MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema chromosome

Total Repeats: 24258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017808	TTTTAC	2	12	498	509	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386859227
2	NC_017808	AAT	2	6	512	517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859227
3	NC_017808	TCA	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859227
4	NC_017808	TAT	2	6	581	586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859227
5	NC_017808	ATA	2	6	626	631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859227
6	NC_017808	ATC	2	6	713	718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859228
7	NC_017808	ACC	3	9	719	727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386859228
8	NC_017808	CTC	2	6	778	783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859228
9	NC_017808	GAT	2	6	808	813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859228
10	NC_017808	ACT	2	6	830	835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859228
11	NC_017808	TTG	2	6	891	896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859228
12	NC_017808	CA	3	6	902	907	50 %	0 %	0 %	50 %	386859228
13	NC_017808	ATT	2	6	920	925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859228
14	NC_017808	T	6	6	924	929	0 %	100 %	0 %	0 %	386859228
15	NC_017808	TCT	2	6	959	964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859228
16	NC_017808	CAATC	2	10	1338	1347	40 %	20 %	0 %	40 %	386859229
17	NC_017808	TCT	2	6	1372	1377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859229
18	NC_017808	CTT	2	6	1609	1614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859230
19	NC_017808	CTGT	2	8	1630	1637	0 %	50 %	25 %	25 %	386859230
20	NC_017808	CTT	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859230
21	NC_017808	T	6	6	1786	1791	0 %	100 %	0 %	0 %	386859231
22	NC_017808	T	7	7	1835	1841	0 %	100 %	0 %	0 %	386859231
23	NC_017808	TGC	2	6	1926	1931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386859231
24	NC_017808	ATC	2	6	1971	1976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859231
25	NC_017808	TAAA	2	8	1998	2005	75 %	25 %	0 %	0 %	386859231
26	NC_017808	ATT	2	6	2752	2757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859232
27	NC_017808	TAA	2	6	2763	2768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859232
28	NC_017808	CTTTT	2	10	2777	2786	0 %	80 %	0 %	20 %	386859232
29	NC_017808	TTTC	2	8	2800	2807	0 %	75 %	0 %	25 %	386859232
30	NC_017808	CAAT	2	8	2825	2832	50 %	25 %	0 %	25 %	386859232
31	NC_017808	TTC	2	6	2859	2864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859232
32	NC_017808	T	6	6	2880	2885	0 %	100 %	0 %	0 %	386859232
33	NC_017808	CAT	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859232
34	NC_017808	TAT	2	6	3028	3033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859233
35	NC_017808	AAATTA	2	12	3118	3129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859233
36	NC_017808	CATAT	2	10	3144	3153	40 %	40 %	0 %	20 %	386859233
37	NC_017808	CTA	2	6	3203	3208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859233
38	NC_017808	TAC	2	6	3221	3226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859233
39	NC_017808	AGCA	2	8	3261	3268	50 %	0 %	25 %	25 %	386859233
40	NC_017808	CTT	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386859233
41	NC_017808	ATT	2	6	3309	3314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859233
42	NC_017808	A	6	6	3322	3327	100 %	0 %	0 %	0 %	386859233
43	NC_017808	CAA	2	6	3437	3442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859233
44	NC_017808	CATATT	2	12	3540	3551	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386859233
45	NC_017808	GTT	2	6	3569	3574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386859233
46	NC_017808	TTTTCA	2	12	3664	3675	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386859233
47	NC_017808	CTA	2	6	3682	3687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859233
48	NC_017808	TCA	2	6	3703	3708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859233
49	NC_017808	T	7	7	3738	3744	0 %	100 %	0 %	0 %	386859233
50	NC_017808	AATT	2	8	3753	3760	50 %	50 %	0 %	0 %	386859233
51	NC_017808	T	6	6	3759	3764	0 %	100 %	0 %	0 %	386859233
52	NC_017808	ATAATC	2	12	3987	3998	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386859233
53	NC_017808	A	6	6	4032	4037	100 %	0 %	0 %	0 %	386859233
54	NC_017808	ATA	2	6	4049	4054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859233
55	NC_017808	T	6	6	4078	4083	0 %	100 %	0 %	0 %	386859233
56	NC_017808	ATT	2	6	4114	4119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859234
57	NC_017808	A	6	6	4150	4155	100 %	0 %	0 %	0 %	386859234
58	NC_017808	ATA	2	6	4190	4195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859234
59	NC_017808	TAA	2	6	4203	4208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859234
60	NC_017808	ATCT	2	8	4227	4234	25 %	50 %	0 %	25 %	386859234
61	NC_017808	ATT	2	6	4361	4366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859234
62	NC_017808	A	8	8	4420	4427	100 %	0 %	0 %	0 %	386859234
63	NC_017808	CCT	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386859234
64	NC_017808	ATT	2	6	4501	4506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859234
65	NC_017808	ATC	3	9	4507	4515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859234
66	NC_017808	TAAAAT	2	12	4516	4527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859234
