MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07 chromosome

Total Repeats: 38090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_017867	CGTAGT	2	12	1933748	1933759	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387823176
38003	NC_017867	TCG	2	6	1933771	1933776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823176
38004	NC_017867	TCG	2	6	1933795	1933800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823176
38005	NC_017867	TTCGG	2	10	1933811	1933820	0 %	40 %	40 %	20 %	387823176
38006	NC_017867	GATG	2	8	1933857	1933864	25 %	25 %	50 %	0 %	387823176
38007	NC_017867	ACC	2	6	1933870	1933875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823176
38008	NC_017867	CG	3	6	1933923	1933928	0 %	0 %	50 %	50 %	387823176
38009	NC_017867	CGT	2	6	1933940	1933945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823176
38010	NC_017867	GCC	2	6	1934053	1934058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387823176
38011	NC_017867	CGT	2	6	1934067	1934072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823176
38012	NC_017867	CGC	2	6	1934087	1934092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387823176
38013	NC_017867	GCT	2	6	1934132	1934137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823176
38014	NC_017867	ATGC	2	8	1934156	1934163	25 %	25 %	25 %	25 %	387823176
38015	NC_017867	GCT	2	6	1934262	1934267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823176
38016	NC_017867	GT	3	6	1934274	1934279	0 %	50 %	50 %	0 %	387823176
38017	NC_017867	CGA	2	6	1934927	1934932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823177
38018	NC_017867	CG	3	6	1934983	1934988	0 %	0 %	50 %	50 %	387823177
38019	NC_017867	GC	3	6	1935018	1935023	0 %	0 %	50 %	50 %	387823177
38020	NC_017867	CGG	2	6	1935041	1935046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823177
38021	NC_017867	GCG	2	6	1935077	1935082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823177
38022	NC_017867	CAC	2	6	1935141	1935146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823177
38023	NC_017867	GCG	2	6	1935241	1935246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823177
38024	NC_017867	CCT	2	6	1935251	1935256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387823177
38025	NC_017867	GC	4	8	1935261	1935268	0 %	0 %	50 %	50 %	387823177
38026	NC_017867	CA	3	6	1935303	1935308	50 %	0 %	0 %	50 %	387823177
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38028	NC_017867	GGC	2	6	1935375	1935380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823177
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38031	NC_017867	GGC	2	6	1935474	1935479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823177
38032	NC_017867	CG	3	6	1935536	1935541	0 %	0 %	50 %	50 %	387823177
38033	NC_017867	TCG	2	6	1935637	1935642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823177
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38035	NC_017867	GTC	2	6	1936118	1936123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823178
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38037	NC_017867	CACG	2	8	1936237	1936244	25 %	0 %	25 %	50 %	387823178
38038	NC_017867	GAT	2	6	1936253	1936258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387823178
38039	NC_017867	CGCTTG	2	12	1936356	1936367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823178
38040	NC_017867	CTG	2	6	1936415	1936420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823178
38041	NC_017867	GCT	2	6	1936438	1936443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823178
38042	NC_017867	ACC	2	6	1936455	1936460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387823178
38043	NC_017867	GTC	3	9	1936496	1936504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387823178
38044	NC_017867	GGC	2	6	1936525	1936530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823178
38045	NC_017867	AGC	2	6	1936578	1936583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823178
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38050	NC_017867	CTC	4	12	1936873	1936884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387823179
38051	NC_017867	CGGC	2	8	1936891	1936898	0 %	0 %	50 %	50 %	387823179
38052	NC_017867	CTTC	2	8	1936899	1936906	0 %	50 %	0 %	50 %	387823179
38053	NC_017867	CTT	2	6	1936912	1936917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387823179
38054	NC_017867	CGG	2	6	1936953	1936958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823179
38055	NC_017867	GCA	2	6	1937004	1937009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387823179
38056	NC_017867	TGT	2	6	1937019	1937024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387823179
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38089	NC_017867	GC	3	6	1938521	1938526	0 %	0 %	50 %	50 %	387823182
38090	NC_017867	CGG	3	9	1938574	1938582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387823182

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.