MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07 chromosome

Total Repeats: 38090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_017867	GTC	3	9	1237363	1237371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822648
24503	NC_017867	CTC	2	6	1237384	1237389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387822648
24504	NC_017867	TTGACC	2	12	1237403	1237414	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387822648
24505	NC_017867	CGC	2	6	1237443	1237448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387822648
24506	NC_017867	GGT	2	6	1237468	1237473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387822648
24507	NC_017867	CTC	2	6	1237474	1237479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387822648
24508	NC_017867	TCG	2	6	1237505	1237510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822648
24509	NC_017867	CCT	2	6	1237554	1237559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387822648
24510	NC_017867	GTT	2	6	1237681	1237686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387822648
24511	NC_017867	GAC	2	6	1237761	1237766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822648
24512	NC_017867	GTC	2	6	1237798	1237803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822648
24513	NC_017867	GCG	2	6	1237805	1237810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387822648
24514	NC_017867	CGGA	2	8	1237852	1237859	25 %	0 %	50 %	25 %	387822648
24515	NC_017867	CATA	2	8	1237884	1237891	50 %	25 %	0 %	25 %	387822648
24516	NC_017867	CGA	2	6	1237950	1237955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822648
24517	NC_017867	TTG	2	6	1238230	1238235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387822649
24518	NC_017867	ACG	2	6	1238257	1238262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822649
24519	NC_017867	GTCC	2	8	1238272	1238279	0 %	25 %	25 %	50 %	387822649
24520	NC_017867	AGC	2	6	1238309	1238314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822649
24521	NC_017867	CAC	2	6	1238434	1238439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387822649
24522	NC_017867	TCG	2	6	1238483	1238488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822649
24523	NC_017867	CCT	2	6	1238505	1238510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387822649
24524	NC_017867	ATGC	2	8	1238596	1238603	25 %	25 %	25 %	25 %	387822649
24525	NC_017867	CGTT	2	8	1238609	1238616	0 %	50 %	25 %	25 %	387822649
24526	NC_017867	GAGC	2	8	1238617	1238624	25 %	0 %	50 %	25 %	387822649
24527	NC_017867	ACTG	2	8	1238637	1238644	25 %	25 %	25 %	25 %	387822649
24528	NC_017867	GAT	2	6	1238674	1238679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387822649
24529	NC_017867	GCA	2	6	1238787	1238792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822649
24530	NC_017867	CTC	2	6	1238872	1238877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387822649
24531	NC_017867	GGC	2	6	1239094	1239099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387822649
24532	NC_017867	GATCG	2	10	1239244	1239253	20 %	20 %	40 %	20 %	387822649
24533	NC_017867	AGC	2	6	1239254	1239259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822649
24534	NC_017867	AGCC	2	8	1239390	1239397	25 %	0 %	25 %	50 %	387822649
24535	NC_017867	CTTC	2	8	1239423	1239430	0 %	50 %	0 %	50 %	387822649
24536	NC_017867	CCT	2	6	1239480	1239485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387822649
24537	NC_017867	CTG	2	6	1239605	1239610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822650
24538	NC_017867	TCC	2	6	1239651	1239656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387822650
24539	NC_017867	TGG	2	6	1239702	1239707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387822650
24540	NC_017867	GCA	2	6	1239712	1239717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822650
24541	NC_017867	TCC	2	6	1239780	1239785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387822650
24542	NC_017867	TCT	2	6	1239826	1239831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387822650
24543	NC_017867	CCT	2	6	1239836	1239841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387822650
24544	NC_017867	TGG	2	6	1239865	1239870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387822650
24545	NC_017867	GTC	2	6	1239947	1239952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822650
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24548	NC_017867	CGC	2	6	1240072	1240077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387822650
24549	NC_017867	GCC	2	6	1240091	1240096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387822650
24550	NC_017867	ACC	2	6	1240137	1240142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387822650
24551	NC_017867	CGA	2	6	1240403	1240408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822650
24552	NC_017867	CGT	2	6	1240424	1240429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822650
24553	NC_017867	GCT	2	6	1240612	1240617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822651
24554	NC_017867	GCA	2	6	1240723	1240728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822651
24555	NC_017867	CGA	2	6	1240780	1240785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822651
24556	NC_017867	CGT	2	6	1240864	1240869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822651
24557	NC_017867	CAC	2	6	1241050	1241055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387822651
24558	NC_017867	TCG	3	9	1241127	1241135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822651
24559	NC_017867	ACC	2	6	1241175	1241180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387822651
24560	NC_017867	TCG	2	6	1241184	1241189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822651
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24563	NC_017867	CATG	2	8	1241386	1241393	25 %	25 %	25 %	25 %	387822651
24564	NC_017867	AATG	2	8	1241395	1241402	50 %	25 %	25 %	0 %	387822651
24565	NC_017867	GAT	2	6	1241513	1241518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387822651
24566	NC_017867	GCC	2	6	1241558	1241563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387822651
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24568	NC_017867	GAA	2	6	1241609	1241614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387822651
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24570	NC_017867	GCA	2	6	1241648	1241653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822651
24571	NC_017867	GTTCG	2	10	1241792	1241801	0 %	40 %	40 %	20 %	387822651
24572	NC_017867	GGTCCC	2	12	1241802	1241813	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387822651
24573	NC_017867	GAGCGT	2	12	1241822	1241833	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387822651
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24581	NC_017867	GC	3	6	1242170	1242175	0 %	0 %	50 %	50 %	387822651
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24584	NC_017867	TCG	2	6	1242234	1242239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822651
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24587	NC_017867	ACG	2	6	1242362	1242367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822651
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24589	NC_017867	GCGGCC	2	12	1242383	1242394	0 %	0 %	50 %	50 %	387822651
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24599	NC_017867	AGCC	2	8	1242655	1242662	25 %	0 %	25 %	50 %	387822651
24600	NC_017867	CCG	2	6	1242679	1242684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387822651
24601	NC_017867	CAT	2	6	1242700	1242705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387822651
24602	NC_017867	GCT	2	6	1242712	1242717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822651
24603	NC_017867	GTC	2	6	1242740	1242745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822651
24604	NC_017867	GTCG	2	8	1242773	1242780	0 %	25 %	50 %	25 %	387822651
24605	NC_017867	TCA	2	6	1242798	1242803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387822651
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24607	NC_017867	TGAA	2	8	1242828	1242835	50 %	25 %	25 %	0 %	387822651
24608	NC_017867	GAAC	2	8	1242871	1242878	50 %	0 %	25 %	25 %	387822651
24609	NC_017867	ACT	2	6	1243168	1243173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387822652
24610	NC_017867	ATT	2	6	1243190	1243195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387822652
24611	NC_017867	TCC	2	6	1243212	1243217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387822652
24612	NC_017867	TTG	2	6	1243224	1243229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387822652
24613	NC_017867	CTT	2	6	1243232	1243237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387822652
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24615	NC_017867	TGTCA	2	10	1243364	1243373	20 %	40 %	20 %	20 %	387822652
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24960	NC_017867	GCT	2	6	1258918	1258923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822664
24961	NC_017867	GGCA	2	8	1258966	1258973	25 %	0 %	50 %	25 %	387822664
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24988	NC_017867	GGT	2	6	1260324	1260329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387822665
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