67	NC_017808	CCCT	2	8	4528	4535	0 %	25 %	0 %	75 %	386859234
68	NC_017808	GTG	2	6	4545	4550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386859234
69	NC_017808	CAG	2	6	4572	4577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859234
70	NC_017808	AT	3	6	4649	4654	50 %	50 %	0 %	0 %	386859234
71	NC_017808	T	6	6	4660	4665	0 %	100 %	0 %	0 %	386859234
72	NC_017808	A	7	7	4739	4745	100 %	0 %	0 %	0 %	386859234
73	NC_017808	CTTT	2	8	4746	4753	0 %	75 %	0 %	25 %	386859234
74	NC_017808	ATT	2	6	4756	4761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859234
75	NC_017808	AAT	2	6	4860	4865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859234
76	NC_017808	ATT	2	6	4882	4887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859234
77	NC_017808	A	6	6	4904	4909	100 %	0 %	0 %	0 %	386859234
78	NC_017808	AATT	2	8	4915	4922	50 %	50 %	0 %	0 %	386859234
79	NC_017808	ATA	2	6	4984	4989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859234
80	NC_017808	A	6	6	5098	5103	100 %	0 %	0 %	0 %	386859234
81	NC_017808	A	6	6	5135	5140	100 %	0 %	0 %	0 %	386859234
82	NC_017808	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859234
83	NC_017808	TCTT	2	8	5247	5254	0 %	75 %	0 %	25 %	386859234
84	NC_017808	CAG	2	6	5262	5267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386859234
85	NC_017808	TGA	2	6	5290	5295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859234
86	NC_017808	ATC	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859234
87	NC_017808	T	6	6	5326	5331	0 %	100 %	0 %	0 %	386859234
88	NC_017808	ATT	2	6	5335	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859234
89	NC_017808	CAA	2	6	5343	5348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859234
90	NC_017808	TTTAA	2	10	5363	5372	40 %	60 %	0 %	0 %	386859234
91	NC_017808	TAT	2	6	5403	5408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859234
92	NC_017808	AT	3	6	5433	5438	50 %	50 %	0 %	0 %	386859234
93	NC_017808	A	6	6	5487	5492	100 %	0 %	0 %	0 %	386859234
94	NC_017808	CA	3	6	5508	5513	50 %	0 %	0 %	50 %	386859234
95	NC_017808	A	6	6	5613	5618	100 %	0 %	0 %	0 %	386859235
96	NC_017808	TA	3	6	5620	5625	50 %	50 %	0 %	0 %	386859235
97	NC_017808	A	6	6	5643	5648	100 %	0 %	0 %	0 %	386859235
98	NC_017808	CT	3	6	5668	5673	0 %	50 %	0 %	50 %	386859235
99	NC_017808	A	7	7	5706	5712	100 %	0 %	0 %	0 %	386859235
100	NC_017808	AAAT	2	8	5732	5739	75 %	25 %	0 %	0 %	386859235
101	NC_017808	GAT	2	6	5743	5748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859235
102	NC_017808	AAT	2	6	5763	5768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859235
103	NC_017808	TTGGA	2	10	5822	5831	20 %	40 %	40 %	0 %	386859235
104	NC_017808	ATA	2	6	5863	5868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859235
105	NC_017808	T	7	7	5904	5910	0 %	100 %	0 %	0 %	386859235
106	NC_017808	GAT	2	6	6031	6036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859235
107	NC_017808	ATA	2	6	6070	6075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859235
108	NC_017808	CAAAT	2	10	6079	6088	60 %	20 %	0 %	20 %	386859235
109	NC_017808	ATA	2	6	6089	6094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859235
110	NC_017808	TAA	2	6	6110	6115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859235
111	NC_017808	A	6	6	6114	6119	100 %	0 %	0 %	0 %	386859235
112	NC_017808	TAA	2	6	6122	6127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859235
113	NC_017808	A	7	7	6126	6132	100 %	0 %	0 %	0 %	386859235
114	NC_017808	TAA	3	9	6144	6152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859235
115	NC_017808	CAA	2	6	6241	6246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386859235
116	NC_017808	AT	3	6	6250	6255	50 %	50 %	0 %	0 %	386859235
117	NC_017808	A	6	6	6304	6309	100 %	0 %	0 %	0 %	386859235
118	NC_017808	AAT	2	6	6321	6326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859235
119	NC_017808	GGA	2	6	6340	6345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386859235
120	NC_017808	TCAAT	2	10	6353	6362	40 %	40 %	0 %	20 %	386859235
121	NC_017808	A	7	7	6472	6478	100 %	0 %	0 %	0 %	386859235
122	NC_017808	ATTC	2	8	6506	6513	25 %	50 %	0 %	25 %	386859235
123	NC_017808	ATT	2	6	6589	6594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386859235
124	NC_017808	TCA	2	6	6595	6600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859235
125	NC_017808	A	6	6	6602	6607	100 %	0 %	0 %	0 %	386859235
126	NC_017808	A	8	8	6661	6668	100 %	0 %	0 %	0 %	386859235
127	NC_017808	ATG	2	6	6686	6691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859235
128	NC_017808	A	6	6	6710	6715	100 %	0 %	0 %	0 %	386859235
129	NC_017808	TAA	3	9	6806	6814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859235
130	NC_017808	GGA	2	6	6838	6843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386859235
131	NC_017808	CA	3	6	6849	6854	50 %	0 %	0 %	50 %	386859235
132	NC_017808	TGA	2	6	6978	6983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386859235
133	NC_017808	ATC	2	6	7023	7028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386859235
134	NC_017808	AAG	2	6	7031	7036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386859235
135	NC_017808	ACTA	2	8	7078	7085	50 %	25 %	0 %	25 %	386859235
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137	NC_017808	ATA	2	6	7126	7131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386859235
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