MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens Y2 chromosome

Total Repeats: 76290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017912	CAG	2	6	143	148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896524
2	NC_017912	ATA	2	6	169	174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896524
3	NC_017912	T	7	7	221	227	0 %	100 %	0 %	0 %	387896524
4	NC_017912	A	8	8	235	242	100 %	0 %	0 %	0 %	387896524
5	NC_017912	A	6	6	257	262	100 %	0 %	0 %	0 %	387896524
6	NC_017912	T	7	7	287	293	0 %	100 %	0 %	0 %	387896524
7	NC_017912	AT	3	6	693	698	50 %	50 %	0 %	0 %	387896525
8	NC_017912	CGA	2	6	774	779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
9	NC_017912	CTGG	2	8	841	848	0 %	25 %	50 %	25 %	387896525
10	NC_017912	AT	3	6	881	886	50 %	50 %	0 %	0 %	387896525
11	NC_017912	GAA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896525
12	NC_017912	GAA	2	6	941	946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896525
13	NC_017912	A	6	6	971	976	100 %	0 %	0 %	0 %	387896525
14	NC_017912	ATCGG	2	10	1049	1058	20 %	20 %	40 %	20 %	387896525
15	NC_017912	GCA	2	6	1076	1081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
16	NC_017912	TTTA	2	8	1123	1130	25 %	75 %	0 %	0 %	387896525
17	NC_017912	TA	3	6	1129	1134	50 %	50 %	0 %	0 %	387896525
18	NC_017912	GTG	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387896525
19	NC_017912	TCT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896525
20	NC_017912	TCA	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896525
21	NC_017912	GAT	2	6	1325	1330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896525
22	NC_017912	AACA	2	8	1353	1360	75 %	0 %	0 %	25 %	387896525
23	NC_017912	GAA	2	6	1397	1402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896525
24	NC_017912	CAAA	2	8	1405	1412	75 %	0 %	0 %	25 %	387896525
25	NC_017912	CCG	2	6	1433	1438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896525
26	NC_017912	GATT	2	8	1488	1495	25 %	50 %	25 %	0 %	387896525
27	NC_017912	CCG	2	6	1508	1513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896525
28	NC_017912	GAAA	2	8	1542	1549	75 %	0 %	25 %	0 %	387896525
29	NC_017912	ATT	2	6	1718	1723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896525
30	NC_017912	CAG	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
31	NC_017912	TTC	2	6	1882	1887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896525
32	NC_017912	GAA	2	6	1904	1909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896525
33	NC_017912	GGC	2	6	1913	1918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896525
34	NC_017912	CTG	2	6	1964	1969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896525
35	NC_017912	TGA	2	6	1972	1977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896525
36	NC_017912	AGC	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
37	NC_017912	CAG	3	9	1988	1996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896525
38	NC_017912	GAAA	2	8	1999	2006	75 %	0 %	25 %	0 %	387896525
39	NC_017912	ATA	2	6	2023	2028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896525
40	NC_017912	TCG	2	6	2314	2319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896526
41	NC_017912	TCAT	2	8	2373	2380	25 %	50 %	0 %	25 %	387896526
42	NC_017912	AGA	3	9	2387	2395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896526
43	NC_017912	CGAT	2	8	2413	2420	25 %	25 %	25 %	25 %	387896526
44	NC_017912	TGC	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896526
45	NC_017912	TTC	2	6	2451	2456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896526
46	NC_017912	A	6	6	2469	2474	100 %	0 %	0 %	0 %	387896526
47	NC_017912	AATTT	2	10	2545	2554	40 %	60 %	0 %	0 %	387896526
48	NC_017912	ATT	2	6	2729	2734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896526
49	NC_017912	TTC	2	6	2928	2933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896526
50	NC_017912	GCT	2	6	2939	2944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896526
51	NC_017912	TCG	2	6	3001	3006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896526
52	NC_017912	CTT	2	6	3043	3048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896526
53	NC_017912	AAC	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896526
54	NC_017912	CGG	2	6	3097	3102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896526
55	NC_017912	TCA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896526
56	NC_017912	GCTG	2	8	3158	3165	0 %	25 %	50 %	25 %	387896526
57	NC_017912	TTCA	2	8	3194	3201	25 %	50 %	0 %	25 %	387896526
58	NC_017912	AT	3	6	3209	3214	50 %	50 %	0 %	0 %	387896526
59	NC_017912	ATG	2	6	3301	3306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896526
60	NC_017912	ATA	2	6	3477	3482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896527
61	NC_017912	CGG	2	6	3559	3564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896527
62	NC_017912	GAGC	2	8	3583	3590	25 %	0 %	50 %	25 %	387896527
