MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 45739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017999	GCA	2	6	617865	617870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936408
12502	NC_017999	GTC	2	6	617911	617916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936408
12503	NC_017999	TTG	2	6	618231	618236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390936410
12504	NC_017999	GCA	2	6	618272	618277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936410
12505	NC_017999	GAT	2	6	618309	618314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936410
12506	NC_017999	CCA	2	6	618339	618344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936410
12507	NC_017999	GTTC	2	8	618356	618363	0 %	50 %	25 %	25 %	390936410
12508	NC_017999	CGA	2	6	618365	618370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936410
12509	NC_017999	GAC	2	6	618402	618407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936410
12510	NC_017999	TCGGCG	2	12	618409	618420	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	390936410
12511	NC_017999	GCGT	2	8	618560	618567	0 %	25 %	50 %	25 %	390936410
12512	NC_017999	TGAG	2	8	618569	618576	25 %	25 %	50 %	0 %	390936410
12513	NC_017999	CAG	2	6	618657	618662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936410
12514	NC_017999	GTA	2	6	618663	618668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936410
12515	NC_017999	GGT	2	6	618689	618694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936410
12516	NC_017999	GTCGCC	2	12	618720	618731	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	390936410
12517	NC_017999	CGG	2	6	618736	618741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936410
12518	NC_017999	CGT	2	6	618761	618766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936410
12519	NC_017999	ACCGGA	2	12	618776	618787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936410
12520	NC_017999	TGT	2	6	618827	618832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390936410
12521	NC_017999	GTG	2	6	618862	618867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936410
12522	NC_017999	GTT	2	6	618869	618874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390936410
12523	NC_017999	GCGCC	2	10	618962	618971	0 %	0 %	40 %	60 %	390936410
12524	NC_017999	CCG	2	6	619062	619067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936410
12525	NC_017999	TGA	2	6	619205	619210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936410
12526	NC_017999	GAT	2	6	619255	619260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936410
12527	NC_017999	GTC	3	9	619477	619485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936411
12528	NC_017999	GCGT	2	8	619532	619539	0 %	25 %	50 %	25 %	390936411
12529	NC_017999	GCA	2	6	619548	619553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936411
12530	NC_017999	CGA	2	6	619554	619559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936411
12531	NC_017999	CGC	2	6	619653	619658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936411
12532	NC_017999	GCC	2	6	619663	619668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936411
12533	NC_017999	CCA	2	6	619716	619721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936411
12534	NC_017999	TGGT	2	8	619727	619734	0 %	50 %	50 %	0 %	390936411
12535	NC_017999	GCG	2	6	619740	619745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936411
12536	NC_017999	CGGC	2	8	619764	619771	0 %	0 %	50 %	50 %	390936411
12537	NC_017999	TTC	2	6	619784	619789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936411
12538	NC_017999	GAT	2	6	619803	619808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936411
12539	NC_017999	GTC	2	6	619870	619875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936411
12540	NC_017999	CTG	2	6	619882	619887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936411
12541	NC_017999	CCG	2	6	619896	619901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936411
12542	NC_017999	CTT	2	6	619965	619970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936411
12543	NC_017999	GC	3	6	619980	619985	0 %	0 %	50 %	50 %	390936411
12544	NC_017999	GTC	2	6	619990	619995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936411
12545	NC_017999	TGG	2	6	620007	620012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936411
12546	NC_017999	CGG	2	6	620045	620050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936411
12547	NC_017999	AT	3	6	620080	620085	50 %	50 %	0 %	0 %	390936411
12548	NC_017999	CGT	2	6	620143	620148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936411
12549	NC_017999	GTT	2	6	620203	620208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390936411
12550	NC_017999	TCG	2	6	620217	620222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936411
12551	NC_017999	GCAT	2	8	620437	620444	25 %	25 %	25 %	25 %	390936412
12552	NC_017999	GCG	3	9	620499	620507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936412
12553	NC_017999	CCG	2	6	620513	620518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936412
12554	NC_017999	GTGA	2	8	620546	620553	25 %	25 %	50 %	0 %	390936412
12555	NC_017999	ACG	2	6	620558	620563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936413
12556	NC_017999	GCA	2	6	620569	620574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936413
