MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium bifidum BGN4 chromosome

Total Repeats: 45739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_017999	ATC	2	6	500252	500257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936321
10003	NC_017999	GCCG	2	8	500278	500285	0 %	0 %	50 %	50 %	390936321
10004	NC_017999	CTG	2	6	500330	500335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936321
10005	NC_017999	GT	3	6	500340	500345	0 %	50 %	50 %	0 %	390936321
10006	NC_017999	CCG	3	9	500346	500354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936321
10007	NC_017999	TTC	2	6	500429	500434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936321
10008	NC_017999	ACC	2	6	500522	500527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936321
10009	NC_017999	GTG	2	6	500585	500590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936321
10010	NC_017999	GCA	2	6	500640	500645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936321
10011	NC_017999	CAA	2	6	500646	500651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936321
10012	NC_017999	A	6	6	500770	500775	100 %	0 %	0 %	0 %	390936321
10013	NC_017999	AAG	2	6	500777	500782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390936321
10014	NC_017999	GGA	2	6	500788	500793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936321
10015	NC_017999	AGG	2	6	500811	500816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390936321
10016	NC_017999	GCT	2	6	500893	500898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936321
10017	NC_017999	TCG	2	6	500904	500909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936321
10018	NC_017999	GCC	2	6	500969	500974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936321
10019	NC_017999	TCG	2	6	500982	500987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936321
10020	NC_017999	CG	3	6	500986	500991	0 %	0 %	50 %	50 %	390936321
10021	NC_017999	TGC	2	6	501036	501041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936321
10022	NC_017999	CCA	2	6	501063	501068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390936321
10023	NC_017999	CTC	2	6	501080	501085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936321
10024	NC_017999	CTGATG	2	12	501108	501119	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390936321
10025	NC_017999	TCC	2	6	501131	501136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390936321
10026	NC_017999	GGC	2	6	501141	501146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936321
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10028	NC_017999	GC	3	6	501152	501157	0 %	0 %	50 %	50 %	390936321
10029	NC_017999	GGT	2	6	501168	501173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936321
10030	NC_017999	GCGTG	2	10	501242	501251	0 %	20 %	60 %	20 %	390936321
10031	NC_017999	CCG	2	6	501300	501305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936321
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10033	NC_017999	AAC	2	6	501368	501373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390936321
10034	NC_017999	CGG	2	6	501401	501406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390936321
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10039	NC_017999	CGGG	2	8	501659	501666	0 %	0 %	75 %	25 %	390936321
10040	NC_017999	GAC	2	6	501670	501675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936321
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10043	NC_017999	TGC	2	6	501735	501740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936321
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10049	NC_017999	CAT	2	6	501892	501897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936321
10050	NC_017999	AGGTTC	2	12	501898	501909	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	390936321
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10054	NC_017999	ATG	3	9	502088	502096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936321
10055	NC_017999	GCT	2	6	502114	502119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936321
10056	NC_017999	GTCGC	2	10	502120	502129	0 %	20 %	40 %	40 %	390936321
10057	NC_017999	CGA	2	6	502138	502143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936321
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10060	NC_017999	GAAG	2	8	502216	502223	50 %	0 %	50 %	0 %	390936321
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10065	NC_017999	GTCG	2	8	502336	502343	0 %	25 %	50 %	25 %	390936321
10066	NC_017999	TCG	2	6	502374	502379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936321
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10110	NC_017999	CG	3	6	504260	504265	0 %	0 %	50 %	50 %	390936321
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10116	NC_017999	CG	3	6	504898	504903	0 %	0 %	50 %	50 %	390936322
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10118	NC_017999	CGC	2	6	504947	504952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936322
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10237	NC_017999	GAC	2	6	511208	511213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936329
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10343	NC_017999	GTC	2	6	516255	516260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936331
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10350	NC_017999	CAG	2	6	516601	516606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936331
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10471	NC_017999	ACG	2	6	521970	521975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936336
10472	NC_017999	CGA	2	6	522024	522029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936336
10473	NC_017999	GAT	2	6	522030	522035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936336
10474	NC_017999	GCA	2	6	522041	522046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936336
10475	NC_017999	TCA	2	6	522053	522058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936336
10476	NC_017999	GCC	2	6	522090	522095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936336
10477	NC_017999	ATG	2	6	522125	522130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390936336
10478	NC_017999	CG	3	6	522133	522138	0 %	0 %	50 %	50 %	390936336
10479	NC_017999	CGCTG	2	10	522150	522159	0 %	20 %	40 %	40 %	390936336
10480	NC_017999	CAT	2	6	522208	522213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936336
10481	NC_017999	CGC	2	6	522229	522234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	390936336
10482	NC_017999	TCA	2	6	522239	522244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936336
10483	NC_017999	CGA	2	6	522300	522305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936336
10484	NC_017999	TCG	2	6	522311	522316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936336
10485	NC_017999	GTG	3	9	522367	522375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936336
10486	NC_017999	CG	3	6	522430	522435	0 %	0 %	50 %	50 %	390936336
10487	NC_017999	GAGC	2	8	522438	522445	25 %	0 %	50 %	25 %	390936336
10488	NC_017999	CAT	2	6	522555	522560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936336
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10490	NC_017999	ACCTCG	2	12	522572	522583	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	390936336
10491	NC_017999	AGGTC	2	10	522608	522617	20 %	20 %	40 %	20 %	390936336
10492	NC_017999	GCT	2	6	522621	522626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936336
10493	NC_017999	ATC	2	6	522643	522648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390936336
10494	NC_017999	TTC	2	6	522667	522672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390936336
10495	NC_017999	GGT	2	6	522702	522707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390936336
10496	NC_017999	CGA	2	6	522732	522737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	390936336
10497	NC_017999	TAT	2	6	522751	522756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390936336
10498	NC_017999	GC	3	6	522761	522766	0 %	0 %	50 %	50 %	390936336
10499	NC_017999	CCCA	2	8	522772	522779	25 %	0 %	0 %	75 %	390936336
10500	NC_017999	TGC	2	6	522783	522788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390936336

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