6	643714	643719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936432
13050	NC_017999	TGG	2	6	643920	643925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936433
13051	NC_017999	TCG	2	6	643956	643961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936433
13052	NC_017999	CGC	3	9	643993	644001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936433
13053	NC_017999	GCA	2	6	644077	644082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936433
13054	NC_017999	GTC	2	6	644156	644161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936433
13055	NC_017999	CAT	2	6	644227	644232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936433
13056	NC_017999	CAT	2	6	644239	644244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936433
13057	NC_017999	ATG	2	6	644252	644257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936433
13058	NC_017999	TCA	2	6	644286	644291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936433
13059	NC_017999	CGT	2	6	644305	644310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936433
13060	NC_017999	CACG	2	8	644311	644318	25 %	0 %	25 %	50 %	390936433
13061	NC_017999	ACCA	2	8	644345	644352	50 %	0 %	0 %	50 %	390936433
13062	NC_017999	CAG	2	6	644408	644413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936433
13063	NC_017999	CGTCAA	2	12	644419	644430	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	390936433
13064	NC_017999	CCA	2	6	644493	644498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936433
13065	NC_017999	GCC	2	6	644555	644560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936433
13066	NC_017999	GAG	2	6	644567	644572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936433
13067	NC_017999	CCA	2	6	644575	644580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936433
13068	NC_017999	CGC	2	6	644593	644598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936433
13069	NC_017999	ATC	2	6	644606	644611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936433
13070	NC_017999	CCA	2	6	644625	644630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936433
13071	NC_017999	CGCCAT	2	12	644635	644646	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390936433
13072	NC_017999	CAT	2	6	644659	644664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936433
13073	NC_017999	GCT	2	6	644761	644766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936433
13074	NC_017999	GCC	2	6	644822	644827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936433
13075	NC_017999	CG	3	6	645285	645290	0 %	0 %	50 %	50 %	390936434
13076	NC_017999	GCA	2	6	645291	645296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936434
13077	NC_017999	ATG	2	6	645317	645322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936434
13078	NC_017999	TCG	2	6	645360	645365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936434
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13084	NC_017999	TCG	2	6	645552	645557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936434
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13088	NC_017999	TTC	2	6	645638	645643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936434
13089	NC_017999	ATC	3	9	645677	645685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936434
13090	NC_017999	GCA	2	6	645694	645699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936434
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13094	NC_017999	ATG	2	6	645788	645793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936434
13095	NC_017999	CGG	2	6	645826	645831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936434
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13098	NC_017999	TGC	2	6	645891	645896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936434
13099	NC_017999	GGA	2	6	645898	645903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936434
13100	NC_017999	CGGA	2	8	645909	645916	25 %	0 %	50 %	25 %	390936434
13101	NC_017999	CGA	2	6	645925	645930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936434
13102	NC_017999	GTAC	2	8	645932	645939	25 %	25 %	25 %	25 %	390936434
13103	NC_017999	CGT	2	6	645961	645966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936434
13104	NC_017999	GTG	2	6	646031	646036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936434
13105	NC_017999	GGC	2	6	646060	646065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936434
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13107	NC_017999	GCA	2	6	646334	646339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936435
13108	NC_017999	GAC	2	6	646344	646349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936435
13109	NC_017999	TCG	3	9	646456	646464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936435
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13112	NC_017999	ATC	2	6	646549	646554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936435
13113	NC_017999	CAT	2	6	646622	646627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936435
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13115	NC_017999	CGG	2	6	646658	646663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936435
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13350	NC_017999	CGGC	2	8	658456	658463	0 %	0 %	50 %	50 %	390936445
13351	NC_017999	GC	3	6	658540	658545	0 %	0 %	50 %	50 %	390936445
13352	NC_017999	GCG	2	6	658550	658555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936445
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13354	NC_017999	GAC	2	6	658647	658652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936445
13355	NC_017999	TGC	2	6	658660	658665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936445
13356	NC_017999	GAC	2	6	658712	658717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936445
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13470	NC_017999	TGC	2	6	663542	663547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936449
13471	NC_017999	GTC	2	6	663562	663567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936449
13472	NC_017999	GGCAAG	2	12	663577	663588	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	390936449
13473	NC_017999	CGA	2	6	663591	663596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936449
13474	NC_017999	TGG	2	6	663608	663613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936449
13475	NC_017999	GC	3	6	663618	663623	0 %	0 %	50 %	50 %	390936449
13476	NC_017999	CGC	2	6	663771	663776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936449
13477	NC_017999	GCCT	2	8	663782	663789	0 %	25 %	25 %	50 %	390936449
13478	NC_017999	AGC	2	6	663824	663829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936449
13479	NC_017999	CGG	3	9	663858	663866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936449
13480	NC_017999	TGG	2	6	663872	663877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936449
13481	NC_017999	GCT	2	6	663924	663929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936449
13482	NC_017999	ACCGG	2	10	663936	663945	20 %	0 %	40 %	40 %	390936449
13483	NC_017999	CGC	2	6	663990	663995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936449
13484	NC_017999	CGACG	2	10	664168	664177	20 %	0 %	40 %	40 %	390936450
13485	NC_017999	CATCGG	2	12	664204	664215	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	390936450
13486	NC_017999	CAG	2	6	664343	664348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936450
13487	NC_017999	CGTG	2	8	664357	664364	0 %	25 %	50 %	25 %	390936450
13488	NC_017999	GTG	2	6	664376	664381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936450
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13490	NC_017999	TGA	2	6	664476	664481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936450
13491	NC_017999	GCC	2	6	664485	664490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936450
13492	NC_017999	GCT	2	6	664537	664542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936450
13493	NC_017999	CGG	2	6	664600	664605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936450
13494	NC_017999	CGG	2	6	664639	664644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936450
13495	NC_017999	CGA	2	6	664768	664773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936450
13496	NC_017999	TCG	2	6	664794	664799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936450
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13498	NC_017999	GCCGTG	2	12	664853	664864	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	390936450
13499	NC_017999	CCGT	2	8	664880	664887	0 %	25 %	25 %	50 %	390936450
13500	NC_017999	CCA	2	6	664911	664916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936450

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