12557	NC_017999	CCG	2	6	620660	620665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936413
12558	NC_017999	AC	3	6	620670	620675	50 %	0 %	0 %	50 %	390936413
12559	NC_017999	GC	3	6	620677	620682	0 %	0 %	50 %	50 %	390936413
12560	NC_017999	GAG	2	6	620687	620692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936413
12561	NC_017999	TAC	2	6	620735	620740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936413
12562	NC_017999	GAC	2	6	620800	620805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936413
12563	NC_017999	CGA	2	6	620838	620843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936413
12564	NC_017999	GCA	2	6	620865	620870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936413
12565	NC_017999	GTG	2	6	620885	620890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936413
12566	NC_017999	CGC	2	6	620917	620922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936413
12567	NC_017999	TTC	2	6	620930	620935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936413
12568	NC_017999	GC	4	8	620947	620954	0 %	0 %	50 %	50 %	390936413
12569	NC_017999	CGA	2	6	620968	620973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936413
12570	NC_017999	GCA	2	6	621013	621018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936413
12571	NC_017999	TGCG	2	8	621021	621028	0 %	25 %	50 %	25 %	390936413
12572	NC_017999	GCG	2	6	621116	621121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936413
12573	NC_017999	CGT	2	6	621184	621189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936413
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12578	NC_017999	CAT	2	6	621259	621264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936413
12579	NC_017999	CGATTT	2	12	621316	621327	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	390936413
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12583	NC_017999	CTC	2	6	621645	621650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936414
12584	NC_017999	CG	3	6	621685	621690	0 %	0 %	50 %	50 %	390936414
12585	NC_017999	GATC	2	8	621717	621724	25 %	25 %	25 %	25 %	390936414
12586	NC_017999	GCT	2	6	621738	621743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936414
12587	NC_017999	GC	3	6	621744	621749	0 %	0 %	50 %	50 %	390936414
12588	NC_017999	GCG	2	6	621760	621765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936414
12589	NC_017999	ACG	2	6	621776	621781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936414
12590	NC_017999	GCA	2	6	621822	621827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936414
12591	NC_017999	TGC	2	6	621841	621846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936414
12592	NC_017999	ATCG	2	8	621907	621914	25 %	25 %	25 %	25 %	390936414
12593	NC_017999	CCG	2	6	621965	621970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936414
12594	NC_017999	CAT	2	6	622489	622494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936415
12595	NC_017999	ATC	2	6	622538	622543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936415
12596	NC_017999	CGGC	2	8	622544	622551	0 %	0 %	50 %	50 %	390936415
12597	NC_017999	AGA	2	6	622566	622571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936415
12598	NC_017999	TCG	2	6	622580	622585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936415
12599	NC_017999	CTAT	2	8	622591	622598	25 %	50 %	0 %	25 %	390936415
12600	NC_017999	CCT	2	6	622625	622630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936415
12601	NC_017999	ATGG	2	8	622989	622996	25 %	25 %	50 %	0 %	390936416
12602	NC_017999	GCATG	2	10	623012	623021	20 %	20 %	40 %	20 %	390936416
12603	NC_017999	ATG	3	9	623019	623027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936416
12604	NC_017999	T	6	6	623059	623064	0 %	100 %	0 %	0 %	390936417
12605	NC_017999	GCC	2	6	623071	623076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936417
12606	NC_017999	CTC	2	6	623094	623099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936417
12607	NC_017999	CG	3	6	623155	623160	0 %	0 %	50 %	50 %	390936417
12608	NC_017999	GAT	2	6	623220	623225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936417
12609	NC_017999	T	6	6	623256	623261	0 %	100 %	0 %	0 %	390936417
12610	NC_017999	GAT	3	9	623294	623302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936417
12611	NC_017999	CGT	2	6	623306	623311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936417
12612	NC_017999	GGA	2	6	623426	623431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936417
12613	NC_017999	GAC	2	6	623551	623556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936417
12614	NC_017999	GAT	2	6	623581	623586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936417
12615	NC_017999	TGA	2	6	623600	623605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936417
12616	NC_017999	TCC	2	6	623629	623634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936417
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12974	NC_017999	TCG	2	6	640216	640221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936430
12975	NC_017999	CAC	2	6	640275	640280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936430
12976	NC_017999	TCA	2	6	640322	640327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936430
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12981	NC_017999	GTTC	2	8	640481	640488	0 %	50 %	25 %	25 %	390936430
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