MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017815	T	6	6	488	493	0 %	100 %	0 %	0 %	386860092
2	NC_017815	ACG	2	6	546	551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386860092
3	NC_017815	T	8	8	563	570	0 %	100 %	0 %	0 %	386860092
4	NC_017815	T	6	6	638	643	0 %	100 %	0 %	0 %	386860092
5	NC_017815	ATT	2	6	655	660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860092
6	NC_017815	A	7	7	668	674	100 %	0 %	0 %	0 %	386860092
7	NC_017815	A	7	7	704	710	100 %	0 %	0 %	0 %	386860092
8	NC_017815	TAT	2	6	879	884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860092
9	NC_017815	AT	3	6	883	888	50 %	50 %	0 %	0 %	386860092
10	NC_017815	T	6	6	968	973	0 %	100 %	0 %	0 %	386860092
11	NC_017815	TTTC	2	8	975	982	0 %	75 %	0 %	25 %	386860092
12	NC_017815	TTTATT	2	12	1001	1012	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386860092
13	NC_017815	TAAT	2	8	1023	1030	50 %	50 %	0 %	0 %	386860092
14	NC_017815	TA	3	6	1172	1177	50 %	50 %	0 %	0 %	386860093
15	NC_017815	TCT	2	6	1227	1232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860093
16	NC_017815	TGT	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386860093
17	NC_017815	TAA	2	6	1280	1285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
18	NC_017815	ATTTA	2	10	1346	1355	40 %	60 %	0 %	0 %	386860093
19	NC_017815	A	6	6	1361	1366	100 %	0 %	0 %	0 %	386860093
20	NC_017815	AAT	2	6	1371	1376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
21	NC_017815	CT	3	6	1383	1388	0 %	50 %	0 %	50 %	386860093
22	NC_017815	CTG	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386860093
23	NC_017815	TAA	2	6	1432	1437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
24	NC_017815	T	6	6	1524	1529	0 %	100 %	0 %	0 %	386860093
25	NC_017815	TTC	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860093
26	NC_017815	AATG	2	8	1566	1573	50 %	25 %	25 %	0 %	386860093
27	NC_017815	TAA	2	6	1592	1597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
28	NC_017815	CAT	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860093
29	NC_017815	TTA	2	6	1633	1638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860093
30	NC_017815	AT	4	8	1661	1668	50 %	50 %	0 %	0 %	386860093
31	NC_017815	T	7	7	1668	1674	0 %	100 %	0 %	0 %	386860093
32	NC_017815	CAAAT	2	10	1679	1688	60 %	20 %	0 %	20 %	386860093
33	NC_017815	TCT	2	6	1692	1697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860093
34	NC_017815	T	7	7	1702	1708	0 %	100 %	0 %	0 %	386860093
35	NC_017815	ATA	2	6	1774	1779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860093
36	NC_017815	TAT	2	6	1790	1795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860093
37	NC_017815	TTA	2	6	1840	1845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386860093
38	NC_017815	T	6	6	1853	1858	0 %	100 %	0 %	0 %	386860093
39	NC_017815	TTTC	2	8	1894	1901	0 %	75 %	0 %	25 %	386860094
40	NC_017815	T	6	6	1981	1986	0 %	100 %	0 %	0 %	386860094
41	NC_017815	TAC	2	6	2022	2027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386860094
42	NC_017815	T	6	6	2029	2034	0 %	100 %	0 %	0 %	386860094
43	NC_017815	TTC	2	6	2092	2097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860094
44	NC_017815	ATA	2	6	2137	2142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386860094
45	NC_017815	CTT	2	6	2163	2168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860094
46	NC_017815	A	6	6	2175	2180	100 %	0 %	0 %	0 %	386860094
47	NC_017815	TTC	2	6	2200	2205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386860094

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.