MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 222

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017822	CAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859016
2	NC_017822	AAT	2	6	217	222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859016
3	NC_017822	TATC	2	8	255	262	25 %	50 %	0 %	25 %	386859016
4	NC_017822	TTA	2	6	263	268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859016
5	NC_017822	TAG	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859016
6	NC_017822	ATC	2	6	391	396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859016
7	NC_017822	TC	3	6	402	407	0 %	50 %	0 %	50 %	386859016
8	NC_017822	AAT	2	6	566	571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859017
9	NC_017822	CAT	3	9	614	622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859017
10	NC_017822	AATA	2	8	647	654	75 %	25 %	0 %	0 %	386859017
11	NC_017822	ACT	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859017
12	NC_017822	TAA	2	6	684	689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859017
13	NC_017822	TAA	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859017
14	NC_017822	TTG	2	6	758	763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859017
15	NC_017822	ATAA	2	8	831	838	75 %	25 %	0 %	0 %	386859017
16	NC_017822	CAG	2	6	839	844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859017
17	NC_017822	CAC	2	6	884	889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859017
18	NC_017822	ATG	2	6	926	931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859017
19	NC_017822	ATT	2	6	1038	1043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859017
20	NC_017822	AATA	2	8	1090	1097	75 %	25 %	0 %	0 %	386859017
21	NC_017822	T	8	8	1145	1152	0 %	100 %	0 %	0 %	386859018
22	NC_017822	ATT	2	6	1154	1159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859018
23	NC_017822	GTT	2	6	1186	1191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859018
24	NC_017822	CAA	2	6	1228	1233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859018
25	NC_017822	CTA	2	6	1234	1239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859018
26	NC_017822	AT	4	8	1322	1329	50 %	50 %	0 %	0 %	386859018
27	NC_017822	TTTAA	2	10	1385	1394	40 %	60 %	0 %	0 %	386859019
28	NC_017822	T	7	7	1419	1425	0 %	100 %	0 %	0 %	386859019
29	NC_017822	TCA	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859019
30	NC_017822	TTA	3	9	1466	1474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859019
31	NC_017822	TAC	2	6	1645	1650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859020
32	NC_017822	ATT	2	6	1688	1693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859020
33	NC_017822	TTC	2	6	1700	1705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859020
34	NC_017822	ATT	2	6	1736	1741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859020
35	NC_017822	TACA	2	8	1774	1781	50 %	25 %	0 %	25 %	386859020
36	NC_017822	AGT	2	6	2420	2425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859021
37	NC_017822	ATA	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859021
38	NC_017822	AAC	2	6	2484	2489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859021
39	NC_017822	A	6	6	2502	2507	100 %	0 %	0 %	0 %	386859021
40	NC_017822	GAA	2	6	2513	2518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859021
41	NC_017822	GA	3	6	2524	2529	50 %	0 %	50 %	0 %	386859021
42	NC_017822	A	6	6	2549	2554	100 %	0 %	0 %	0 %	386859021
43	NC_017822	T	6	6	2563	2568	0 %	100 %	0 %	0 %	386859021
44	NC_017822	AAG	2	6	2571	2576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859021
45	NC_017822	TAAAA	2	10	2626	2635	80 %	20 %	0 %	0 %	386859021
46	NC_017822	A	8	8	2696	2703	100 %	0 %	0 %	0 %	386859021
47	NC_017822	AGT	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859021
48	NC_017822	CAAT	2	8	2788	2795	50 %	25 %	0 %	25 %	386859021
49	NC_017822	T	6	6	3458	3463	0 %	100 %	0 %	0 %	386859022
50	NC_017822	GCT	2	6	3515	3520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859022
51	NC_017822	CCTT	2	8	3548	3555	0 %	50 %	0 %	50 %	386859022
52	NC_017822	CTT	2	6	3620	3625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859023
53	NC_017822	T	6	6	3633	3638	0 %	100 %	0 %	0 %	386859023
54	NC_017822	ATC	2	6	3639	3644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859023
55	NC_017822	AGC	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859023
56	NC_017822	TGC	2	6	3669	3674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859023
57	NC_017822	CAA	2	6	3701	3706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859023
58	NC_017822	AT	3	6	3734	3739	50 %	50 %	0 %	0 %	386859023
59	NC_017822	TTG	2	6	3763	3768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859024
60	NC_017822	GCT	2	6	3777	3782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859024
61	NC_017822	T	6	6	3885	3890	0 %	100 %	0 %	0 %	386859024
62	NC_017822	ACT	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859024
63	NC_017822	TGC	2	6	3957	3962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859024
64	NC_017822	CAG	2	6	3971	3976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859025
65	NC_017822	CAC	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859025
66	NC_017822	CTT	2	6	4022	4027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859025
67	NC_017822	AGT	2	6	4038	4043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859025
68	NC_017822	ACC	2	6	4053	4058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859025
69	NC_017822	TGC	2	6	4089	4094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859025
