MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017813	TATT	2	8	603	610	25 %	75 %	0 %	0 %	386858962
2	NC_017813	TTA	2	6	649	654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858962
3	NC_017813	TAAA	2	8	657	664	75 %	25 %	0 %	0 %	386858962
4	NC_017813	TAA	2	6	708	713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858962
5	NC_017813	TTCT	2	8	714	721	0 %	75 %	0 %	25 %	386858962
6	NC_017813	TGA	2	6	3143	3148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858963
7	NC_017813	ATG	2	6	3181	3186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858963
8	NC_017813	AAAG	2	8	3255	3262	75 %	0 %	25 %	0 %	386858963
9	NC_017813	AAT	2	6	3264	3269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858963
10	NC_017813	AGA	2	6	3272	3277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858963
11	NC_017813	GAA	2	6	3300	3305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858963
12	NC_017813	CAA	2	6	5140	5145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858964
13	NC_017813	AAAAG	2	10	5195	5204	80 %	0 %	20 %	0 %	386858964
14	NC_017813	TGA	2	6	5207	5212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858964
15	NC_017813	ACA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386858964
16	NC_017813	AAG	2	6	5251	5256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858964
17	NC_017813	T	6	6	5342	5347	0 %	100 %	0 %	0 %	386858964
18	NC_017813	AAG	2	6	5361	5366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858964
19	NC_017813	TTG	2	6	5368	5373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386858964
20	NC_017813	AATGCT	2	12	5400	5411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858964
21	NC_017813	GAA	2	6	5421	5426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858964
22	NC_017813	TGG	2	6	5456	5461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858964
23	NC_017813	GTG	2	6	5473	5478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858964
24	NC_017813	AGC	3	9	5486	5494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858964
25	NC_017813	GTG	2	6	5521	5526	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858964
26	NC_017813	TGC	3	9	5609	5617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858964
27	NC_017813	AAGA	2	8	5619	5626	75 %	0 %	25 %	0 %	386858964
28	NC_017813	ATA	2	6	5629	5634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858964
29	NC_017813	AGG	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858964
30	NC_017813	TGA	2	6	5726	5731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858964
31	NC_017813	ATAA	2	8	5841	5848	75 %	25 %	0 %	0 %	386858964
32	NC_017813	GA	3	6	5857	5862	50 %	0 %	50 %	0 %	386858964
33	NC_017813	GGA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
34	NC_017813	AGA	2	6	6669	6674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
35	NC_017813	AGGTA	2	10	6699	6708	40 %	20 %	40 %	0 %	386858965
36	NC_017813	ATAA	2	8	6727	6734	75 %	25 %	0 %	0 %	386858965
37	NC_017813	GAA	2	6	6739	6744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
38	NC_017813	AGC	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858965
39	NC_017813	TGA	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858965
40	NC_017813	AGG	2	6	6789	6794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
41	NC_017813	CTA	2	6	6797	6802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858965
42	NC_017813	TGG	2	6	6807	6812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858965
43	NC_017813	CAG	2	6	6827	6832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858965
44	NC_017813	TAG	2	6	6875	6880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858965
45	NC_017813	GTG	2	6	6883	6888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858965
46	NC_017813	GA	3	6	6893	6898	50 %	0 %	50 %	0 %	386858965
47	NC_017813	ATT	2	6	6957	6962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858965
48	NC_017813	AAG	2	6	6967	6972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
49	NC_017813	CTG	2	6	7070	7075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858965
50	NC_017813	ATA	3	9	7076	7084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858965
51	NC_017813	GAA	2	6	7093	7098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858965
52	NC_017813	TGC	3	9	7119	7127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858965
53	NC_017813	AAGA	2	8	7129	7136	75 %	0 %	25 %	0 %	386858965
54	NC_017813	GAT	2	6	7138	7143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858965
55	NC_017813	AAGA	2	8	7144	7151	75 %	0 %	25 %	0 %	386858965
56	NC_017813	AAGG	2	8	7156	7163	50 %	0 %	50 %	0 %	386858965
57	NC_017813	AAAG	2	8	7167	7174	75 %	0 %	25 %	0 %	386858965
58	NC_017813	AGG	2	6	7188	7193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
59	NC_017813	AGG	2	6	7218	7223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858965
60	NC_017813	GA	3	6	7370	7375	50 %	0 %	50 %	0 %	386858965
61	NC_017813	AAG	2	6	7613	7618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858966
62	NC_017813	GAAG	2	8	7677	7684	50 %	0 %	50 %	0 %	386858966
63	NC_017813	GAA	2	6	7691	7696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858966
64	NC_017813	GAA	2	6	7710	7715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858966
65	NC_017813	TGG	2	6	7727	7732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858966
66	NC_017813	TGA	2	6	7733	7738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858966
67	NC_017813	GGA	2	6	7771	7776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858966
68	NC_017813	AAGAA	2	10	7781	7790	80 %	0 %	20 %	0 %	386858966
