MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07 chromosome

Total Repeats: 38090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_017867	GTT	2	6	1213163	1213168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387822629
24003	NC_017867	GTT	2	6	1213196	1213201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387822629
24004	NC_017867	TCGA	2	8	1213251	1213258	25 %	25 %	25 %	25 %	387822629
24005	NC_017867	CGT	2	6	1213307	1213312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822629
24006	NC_017867	TCG	2	6	1213332	1213337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822629
24007	NC_017867	CAG	2	6	1213367	1213372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822629
24008	NC_017867	TGC	2	6	1213413	1213418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822629
24009	NC_017867	ACG	2	6	1213440	1213445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822629
24010	NC_017867	TCG	2	6	1213480	1213485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822629
24011	NC_017867	CGG	3	9	1213492	1213500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387822629
24012	NC_017867	GGC	2	6	1213556	1213561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387822629
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24014	NC_017867	GGC	2	6	1213604	1213609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387822629
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24016	NC_017867	TGG	2	6	1213894	1213899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387822629
24017	NC_017867	GTGC	2	8	1213902	1213909	0 %	25 %	50 %	25 %	387822629
24018	NC_017867	GCC	2	6	1214000	1214005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387822629
24019	NC_017867	GA	3	6	1214006	1214011	50 %	0 %	50 %	0 %	387822629
24020	NC_017867	CCCACG	2	12	1214055	1214066	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387822629
24021	NC_017867	CCT	2	6	1214101	1214106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387822629
24022	NC_017867	TGG	2	6	1214134	1214139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387822629
24023	NC_017867	GCA	2	6	1214152	1214157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822629
24024	NC_017867	CGG	2	6	1214169	1214174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387822629
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24027	NC_017867	GTCAC	2	10	1214265	1214274	20 %	20 %	20 %	40 %	387822629
24028	NC_017867	GC	3	6	1214317	1214322	0 %	0 %	50 %	50 %	387822629
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24032	NC_017867	TCG	2	6	1214536	1214541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822629
24033	NC_017867	TCG	2	6	1214559	1214564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822629
24034	NC_017867	CGA	2	6	1214579	1214584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822629
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24050	NC_017867	CGG	2	6	1215245	1215250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387822630
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24053	NC_017867	ATG	2	6	1215394	1215399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387822630
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24055	NC_017867	GCT	3	9	1215539	1215547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822630
24056	NC_017867	TTCG	2	8	1215561	1215568	0 %	50 %	25 %	25 %	387822630
24057	NC_017867	GT	3	6	1215599	1215604	0 %	50 %	50 %	0 %	387822630
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24098	NC_017867	G	6	6	1217664	1217669	0 %	0 %	100 %	0 %	387822632
24099	NC_017867	GTA	2	6	1217698	1217703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387822632
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24102	NC_017867	ACG	2	6	1217814	1217819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822632
24103	NC_017867	GGA	2	6	1217826	1217831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387822632
24104	NC_017867	CGG	2	6	1217849	1217854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387822632
24105	NC_017867	TCACC	2	10	1217856	1217865	20 %	20 %	0 %	60 %	387822632
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24107	NC_017867	ATC	2	6	1217924	1217929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387822632
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24109	NC_017867	GTC	2	6	1217959	1217964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822632
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24113	NC_017867	GCCA	2	8	1218310	1218317	25 %	0 %	25 %	50 %	387822632
24114	NC_017867	TGA	2	6	1218321	1218326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387822632
24115	NC_017867	GAT	2	6	1218358	1218363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387822632
24116	NC_017867	CTA	2	6	1218411	1218416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387822632
24117	NC_017867	AAC	2	6	1218444	1218449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387822632
24118	NC_017867	CAT	2	6	1218453	1218458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387822632
24119	NC_017867	CGTGC	2	10	1218475	1218484	0 %	20 %	40 %	40 %	387822632
24120	NC_017867	GAG	2	6	1218488	1218493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387822632
24121	NC_017867	TCA	2	6	1218516	1218521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387822632
24122	NC_017867	GC	3	6	1218808	1218813	0 %	0 %	50 %	50 %	387822633