70	NC_017822	CACT	2	8	4157	4164	25 %	25 %	0 %	50 %	386859025
71	NC_017822	T	7	7	4244	4250	0 %	100 %	0 %	0 %	386859026
72	NC_017822	TCA	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859026
73	NC_017822	CTA	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859026
74	NC_017822	CAG	2	6	4385	4390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859026
75	NC_017822	GCT	2	6	4438	4443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859026
76	NC_017822	CTA	2	6	4457	4462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859026
77	NC_017822	TAA	2	6	4481	4486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859026
78	NC_017822	CTT	2	6	4499	4504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859026
79	NC_017822	TAG	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859026
80	NC_017822	ACT	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859027
81	NC_017822	CAT	2	6	4748	4753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859027
82	NC_017822	TTC	2	6	4953	4958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859028
83	NC_017822	T	6	6	4965	4970	0 %	100 %	0 %	0 %	386859028
84	NC_017822	TCT	2	6	5014	5019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859028
85	NC_017822	TAT	2	6	5046	5051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859028
86	NC_017822	CCG	2	6	5054	5059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386859028
87	NC_017822	TAT	2	6	5072	5077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859028
88	NC_017822	ACC	2	6	5082	5087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859028
89	NC_017822	ATT	2	6	5088	5093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859028
90	NC_017822	TGC	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859028
91	NC_017822	T	6	6	5369	5374	0 %	100 %	0 %	0 %	386859029
92	NC_017822	CAT	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859029
93	NC_017822	TAT	2	6	5389	5394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859029
94	NC_017822	CTTT	2	8	5417	5424	0 %	75 %	0 %	25 %	386859029
95	NC_017822	TA	3	6	5478	5483	50 %	50 %	0 %	0 %	386859029
96	NC_017822	CTTT	2	8	5484	5491	0 %	75 %	0 %	25 %	386859029
97	NC_017822	T	8	8	5515	5522	0 %	100 %	0 %	0 %	386859029
98	NC_017822	A	9	9	7457	7465	100 %	0 %	0 %	0 %	386859030
99	NC_017822	AAT	2	6	7470	7475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859030
100	NC_017822	GGT	2	6	7495	7500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386859030
101	NC_017822	ATT	2	6	7522	7527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859030
102	NC_017822	A	7	7	7554	7560	100 %	0 %	0 %	0 %	386859030
103	NC_017822	TTG	2	6	7568	7573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859030
104	NC_017822	A	6	6	7620	7625	100 %	0 %	0 %	0 %	386859030
105	NC_017822	AAT	2	6	7636	7641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859030
106	NC_017822	AT	4	8	7640	7647	50 %	50 %	0 %	0 %	386859030
107	NC_017822	ATA	2	6	7706	7711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859030
108	NC_017822	CTTT	2	8	7777	7784	0 %	75 %	0 %	25 %	386859030
109	NC_017822	TTG	2	6	7898	7903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859030
110	NC_017822	TGA	2	6	7949	7954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859030
111	NC_017822	AT	3	6	7956	7961	50 %	50 %	0 %	0 %	386859030
112	NC_017822	TA	3	6	7978	7983	50 %	50 %	0 %	0 %	386859030
113	NC_017822	AT	3	6	7997	8002	50 %	50 %	0 %	0 %	386859030
114	NC_017822	TAG	2	6	8006	8011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859030
115	NC_017822	TTAA	2	8	8083	8090	50 %	50 %	0 %	0 %	386859030
116	NC_017822	TAA	2	6	8109	8114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859030
117	NC_017822	AAT	2	6	8131	8136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859030
118	NC_017822	TTA	2	6	8163	8168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859030
119	NC_017822	AAAATT	2	12	8203	8214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859030
120	NC_017822	A	6	6	8288	8293	100 %	0 %	0 %	0 %	386859031
121	NC_017822	AAG	3	9	8341	8349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859031
122	NC_017822	A	8	8	8375	8382	100 %	0 %	0 %	0 %	386859031
123	NC_017822	AAAAT	2	10	8401	8410	80 %	20 %	0 %	0 %	386859031
124	NC_017822	AAT	2	6	8414	8419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859031
125	NC_017822	TTATC	2	10	8453	8462	20 %	60 %	0 %	20 %	386859031
126	NC_017822	A	7	7	8508	8514	100 %	0 %	0 %	0 %	386859031
127	NC_017822	CATATT	2	12	8521	8532	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386859031
128	NC_017822	AT	3	6	8538	8543	50 %	50 %	0 %	0 %	386859031
129	NC_017822	CAAA	2	8	8582	8589	75 %	0 %	0 %	25 %	386859031
130	NC_017822	TAA	2	6	8659	8664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859031
131	NC_017822	GAA	2	6	8745	8750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859031
132	NC_017822	T	6	6	8752	8757	0 %	100 %	0 %	0 %	386859031
133	NC_017822	TGAT	2	8	8813	8820	25 %	50 %	25 %	0 %	386859031
134	NC_017822	AGA	2	6	10845	10850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859032
135	NC_017822	TGA	2	6	10893	10898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859032
136	NC_017822	AG	3	6	10926	10931	50 %	0 %	50 %	0 %	386859032
137	NC_017822	ATA	2	6	10940	10945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859032
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222	NC_017822	GAT	2	6	15195	15200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859036

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.