63	NC_017912	CAA	2	6	3604	3609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896527
64	NC_017912	CGC	2	6	3623	3628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896527
65	NC_017912	GTC	2	6	3686	3691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896527
66	NC_017912	GC	3	6	3757	3762	0 %	0 %	50 %	50 %	387896528
67	NC_017912	ATC	2	6	3794	3799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896528
68	NC_017912	GAAG	2	8	3923	3930	50 %	0 %	50 %	0 %	387896528
69	NC_017912	TGA	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896528
70	NC_017912	A	6	6	3977	3982	100 %	0 %	0 %	0 %	387896528
71	NC_017912	AGC	2	6	4011	4016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896528
72	NC_017912	TCAG	2	8	4023	4030	25 %	25 %	25 %	25 %	387896528
73	NC_017912	GAG	3	9	4102	4110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387896528
74	NC_017912	A	6	6	4173	4178	100 %	0 %	0 %	0 %	387896528
75	NC_017912	AGC	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896528
76	NC_017912	GAA	2	6	4367	4372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896528
77	NC_017912	AAAAGA	2	12	4465	4476	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	387896528
78	NC_017912	ATT	2	6	4495	4500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896528
79	NC_017912	GAT	2	6	4514	4519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896528
80	NC_017912	T	6	6	4524	4529	0 %	100 %	0 %	0 %	387896528
81	NC_017912	CAG	2	6	4571	4576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896528
82	NC_017912	ACG	2	6	4580	4585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896528
83	NC_017912	GAA	2	6	4625	4630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896528
84	NC_017912	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896528
85	NC_017912	GAT	2	6	4679	4684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896528
86	NC_017912	CAC	2	6	4738	4743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387896528
87	NC_017912	AGTGA	2	10	4816	4825	40 %	20 %	40 %	0 %	387896528
88	NC_017912	GAC	2	6	4861	4866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896529
89	NC_017912	TCG	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896529
90	NC_017912	GAA	2	6	4933	4938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896529
91	NC_017912	GACA	2	8	4945	4952	50 %	0 %	25 %	25 %	387896529
92	NC_017912	GAAA	2	8	4953	4960	75 %	0 %	25 %	0 %	387896529
93	NC_017912	AGT	2	6	4962	4967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896529
94	NC_017912	CCGT	2	8	4969	4976	0 %	25 %	25 %	50 %	387896529
95	NC_017912	AT	4	8	5015	5022	50 %	50 %	0 %	0 %	387896529
96	NC_017912	GAA	2	6	5049	5054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896529
97	NC_017912	CAG	2	6	5151	5156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896530
98	NC_017912	ATG	2	6	5167	5172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896530
99	NC_017912	CAC	2	6	5259	5264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387896530
100	NC_017912	TCG	2	6	5278	5283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896530
101	NC_017912	ACA	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896530
102	NC_017912	CGGT	2	8	5386	5393	0 %	25 %	50 %	25 %	387896530
103	NC_017912	GCC	2	6	5410	5415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896530
104	NC_017912	TCA	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896530
105	NC_017912	CGG	2	6	5450	5455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896530
106	NC_017912	CGG	2	6	5486	5491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896530
107	NC_017912	CGTC	2	8	5509	5516	0 %	25 %	25 %	50 %	387896530
108	NC_017912	TCCGGA	2	12	5660	5671	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387896530
109	NC_017912	AAC	2	6	5684	5689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387896530
110	NC_017912	AAG	2	6	5854	5859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896530
111	NC_017912	TTGCA	2	10	5917	5926	20 %	40 %	20 %	20 %	387896530
112	NC_017912	ATA	2	6	5968	5973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387896530
113	NC_017912	AAG	2	6	6047	6052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896530
114	NC_017912	GAT	2	6	6093	6098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896530
115	NC_017912	GA	3	6	6101	6106	50 %	0 %	50 %	0 %	387896530
116	NC_017912	ATT	2	6	6120	6125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896530
117	NC_017912	TCT	2	6	6216	6221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896530
118	NC_017912	CTT	2	6	6237	6242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896530
119	NC_017912	A	6	6	6312	6317	100 %	0 %	0 %	0 %	387896530
120	NC_017912	TTC	2	6	6386	6391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896530
121	NC_017912	GCGG	2	8	6438	6445	0 %	0 %	75 %	25 %	387896530
122	NC_017912	GGGAC	2	10	6458	6467	20 %	0 %	60 %	20 %	387896530