69	NC_017813	AGATA	2	10	7845	7854	60 %	20 %	20 %	0 %	386858967
70	NC_017813	TGG	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858967
71	NC_017813	TGC	2	6	7917	7922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858967
72	NC_017813	TGG	2	6	7932	7937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858967
73	NC_017813	GTA	2	6	7963	7968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858967
74	NC_017813	AAT	2	6	8068	8073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858967
75	NC_017813	TTGT	2	8	8092	8099	0 %	75 %	25 %	0 %	386858967
76	NC_017813	TGC	2	6	8109	8114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858967
77	NC_017813	TGA	2	6	8118	8123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858967
78	NC_017813	A	6	6	8125	8130	100 %	0 %	0 %	0 %	386858967
79	NC_017813	GCA	2	6	8143	8148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858967
80	NC_017813	TGC	2	6	8211	8216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858967
81	NC_017813	GCT	2	6	8224	8229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858967
82	NC_017813	AAT	2	6	8230	8235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858967
83	NC_017813	AAT	4	12	8242	8253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858967
84	NC_017813	AGG	2	6	8283	8288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858967
85	NC_017813	TGG	2	6	8340	8345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858967
86	NC_017813	ATG	2	6	8348	8353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858967
87	NC_017813	A	6	6	8458	8463	100 %	0 %	0 %	0 %	386858967
88	NC_017813	ACT	2	6	8497	8502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858967
89	NC_017813	GAGAA	2	10	9056	9065	60 %	0 %	40 %	0 %	386858968
90	NC_017813	GAA	2	6	9070	9075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858968
91	NC_017813	TGA	3	9	9108	9116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858968
92	NC_017813	TGG	2	6	9117	9122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858968
93	NC_017813	TGATGG	2	12	9123	9134	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386858968
94	NC_017813	GGA	3	9	9146	9154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858968
95	NC_017813	AGGA	2	8	9159	9166	50 %	0 %	50 %	0 %	386858968
96	NC_017813	AAGG	2	8	9181	9188	50 %	0 %	50 %	0 %	386858968
97	NC_017813	AAG	2	6	9264	9269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858968
98	NC_017813	TGC	2	6	9343	9348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858968
99	NC_017813	TGA	2	6	9448	9453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858968
100	NC_017813	AAAGC	2	10	9480	9489	60 %	0 %	20 %	20 %	386858968
101	NC_017813	T	6	6	9496	9501	0 %	100 %	0 %	0 %	386858968
102	NC_017813	AAG	2	6	9537	9542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858968
103	NC_017813	GAC	2	6	9551	9556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858968
104	NC_017813	AGC	2	6	9565	9570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858968
105	NC_017813	ATA	2	6	9585	9590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858968
106	NC_017813	ATT	2	6	9643	9648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386858968
107	NC_017813	GCT	2	6	9653	9658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386858968
108	NC_017813	ATG	2	6	9672	9677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858968
109	NC_017813	CTA	2	6	9699	9704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858968
110	NC_017813	GAT	2	6	10950	10955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858969
111	NC_017813	AAG	2	6	10956	10961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386858969
112	NC_017813	TGG	2	6	11000	11005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858969
113	NC_017813	AGC	3	9	11024	11032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858969
114	NC_017813	CTAATG	2	12	11089	11100	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386858969
115	NC_017813	ATG	2	6	11131	11136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858969
116	NC_017813	CAG	2	6	11137	11142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858969
117	NC_017813	TGA	4	12	11171	11182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858969
118	NC_017813	ACT	2	6	11190	11195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386858969
119	NC_017813	AAAG	2	8	11204	11211	75 %	0 %	25 %	0 %	386858969
120	NC_017813	AGC	2	6	11222	11227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858969
121	NC_017813	ATA	2	6	11287	11292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386858969
122	NC_017813	AGC	2	6	11321	11326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386858969
123	NC_017813	GA	3	6	11416	11421	50 %	0 %	50 %	0 %	386858969
124	NC_017813	TTAA	2	8	11452	11459	50 %	50 %	0 %	0 %	386858969
125	NC_017813	AATG	2	8	11653	11660	50 %	25 %	25 %	0 %	386858970
126	NC_017813	GAAG	2	8	11686	11693	50 %	0 %	50 %	0 %	386858970
127	NC_017813	GAAA	2	8	11700	11707	75 %	0 %	25 %	0 %	386858970
128	NC_017813	GAG	2	6	11708	11713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386858970
129	NC_017813	GGAAG	2	10	11718	11727	40 %	0 %	60 %	0 %	386858970
130	NC_017813	TGGTGA	2	12	11748	11759	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	386858970
131	NC_017813	TGA	3	9	11757	11765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386858970
132	NC_017813	GTG	2	6	11787	11792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386858970
133	NC_017813	GA	3	6	11799	11804	50 %	0 %	50 %	0 %	386858970
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.