MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Burkholderia sp. KJ006 chromosome 1

Total Repeats: 82619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017920	CGC	2	6	149	154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900763
2	NC_017920	ACGC	2	8	199	206	25 %	0 %	25 %	50 %	387900763
3	NC_017920	CGCGAC	2	12	233	244	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387900763
4	NC_017920	A	6	6	275	280	100 %	0 %	0 %	0 %	387900763
5	NC_017920	TGA	2	6	292	297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387900763
6	NC_017920	CTG	2	6	324	329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900764
7	NC_017920	CAG	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900764
8	NC_017920	ACGTG	2	10	355	364	20 %	20 %	40 %	20 %	387900764
9	NC_017920	CGC	2	6	419	424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900764
10	NC_017920	GCGCG	2	10	548	557	0 %	0 %	60 %	40 %	387900764
11	NC_017920	GCCGC	2	10	576	585	0 %	0 %	40 %	60 %	387900764
12	NC_017920	CGC	2	6	611	616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900764
13	NC_017920	CGC	2	6	623	628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900764
14	NC_017920	GC	3	6	670	675	0 %	0 %	50 %	50 %	387900764
15	NC_017920	CGG	2	6	700	705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900764
16	NC_017920	CCG	2	6	706	711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900764
17	NC_017920	CAC	2	6	714	719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387900764
18	NC_017920	CGA	2	6	728	733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900764
19	NC_017920	GCG	2	6	771	776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900764
20	NC_017920	GCCG	2	8	777	784	0 %	0 %	50 %	50 %	387900764
21	NC_017920	GCGCC	2	10	808	817	0 %	0 %	40 %	60 %	387900764
22	NC_017920	CG	4	8	914	921	0 %	0 %	50 %	50 %	387900764
23	NC_017920	CCG	2	6	922	927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900764
24	NC_017920	CGG	2	6	980	985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900764
25	NC_017920	GCT	3	9	1031	1039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900764
26	NC_017920	GC	3	6	1051	1056	0 %	0 %	50 %	50 %	387900764
27	NC_017920	CGT	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900764
28	NC_017920	CGA	2	6	1124	1129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900764
29	NC_017920	CTA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387900764
30	NC_017920	CTCG	2	8	1148	1155	0 %	25 %	25 %	50 %	387900764
31	NC_017920	CTG	2	6	1158	1163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900764
32	NC_017920	CGA	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900764
33	NC_017920	TTC	2	6	1182	1187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387900764
34	NC_017920	CGCA	2	8	1200	1207	25 %	0 %	25 %	50 %	387900764
35	NC_017920	GGA	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387900764
36	NC_017920	TTC	2	6	1215	1220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387900764
37	NC_017920	ATC	2	6	1260	1265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387900764
38	NC_017920	CGA	2	6	1301	1306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900764
39	NC_017920	GCC	2	6	1352	1357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900764
40	NC_017920	TTC	2	6	1434	1439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387900764
41	NC_017920	GC	3	6	1480	1485	0 %	0 %	50 %	50 %	387900764
42	NC_017920	TCGA	2	8	1530	1537	25 %	25 %	25 %	25 %	387900764
43	NC_017920	CTG	2	6	1563	1568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900764
44	NC_017920	AGA	2	6	1606	1611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387900764
45	NC_017920	ACA	2	6	1627	1632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387900764
46	NC_017920	GAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387900764
47	NC_017920	CG	3	6	1676	1681	0 %	0 %	50 %	50 %	387900764
48	NC_017920	AGA	2	6	1723	1728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387900764
49	NC_017920	CGG	2	6	1754	1759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900764
50	NC_017920	CAC	2	6	1769	1774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387900764
51	NC_017920	TGC	2	6	1777	1782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900764
52	NC_017920	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900764
53	NC_017920	CTC	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387900765
54	NC_017920	TCG	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900765
55	NC_017920	CGC	2	6	2109	2114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900765
56	NC_017920	CTG	2	6	2139	2144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900765
57	NC_017920	TTTC	2	8	2167	2174	0 %	75 %	0 %	25 %	387900765
58	NC_017920	CGAC	2	8	2179	2186	25 %	0 %	25 %	50 %	387900765
59	NC_017920	CAC	2	6	2201	2206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387900765
60	NC_017920	GC	3	6	2207	2212	0 %	0 %	50 %	50 %	387900765
61	NC_017920	GCT	2	6	2264	2269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900765
62	NC_017920	GC	3	6	2279	2284	0 %	0 %	50 %	50 %	387900765
63	NC_017920	TCGC	2	8	2310	2317	0 %	25 %	25 %	50 %	387900765
64	NC_017920	CGC	2	6	2372	2377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900765
65	NC_017920	CGC	2	6	2414	2419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900765
66	NC_017920	GCT	2	6	2453	2458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900765
67	NC_017920	GCA	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900765
68	NC_017920	CTA	2	6	2498	2503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387900765
69	NC_017920	TGC	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900765
70	NC_017920	TCG	3	9	2521	2529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900765
71	NC_017920	TCG	2	6	2580	2585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900765