123	NC_017912	TC	3	6	6539	6544	0 %	50 %	0 %	50 %	387896530
124	NC_017912	TCA	2	6	6634	6639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896530
125	NC_017912	TTA	2	6	6681	6686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896530
126	NC_017912	TTC	2	6	6690	6695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896530
127	NC_017912	ATC	2	6	6714	6719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896530
128	NC_017912	GCC	2	6	6746	6751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896530
129	NC_017912	GCA	2	6	6764	6769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896530
130	NC_017912	AGC	2	6	6802	6807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896530
131	NC_017912	TGA	2	6	6809	6814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896530
132	NC_017912	AC	3	6	7290	7295	50 %	0 %	0 %	50 %	387896531
133	NC_017912	TCAG	2	8	7317	7324	25 %	25 %	25 %	25 %	387896531
134	NC_017912	AATG	2	8	7432	7439	50 %	25 %	25 %	0 %	387896531
135	NC_017912	A	6	6	7469	7474	100 %	0 %	0 %	0 %	387896531
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248	NC_017912	GGC	2	6	19172	19177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896535
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263	NC_017912	TTG	2	6	19869	19874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387896535
264	NC_017912	GTC	2	6	20105	20110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896536
265	NC_017912	CGGG	2	8	20157	20164	0 %	0 %	75 %	25 %	387896536
266	NC_017912	GCG	2	6	20179	20184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896536
267	NC_017912	GCC	2	6	20228	20233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387896536
268	NC_017912	GTC	2	6	20330	20335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896536
269	NC_017912	TGA	2	6	20398	20403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896536
270	NC_017912	TATT	2	8	20418	20425	25 %	75 %	0 %	0 %	387896536
271	NC_017912	CG	3	6	20426	20431	0 %	0 %	50 %	50 %	387896536
272	NC_017912	GCT	2	6	20520	20525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387896536
273	NC_017912	GAT	2	6	20546	20551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896536
274	NC_017912	TGAT	2	8	20935	20942	25 %	50 %	25 %	0 %	387896537
275	NC_017912	AGAGA	2	10	21043	21052	60 %	0 %	40 %	0 %	387896537
276	NC_017912	AGA	2	6	21068	21073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896537
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279	NC_017912	ATT	2	6	21147	21152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896537
280	NC_017912	GAA	2	6	21174	21179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896537
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282	NC_017912	TGA	2	6	21191	21196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896537
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286	NC_017912	TGA	2	6	21491	21496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896537
287	NC_017912	TCC	2	6	21518	21523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387896537
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290	NC_017912	CGG	2	6	21625	21630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896537
291	NC_017912	GCTT	2	8	21708	21715	0 %	50 %	25 %	25 %	387896537
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295	NC_017912	CCAAG	2	10	21957	21966	40 %	0 %	20 %	40 %	387896537
296	NC_017912	TCT	2	6	21984	21989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387896537
297	NC_017912	CAG	2	6	22134	22139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387896537
298	NC_017912	ATT	2	6	22155	22160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387896537
299	NC_017912	TCA	2	6	22198	22203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387896537
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302	NC_017912	GCG	2	6	22256	22261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896538
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304	NC_017912	CGG	2	6	22449	22454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387896538
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373	NC_017912	ATGA	2	8	27166	27173	50 %	25 %	25 %	0 %	387896543
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383	NC_017912	T	6	6	27591	27596	0 %	100 %	0 %	0 %	387896543
384	NC_017912	AAAG	2	8	27615	27622	75 %	0 %	25 %	0 %	387896543
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387	NC_017912	T	6	6	28044	28049	0 %	100 %	0 %	0 %	387896544
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389	NC_017912	ATG	2	6	28102	28107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387896544
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391	NC_017912	AGA	2	6	28337	28342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387896545
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