MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017821	TC	3	6	470	475	0 %	50 %	0 %	50 %	386858649
2	NC_017821	TCA	2	6	492	497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858649
3	NC_017821	T	8	8	514	521	0 %	100 %	0 %	0 %	386858649
4	NC_017821	AAT	2	6	527	532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858649
5	NC_017821	T	8	8	563	570	0 %	100 %	0 %	0 %	386858649
6	NC_017821	T	6	6	637	642	0 %	100 %	0 %	0 %	386858649
7	NC_017821	TAA	2	6	666	671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858649
8	NC_017821	AGA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858649
9	NC_017821	TA	3	6	703	708	50 %	50 %	0 %	0 %	386858649
10	NC_017821	CTC	2	6	709	714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858649
11	NC_017821	TA	3	6	751	756	50 %	50 %	0 %	0 %	386858649
12	NC_017821	CTT	2	6	819	824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386858649
13	NC_017821	TA	3	6	826	831	50 %	50 %	0 %	0 %	386858649
14	NC_017821	ATC	2	6	905	910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858649
15	NC_017821	ACC	2	6	965	970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386858649
16	NC_017821	TAT	2	6	1002	1007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858649
17	NC_017821	AGAT	2	8	1036	1043	50 %	25 %	25 %	0 %	386858649
18	NC_017821	ATA	2	6	1079	1084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858649
19	NC_017821	TA	3	6	1118	1123	50 %	50 %	0 %	0 %	386858650
20	NC_017821	A	7	7	1148	1154	100 %	0 %	0 %	0 %	386858650
21	NC_017821	AT	3	6	1179	1184	50 %	50 %	0 %	0 %	386858650
22	NC_017821	T	7	7	1189	1195	0 %	100 %	0 %	0 %	386858650
23	NC_017821	A	6	6	1259	1264	100 %	0 %	0 %	0 %	386858650
24	NC_017821	TAA	2	6	1288	1293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858650
25	NC_017821	A	7	7	1334	1340	100 %	0 %	0 %	0 %	386858650
26	NC_017821	ACA	2	6	1377	1382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858650
27	NC_017821	TAT	2	6	1426	1431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858650
28	NC_017821	TA	3	6	1495	1500	50 %	50 %	0 %	0 %	386858650
29	NC_017821	ATC	2	6	1507	1512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858650
30	NC_017821	T	7	7	1531	1537	0 %	100 %	0 %	0 %	386858650
31	NC_017821	TTA	2	6	1565	1570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858650
32	NC_017821	TAT	2	6	1624	1629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858650
33	NC_017821	TTA	2	6	1661	1666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858650
34	NC_017821	AT	4	8	1693	1700	50 %	50 %	0 %	0 %	386858650
35	NC_017821	AT	3	6	1716	1721	50 %	50 %	0 %	0 %	386858650
36	NC_017821	ATA	2	6	1744	1749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858650
37	NC_017821	T	6	6	1798	1803	0 %	100 %	0 %	0 %	386858650
38	NC_017821	ATA	2	6	1823	1828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858650
39	NC_017821	CCT	2	6	1850	1855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386858650
40	NC_017821	T	7	7	1885	1891	0 %	100 %	0 %	0 %	386858650
41	NC_017821	T	6	6	1926	1931	0 %	100 %	0 %	0 %	386858651
42	NC_017821	TATC	2	8	2000	2007	25 %	50 %	0 %	25 %	386858651
43	NC_017821	CTAA	2	8	2017	2024	50 %	25 %	0 %	25 %	386858651
44	NC_017821	T	6	6	2061	2066	0 %	100 %	0 %	0 %	386858651
45	NC_017821	TA	3	6	2079	2084	50 %	50 %	0 %	0 %	386858651
46	NC_017821	AAAT	2	8	2208	2215	75 %	25 %	0 %	0 %	386858651
47	NC_017821	T	6	6	2228	2233	0 %	100 %	0 %	0 %	386858651
48	NC_017821	TTGA	2	8	2235	2242	25 %	50 %	25 %	0 %	386858651
49	NC_017821	A	6	6	2262	2267	100 %	0 %	0 %	0 %	386858651
50	NC_017821	TTA	2	6	2284	2289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858651
51	NC_017821	AT	3	6	2297	2302	50 %	50 %	0 %	0 %	386858651
52	NC_017821	T	9	9	2382	2390	0 %	100 %	0 %	0 %	386858651
53	NC_017821	T	8	8	2400	2407	0 %	100 %	0 %	0 %	386858651

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.