72	NC_017920	GGC	2	6	2598	2603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900765
73	NC_017920	GCC	2	6	2611	2616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900765
74	NC_017920	CGA	2	6	2675	2680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900765
75	NC_017920	CGG	2	6	2726	2731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900765
76	NC_017920	CG	3	6	2850	2855	0 %	0 %	50 %	50 %	387900765
77	NC_017920	CAT	2	6	2894	2899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387900765
78	NC_017920	GAA	2	6	2955	2960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387900765
79	NC_017920	GC	3	6	3082	3087	0 %	0 %	50 %	50 %	387900765
80	NC_017920	ACG	2	6	3106	3111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900765
81	NC_017920	CGGC	2	8	3267	3274	0 %	0 %	50 %	50 %	387900766
82	NC_017920	CGC	2	6	3300	3305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900766
83	NC_017920	CAG	2	6	3372	3377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900767
84	NC_017920	TCG	2	6	3388	3393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900767
85	NC_017920	CAC	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387900767
86	NC_017920	TCGA	2	8	3505	3512	25 %	25 %	25 %	25 %	387900767
87	NC_017920	CCGA	2	8	3601	3608	25 %	0 %	25 %	50 %	387900767
88	NC_017920	AGCGC	2	10	3638	3647	20 %	0 %	40 %	40 %	387900767
89	NC_017920	TGA	2	6	3659	3664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387900767
90	NC_017920	GCGG	2	8	3676	3683	0 %	0 %	75 %	25 %	387900767
91	NC_017920	CGGG	2	8	3713	3720	0 %	0 %	75 %	25 %	387900767
92	NC_017920	GGCGTG	2	12	3727	3738	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	387900767
93	NC_017920	CGTG	2	8	3740	3747	0 %	25 %	50 %	25 %	387900767
94	NC_017920	AAG	2	6	3793	3798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387900767
95	NC_017920	CGA	2	6	3932	3937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900767
96	NC_017920	AAC	2	6	4003	4008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387900767
97	NC_017920	CGG	2	6	4068	4073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900767
98	NC_017920	TCG	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900767
99	NC_017920	CAA	2	6	4098	4103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387900767
100	NC_017920	TTC	2	6	4132	4137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387900767
101	NC_017920	GTGCT	2	10	4207	4216	0 %	40 %	40 %	20 %	387900767
102	NC_017920	AAC	2	6	4222	4227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387900767
103	NC_017920	CGG	2	6	4242	4247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900767
104	NC_017920	GC	3	6	4266	4271	0 %	0 %	50 %	50 %	387900767
105	NC_017920	CG	3	6	4280	4285	0 %	0 %	50 %	50 %	387900767
106	NC_017920	TCA	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387900767
107	NC_017920	GAA	2	6	4320	4325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387900767
108	NC_017920	GAC	2	6	4338	4343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900767
109	NC_017920	CGA	2	6	4347	4352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900767
110	NC_017920	CGTG	2	8	4370	4377	0 %	25 %	50 %	25 %	387900767
111	NC_017920	GTC	2	6	4434	4439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900767
112	NC_017920	GTGC	2	8	4444	4451	0 %	25 %	50 %	25 %	387900767
113	NC_017920	GTC	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900767
114	NC_017920	CCGA	2	8	4504	4511	25 %	0 %	25 %	50 %	387900767
115	NC_017920	ATC	2	6	4519	4524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387900767
116	NC_017920	TCG	2	6	4535	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900767
117	NC_017920	GCT	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900767
118	NC_017920	TGC	2	6	4560	4565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900767
119	NC_017920	GC	3	6	4573	4578	0 %	0 %	50 %	50 %	387900767
120	NC_017920	GACGC	2	10	4584	4593	20 %	0 %	40 %	40 %	387900767
121	NC_017920	TCG	2	6	4676	4681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900767
122	NC_017920	GGC	2	6	4696	4701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900767
123	NC_017920	CAAG	2	8	4707	4714	50 %	0 %	25 %	25 %	387900767
124	NC_017920	GC	3	6	4777	4782	0 %	0 %	50 %	50 %	387900767
125	NC_017920	GCT	2	6	4791	4796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900767
126	NC_017920	GTC	2	6	4797	4802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900767
127	NC_017920	CAT	4	12	4887	4898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387900767
128	NC_017920	GCT	3	9	4935	4943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900767
129	NC_017920	TTC	2	6	4948	4953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387900767
130	NC_017920	GCC	2	6	5004	5009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900767
131	NC_017920	GAC	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387900767
132	NC_017920	TGC	2	6	5078	5083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900767
133	NC_017920	CGGCG	2	10	5124	5133	0 %	0 %	60 %	40 %	387900767
134	NC_017920	CTG	2	6	5173	5178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387900767
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136	NC_017920	GCG	2	6	5305	5310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900767
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492	NC_017920	CGGCGC	2	12	32161	32172	0 %	0 %	50 %	50 %	387900782
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498	NC_017920	GCC	2	6	32438	32443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387900783
499	NC_017920	GC	3	6	32472	32477	0 %	0 %	50 %	50 %	387900783
500	NC_017920	GCG	2	6	32501	32506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387900783

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