24123	NC_017867	TCG	2	6	1218838	1218843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822633
24124	NC_017867	ATG	2	6	1218844	1218849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387822633
24125	NC_017867	TCG	2	6	1218850	1218855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822633
24126	NC_017867	TCC	2	6	1218907	1218912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387822633
24127	NC_017867	CGT	2	6	1218939	1218944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822633
24128	NC_017867	CAG	2	6	1218990	1218995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822633
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24130	NC_017867	TCGA	2	8	1219123	1219130	25 %	25 %	25 %	25 %	387822633
24131	NC_017867	TCGAC	2	10	1219142	1219151	20 %	20 %	20 %	40 %	387822633
24132	NC_017867	GCA	3	9	1219238	1219246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822633
24133	NC_017867	GCA	2	6	1219286	1219291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822633
24134	NC_017867	CG	3	6	1219296	1219301	0 %	0 %	50 %	50 %	387822633
24135	NC_017867	CCTC	2	8	1219420	1219427	0 %	25 %	0 %	75 %	387822633
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24137	NC_017867	TGGCG	2	10	1219527	1219536	0 %	20 %	60 %	20 %	387822633
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24139	NC_017867	CCT	2	6	1219667	1219672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387822633
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24141	NC_017867	GGT	3	9	1219704	1219712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387822633
24142	NC_017867	GCA	2	6	1219739	1219744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822633
24143	NC_017867	GGC	2	6	1219773	1219778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387822633
24144	NC_017867	GCA	2	6	1219831	1219836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822633
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24148	NC_017867	AT	3	6	1220388	1220393	50 %	50 %	0 %	0 %	387822634
24149	NC_017867	AT	3	6	1220449	1220454	50 %	50 %	0 %	0 %	387822634
24150	NC_017867	GCTC	2	8	1220499	1220506	0 %	25 %	25 %	50 %	387822634
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24184	NC_017867	CTG	2	6	1222535	1222540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822636
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24217	NC_017867	GCACG	2	10	1223811	1223820	20 %	0 %	40 %	40 %	387822637
24218	NC_017867	GC	3	6	1223834	1223839	0 %	0 %	50 %	50 %	387822637
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24224	NC_017867	TCG	2	6	1224177	1224182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822637
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24227	NC_017867	CGG	2	6	1224289	1224294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387822637
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24345	NC_017867	GAT	2	6	1230239	1230244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387822642
24346	NC_017867	CGG	2	6	1230308	1230313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387822642
24347	NC_017867	GCC	2	6	1230323	1230328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387822642
24348	NC_017867	CG	3	6	1230356	1230361	0 %	0 %	50 %	50 %	387822642
24349	NC_017867	GGT	2	6	1230380	1230385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387822642
24350	NC_017867	CGA	2	6	1230409	1230414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822642
24351	NC_017867	GAA	2	6	1230419	1230424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387822642
24352	NC_017867	CAG	2	6	1230431	1230436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822642
24353	NC_017867	ATG	2	6	1230576	1230581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387822642
24354	NC_017867	GCC	2	6	1230603	1230608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387822642
24355	NC_017867	CTGC	2	8	1230804	1230811	0 %	25 %	25 %	50 %	387822643
24356	NC_017867	CCT	2	6	1230869	1230874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387822643
24357	NC_017867	TCG	2	6	1230892	1230897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822643
24358	NC_017867	TCA	2	6	1230937	1230942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387822643
24359	NC_017867	CGT	2	6	1231013	1231018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822643
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24362	NC_017867	GGC	2	6	1231104	1231109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387822643
24363	NC_017867	CATG	2	8	1231110	1231117	25 %	25 %	25 %	25 %	387822643
24364	NC_017867	CCA	2	6	1231118	1231123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387822643
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24366	NC_017867	TGC	2	6	1231142	1231147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822643
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24373	NC_017867	ACCG	2	8	1231511	1231518	25 %	0 %	25 %	50 %	387822643
24374	NC_017867	CAG	2	6	1231533	1231538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387822643
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24404	NC_017867	TCG	2	6	1233120	1233125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387822644
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24445	NC_017867	GAGCAT	2	12	1234995	1235006	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387822646
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